Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Gender-based incidence, recovery period, and mortality rate of COVID-19 among the population of district Attock, Pakistan / Incidência baseada em gênero, período de recuperação e taxa de mortalidade de COVID-19 entre a população do distrito de Attock, Paquistão

Abstract COVID-19 is reported as an extremely contagious disease with common symptoms of fever, dry cough, sore throat, and tiredness. The published literature on incidence and gender-wise prevalence of COVID-19 is scarce in Pakistan. Therefore, the present study was designed to compare the distribution, incubation period and mortality rate of COVID-19 among the male and female population of district Attock. The data were collected between 01 April 2020 and 07 December 2020 from the population of district Attock, Pakistan. A total of 22,962 individuals were screened and 843 were found positive for RT-qPCR for SARS-CoV-2. The confirmed positive cases were monitored carefully. Among the positive cases, the incidence of COVID-19 was 61.7% among males and 38.2% among females. The average recovery period of males was 18.89±7.75 days and females were 19±8.40 days from SARS-CoV-2. The overall mortality rate was 8.06%. The death rate of male patients was significantly higher (P<0.05) compared to female patients. Also, the mortality rate was higher (P<0.05) in male patients of 40-60 years of age compared to female patients of the same age group. Moreover, the mortality rate significantly increased (P<0.05) with the increase of age irrespective of gender. In conclusion, the incidence and mortality rate of COVID-19 is higher in males compared to the female population. Moreover, irrespective of gender the mortality rate was significantly lower among patients aged <40 years.

Resumo Covid-19 é relatada como uma doença extremamente contagiosa com sintomas comuns de febre, tosse seca, dor de garganta e cansaço. A literatura publicada sobre incidência e prevalência de Covid-19 com base no gênero é escassa no Paquistão. Portanto, o presente estudo teve como objetivo comparar a distribuição, o período de incubação e a taxa de mortalidade de Covid-19 entre a população masculina e feminina do distrito de Attock. Os dados foram coletados entre 1 de abril de 2020 e 7 de dezembro de 2020 da população do distrito de Attock, Paquistão. Um total de 22.962 indivíduos foi selecionado, e 843 foram considerados positivos para RT-qPCR para SARS-CoV-2. Os casos positivos confirmados foram monitorados cuidadosamente. Entre os casos positivos, a incidência de Covid-19 foi de 61,7% no sexo masculino e 38,2% no feminino. O período médio de recuperação dos homens foi de 18,89 ± 7,75 dias e das mulheres 19 ± 8,40 dias do SARS-CoV-2. A mortalidade geral foi de 8,06%. A taxa de mortalidade de pacientes do sexo masculino foi significativamente maior (P < 0,05) em comparação com pacientes do sexo feminino. Além disso, a taxa de mortalidade foi maior (P < 0,05) em pacientes do sexo masculino com 40-60 anos de idade em comparação com pacientes do sexo feminino da mesma faixa etária. Além disso, a taxa de mortalidade aumentou significativamente (P < 0,05) com o aumento da idade, independentemente do sexo. Em conclusão, a incidência e a taxa de mortalidade de Covid-19 são maiores no sexo masculino em comparação com a população feminina. E também, independentemente do sexo, a taxa de mortalidade foi significativamente menor entre os pacientes com idade < 40 anos.

A threefold approach including quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic studies to explore the natural compounds from Centaurea jacea as the potential inhibitors for COVID-19 / Uma abordagem tríplice incluindo química quântica, docking molecular e estudos dinâmicos moleculares para explorar os compostos naturais de Centaurea jacea como inibidores potenciais para Covid-19

Abstract In the current report, we studied the possible inhibitors of COVID-19 from bioactive constituents of Centaurea jacea using a threefold approach consisting of quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic techniques. Centaurea jacea is a perennial herb often used in folk medicines of dermatological complaints and fever. Moreover, anticancer, antioxidant, antibacterial and antiviral properties of its bioactive compounds are also reported. The Mpro (Main proteases) was docked with different compounds of Centaurea jacea through molecular docking. All the studied compounds including apigenin, axillarin, Centaureidin, Cirsiliol, Eupatorin and Isokaempferide, show suitable binding affinities to the binding site of SARS-CoV-2 main protease with their binding energies -6.7 kcal/mol, -7.4 kcal/mol, -7.0 kcal/mol, -5.8 kcal/mol, -6.2 kcal/mol and -6.8 kcal/mol, respectively. Among all studied compounds, axillarin was found to have maximum inhibitor efficiency followed by Centaureidin, Isokaempferide, Apigenin, Eupatorin and Cirsiliol. Our results suggested that axillarin binds with the most crucial catalytic residues CYS145 and HIS41 of the Mpro, moreover axillarin shows 5 hydrogen bond interactions and 5 hydrophobic interactions with various residues of Mpro. Furthermore, the molecular dynamic calculations over 60 ns (6×106 femtosecond) time scale also shown significant insights into the binding effects of axillarin with Mpro of SARS-CoV-2 by imitating protein like aqueous environment. From molecular dynamic calculations, the RMSD and RMSF computations indicate the stability and dynamics of the best docked complex in aqueous environment. The ADME properties and toxicity prediction analysis of axillarin also recommended it as safe drug candidate. Further, in vivo and in vitro investigations are essential to ensure the anti SARS-CoV-2 activity of all bioactive compounds particularly axillarin to encourage preventive use of Centaurea jacea against COVID-19 infections.

