Resumo
Fourteen novel microsatellite loci are described and characterized in two species of electric eels, Electrophorus variiand E. voltaifrom floodplains and rivers of the Amazon rainforest. These loci are polymorphic, highly informative, and have the capacity to detect reliable levels of genetic diversity. Likewise, the high combined probability of paternity exclusion value and low combined probability of genetic identity value obtained demonstrate that the new set of loci displays suitability for paternity studies on electric eels. In addition, the cross-amplification of electric eel species implies that it may also be useful in the study of the closely related E. electricus, and to other Neotropical electric fishes (Gymnotiformes) species as tested herein.(AU)
Catorze novos loci microsatélites são descritos e caracterizados em duas espécies de poraquês, Electrophorus varii e E. voltai de planícies alagadas e rios da floresta amazônica. Esses loci são polimórficos, altamente informativos e têm a capacidade de detectar níveis confiáveis de diversidade genética. Da mesma forma, o alto valor de exclusão de paternidade combinado com a baixa probabilidade de identidade genética demonstra que o novo conjunto de loci exibe adequação para estudos de paternidade em poraquês. Além disso, a amplificação cruzada de espécies de peixes elétricos implica que também pode ser útil no estudo da espécie intimamente relacionada E. electricus, e de outras espécies de peixes elétricos neotropicais (Gymnotiformes).(AU)
Assuntos
Masculino , Repetições de Microssatélites/genética , Gimnotiformes/genética , Variação Genética/genética , Repetições de MicrossatélitesResumo
Fourteen novel microsatellite loci are described and characterized in two species of electric eels, Electrophorus variiand E. voltaifrom floodplains and rivers of the Amazon rainforest. These loci are polymorphic, highly informative, and have the capacity to detect reliable levels of genetic diversity. Likewise, the high combined probability of paternity exclusion value and low combined probability of genetic identity value obtained demonstrate that the new set of loci displays suitability for paternity studies on electric eels. In addition, the cross-amplification of electric eel species implies that it may also be useful in the study of the closely related E. electricus, and to other Neotropical electric fishes (Gymnotiformes) species as tested herein.(AU)
Catorze novos loci microsatélites são descritos e caracterizados em duas espécies de poraquês, Electrophorus varii e E. voltai de planícies alagadas e rios da floresta amazônica. Esses loci são polimórficos, altamente informativos e têm a capacidade de detectar níveis confiáveis de diversidade genética. Da mesma forma, o alto valor de exclusão de paternidade combinado com a baixa probabilidade de identidade genética demonstra que o novo conjunto de loci exibe adequação para estudos de paternidade em poraquês. Além disso, a amplificação cruzada de espécies de peixes elétricos implica que também pode ser útil no estudo da espécie intimamente relacionada E. electricus, e de outras espécies de peixes elétricos neotropicais (Gymnotiformes).(AU)
Assuntos
Masculino , Repetições de Microssatélites/genética , Gimnotiformes/genética , Variação Genética/genética , Repetições de MicrossatélitesResumo
ABSTRACT Behavioral observations made on fish have revealed remarkably diverse reproductive strategies, including polygamy by both sexes. Still, to date, most Neotropical species remain unstudied as to whether the observed reproductive behavior in natural populations correlates with their genetic mating systems. Here, we investigated the genetic mating system of a wild population of Prochilodus lineatus settled in the Middle Uruguay River basin. By using sibship reconstruction and parental inference methods based on microsatellites genotypes, we inferred 45 females and 47 males as potential parents of the 87 larvae analyzed. We found evidence supporting polygamous mating in both sexes: while a high percentage of males (44.7%) fertilized the eggs of one female, 55.3% of the inferred males fertilized eggs of up to four females. Likewise, while 44.5% of the inferred females had their eggs fertilized by one only male, 55.5% of females were fertilized by multiple males. The estimated proxy of the effective population size (Nb) was 126, exhibiting moderate to high levels of genetic diversity. The genetic evidence contributed in this study complements earlier behavioral observations of formation of spawning nuclei of aggregating breeders, which may be promoting a polygamous mating strategy in this long-distance migratory fish.
RESUMO Observações do comportamento de peixes neotropicais têm revelado estratégias reprodutivas marcadamente variáveis, incluindo poligamia nos dois sexos. Ainda assim, até então, a correlação entre comportamento reprodutivo observado em populações naturais e sistemas de acasalamento genético permanece pouco explorada para maioria de espécies Neotropicais. Neste estudo investigamos o sistema genético de acasalamento de Prochilodus lineatus em uma população natural estabelecida no Médio rio Uruguai. Utilizando métodos de reconstrução de grupos familiares e inferências parentais baseados em genótipos de microssatélites, inferimos 45 fêmeas e 47 machos como os possíveis parentais das 87 larvas amostradas. Encontramos evidência que permite apoiar a ocorrência de acasalamento poligâmico em ambos os sexos: enquanto uma percentagem alta de machos (44,7%) fertilizou somente uma fêmea, 55,3% dos machos inferidos fertilizaram mais de uma fêmea (até quatro por macho). Da mesma forma, enquanto que 44,5% das fêmeas inferidas tiveram seus ovos fertilizados por apenas um único macho, 55,5% das fêmeas tiveram ovos fertilizados por múltiplos machos. A estimativa do tamanho populacional efetivo (Nb) foi 126, exibindo níveis entre moderados e altos de diversidade genética. A evidência genética que apresentamos nesse estudo complementa observações iniciais da formação de núcleos de desova que podem promover estratégias de acasalamento poligâmico nessa espécie migratória de longa distância.