Resumo No presente relatório, estudamos os possíveis inibidores de Covid-19 de constituintes bioativos de Centaurea jacea usando uma abordagem tripla que consiste em técnicas de química quântica, docking molecular e dinâmica molecular. Centaurea jacea é uma erva perene frequentemente usada em remédios populares de doenças dermatológicas e febre. Além disso, as propriedades anticâncer, antioxidante, antibacteriana e antiviral de seus compostos bioativos também são relatadas. A Mpro (proteases principais) foi acoplada a diferentes compostos de Centaurea jacea por meio de docking molecular. Todos os compostos estudados, incluindo apigenina, axilarina, Centaureidina, Cirsiliol, Eupatorina e Isokaempferide, mostram afinidades de ligação adequadas ao sítio de ligação da protease principal SARS-CoV-2 com suas energias de ligação -6,7 kcal / mol, -7,4 kcal / mol, - 7,0 kcal / mol, -5,8 kcal / mol, -6,2 kcal / mol e -6,8 kcal / mol, respectivamente. Dentre todos os compostos estudados, a axilarina apresentou eficiência máxima de inibidor, seguida pela Centaureidina, Isokaempferida, Apigenina, Eupatorina e Cirsiliol. Nossos resultados sugeriram que a axilarina se liga aos resíduos catalíticos mais cruciais CYS145 e HIS41 do Mpro, além disso a axilarina mostra 5 interações de ligações de hidrogênio e 5 interações hidrofóbicas com vários resíduos de Mpro. Além disso, os cálculos de dinâmica molecular em uma escala de tempo de 60 ns (6 × 106 femtossegundos) também mostraram percepções significativas sobre os efeitos de ligação da axilarina com Mpro de SARS-CoV-2 por imitação de proteínas como o ambiente aquoso. A partir de cálculos de dinâmica molecular, os cálculos RMSD e RMSF indicam a estabilidade e dinâmica do melhor complexo ancorado em ambiente aquoso. As propriedades ADME e a análise de previsão de toxicidade da axilarina também a recomendaram como um candidato a medicamento seguro. Além disso, as investigações in vivo e in vitro são essenciais para garantir a atividade anti-SARS-CoV-2 de todos os compostos bioativos, particularmente a axilarina, para encorajar o uso preventivo de Centaurea jacea contra infecções por Covid-19.

Death caused by covid-19 in top ten countries in Asia affected by covid-19 pandemic with special reference to Pakistan / Morte causada por covid-19 nos dez principais países da Ásia afetados pela pandemia de covid-19, com referência especial ao Paquistão

Abstract The COVID-19 is a contagious viral disease, was first emerged in Wuhan, China in December 2019 and became the whole world on alert. The mortality rate in top most countries in Asia with special reference to Pakistan has been focused. Since February 26 to September 2020 the total confirmed cases and mortality rate was measured through Wikipedia and the notable journals. Iran is the only country having highest number of deaths (5.73%) followed by Indonesia (3.77%) while Saudi Arabia shows the lowest number of deaths as 1.39%. In Pakistan the first case was confirmed in 26th February, 2020. The nCov-19 has closely related to severe acute respiratory syndrome (SARS) hence SARS COV-2 was named. This virus is responsible for more than 33.9 million deaths in over all the world as of 20th September, 2020. The number of new cases is increasing time to time. Sindh province of Pakistan has reported the highest number of cases till September, 20, 2020 as compared to other parts of the country and has the highest number of death followed by Khyber Pakhtunkhwa. Because of the person to person contact the disease is spreading rapidly. The individuals who has already infected with other diseases like cancer or diabetic etc. are vulnerable. The nCOV-19 is the most contagious due to its mode of transmission. There is still no vaccine is available for the treatment of disease caused by nCoV-2019. It is therefore the only option to control this pandemic is to adopt effective preventive measures.

Resumo A covid-19 é uma doença viral contagiosa, que surgiu pela primeira vez em Wuhan, China, em dezembro de 2019, e deixou o mundo todo em alerta. A taxa de mortalidade na maioria dos principais países da Ásia, com referência especial ao Paquistão, foi enfocada. De 26 de fevereiro a setembro de 2020, o total de casos confirmados e a taxa de mortalidade foram medidos por meio da Wikipedia e de periódicos notáveis. O Irã é o único país com maior número de mortes (5,73%), seguido pela Indonésia (3,77%), enquanto a Arábia Saudita mostra o menor número de mortes, 1,39%. No Paquistão, o primeiro caso foi confirmado em 26 de fevereiro de 2020. O nCov-19 está intimamente relacionado à síndrome respiratória aguda grave (SARS), daí o nome SARS COV-2. Esse vírus é responsável por mais de 33,9 milhões de mortes em todo o mundo em 20 de setembro de 2020. O número de novos casos está aumentando de tempos em tempos. A província de Sindh, no Paquistão, registrou o maior número de casos até 20 de setembro de 2020, em comparação com outras partes do país, e tem o maior número de mortes, seguida por Khyber Pakhtunkhwa. Por causa do contato pessoa a pessoa, a doença está se espalhando rapidamente. Indivíduos que já foram diagnosticados com outras doenças, como câncer ou diabetes, etc. são mais vulneráveis. O nCOV-19 é o mais contagioso devido ao seu modo de transmissão. Ainda não há vacina disponível para o tratamento da doença causada pelo nCoV-2019. Portanto, a única opção para controlar essa pandemia é a adoção de medidas preventivas eficazes.

Use of convalescent plasma to treat COVID-19: case studies / Uso de plasma convalescente para tratar COVID-19: estudos de caso

There have been several efforts to minimize the effects caused by the COVID-19 virus around the world. Vaccines were developed in record time and alternative therapies were studied and applied in several countries, such as the use of plasma from recovered patients. Identifying, systematically evaluating and summarizing the best available scientific evidence on the efficacy and safety of using plasma from recovered COVID-19 patients remains the objective of this study. The studies carried out showed that the application of convalescent plasma contributes to the reduction of mortality, viral load and length of hospital stay. However, the effectiveness of the therapy still raises doubts due to the number of patients evaluated in clinical studies, in addition to its high cost and limitations in terms of availability and implementation, with the drug being authorized only for hospital use.

Houve vários esforços para minimizar os efeitos causados pelo vírus COVID-19 em todo o mundo. As vacinas foram desenvolvidas em tempo recorde e terapias alternativas foram estudadas e aplicadas em vários países, como o uso de plasma de pacientes recuperados. Identificar, avaliar sistematicamente e resumir as melhores evidências científicas disponíveis sobre a eficácia e segurança do uso de plasma de pacientes recuperados com COVID-19 continua sendo o objetivo deste estudo. Os estudos realizados mostraram que a aplicação de plasma convalescente contribui para a redução da mortalidade, carga viral e tempo de internação hospitalar. No entanto, a eficácia da terapia ainda gera dúvidas devido ao número de pacientes avaliados em estudos clínicos, além de seu alto custo e limitações em termos de disponibilidade e implementação, sendo o medicamento autorizado apenas para uso hospitalar.

COVID-19 impacts on healthcare access in sub-Saharan Africa: an overview

Abstract This overview aimed to describe the situation of healthcare access in sub-Saharan Africa, excluding South Africa, during the COVID-19 pandemic. A PubMed® search from March 31, 2020, to August 15, 2022, selected 116 articles. Healthcare access and consequences of COVID-19 were assessed based on comparisons with months before its onset or an identical season in previous years. A general reduction of healthcare delivery, associated with the decline of care quality, and closure of many specialty services were reported. The impact was heterogeneous in space and time, with an increase in urban areas at the beginning of the pandemic (March-June 2020). The return to normalcy was gradual from the 3rd quarter of 2020 until the end of 2021. The impact of COVID-19 on the health system and its use was attributed to (a) conjunctural factors resulting from government actions to mitigate the spread of the epidemic (containment, transportation restrictions, closures of businesses, and places of entertainment or worship); (b) structural factors related to the disruption of public and private facilities and institutions, in particular, the health system; and (c) individual factors linked to the increase in costs, impoverishment of the population, and fear of contamination or stigmatization, which discouraged patients from going to health centers. They have caused considerable socio-economic damage. Several studies emphasized some adaptability of the healthcare offer and resilience of the healthcare system, despite its unpreparedness, which explained a return to normal activities as early as 2022 while the COVID-19 epidemic persisted. There appears to be a strong disproportion between the moderate incidence and severity of COVID-19 in sub-Saharan Africa, and the dramatic impact on healthcare access. Several articles make recommendations for lowering the socioeconomic consequences of future epidemics to ensure better management of health issues.

Impact of Covid-19 on the supply and prices of lettuce, potato and tomato in Minas Gerais / Impacto da pandemia de Covid-19 na oferta e preços de alface, batata e tomate em Minas Gerais

The COVID-19 pandemic hasaffected the dynamics of the production, commercialization and consumption of vegetables. Lettuce, potato and tomato, an herbaceous vegetable, a tuberous vegetable and a fruit vegetable, respectively, are among thegroup of vegetables purchased most frequently. The objective of this studywas to evaluate how the pandemic affected the price and supply of lettuce, potato and tomato in 2020 compared to previous yearsbased on data from CEASA-MG from 2016 to 2021. The supply of lettuce wasconstant in 2020 butlower than the previous year until the month of August, and in December, the price was equal to that of the previous year. The supply of potato was lower throughout 2020 than in previous years. The price of potato was lower in 2020 than the price charged in 2019,until October 2020. The supply of tomato was low throughout 2020. Additionally, with respect to price, there was a decrease from March to July 2020 and a subsequent increase, surpassing the prices of previous years starting in October. In conclusion, both the supply and price of these vegetables were affected by the COVID-19 pandemic.(AU)

A pandemia causada por Covid-19 afetou a dinâmica de produção, comercialização e consumo das hortaliças. Foi realizado um estudo abrangendo uma hortaliça herbácea, uma hortaliça tuberosa e uma hortaliça fruto, sendo elas, alface, batata e tomate, as quais pertencem ao grupo de hortaliças com maior porcentagem de compra. A partir de dados do atacado do CEASA-MG de 2016 a 2021 objetivou-se avaliar como a pandemia do novo coronavírus afetou o preço e oferta de alface, batata e tomate em 2020 comparado aos anos anteriores. A alface teve oferta constante em 2020 e mais baixa que o ano anterior até o mês de agosto, sendo o preço igualado ao do ano anterior em dezembro. A oferta da batata foi inferior ao longo de 2020 quando comparado aos anos anteriores. O preço da batata foi inferior ao preço praticado em 2019 até outubro de 2020. O tomate teve a oferta mais baixa ao longo de 2020. E, com relação ao preço, houve queda de março a julho de 2020 e posteriormente aumento, superando os preços dos anos anteriores a partir de outubro. Conclui-se que tanto a oferta como o preço dessas hortaliças foram afetadas pela pandemia causada por Covid-19.(AU)

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Current understanding of an Emerging Coronavirus usingin silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) / Compreensão atual de um coronavírus emergente usando abordagem in silico: síndrome respiratória aguda grave - coronavírus-2 (SARS-CoV-2)

Novel coronavirus (nCoV) namely "SARS-CoV-2" is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the "SARS-CoV-2" although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among "SARS-CoV-2" and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that "SARS-CoV-2" has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.(AU)

O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente "SARS-CoV-2", foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o "SARS-CoV-2", embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre "SARS-CoV-2" e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que "SARS-CoV-2" tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.(AU)

Current understanding of an Emerging Coronavirus using in silico approach: Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)

Abstract Novel coronavirus (nCoV) namely SARS-CoV-2 is being found responsible for current PANDEMIC commenced from Wuhan (China) since December 2019 and has been described with epidemiological linkage to China in about 221 countries and territories until now. In this study we have characterized the genetic lineage of SARS-CoV-2 and report the recombination within the genus and subgenus of coronaviruses. Phylogenetic relationship of thirty nine coronaviruses belonging to its four genera and five subgenera was analyzed by using the Neighbor-joining method using MEGA 6.0. Phylogenetic trees of full length genome, various proteins (spike, envelope, membrane and nucleocapsid) nucleotide sequences were constructed separately. Putative recombination was probed via RDP4. Our analysis describes that the SARS-CoV-2 although shows great similarity to Bat-SARS-CoVs sequences through whole genome (giving sequence similarity 89%), exhibits conflicting grouping with the Bat-SARS-like coronavirus sequences (MG772933 and MG772934). Furthermore, seven recombination events were observed in SARS-CoV-2 (NC_045512) by RDP4. But not a single recombination event fulfills the high level of certainty. Recombination mostly housed in spike protein genes than rest of the genome indicating breakpoint cluster arises beyond the 95% and 99% breakpoint density intervals. Genetic similarity levels observed among SARS-CoV-2 and Bat-SARS-CoVs advocated that the latter did not exhibit the specific variant that cause outbreak in humans, proposing a suggestion that SARS-CoV-2 has originated possibly from bats. These genomic features and their probable association with virus characteristics along with virulence in humans require further consideration.