Resumo
The knowledge of appropriate reproductive managements is fundamental for the management and orientation of activities in restocking centers. The aim of the present study was to evaluate the influence of artificial and semi-natural reproductive systems and sex ratios on parental contribution progeny of Prochilodus lineatus. Samples of caudal fins from 25 breeders subjected to the artificial reproductive system and 10 breeders subjected to the semi-natural reproductive system were collected in different sex ratios (1♂:1♀ and 2♂:1♀, and 1♂:1♀, respectively). Two hundred and eight fingerlings from these matings were evaluated. Breeding mortality was recorded shortly after reproductive procedures. For paternity analysis, 10 microsatellite loci were amplified. Three breeders died in the artificial reproductive system (two in the 1:1 ratio and one in the 2:1 ratio). In the 1:1 ratio in the artificial reproductive system, one male (M1.4) had a higher contribution in the progeny formation (41.8%), whereas in the 2:1 ratio, four males contributed from 14.5 to 21.7%. Lower reproductive dominance was identified in the semi-natural reproductive system, with values ranging from 22.86 to 25.71% for four males. In the formation of families, both systems demonstrated a reproductive dominance of some couples. So, the semi-natural reproductive system allowed greater homogeneity in the contribution of progeny without losses due to mortality.(AU)
O conhecimento de manejos apropriados para a reprodução é fundamental para a gestão e direcionamento das atividades em centrais de repovoamento. O objetivo deste estudo foi avaliar a influência dos sistemas reprodutivos por extrusão e seminatural e da proporção de sexo na contribuição parental de progênies de P. lineatus. Amostras de nadadeiras caudais de 25 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo por extrusão e 10 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo seminatural foram coletados em diferentes proporções de sexo (1♂:1♀ e 2♂:1♀, e 1♂:1♀, respectivamente). Duzentos e oito alevinos oriundos desses acasalamentos foram avaliados. A mortalidade dos reprodutores foi registrada logo após os procedimentos reprodutivos. Para a análise de paternidade, foram amplificados 10 loci microssatélites. Três reprodutores foram a óbito no sistema extrusão (dois na proporção 1:1 e um na proporção 2:1). No sistema extrusão 1:1 observou-se que um macho (M1.4) obteve maior contribuição na formação progênie (41,8%), enquanto que na proporção 2:1, quatro machos contribuíram entre 14,5 a 21,7%. A menor dominância reprodutiva foi identificada no sistema seminatural, com valores variando de 22,86% a 25,71% para quatro machos. Na formação das famílias, foi observada dominância reprodutiva de alguns casais em ambos os sistemas. Conclui-se que o sistema seminatural permitiu maior homogeneidade na contribuição na progênie sem perdas por mortalidade.(AU)
Assuntos
Animais , Técnicas Reprodutivas/veterinária , Técnicas Reprodutivas/mortalidade , Cruzamento/métodos , Caraciformes , Tamanho da NinhadaResumo
The knowledge of appropriate reproductive managements is fundamental for the management and orientation of activities in restocking centers. The aim of the present study was to evaluate the influence of artificial and semi-natural reproductive systems and sex ratios on parental contribution progeny of Prochilodus lineatus. Samples of caudal fins from 25 breeders subjected to the artificial reproductive system and 10 breeders subjected to the semi-natural reproductive system were collected in different sex ratios (1♂:1♀ and 2♂:1♀, and 1♂:1♀, respectively). Two hundred and eight fingerlings from these matings were evaluated. Breeding mortality was recorded shortly after reproductive procedures. For paternity analysis, 10 microsatellite loci were amplified. Three breeders died in the artificial reproductive system (two in the 1:1 ratio and one in the 2:1 ratio). In the 1:1 ratio in the artificial reproductive system, one male (M1.4) had a higher contribution in the progeny formation (41.8%), whereas in the 2:1 ratio, four males contributed from 14.5 to 21.7%. Lower reproductive dominance was identified in the semi-natural reproductive system, with values ranging from 22.86 to 25.71% for four males. In the formation of families, both systems demonstrated a reproductive dominance of some couples. So, the semi-natural reproductive system allowed greater homogeneity in the contribution of progeny without losses due to mortality.
O conhecimento de manejos apropriados para a reprodução é fundamental para a gestão e direcionamento das atividades em centrais de repovoamento. O objetivo deste estudo foi avaliar a influência dos sistemas reprodutivos por extrusão e seminatural e da proporção de sexo na contribuição parental de progênies de P. lineatus. Amostras de nadadeiras caudais de 25 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo por extrusão e 10 reprodutores submetidos ao sistema reprodutivo seminatural foram coletados em diferentes proporções de sexo (1♂:1♀ e 2♂:1♀, e 1♂:1♀, respectivamente). Duzentos e oito alevinos oriundos desses acasalamentos foram avaliados. A mortalidade dos reprodutores foi registrada logo após os procedimentos reprodutivos. Para a análise de paternidade, foram amplificados 10 loci microssatélites. Três reprodutores foram a óbito no sistema extrusão (dois na proporção 1:1 e um na proporção 2:1). No sistema extrusão 1:1 observou-se que um macho (M1.4) obteve maior contribuição na formação progênie (41,8%), enquanto que na proporção 2:1, quatro machos contribuíram entre 14,5 a 21,7%. A menor dominância reprodutiva foi identificada no sistema seminatural, com valores variando de 22,86% a 25,71% para quatro machos. Na formação das famílias, foi observada dominância reprodutiva de alguns casais em ambos os sistemas. Conclui-se que o sistema seminatural permitiu maior homogeneidade na contribuição na progênie sem perdas por mortalidade.
Assuntos
Animais , Caraciformes , Cruzamento/métodos , Técnicas Reprodutivas/mortalidade , Técnicas Reprodutivas/veterinária , Tamanho da NinhadaResumo
Pollen and seed dispersal patterns greatly influence the spatial distribution of plant genetic diversity. Microsatellite-based parentage analysis provides accurate estimates of contemporary gene dispersal. Although most tropical trees have been shown to exhibit widespread pollen dispersal, few studies have estimated contemporary gene dispersal after seedling establishment. Bertholletia excelsa (Lecythidaceae) is pollinated by large-bodied bees, while previous seed-tracking experiments suggest their seeds are mainly dispersed across very short distances by scatter-hoarding rodents, who primarily act as seed predators. Here we used parentage analysis to provide contemporary estimates of pollen and seed dispersal in B. excelsa recruits. We examined six 25-ha plots located in two natural stands in the Acre River valley, in the southwestern Brazilian Amazon. We used 11 microsatellite markers to estimate genetic diversity and fixation index parameters in adults, seedlings and saplings. Genetic diversity was moderate and did not differ across size classes or sampling locations. We assigned pollen and seed parents for < 20% of the recruits, indicating that most events of realized gene flow occurred beyond our 25-ha plots. Only 10 parentage assignments were confirmed with 80% confidence. Pollen distance ranged from 33 to 372 m and seed dispersal from 58 to 655 m. Actual seed-dispersal distances were far greater than the estimates obtained in previous seed-tracking experiments. Thus, studies encompassing larger sampling areas are necessary to determine a more representative spatial scale of B. excelsas pollen and seed dispersal capacity in natural stands.
Os padrões de dispersão de pólen e sementes influenciam a distribuição espacial da diversidade genética. Muitas espécies arbóreas tropicais apresentam ampla dispersão de pólen, mas poucos estudos avaliaram fluxo gênico a partir de plântulas. Bertholletia excelsa (Lecythidaceae) é polinizada por abelhas e as sementes são dispersas por roedores do tipo scatter-hoarders (que estocam recursos em diferentes pontos de sua área de vida), que atuam primariamente como predadores de sementes. Experimentos de remoção de sementes tem mostrado que a dispersão de sementes por esses roedores é espacialmente limitada. Nosso objetivo foi obter estimativas de dispersão de pólen e sementes em B. excelsa a partir da análise de parentesco de regenerantes. Nós estudamos seis parcelas de 25 ha, em duas áreas de floresta nativa no vale do Rio Acre, no sudoeste da Amazônia brasileira. Parâmetros de diversidade genética e índice de fixação foram estimados em adultos, varetas e plântulas com 11 marcadores microssatélites. A diversidade genética foi moderada e não diferiu entre classes de tamanho ou entre localidades. A paternidade foi determinada em menos de 20% dos regenerantes, indicando que a maioria dos eventos de fluxo gênico ocorreu em distâncias maiores que as encontradas nas parcelas de 25 ha. As distâncias de pólen variaram de 33 a 372 m e as de dispersão de sementes variaram de 58 a 655 m. As distâncias de dispersão obtidas neste estudo excedem em muito as estimativas obtidas em experimentos de remoção de sementes. Estudos envolvendo áreas maiores são necessários para que possamos aprofundar nosso conhecimento sobre capacidade de dispersão de pólen e sementes em populações naturais de B. excelsa.