Resumo O novo coronavírus (nCoV), nomeadamente SARS-CoV-2, foi considerado responsável pela pandemia atual iniciada em Wuhan (China) desde dezembro de 2019 e foi descrito com ligação epidemiológica à China em cerca de 221 países e territórios até agora. Neste estudo, caracterizamos a linhagem genética do SARS-CoV-2 e relatamos a recombinação dentro do gênero e subgênero dos coronavírus. A relação filogenética de 39 coronavírus pertencentes a seus quatro gêneros e cinco subgêneros foi analisada usando o método de Neighbour-joining usando MEGA 6.0. Árvores filogenéticas do genoma de comprimento total, várias proteínas (espícula, envelope, membrana e nucleocapsídeo), sequências de nucleotídeos foram construídas separadamente. A recombinação putativa foi testada via RDP4. Nossa análise descreve que o SARS-CoV-2, embora mostre grande semelhança com as sequências de Bat-SARS-CoVs em todo o genoma (dando semelhança de sequência de 89%), exibe agrupamento conflitante com as sequências de coronavírus do tipo Bat-SARS (MG772933 e MG772934) Além disso, sete eventos de recombinação foram observados em SARS-CoV-2 (NC045512) por RDP4. Mas nem um único evento de recombinação preenche o alto nível de certeza. A recombinação está alojada mais em genes de proteína de pico, principalmente, do que no resto do genoma, indicando que o cluster de ponto de interrupção surge além dos intervalos de densidade de ponto de interrupção de 95% e 99%. Os níveis de similaridade genética observados entre SARS-CoV-2 e Bat-SARS-CoVs defendem que o último não exibe a variante específica que causa surto em humanos, sugerindo que SARS-CoV-2 tenha se originado possivelmente de morcegos. Essas características genômicas e sua provável associação com as características do vírus, juntamente com a virulência em humanos, requerem uma consideração mais aprofundada.

Gender-based incidence, recovery period, and mortality rate of COVID-19 among the population of district Attock, Pakistan / Incidência baseada em gênero, período de recuperação e taxa de mortalidade de COVID-19 entre a população do distrito de Attock, Paquistão

COVID-19 is reported as an extremely contagious disease with common symptoms of fever, dry cough, sore throat, and tiredness. The published literature on incidence and gender-wise prevalence of COVID-19 is scarce in Pakistan. Therefore, the present study was designed to compare the distribution, incubation period and mortality rate of COVID-19 among the male and female population of district Attock. The data were collected between 01 April 2020 and 07 December 2020 from the population of district Attock, Pakistan. A total of 22,962 individuals were screened and 843 were found positive for RT-qPCR for SARS-CoV-2. The confirmed positive cases were monitored carefully. Among the positive cases, the incidence of COVID-19 was 61.7% among males and 38.2% among females. The average recovery period of males was 18.89±7.75 days and females were 19±8.40 days from SARS-CoV-2. The overall mortality rate was 8.06%. The death rate of male patients was significantly higher (P<0.05) compared to female patients. Also, the mortality rate was higher (P<0.05) in male patients of 40-60 years of age compared to female patients of the same age group. Moreover, the mortality rate significantly increased (P<0.05) with the increase of age irrespective of gender. In conclusion, the incidence and mortality rate of COVID-19 is higher in males compared to the female population. Moreover, irrespective of gender the mortality rate was significantly lower among patients aged <40 years.

Covid-19 é relatada como uma doença extremamente contagiosa com sintomas comuns de febre, tosse seca, dor de garganta e cansaço. A literatura publicada sobre incidência e prevalência de Covid-19 com base no gênero é escassa no Paquistão. Portanto, o presente estudo teve como objetivo comparar a distribuição, o período de incubação e a taxa de mortalidade de Covid-19 entre a população masculina e feminina do distrito de Attock. Os dados foram coletados entre 1 de abril de 2020 e 7 de dezembro de 2020 da população do distrito de Attock, Paquistão. Um total de 22.962 indivíduos foi selecionado, e 843 foram considerados positivos para RT-qPCR para SARS-CoV-2. Os casos positivos confirmados foram monitorados cuidadosamente. Entre os casos positivos, a incidência de Covid-19 foi de 61,7% no sexo masculino e 38,2% no feminino. O período médio de recuperação dos homens foi de 18,89 ± 7,75 dias e das mulheres 19 ± 8,40 dias do SARS-CoV-2. A mortalidade geral foi de 8,06%. A taxa de mortalidade de pacientes do sexo masculino foi significativamente maior (P < 0,05) em comparação com pacientes do sexo feminino. Além disso, a taxa de mortalidade foi maior (P < 0,05) em pacientes do sexo masculino com 40-60 anos de idade em comparação com pacientes do sexo feminino da mesma faixa etária. Além disso, a taxa de mortalidade aumentou significativamente (P < 0,05) com o aumento da idade, independentemente do sexo. Em conclusão, a incidência e a taxa de mortalidade de Covid-19 são maiores no sexo masculino em comparação com a população feminina. E também, independentemente do sexo, a taxa de mortalidade foi significativamente menor entre os pacientes com idade < 40 anos.

Gender-based incidence, recovery period, and mortality rate of COVID-19 among the population of district Attock, Pakistan / Incidência baseada em gênero, período de recuperação e taxa de mortalidade de COVID-19 entre a população do distrito de Attock, Paquistão

COVID-19 is reported as an extremely contagious disease with common symptoms of fever, dry cough, sore throat, and tiredness. The published literature on incidence and gender-wise prevalence of COVID-19 is scarce in Pakistan. Therefore, the present study was designed to compare the distribution, incubation period and mortality rate of COVID-19 among the male and female population of district Attock. The data were collected between 01 April 2020 and 07 December 2020 from the population of district Attock, Pakistan. A total of 22,962 individuals were screened and 843 were found positive for RT-qPCR for SARS-CoV-2. The confirmed positive cases were monitored carefully. Among the positive cases, the incidence of COVID-19 was 61.7% among males and 38.2% among females. The average recovery period of males was 18.89±7.75 days and females were 19±8.40 days from SARS-CoV-2. The overall mortality rate was 8.06%. The death rate of male patients was significantly higher (P<0.05) compared to female patients. Also, the mortality rate was higher (P<0.05) in male patients of 40-60 years of age compared to female patients of the same age group. Moreover, the mortality rate significantly increased (P<0.05) with the increase of age irrespective of gender. In conclusion, the incidence and mortality rate of COVID-19 is higher in males compared to the female population. Moreover, irrespective of gender the mortality rate was significantly lower among patients aged <40 years.(AU)

Covid-19 é relatada como uma doença extremamente contagiosa com sintomas comuns de febre, tosse seca, dor de garganta e cansaço. A literatura publicada sobre incidência e prevalência de Covid-19 com base no gênero é escassa no Paquistão. Portanto, o presente estudo teve como objetivo comparar a distribuição, o período de incubação e a taxa de mortalidade de Covid-19 entre a população masculina e feminina do distrito de Attock. Os dados foram coletados entre 1 de abril de 2020 e 7 de dezembro de 2020 da população do distrito de Attock, Paquistão. Um total de 22.962 indivíduos foi selecionado, e 843 foram considerados positivos para RT-qPCR para SARS-CoV-2. Os casos positivos confirmados foram monitorados cuidadosamente. Entre os casos positivos, a incidência de Covid-19 foi de 61,7% no sexo masculino e 38,2% no feminino. O período médio de recuperação dos homens foi de 18,89 ± 7,75 dias e das mulheres 19 ± 8,40 dias do SARS-CoV-2. A mortalidade geral foi de 8,06%. A taxa de mortalidade de pacientes do sexo masculino foi significativamente maior (P < 0,05) em comparação com pacientes do sexo feminino. Além disso, a taxa de mortalidade foi maior (P < 0,05) em pacientes do sexo masculino com 40-60 anos de idade em comparação com pacientes do sexo feminino da mesma faixa etária. Além disso, a taxa de mortalidade aumentou significativamente (P < 0,05) com o aumento da idade, independentemente do sexo. Em conclusão, a incidência e a taxa de mortalidade de Covid-19 são maiores no sexo masculino em comparação com a população feminina. E também, independentemente do sexo, a taxa de mortalidade foi significativamente menor entre os pacientes com idade < 40 anos.(AU)

A threefold approach including quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic studies to explore the natural compounds from Centaurea jacea as the potential inhibitors for COVID-19 / Uma abordagem tríplice incluindo química quântica, docking molecular e estudos dinâmicos moleculares para explorar os compostos naturais de Centaurea jacea como inibidores potenciais para Covid-19

In the current report, we studied the possible inhibitors of COVID-19 from bioactive constituents of Centaurea jacea using a threefold approach consisting of quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic techniques. Centaurea jacea is a perennial herb often used in folk medicines of dermatological complaints and fever. Moreover, anticancer, antioxidant, antibacterial and antiviral properties of its bioactive compounds are also reported. The Mpro (Main proteases) was docked with different compounds of Centaurea jacea through molecular docking. All the studied compounds including apigenin, axillarin, Centaureidin, Cirsiliol, Eupatorin and Isokaempferide, show suitable binding affinities to the binding site of SARS-CoV-2 main protease with their binding energies -6.7 kcal/mol, -7.4 kcal/mol, -7.0 kcal/mol, -5.8 kcal/mol, -6.2 kcal/mol and -6.8 kcal/mol, respectively. Among all studied compounds, axillarin was found to have maximum inhibitor efficiency followed by Centaureidin, Isokaempferide, Apigenin, Eupatorin and Cirsiliol. Our results suggested that axillarin binds with the most crucial catalytic residues CYS145 and HIS41 of the Mpro, moreover axillarin shows 5 hydrogen bond interactions and 5 hydrophobic interactions with various residues of Mpro. Furthermore, the molecular dynamic calculations over 60 ns (6×106 femtosecond) time scale also shown significant insights into the binding effects of axillarin with Mpro of SARS-CoV-2 by imitating protein like aqueous environment. From molecular dynamic calculations, the RMSD and RMSF computations indicate the stability and dynamics of the best docked complex in aqueous environment. The ADME properties and toxicity prediction analysis of axillarin also recommended it as safe drug candidate. Further, in vivo and in [...].

No presente relatório, estudamos os possíveis inibidores de Covid-19 de constituintes bioativos de Centaurea jacea usando uma abordagem tripla que consiste em técnicas de química quântica, docking molecular e dinâmica molecular. Centaurea jacea é uma erva perene frequentemente usada em remédios populares de doenças dermatológicas e febre. Além disso, as propriedades anticâncer, antioxidante, antibacteriana e antiviral de seus compostos bioativos também são relatadas. A Mpro (proteases principais) foi acoplada a diferentes compostos de Centaurea jacea por meio de docking molecular. Todos os compostos estudados, incluindo apigenina, axilarina, Centaureidina, Cirsiliol, Eupatorina e Isokaempferide, mostram afinidades de ligação adequadas ao sítio de ligação da protease principal SARS-CoV-2 com suas energias de ligação -6,7 kcal / mol, -7,4 kcal / mol, - 7,0 kcal / mol, -5,8 kcal / mol, -6,2 kcal / mol e -6,8 kcal / mol, respectivamente. Dentre todos os compostos estudados, a axilarina apresentou eficiência máxima de inibidor, seguida pela Centaureidina, Isokaempferida, Apigenina, Eupatorina e Cirsiliol. Nossos resultados sugeriram que a axilarina se liga aos resíduos catalíticos mais cruciais CYS145 e HIS41 do Mpro, além disso a axilarina mostra 5 interações de ligações de hidrogênio e 5 interações hidrofóbicas com vários resíduos de Mpro. Além disso, os cálculos de dinâmica molecular em uma escala de tempo de 60 ns (6 × 106 femtossegundos) também mostraram percepções significativas sobre os efeitos de ligação da axilarina com Mpro de SARS-CoV-2 por imitação de proteínas como o ambiente aquoso. A partir de cálculos de dinâmica molecular, os cálculos RMSD e RMSF indicam a estabilidade e dinâmica do melhor complexo ancorado em ambiente [...].