Assuntos
Bertholletia/genética , Dispersão Vegetal/genética , Dispersão de Sementes/genética , Pólen/genética , Fluxo Gênico , Reação em Cadeia da Polimerase , Variação GenéticaResumo
Pollen and seed dispersal patterns greatly influence the spatial distribution of plant genetic diversity. Microsatellite-based parentage analysis provides accurate estimates of contemporary gene dispersal. Although most tropical trees have been shown to exhibit widespread pollen dispersal, few studies have estimated contemporary gene dispersal after seedling establishment. Bertholletia excelsa (Lecythidaceae) is pollinated by large-bodied bees, while previous seed-tracking experiments suggest their seeds are mainly dispersed across very short distances by scatter-hoarding rodents, who primarily act as seed predators. Here we used parentage analysis to provide contemporary estimates of pollen and seed dispersal in B. excelsa recruits. We examined six 25-ha plots located in two natural stands in the Acre River valley, in the southwestern Brazilian Amazon. We used 11 microsatellite markers to estimate genetic diversity and fixation index parameters in adults, seedlings and saplings. Genetic diversity was moderate and did not differ across size classes or sampling locations. We assigned pollen and seed parents for < 20% of the recruits, indicating that most events of realized gene flow occurred beyond our 25-ha plots. Only 10 parentage assignments were confirmed with 80% confidence. Pollen distance ranged from 33 to 372 m and seed dispersal from 58 to 655 m. Actual seed-dispersal distances were far greater than the estimates obtained in previous seed-tracking experiments. Thus, studies encompassing larger sampling areas are necessary to determine a more representative spatial scale of B. excelsas pollen and seed dispersal capacity in natural stands.(AU)
Os padrões de dispersão de pólen e sementes influenciam a distribuição espacial da diversidade genética. Muitas espécies arbóreas tropicais apresentam ampla dispersão de pólen, mas poucos estudos avaliaram fluxo gênico a partir de plântulas. Bertholletia excelsa (Lecythidaceae) é polinizada por abelhas e as sementes são dispersas por roedores do tipo scatter-hoarders (que estocam recursos em diferentes pontos de sua área de vida), que atuam primariamente como predadores de sementes. Experimentos de remoção de sementes tem mostrado que a dispersão de sementes por esses roedores é espacialmente limitada. Nosso objetivo foi obter estimativas de dispersão de pólen e sementes em B. excelsa a partir da análise de parentesco de regenerantes. Nós estudamos seis parcelas de 25 ha, em duas áreas de floresta nativa no vale do Rio Acre, no sudoeste da Amazônia brasileira. Parâmetros de diversidade genética e índice de fixação foram estimados em adultos, varetas e plântulas com 11 marcadores microssatélites. A diversidade genética foi moderada e não diferiu entre classes de tamanho ou entre localidades. A paternidade foi determinada em menos de 20% dos regenerantes, indicando que a maioria dos eventos de fluxo gênico ocorreu em distâncias maiores que as encontradas nas parcelas de 25 ha. As distâncias de pólen variaram de 33 a 372 m e as de dispersão de sementes variaram de 58 a 655 m. As distâncias de dispersão obtidas neste estudo excedem em muito as estimativas obtidas em experimentos de remoção de sementes. Estudos envolvendo áreas maiores são necessários para que possamos aprofundar nosso conhecimento sobre capacidade de dispersão de pólen e sementes em populações naturais de B. excelsa.(AU)
Assuntos
Bertholletia/genética , Pólen/genética , Dispersão de Sementes/genética , Dispersão Vegetal/genética , Fluxo Gênico , Variação Genética , Reação em Cadeia da PolimeraseResumo
Objetivo: O Brasil sofreu um rápido e intenso declínio da fecundidade nos últimos 40 anos. Nos últimos 20 anos o jovem passou a ter mais acesso a informações sobre questões sexuais. No final dos anos 80 destacou-se o advento da AIDS e a precocidade da iniciação sexual entre adolescentes na última década. Assim, o presente trabalho propôs-se verificar o nível de conhecimento e utilização de métodos anticoncepcionais entre as mulheres residentes na região Sul da cidade de São Paulo. Métodos: Realizou-se um estudo do tipo inquérito CAP; Conhecimento, Atitude e Prática, em 40 mulheres com faixa etária entre 14 a 50 anos, na região Sul de São Paulo. Resultados: Dentre o total de mulheres entrevistadas, 66% apresentaram faixa etária entre 14 e 30 anos. O nível de escolaridade das entrevistadas foi de 37% com nível superior incompleto e 36% com nível superior completo totalizando 73% das entrevistadas. Quanto ao conhecimento frente aos diferentes métodos anticoncepcionas apresentados, observou-se que 34% fazem uso da pílula como contraceptivo hormonal oral e 33% utilizam a camisinha masculina como contraceptivo de barreira, perfazendo um total de 67 %. Discussão: Ficou evidente por esse estudo o baixo conhecimento da camisinha feminina, bem como da sua utilização como metodo contraceptivo feminino de barreira pelas entrevistadas (8%). Observou-se, ainda que 98% das mulheres entrevistadas já teve orientação sobre Doenças Sexualmente Transmissíveis (DSTs). Esses achados sugerem uma forte associação entre a prática da utilização de metodos contraceptiveis por mulheres com melhores níveis de escolaridade, uma vez que o acesso a informação em escolas, universidades e em leituras somaram 62,5% das mulheres entrevistadas.(AU)
Objective: The Brazil suffered a quick and intense decline of fertility in the last 40 years. In the last 20 years the young man had more access to information about sexual matters. In the late 80 occurred the advent of AIDS and the precocity of sexual initiation among teenagers in the last decade have been observed. Thus, the present work proposed to verify the level of knowledge and use of contraceptive methods among women residing in the region South of São Paulo city. Methods: Enquiry study type KAP; Knowledge, attitude and practice in 40 women between 14 to 50 years was performed in the South of São Paulo city. Results: Among the women interviewed, 66% showed 14 to 30 age years. The education level of the respondents was 37% with upper level incomplete and 36% with upper level complete totaling 73% of respondents. Concerning to the different contraceptives methods presented, it was noted that 34% make use of the pill as a hormonal oral contraceptive and 33% use the male condom as barrier contraceptive, making a total of 67%. Discussion: It became apparent by this study the low knowledge about the female condom, as well as its use as a contraceptive barrier method by female respondents (8%). It was also observed that 98% of women interviewed ever had guidance on sexually transmitted diseases (Std). These findings suggest a strong association between the practice of contraceptives methods used to the best levels of schooling, since the access to information in schools, universities and lectures totaled 62.5% of the interviewed woman.(AU)
Assuntos
Humanos , Feminino , Anticoncepcionais , Dispositivos Anticoncepcionais , Planejamento Familiar , Educação Sexual , Saúde da MulherResumo
Objetivo: O Brasil sofreu um rápido e intenso declínio da fecundidade nos últimos 40 anos. Nos últimos 20 anos o jovem passou a ter mais acesso a informações sobre questões sexuais. No final dos anos 80 destacou-se o advento da AIDS e a precocidade da iniciação sexual entre adolescentes na última década. Assim, o presente trabalho propôs-se verificar o nível de conhecimento e utilização de métodos anticoncepcionais entre as mulheres residentes na região Sul da cidade de São Paulo. Métodos: Realizou-se um estudo do tipo inquérito CAP; Conhecimento, Atitude e Prática, em 40 mulheres com faixa etária entre 14 a 50 anos, na região Sul de São Paulo. Resultados: Dentre o total de mulheres entrevistadas, 66% apresentaram faixa etária entre 14 e 30 anos. O nível de escolaridade das entrevistadas foi de 37% com nível superior incompleto e 36% com nível superior completo totalizando 73% das entrevistadas. Quanto ao conhecimento frente aos diferentes métodos anticoncepcionas apresentados, observou-se que 34% fazem uso da pílula como contraceptivo hormonal oral e 33% utilizam a camisinha masculina como contraceptivo de barreira, perfazendo um total de 67 %. Discussão: Ficou evidente por esse estudo o baixo conhecimento da camisinha feminina, bem como da sua utilização como metodo contraceptivo feminino de barreira pelas entrevistadas (8%). Observou-se, ainda que 98% das mulheres entrevistadas já teve orientação sobre Doenças Sexualmente Transmissíveis (DSTs). Esses achados sugerem uma forte associação entre a prática da utilização de metodos contraceptiveis por mulheres com melhores níveis de escolaridade, uma vez que o acesso a informação em escolas, universidades e em leituras somaram 62,5% das mulheres entrevistadas.