A threefold approach including quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic studies to explore the natural compounds from Centaurea jacea as the potential inhibitors for COVID-19 / Uma abordagem tríplice incluindo química quântica, docking molecular e estudos dinâmicos moleculares para explorar os compostos naturais de Centaurea jacea como inibidores potenciais para Covid-19

In the current report, we studied the possible inhibitors of COVID-19 from bioactive constituents of Centaurea jacea using a threefold approach consisting of quantum chemical, molecular docking and molecular dynamic techniques. Centaurea jacea is a perennial herb often used in folk medicines of dermatological complaints and fever. Moreover, anticancer, antioxidant, antibacterial and antiviral properties of its bioactive compounds are also reported. The Mpro (Main proteases) was docked with different compounds of Centaurea jacea through molecular docking. All the studied compounds including apigenin, axillarin, Centaureidin, Cirsiliol, Eupatorin and Isokaempferide, show suitable binding affinities to the binding site of SARS-CoV-2 main protease with their binding energies -6.7 kcal/mol, -7.4 kcal/mol, -7.0 kcal/mol, -5.8 kcal/mol, -6.2 kcal/mol and -6.8 kcal/mol, respectively. Among all studied compounds, axillarin was found to have maximum inhibitor efficiency followed by Centaureidin, Isokaempferide, Apigenin, Eupatorin and Cirsiliol. Our results suggested that axillarin binds with the most crucial catalytic residues CYS145 and HIS41 of the Mpro, moreover axillarin shows 5 hydrogen bond interactions and 5 hydrophobic interactions with various residues of Mpro. Furthermore, the molecular dynamic calculations over 60 ns (6×106 femtosecond) time scale also shown significant insights into the binding effects of axillarin with Mpro of SARS-CoV-2 by imitating protein like aqueous environment. From molecular dynamic calculations, the RMSD and RMSF computations indicate the stability and dynamics of the best docked complex in aqueous environment. The ADME properties and toxicity prediction analysis of axillarin also recommended it as safe drug candidate. Further, in vivo and in [...].(AU)

No presente relatório, estudamos os possíveis inibidores de Covid-19 de constituintes bioativos de Centaurea jacea usando uma abordagem tripla que consiste em técnicas de química quântica, docking molecular e dinâmica molecular. Centaurea jacea é uma erva perene frequentemente usada em remédios populares de doenças dermatológicas e febre. Além disso, as propriedades anticâncer, antioxidante, antibacteriana e antiviral de seus compostos bioativos também são relatadas. A Mpro (proteases principais) foi acoplada a diferentes compostos de Centaurea jacea por meio de docking molecular. Todos os compostos estudados, incluindo apigenina, axilarina, Centaureidina, Cirsiliol, Eupatorina e Isokaempferide, mostram afinidades de ligação adequadas ao sítio de ligação da protease principal SARS-CoV-2 com suas energias de ligação -6,7 kcal / mol, -7,4 kcal / mol, - 7,0 kcal / mol, -5,8 kcal / mol, -6,2 kcal / mol e -6,8 kcal / mol, respectivamente. Dentre todos os compostos estudados, a axilarina apresentou eficiência máxima de inibidor, seguida pela Centaureidina, Isokaempferida, Apigenina, Eupatorina e Cirsiliol. Nossos resultados sugeriram que a axilarina se liga aos resíduos catalíticos mais cruciais CYS145 e HIS41 do Mpro, além disso a axilarina mostra 5 interações de ligações de hidrogênio e 5 interações hidrofóbicas com vários resíduos de Mpro. Além disso, os cálculos de dinâmica molecular em uma escala de tempo de 60 ns (6 × 106 femtossegundos) também mostraram percepções significativas sobre os efeitos de ligação da axilarina com Mpro de SARS-CoV-2 por imitação de proteínas como o ambiente aquoso. A partir de cálculos de dinâmica molecular, os cálculos RMSD e RMSF indicam a estabilidade e dinâmica do melhor complexo ancorado em ambiente [...].(AU)

One health approach for the surveillance of novel swine viral diseases / Uma abordagem de saúde única para a vigilância de novas doenças virais de suínos

The novel coronavirus pandemic highlighted the importance of discussing and monitoring emerging diseases to scientific society, particularly in the case of zoonotic diseases. Diseases emerge in nature and infect living beings current on all continents, even in the current scenario of biomedical research evolution. Among the most studied emerging animal diseases are the swine viral diseases, due to their high occurrence and severity. Added to this, is the economic impact on the health of pigs and in some cases on human health. The challenges of swine health include endemic diseases, foodborne and transboundary diseases. Idiopathic vesicular diseases and subclinical diseases have also been identified, either alone or in combination with other infections. Several factors have contributed to these phenomena, but failures in biosecurity, biocontainment, and herd immunity imbalances are critical and must be addressed. Viruses evolve naturally, through mutation, rearrangement, or recombination, either to become more virulent or more transmissible, or not. This review will discuss the broad field of emerging swine viral infections, how monitoring the evolution of these viral agents is of supreme importance. Also, when should a new disease or emerging agent is considered a risk to swine production? Although the evolution of pork production systems is admirable, animal diseases continue to account for 20% of the losses. Therefore, international organizations work with member countries to prevent animal diseases, ensure food supply, maintain household income, health, and preserve the future. One Health is not just a concept, but an action of surveillance and control that all countries must implement.