Objective: The Brazil suffered a quick and intense decline of fertility in the last 40 years. In the last 20 years the young man had more access to information about sexual matters. In the late 80 occurred the advent of AIDS and the precocity of sexual initiation among teenagers in the last decade have been observed. Thus, the present work proposed to verify the level of knowledge and use of contraceptive methods among women residing in the region South of São Paulo city. Methods: Enquiry study type KAP; Knowledge, attitude and practice in 40 women between 14 to 50 years was performed in the South of São Paulo city. Results: Among the women interviewed, 66% showed 14 to 30 age years. The education level of the respondents was 37% with upper level incomplete and 36% with upper level complete totaling 73% of respondents. Concerning to the different contraceptives methods presented, it was noted that 34% make use of the pill as a hormonal oral contraceptive and 33% use the male condom as barrier contraceptive, making a total of 67%. Discussion: It became apparent by this study the low knowledge about the female condom, as well as its use as a contraceptive barrier method by female respondents (8%). It was also observed that 98% of women interviewed ever had guidance on sexually transmitted diseases (Std). These findings suggest a strong association between the practice of contraceptives methods used to the best levels of schooling, since the access to information in schools, universities and lectures totaled 62.5% of the interviewed woman.
Assuntos
Feminino , Humanos , Anticoncepcionais , Dispositivos Anticoncepcionais , Educação Sexual , Planejamento Familiar , Saúde da MulherResumo
Ao longo do tempo, estimativas de valores genéticos e estudos de estrutura e diversidade genética das populações animais têm sido realizadas por métodos tradicionais. Utilizando apenas os registros de pedigree era possível obter informações valiosas sobre o potencial produtivo, a história da população e a diversidade genética. Consequentemente, informações de pedigree incorretas ou incompletas podiam reduzir consideravelmente a acurácia das análises. Atualmente, o uso de marcadores tem permitido a correção de informações contidas no pedigree, além de estimar o parentesco entre os animais de forma mais acurada, inclusive na ausência de pedigree. Estimativas mais acuradas de parâmetros populacionais, como endogamia, desequilíbrio de ligação e tamanho efetivo também são possíveis. Com esses parâmetros podemos avaliar a estrutura populacional e a diversidade genética, orientando estratégias de manejo e acasalamento nos rebanhos e na população como um todo. Nesse contexto, nossos objetivos gerais foram: i. Identificar um conjunto de pelo menos 1000 marcadores SNP, presentes nos principais chips comerciais, que permitam com precisão a atribuição de paternidade na raça Gir; ii. Estimar coeficientes de relacionamento em gado Gir com base em marcadores SNP; iii. Estimar coeficientes de endogamia em animais Gir por meio de corridas de homozigose; 4. Estimar tamanho efetivo da população com base no desequilíbrio de ligação em gado Gir. Nós utilizamos a abordagem da razão de verossimilhança para reconstruir o pedigree do gado Gir, a fim de corrigir eventuais erros de anotação e aprofundar as informações contidas nos registros de pedigree. A abordagem provou ser satisfatória, melhorando a profundidade do pedigree e mostrando que ele é bem estabelecido quanto à informações recentes. Os coeficientes de parentesco nos permitiram avaliar a distribuição dos valores para cada categoria do pedigree reconstruído. A estrutura populacional da raça Gir foi analisada por meio do tamanho efetivo, desequilíbrio de ligação e endogamia baseada em corridas de homozigose (ROH). Em que detectamos uma diminuição no tamanho efetivo, e níveis de endogamia, especialmente aqueles baseados em segmentos curtos de ROH, com valores moderados a altos, sugerindo a presença de gargalos no desenvolvimento da população de gado Gir no Brasil. Por outro lado, uma menor porcentagem de ROH residia nas classes de ROH mais longas. O presente estudo fornece informações importantes que podem ser agregadas ao Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro (PNMGL) para aumentar a acurácia e o volume dos registros, além de auxiliar no desenvolvimento de estratégias de manejo de acasalamento.
Over time estimates of genetic values and studies of the structure and genetic diversity of animal populations have been carried out using traditional methods. Using only pedigree records, it was possible to obtain valuable information on their productive potential, history of population and genetic diversity. Consequently, incorrect or incomplete pedigree information could considerably reduce the accuracy of the analyzes. Currently, the use of markers has allowed the correction of information contained in the pedigree, in addition to estimating the relationship between animals more accurately, including in the absence of a pedigree. More accurate estimates of population parameters, such as inbreeding, linkage disequilibrium and effective size are also possible. With these parameters, we can evaluate the population structure and genetic diversity, guiding management and mating strategies in herds and the population as a whole. In this context, our general objectives were i. Identify a set of at least 1000 SNP markers, present in the main commercial chips, that accurately allow parentage assignment to be carried out in Gir breed; ii. Estimate relationship coefficients in Gir cattle based on SNP markers; iii. Estimate the inbreeding coefficients in Gir animals through runs of homozygosity; iv. Estimate the effective population size based on linkage disequilibrium in Gir cattle. We used the likelihood ratio approach to reconstruct the pedigree of Gir cattle, in order to correct any errors in annotation and to deepen the information contained in the pedigree records. The approach proved to be satisfactory, improving the depth of the pedigree and showing that it is well established in terms of recent information. The relationship coefficients allowed us to assess the distribution of values for each relationship category of the reconstructed pedigree. The population structure of the Gir breed was analyzed using effective size, linkage disequilibrium and inbreeding based on runs of homozygosity (ROH). In which a decrease in effective size and levels of inbreeding were detected, especially those based on short segments of ROH, with moderate to high values, suggesting the presence of bottlenecks in the genome of Gir cattle. On the other hand, a lower percentage of ROH resided in the longest ROH classes. The present study provides important information that can be added to the Brazilian Dairy Gir Breeding Program (PNMGL) to increase the accuracy and volume of records, in addition to assisting in the development of mating management strategies.
Resumo
The increasing development of DNA sequencing and genotyping technologies has made possible to analyze the genomes of several species. Genomic studies of production animals have greatly increased the understanding of mechanisms that control the interactions of genetic and environmental factors involved in the expression of traits of economic importance. Several technologies have been presented by different companies for the genotyping of low-density SNP panels, which may be used in different applications with different goals, such as paternity testing, diagnosis of genetic diseases, and identification of genetically superior animals based on polymorphisms characterized in candidate genes. The present review critically analyzes the GoldenGate Beadxpress technology and puts its use in these applications into perspective.(AU)
A crescente evolução das tecnologias de sequenciamento e genotipagem de DNA tornaram possível analisar o genoma de várias espécies, compreender suas funções dentro dos sistemas biológicos e, sobretudo, começar a entender os mecanismos que controlam as interações entre os genótipos e os efeitos ambientais que estão envolvidos com a expressão de características de interesse econômico. Várias tecnologias foram apresentadas por diferentes empresas para a genotipagem de painéis de SNP de baixa densidade, os quais podem ser utilizados em diferentes aplicações com objetivos variados, desde testes de paternidade e diagnósticos de doenças genéticas até a identificação de animais geneticamente superiores, com base em polimorfismos caracterizados em genes candidatos. Essa revisão analisa a tecnologia Goldengate Beadxpress e coloca em perspectiva seu uso nessas aplicações.(AU)
Assuntos
Animais , Melhoramento Genético/métodos , Técnicas Genéticas/veterinária , Técnicas de GenotipagemResumo
A raça Mangalarga Marchador (MM) originária na região sul no estado de Minas Gerais é a maior raça de equinos criados no Brasil. Os objetivos deste estudo foram estimar os efeitos de ambiente e os parâmetros genéticos de características lineares e escores de pontuação (andamento, morfologia e total) obtidos no momento do registro definitivo de animais da raça MM, além de também identificar a existência de possíveis linhagens nesta raça, levando em consideração a frequência alélica observada a partir de informações obtidas por genotipagem em marcadores microssatélites utilizando análise discriminante de componentes principais. Para a obtenção dos parâmetros genéticos avaliaram-se 167.764 animais de 14.252 fazendas entre os anos de 1967 a 2016. As características avaliadas foram alturas: de cernelha (AC) e garupa (AG); comprimentos: de cabeça (Ccab), pescoço (CP), espádua (CE), dorso-lombo (CDL), garupa (CG), corporal (CC); larguras: de cabeça (LC) e garupa (LG); perímetros: torácico (PT) e de canela (PC); pontuações: andamento (And), morfologia (Morf) e total (Ptotal). Os componentes de (co)variância, herdabilidade (h²), correlações genéticas e fenotípicas entre as características lineares foram obtidos pelo método da máxima verossimilhança restrita utilizando o programa AIREMLF90. As características obtidas por escore de pontuação foram avaliadas por análise bayesiana, por meio do programa THRGIBBSF90 e aplicativo POSTGIBBSF90. Para a identificação das linhagens foram utilizados dados de 60.795 equinos da raça MM (24.037 machos e 36.758 fêmeas), distribuídos por todo o território nacional e em todos os estados da federação, genotipados em teste de paternidade por exame de DNA para 13 loci microssatélites entre os anos de 2005 a 2016. Para verificação da possível existência de linhagens foi realizada a análise discriminante dos componentes principais (DAPC), por meio do programa R. O critério de informação bayesiana (Bayesian Information Criterion BIC) foi utilizado para identificar o número ótimo de grupos (K) genéticos. Para escolha do número ideal de componentes principais (PCs) a serem retidos na análise, foi calculado o -score por meio do pacote adegenet do programa R. As estimativas de h² obtidas foram: AC (0,46), AG (0,46), Ccab (0,20), CP (0,21), CDL (0,27), CG (0,23), CE (0,21) e CC (0,35), LC (0,24), LG (0,25), PT (0,22), PC (0,18), And (0,21), Morf (0,22) e Ptotal (0,26). As correlações genéticas variaram de zero, entre CP e And, a 0,96 entre AC e AG. As correlações fenotípicas variaram de zero, entre AG e Morf, a 0,85 entre And e Morf. O número ideal de grupos foi de 300 e de componentes principais retidos na DAPC foram 35, escolhidos a partir do menor valor de BIC (300) e maior valor de -score (35 e 0,8), respectivamente. Não foi observada a existência de dispersão dos valores ao longo do gráfico da DAPC, demonstrando a não formação de grupos ou qualquer distanciamento genético entre animais dentro da raça MM. Os efeitos de sexo, fazenda, ano de nascimento e de registro devem ser incluídos no modelo de análise para estimar parâmetros genéticos para as características morfofuncionais da raça MM. As características de altura de cernelha e garupa devem responder a seleção, resultando em progresso genético em animais MM. A seleção para altura de cernelha deve resultar em mudanças correlacionadas na altura da garupa e no comprimento corporal, assim como a seleção para pontuação total poderá levar a melhoria do mérito genético da morfologia de animais da raça MM. Não foi identificada geneticamente a existência de linhagens na raça MM, considerando dados de microssatélites de animais avaliados a partir do ano de 2005.
The Mangalarga Marchador (MM) breed originating in the southern region in the state of Minas Gerais is the largest breed of horses raised in Brazil. The objectives of this study were to estimate the effects of the environment and the genetic parameters of linear characteristics and score scores (gait, morphology and total) obtained at the time of the definitive registration of MM animals, as well as to identify the existence of possible lines in this breed, taking into account the allele frequency observed from information obtained by genotyping in microsatellite markers using discriminant analysis of principal components. To obtain the genetic parameters, data from 167,764 animals from 14,252 farms between 1967 and 2016 were evaluated. The characteristics evaluated were heights: withers (HW) and croup (HC); lengths: head (LH), neck (LN), shoulder (LS), back-loin (LBL), croup (LC), body (LB); widths: head (WH) and croup (WC); perimeters: thoracic (PT) and cannon (PC); scores: gait (SG), morphology (Morf) and total (Stotal). The components of (co) variance, heritability (h²), genetic and phenotypic correlations between the linear characteristics were obtained using the restricted maximum likelihood method using the AIREMLF90 program. The characteristics obtained by scoring scores were assessed by Bayesian analysis, using the THRGIBBSF90 program and the POSTGIBBSF90 application. For the identification of the lines, data from 60,795 MM horses (24,037 males and 36,758 females) were used, distributed throughout the national territory and in all states of the federation, genotyped in a paternity test by DNA examination for 13 microsatellite loci between years 2005 to 2016. For verification of the possible existence of lines the Discriminant Analysis of the Principal Components (DAPC) was carried out, using the program R. The Bayesian Information Criterion - BIC was used to identify the number optimal number of genetic (K) groups. To choose the ideal number of main components (PCs) to be retained in the analysis, the -score was calculated using the adegenet package of the program R. The h2 obtained were: HW (0.46); HC (0.46); LH (0.20), LN (0.21), LBL (0.27), LC (0.23), LS (0.21); LB (0.35); WH (0.24); WC (0.25); PT (0.22); PC (0.18); SG (0.21), Morf (0.22) and Stotal (0.26). The genetic correlations ranged from zero, between CP and And, to 0.96 between AC and AG. The phenotypic correlations ranged from zero, between AG and Morf, to 0.85 between And and Morf. The ideal number of groups was 300 and the main components retained in the DAPC were 35, chosen from the lowest BIC value (300) and highest -score value (35 and 0.8), respectively. Was not observed the existence of dispersion of values along the DAPC graph, demonstrating the non-formation of groups or any genetic distance between animals within the MM breed. The effects of sex, farm, year of birth and registration must be included in the analysis model to estimate genetic parameters for the morphofunctional characteristics of the MM breed. Withers and croup height characteristics must respond to selection, resulting in genetic progress in MM animals. The selection for withers height should result in correlated changes in the height of the croup and in the body length, as well as the selection for total score may lead to the improvement of the genetic merit of the morphology of animals of the MM breed. The existence of lines in the MM breed was not genetically identified, considering data from microsatellites of animals evaluated from the year 2005.