A pandemia do novo coronavírus enfatizou a importância que a discussão e a vigilância de doenças emergentes representam para a sociedade científica, especialmente no caso de doenças zoonóticas. Mesmo no atual cenário de evolução da pesquisa biomédica, as doenças surgem na natureza e infectam os seres vivos em todos os continentes. Entre as doenças animais emergentes mais estudadas estão as doenças virais suínas, devido à sua alta ocorrência e gravidade. Soma-se a isso o impacto econômico na saúde dos suínos e, em alguns casos, na saúde humana. Os desafios da saúde suína incluem doenças endêmicas, doenças transmitidas por alimentos e doenças transfronteiriças. Além disso, doenças vesiculares idiopáticas e doenças subclínicas foram identificadas isoladamente ou em co-infecções. Vários fatores desencadearam esses fenômenos, mas falhas na biossegurança, biocontenção e desequilíbrio na imunidade do rebanho são fundamentais e devem ser corrigidos. Os vírus evoluem naturalmente, por mutação, rearranjo ou recombinação, para se tornarem mais virulentos ou mais transmissíveis, ou não. Esta revisão discutirá o amplo campo de infecções virais suínas emergentes e como o monitoramento da evolução desses agentes virais é de suma importância. Além disso, quando considerar uma nova doença ou agente emergente um risco para a suinocultura. A evolução dos sistemas de produção de suínos é admirável, mas as doenças dos animais ainda respondem por 20% das perdas. Portanto, as organizações internacionais trabalham com os países membros para prevenir doenças animais, garantir o abastecimento de alimentos, manter a renda familiar, a saúde e preservar o futuro. Saúde Única não é apenas um conceito, mas uma ação de vigilância e controle que todos os países devem implementar.

Potential histopathological and immunological effects of SARS-CoV-2 on the liver / Efeitos histopatológicos e imunológicos potenciais do SARS-CoV-2 no fígado

The coronavirus disease outbreak of 2019 (COVID-19) poses a serious threat to public health worldwide. Lung injury is the most common complication of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection. However, other organs, including the liver, can also be affected. Currently, there is limited evidence that liver impairment is associated with severe SARS-CoV-2 infection. Clinicians will need to determine whether liver injury is caused by an underlying liver condition, COVID-19 therapy, the virus directly, or immune-mediated inflammation or represents a complicated disease course in the context of COVID-19. To address the scarcity of data on histopathological changes and immunological effects on the liver with COVID-19 positivity, we analyze and summarize recent findings. We searched PubMed, Medline, Google Scholar, Science Direct, Scopus, and Web of Science databases up to December 1, 2021, identifying published studies with the search terms "Histopathology in COVID-19," "COVID-19," "Pathological changes in liver in COVID-19," "Liver pathology in COVID-19," "immunological effects in liver in COVID-19," and "SARS-CoV-2." This concise review will aid clinicians and researchers in better understanding the tissue histopathology and immunological consequences of SARS-CoV-2 on the liver, enabling improved care planning and avoiding future dangers.

O surto de doença por coronavírus de 2019 (COVID-19) representa uma séria ameaça à saúde pública em todo o mundo. A lesão pulmonar é a complicação mais comum da infecção por Coronavírus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2). No entanto, outros órgãos, incluindo o fígado, também podem ser afetados. Atualmente, há evidências limitadas de que a insuficiência hepática está associada à infecção grave por SARS-CoV-2. Os médicos precisarão determinar se a lesão hepática é causada por condição hepática subjacente, terapia COVID-19, vírus diretamente, inflamação imunomediada ou se representa um curso complicado da doença no contexto da COVID-19. Para abordar a escassez de dados sobre alterações histopatológicas e efeitos imunológicos no fígado com positividade para COVID-19, analisamos e resumimos os achados recentes. Pesquisamos os bancos de dados PubMed, Medline, Google Scholar, Science Direct, Scopus e Web of Science até 1º de dezembro de 2021, identificando estudos publicados com os termos de pesquisa "Histopatologia em COVID-19", "COVID-19", "Alterações patológicas no fígado em COVID-19", "Patologia hepática em COVID-19", "Efeitos imunológicos no fígado em COVID-19" e "SARS-CoV-2". Esta revisão concisa ajudará médicos e pesquisadores a entender melhor a histopatologia do tecido e as consequências imunológicas do SARS-CoV-2 no fígado, permitindo um melhor planejamento de cuidados e evitando perigos futuros.

SARS-CoV-2 em cães e gatos: revisão de literatura / SARS-CoV-2 in dogs and cats: literature review / SARS-CoV-2 en perros y gatos: revisión de literatura

Ao final de 2019, um novo coronavírus foi identificado na China, em pacientes com pneumonia severa. Desde sua descoberta, o SARS-CoV-2 se disseminou rapidamente por todo o mundo. Esta revisão de literatura foi realizada para definir o papel de cães e gatos na epidemiologia do SARS-CoV-2. O coronavírus pertence à família Coronaviridae, gêneros Betacoronavírus, é o agente causador da COVID-19 humana e apresenta glicoproteínas de pico que permitem a entrada do vírus na célula hospedeira, por meio da ligação da proteína de pico com os receptores da enzima conversora de angiotensina tipo 2. Não há relatos de que animais de companhia sejam fonte de infecção para seres humanos, entretanto, evidências apontam que humanos infectados possam transmitir partículas virais para os animais de forma natural. Animais infectados podem apresentar sinais clínicos leves e autolimitantes. Assim cães e gatos podem adquirir o SARS-CoV-2 de seus tutores e podem transmitir para outros animais, mas não para humanos e que é importante o entendimento da susceptibilidade de cães e gatos devido ao seu contato próximo com seres humanos.

By the end of 2019, a new coronavirus was identified in China, in patients with severe pneumonia. Since its discovery, the SARS-CoV-2 has quickly spread throughout the world. This literature review was conducted to define the role of dogs and cats in the epidemiology of SARS-CoV-2. The coronavirus belongs to the Coronaviridae family, Betacoronavirus genera, is the causative agent of the human COVID-19 and shows spike glycotproteins which allow the virus to enter in the host cell through the binding the spike protein with the receptors of the angiotensin-converting enzyme type 2. There is no reports that companion animals are a source of infection for human beings, however, evidences show that infected humans can transmit viral particles to the animals in a natural way. Infected animals may show mild and self-limiting clinical signs. Thus, dogs and cats can acquire SARS-CoV-2 from their tutors and may transmit to other animals, but not to humans and that is important the understanding about the susceptibility of dogs and cats due their close contact with human beings.