Resumo
Os sistemas suinícolas atuais, aliados aos programas de melhoramento genético avançados, trouxeram inúmeros ganhos produtivos e sanitários para a indústria. O repertório comportamental natural da espécie, importante para manter o bem-estar dos animais, é raramente priorizado nos sistemas de produção comercial de suínos. Em consequência disso, comportamentos anormais, alterações fisiológicas e emocionais, e indicadores de bem-estar comprometido são frequentemente observados. Esses comportamentos são uma tentativa dos animais de adaptação ao meio onde estão inseridos, e os sistemas emocionais básicos dos animais têm funções adaptativas e fundamentais para o indivíduo. O alojamento de machos reprodutores suínos desafia o bem-estar dos mesmos pela restrição de movimento, isolamento social e falta de enriquecimento ambiental. Estudos recentes em animais de laboratório indicam que situações de estresse nos machos podem alterar características no sêmen e alterar as características da prole. O objetivo da pesquisa foi estudar o efeito do sistema de alojamento de machos suínos sobre a emocionalidade da sua prole. Foram utilizados 18 machos alojados em três sistemas: cela (C:N=6), baia (B:N=6) e baia enriquecida com o fornecimento de feno, escovação, banho (E:N=6). Submetidos à colheita de sêmen semanalmente por seis semanas. Na quarta semana, três pools de sêmen, cada pool representando todos os três tratamentos, com dois machos de cada tratamento (C, B e E), selecionados de acordo com métodos objetivos de avaliação do sêmen, foram utilizados para inseminar 15 marrãs alojadas em grupo no sistema ao ar livre. Foram realizadas avalições comportamentais e fisiológicas a cada terço gestacional. Os leitões foram identificados no terceiro dia de idade e seus pesos registrados aos 10º, 25º e 29º dias de idade. No 25º dia, foram realizadas as avaliações emocionais dos leitões (medo e ansiedade) (N=138) através do comportamento gravado durante os testes de campo aberto, objeto novo e labirinto em cruz elevada. No 29º dia, os leitões foram desmamados (N=138) e reagrupados por peso em três baias com feno. Imagens corporais dos leitões (N=138) foram registradas no desmame e nos quatro dias subsequentes para contabilizar as lesões de pele. No 34º dia, eles foram submetidos à avaliação nociceptiva, estimulados duas vezes consecutivas do lado direito e esquerdo x da região coxofemoral e quartela. Após, amostras de pelo foram colhidas para realização do teste de paternidade. Após o recebimento dos dados de paternidade, os leitões foram alocados nos tratamentos representando o alojamento dos pais (C, B e E). Os dados comportamentais das fêmeas foram avaliados para normalidade (Shapiro-Wilk) e submetidos a uma análise estatística descritiva, e analisados por coeficiente de correlação de Spearman e Two way ANOVA com p<0,05. Na análise dos dados da prole utilizou-se a análise fatorial com o intuito de resumir em quatro fatores latentes a informação relativa à variabilidade e correlações entre as variáveis. Os escores fatoriais foram classificados como negativos, centrais e positivos, com base no primeiro e terceiro quartis. O teste de qui quadrado (alfa=0,05) foi usado para testar a homogeneidade da distribuição desses escores nos três tratamentos a que os machos foram submetidos. Uma análise de correspondência buscou associações entre as frequências de leitões nos tratamentos e categorias dos escores fatoriais. Os resultados da prole indicam a influência do ambiente herdado através dos machos; os leitões filhos de machos alojados com acesso ao enriquecimento tiveram menor número de lesões de pele (p=0,008). Leitões oriundos de machos alojados em celas apresentaram valores nociceptivos mais hipoalgésicos, em contrapartida, a prole de machos alojados nas baias sem enriquecimento foram menos hipoalgésicos (p=0,029). Compreender o mecanismo de ação de tais alterações requer futuras pesquisas associando os princípios da epigenética e sua interação na construção do comportamento animal.
Current pig production systems, combined with advanced genetic improvement programs, have brought numerous productive and health gains to the industry. However, the species' natural behavioral repertoire, which is important for maintaining good animal welfare, is rarely prioritized in commercial pig production systems. As a result, abnormal behaviors, physiological and emotional changes, all indicators of impaired welfare, are often observed. These behaviors are an attempt by animals to adapt to the environment in which they live, and the basic emotional systems of animals have adaptive and fundamental functions for the individual. The housing of boars challenges their welfare as a result of movement restriction, social isolation and lack of environmental enrichment. Recent studies in laboratory animals indicate that stressful situations in males can alter characteristics in the semen and change the phenotype of their offspring. Eighteen males housed in three systems were studied: crate (C:N=6), pen (P:N=6), and enriched pen, which included the supply of hay, brushing and bathing (E:N=6). Animals were submitted to semen collection weekly for six weeks. In the fourth week, three pools of semen, each pool representing two males per treatment (C, P and E), matched for objective semen quality indicators, from the animals of the three treatments was used to inseminate 15 gilts, five gilts for each different pool. Gilts were housed in group in an outdoor system. Behavioral and physiological evaluations were carried out at each third of gestation. The piglets, offspring of 13 gilts, were identified on the third day of age and their weights recorded at the 10th, 25th, and 29th days of age. On the 25th day, the piglets' emotional assessments (fear and anxiety) were carried out through the behavior recorded during the tests open field, novel object, and elevated plus maze (N=138). On the 29th day, the piglets were weaned and regrouped by weight in three pens with hay. Body images of the piglets (N=138) were recorded at weaning and in the subsequent four days to account for skin lesions (N=138). On the 34th day, they were submitted to a nociceptive evaluation, stimulated twice in a row on the right and left side of the plantar surface of the xii metacarpal and hip region. Afterward, hair samples were taken to perform the paternity test. After receiving the results of the paternity tests, the piglets were allocated to the experimental groups representing the treatments applied to the boars (C, P and E). The behavioral data of the females were evaluated for normality (Shapiro-Wilk) and subjected to descriptive statistical analysis, and analyzed by Spearman's correlation coefficient and Two way ANOVA with p <0.05. In the analysis of the offspring data, factor analysis was used to summarize the information regarding the variability and correlations between the variables in four latent factors. The factor scores were classified as negative, central, and positive, based on the first and third quartiles. The chi-square test (alpha=0.05) was used to test the homogeneity of the distribution of these scores in the three treatments to which the males were submitted. A correspondence analysis sought associations between the frequencies of piglets in the treatments and categories of factor scores. The offspring results indicate the influence of the environment inherited through males; piglets born to males housed with access to enrichment had fewer skin lesions (p=0.008). Piglets from males housed in cells showed nociceptive values more hypoalgesic, in contrast, the offspring of males housed in pens without enrichment were less hypoalgesic (p=0.029). Understanding the mechanism of action of such changes requires further research associating the principles of epigenetics and their interaction in the construction of animal behavior.
Resumo
Arapaima gigas is one of the largest freshwater fishes of the world. It is socially monogamous, forming pairs, constructing a nest and providing parental care. We performed a paternity analysis under three scenarios in captive, semi-natural and natural areas using 10 microsatellite markers. As a positive control, we analyzed three pairs and their offspring isolated individually in artificial breeding ponds (a priori very high probability of monogamy). We then analyzed two samples of offspring from large artificial ponds with multiple adults but only one reproductive pair (a priori high probability of monogamy), two samples from semi-natural breeding station with multiple adults but only one reproductive pair (a priori high probability of monogamy), and a sample from a natural lake with multiple adults, some potentially breeding (a priori medium probability of monogamy). Analysis of patterns of Mendelian heredity suggested an extra-pair contribution for all broods except the positive controls. Similarly, results based on multilocus analysis estimated at least two sib-groups per nest. These results reject monogamy as a system of breeding in Arapaima gigas. From a management perspective, this behavior may be exploited to maintain genetic diversity in captive and as well in wild populations of Arapaima gigas.(AU)
O pirarucu Arapaima gigas é um dos maiores peixes de água doce do mundo. É socialmente monogâmico, forma casais, constrói ninhos e fornece cuidado parental. Com o objetivo de acessar o sistema de acasalamento do pirarucu, analisamos três cenários: em áreas de cativeiro, semi-naturais e naturais, utilizando 10 marcadores microssatélites. Como controle positivo, analisamos três casais e suas ninhadas isolados em açudes individuais (probabilidade a priori muito alta de monogamia). A seguir, analisamos duas amostras de ninhadas de um açude com vários adultos, mas somente um casal reprodutivo (probabilidade a priori alta de monogamia), duas amostras de estação de criação semi-natural com vários adultos mas somente um casal reprodutivo (probabilidade a priori alta de monogamia), e uma amostra de lago natural com vários adultos alguns potencialmente em fase de reprodução (probabilidade a priori média de monogamia). Análises de padrões mendelianos de hereditariedade sugerem contribuição extra-par para todas as ninhadas, exceto as do controle positivo. Similarmente, resultados baseados em análises multilocus realizadas no programa KINALYZER estimaram pelo menos dois grupos-irmãos por ninhada. Nossos resultados rejeitam a monogamia como sistema de acasalamento em Arapaima gigas. Da perspectiva de manejo, esse comportamento pode ser explorado para manter a diversidade genética em cativeiro assim como em populações naturais de Arapaima gigas.(AU)
Assuntos
Animais , Comportamento Sexual Animal , Ligação do Par , Peixes/fisiologia , PaternidadeResumo
The objective of this study was to estimate the genetic diversity and the paternity of Brycon orbignyanus offsprings obtained with the extrusion and semi-natural reproductive systems, by microsatellites markers. The four loci used produced 11 alleles, being observed three alleles (BoM1, BoM5 and BoM7) and two alleles (BoM2) for locus present in the parental and in the offspring of both reproductive systems. In the offspring of the extrusion system low frequency alleles was observed for the locus BoM5 (allele B = 0.095) and BoM7 (allele C = 0.059) and there was a decrease of genetic variability (observe heterozygosity-Ho = 0.900 and 0.823; Shannon index-IS = 0.937 and 0.886; Nei genetic diversity-DGN = 0.604 and 0.566, respectively). For the offspring of the semi-natural system the allele frequencies stayed stable being verified an unequal frequency for each locus. The genetic variability in the offspring was preserved, being corroborated by the Ho values (0.975 and 0.945), IS (0.927 and 0.924) and DGN (0.593 and 0.581) for parental and offspring, respectively. Deviations were observed (P 0.01) in the Hardy-Weinberg equilibrium and linkage disequilibrium for the two reproductive systems. The inbreeding coefficient (Fis) it showed deficit of heterozygote in the offspring of the extrusion system. Multiple paternity and differed reproductive contributions in the composition of the families in the offspring in the two reproductive systems was observed, with the presence of reproductive dominance in the semi-natural system.(AU)
O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética e a paternidade de progênies de Brycon orbignyanus obtidas pelos sistemas reprodutivos por extrusão e seminatural, através do marcador microssatélite. Os quatro loci utilizados produziram 11 alelos, sendo observados três alelos (BoM1, BoM5 e BoM7) e dois alelos (BoM2) por locus presentes nos parentais e na progênie de ambos sistemas reprodutivos. Na progênie do sistema por extrusão foram observados alelos de baixa frequência para os locus BoM5 (alelo B = 0,095) e BoM7 (alelo C = 0,059) e houve uma diminuição da variabilidade genética (Heterozigosidade observada-Ho = 0,900 e 0,823; Índice de Shannon-IS = 0,937 e 0,886; diversidade genética de Nei-DGN = 0,604 e 0,566, respectivamente). Na progênie do sistema seminatural as frequências dos alelos se mantiveram estáveis, sendo verificada uma frequência desigual para cada locus. A variabilidade genética foi preservada, sendo corroborado pelos valores de Ho (0,975 e 0,945), IS (0,927 e 0,924) e DGN (0,593 e 0,581) para parentais e progênie, respectivamente. Observaram-se desvios (P 0.01) no equilíbrio de Hardy-Weinberg e desequilíbrio de ligação nos dois sistemas reprodutivos. O coeficiente de endogamia (Fis) mostrou déficit de heterozigotos na progênie do sistema por extrusão. Observou-se paternidade múltipla e contribuição reprodutiva diferenciada na composição das famílias na progênie nos dois sistemas reprodutivos, com a presença de dominância reprodutiva no sistema seminatural.(AU)
Assuntos
Animais , Characidae , Variação Genética , Repetições de Microssatélites , Técnicas ReprodutivasResumo
Monogamy is rare in fishes and is usually associated with elaborate parental care. When parental care is present in fishes, it is usually the male that is responsible, and it is believed that there is a relationship between the high energetic investment and the certainty of paternity (except in the case of sneaker males). Osteoglossum bicirrhosum is considered a monogamous fish, and has particular behavioral traits that permit the study of mating systems and parental care, such as male mouthbrooding. We investigated the genetic relationships of males with the broods found in their oral cavities in Osteoglossum samples collected in a natural environment in the lower Purus river basin, Amazonas, Brazil. Fourteen broods were analyzed for parentage (268 young and 14 adult males) using eight microsatellite loci. The results indicate that eleven broods show a monogamous system. In one brood, however, approximately 50% of the young were genetically compatible with being offspring of another male, and in another two broods, none of the subsampled young were compatible with the genotypes of the brooding male. The result of this first brood may be explained by the extra-parental contribution of a sneaker male, whereas cooperative parental care may explain the result in the other two broods. Monogamia é rara em peixes e está geralmente associada a cuidado parental elaborado. Quando cuidado parental está presente em peixes, usualmente o macho é responsável, e acredita-se que exista uma relação entre investimento energético elevado e a certeza da paternidade (exceto no caso de machos oportunistas). Osteoglossum bicirrhosum é considerado monogâmico e possui determinadas características comportamentais que permitem o estudo de sistemas de acasalamento e cuidado parental, como incubação bucal dos ovos e filhotes pelos machos. Quatorze ninhadas (268 filhotes e 14 machos adultos) foram coletadas em ambiente natural na bacia do baixo rio Purus, Amazonas, Brasil e analisadas para parentesco utilizando oito loci de microssatélites. Os resultados sugeriram, para onze ninhadas, um sistema de acasalamento monogâmico. Em uma ninhada, no entanto, cerca de 50% dos jovens eram geneticamente compatíveis como sendo descendentes de outro macho, e em outras duas ninhadas nenhum dos filhotes amostrados eram filhos dos machos que estavam realizando o cuidado. O resultado da primeira ninhada pode ser explicado pela contribuição extra-par de um macho oportunista, enquanto que o cuidado parental cooperativo pode explicar os resultados nas outras duas ninhadas.(AU)