Al final de 2019, un nuevo coronavirus fue identificado en China, en pacientes con neumonía severa. Desde su descubrimiento, el SARS-CoV-2 se diseminó rápidamente por todo el mundo. Esta revisión de literatura fue realizada para definir el papel de perros y gatos en la epidemiología del SARS-CoV-2. El coronavirus pertenece a la familia Coronaviridae, género Betacoronavírus, es el agente causador de la COVID-19 humana y presenta glicoproteínas de pico que permiten la entrada del virus en la célula hospedadora, mediante la unión de la proteína de pico con los receptores de la enzima convertidora de antiogensina tipo 2. No hay reportes de que animales de compañía sean fuente de infección para los seres humanos, entretanto, evidencias apuntan que humanos infectados puedan transmitir partículas virales para los animales de forma natural. Animales infectados pueden presentar signos clínicos leves y autolimitados Así perros y gatos pueden adquirir el SARS-CoV-2 de sus tutores y pueden transmitir para otros animales, pero no para humanos y es importante el entendimiento de la susceptibilidad de perros y gatos debido a su contacto próximo con seres humanos.

Atuação do médico-veterinário na pandemia contra SARS-COV-2 (COVID-19) / Veterinarian performance in pandemic against SARS-COV-2 (COVID-19)

A pandemia pelo novo coronavirus é um dos maiores desafios deste século, sendo uma emergência na saúde pública de importância global. Tendo a Medicina Veterinária papel fundamental na saúde pública, este trabalho tem como objetivo verificar o grau de conhecimento das pessoas sobre o papel do médico-veterinário na pandemia novo coronavirus. Para sua realização, foi elaborado um questionário on-line por meio da plataforma Google Docs. Ao todo, foram registradas 457 respostas, mostrando que 49% dos respondentes afirmaram conhecer a Medicina Veterinária, mas 56,7% não sabem informar a atuação dessa categoria profissional em relação ao combate da covid-19.

The new coronavirus pandemic is one of the greatest challenges of this century and is a public health emergency of global importance. Veterinary medicine has a fundamental role in public health, considering this, this work aims to verify the degree of knowledge of people about the role of the veterinarian in the new coronavirus pandemic. To carry out this work, a questionnaire with online questions was created through the Google Docs platform Altogether, 457 responses were registered and it is possible to conclude that 49% of respondents claim to know veterinary medicine, but 56.7% do not know how to inform the performance of this professional category combating covid-19.

Persistent SARS-CoV-2 antigen presence in multiple organs of a naturally infected cat from Brazil

Background: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the etiological agent of the disease coronavirus 2019 (COVID-19) in humans. SARS-CoV-2 has been identified in cats with or without clinical signs. Case presentation: We describe the pathological and molecular findings in a six-month-old asymptomatic cat with SARS-CoV-2 infection from Brazil, belonging to a human family with COVID-19 cases. The pool of nasopharynx and oropharynx swabs at day zero tested positive by RT-qPCR for SARS-CoV-2. No amplification resulted from molecular testing performed on days 7 and 14. The cat was hit by a car and died 43 days after the molecular diagnosis. Immunohistochemistry at post-mortem examination demonstrated nucleocapsid protein in samples from the lungs, kidneys, nasal conchae, trachea, intestine, brain and spleen. Conclusion: The present study has highlighted the possibility that viral antigens can be detected by immunohistochemistry in multiple organs six weeks after infection, although the same tissues tested negative by RT-PCR.(AU)

Consumo de produtos apícolas no Piauí durante a pandemia da Covid-19 / Consumption of bee products during the Covid-19 pandemic in Piaui

Objetivou-se investigar o consumo dos produtos apícolas no estado do Piauí durante a pandemia da COVID-19. Para tanto, a coleta de dados deu-se de forma remota por meio de formulário online disponibilizado via Whatsapp e Instagram. A amostragem foi estratificada considerando-se as quatro mesorregiões do Piauí e o gênero dos participantes e para tal, foi utilizada a Calculadora Survey Monkey. Após a estratificação, a pesquisa abrangeu 392 participantes. Observou-se que 85,46% dos entrevistados afirmaram ter o hábito de consumir produtos apícolas, relacionando-o principalmente ao potencial nutricional que apresentam (24,78%). Em relação ao consumo durante a pandemia, 79,34% afirmaram estarem utilizando os produtos apícolas, sendo o mel o produto mais consumido (59,16%), em seguida, mel e própolis (26,04%) e a própolis unicamente (4,82%). Sobre a utilização referente à COVID-19, verificou-se que 23,47% e 3,21% dos entrevistados relacionou o uso à prevenção ou tratamento da doença, respectivamente. No geral, foi verificado um aumento de 37,24% no consumo dos produtos apícolas durante a pandemia, porém a maioria dos participantes (52,05%) não soube afirmar o quanto.(AU)

The aim was to investigate the use of bee products in Piaui state during the COVID-19 pandemic. To that end, data were collected remotely via an online form sent on WhatsApp and Instagram. Sampling was stratified considering the four mesoregions of Piaui and the sex of the participants using the Survey Monkey calculator. After stratification, the study contained 392 participants. A total of 85.46% of the interviewees reported regularly consuming bee products, primarily (24.78%) due to their nutritional potential. During the pandemic, 79.34% used bee products, honey being the most consumed (59.16%), followed by propolis honey (26.04%) and propolis alone (4.82%). With respect to COVID-19-related use, 23.47% and 3.21% of the subjects related consumption for disease prevention and treatment, respectively. In general, there was a 37.24% increase in the consumption of bee products during the pandemic, but most of the participants (52.05%) did not know the extent of the increase.(AU)