Assuntos
Animais , Comportamento Animal , Especificidade da Espécie , PeixesResumo
The paper aims to analyze the structure of additive genetic groups as an alternative to include animals with unknown parentage in genetic evaluation. Several traits were studied: weaning weight; yearling weight; post-weaning weight gain in 345 days; scrotal circumference at 18 months of age; and visual muscling scores at 18 months of age. As a control group it was used a database where all animals had known paternity. Thus, three scenarios were defined where 30%; 50% or 70% of the observations were randomly taken as animals with unknown parentage. For these three simulated databases, the strategies considered to define additive genetic groups were: effect of year at birth; effect of farm at birth; effect of year and farm at birth; and a negative control group, which considered animals with unknown paternity. The most appropriate strategy for additive genetic group was chosen as the one that resulted in a higher regression coefficient and additive genetic value closest to the predicted for those animals in the control group. The results considering the strategy of additive genetic show large agreement with the control group. Among the strategies proposed, farm of birth and year of birth of the animal with unknown parentage achieved the best results.
O objetivo do estudo foi avaliar a estrutura de grupos genéticos aditivos como uma alternativa para melhor ajuste de animais com paternidade desconhecida nas avaliações genéticas. As características estudadas foram: peso a desmama; peso ao sobreano; ganho de peso pós-desmama em 345 dias; perímetro escrotal ao sobreano e o escore visual de musculosidade ao sobreano. Um banco em que todos os animais tinham paternidade conhecida foi utilizado como grupo controle. A partir deste, três cenários foram criados em que 30; 50 ou 70% dos indivíduos foram aleatoriamente assumidos como animais com paternidade desconhecida. As estratégias consideradas de grupos genéticos aditivos foram: ano de nascimento do animal com paternidade desconhecida; fazenda de nascimento do animal com paternidade desconhecida; ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e um grupo controle negativo que manteve os animais com pais desconhecidos. A estratégia adequada de grupo genético aditivo foi escolhida como sendo aquela que resultou em um maior coeficiente de regressão e com valor genético aditivo mais próximos ao predito para os animais do grupo controle. Os resultados que incluíram a estratégia de grupo genético aditivo nos modelos de predição dos valores genéticos mostraram maior coerência com o grupo controle, frente a não inclusão destes nas análises. Dentre as estratégias propostas, ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e apenas ano de nascimento do animal com paternidade desconhecida obtiveram os melhores resultados.
Resumo
The paper aims to analyze the structure of additive genetic groups as an alternative to include animals with unknown parentage in genetic evaluation. Several traits were studied: weaning weight; yearling weight; post-weaning weight gain in 345 days; scrotal circumference at 18 months of age; and visual muscling scores at 18 months of age. As a control group it was used a database where all animals had known paternity. Thus, three scenarios were defined where 30%; 50% or 70% of the observations were randomly taken as animals with unknown parentage. For these three simulated databases, the strategies considered to define additive genetic groups were: effect of year at birth; effect of farm at birth; effect of year and farm at birth; and a negative control group, which considered animals with unknown paternity. The most appropriate strategy for additive genetic group was chosen as the one that resulted in a higher regression coefficient and additive genetic value closest to the predicted for those animals in the control group. The results considering the strategy of additive genetic show large agreement with the control group. Among the strategies proposed, farm of birth and year of birth of the animal with unknown parentage achieved the best results.(AU)
O objetivo do estudo foi avaliar a estrutura de grupos genéticos aditivos como alternativa para incluir animais com paternidade desconhecida nas avaliações genéticas. As características estudadas foram: peso a desmama; peso ao sobreano; ganho de peso pós-desmama em 345 dias; perímetro escrotal ao sobreano e o escore visual de musculosidade ao sobreano. Um banco em que todos os animais tinham paternidade conhecida foi utilizado como grupo controle. A partir deste, três cenários foram criados em que 30; 50 ou 70% dos indivíduos foram aleatoriamente assumidos como animais com paternidade desconhecida. As estratégias consideradas de grupos genéticos aditivos foram: safra de nascimento do animal com paternidade desconhecida; fazenda de nascimento do animal com paternidade desconhecida; ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e um grupo controle negativo que manteve os animais com pais desconhecidos. A estratégia adequada de grupo genético aditivo foi escolhida como sendo aquela que resultou em um maior coeficiente de regressão e com valor genético aditivo mais próximos ao predito para os animais do grupo controle. Os resultados que incluíram a estratégia de grupo genético aditivo nos modelos de predição dos valores genéticos mostraram maior coerência com o grupo controle, frente a não inclusão destes nas análises. Dentre as estratégias propostas, ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e apenas ano de nascimento do animal com paternidade desconhecida obtiveram os melhores resultados.(AU)
Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/genética , Comportamento Aditivo/genética , Modelos Lineares , Modelos Genéticos , DesmameResumo
The paper aims to analyze the structure of additive genetic groups as an alternative to include animals with unknown parentage in genetic evaluation. Several traits were studied: weaning weight; yearling weight; post-weaning weight gain in 345 days; scrotal circumference at 18 months of age; and visual muscling scores at 18 months of age. As a control group it was used a database where all animals had known paternity. Thus, three scenarios were defined where 30%; 50% or 70% of the observations were randomly taken as animals with unknown parentage. For these three simulated databases, the strategies considered to define additive genetic groups were: effect of year at birth; effect of farm at birth; effect of year and farm at birth; and a negative control group, which considered animals with unknown paternity. The most appropriate strategy for additive genetic group was chosen as the one that resulted in a higher regression coefficient and additive genetic value closest to the predicted for those animals in the control group. The results considering the strategy of additive genetic show large agreement with the control group. Among the strategies proposed, farm of birth and year of birth of the animal with unknown parentage achieved the best results.
O objetivo do estudo foi avaliar a estrutura de grupos genéticos aditivos como alternativa para incluir animais com paternidade desconhecida nas avaliações genéticas. As características estudadas foram: peso a desmama; peso ao sobreano; ganho de peso pós-desmama em 345 dias; perímetro escrotal ao sobreano e o escore visual de musculosidade ao sobreano. Um banco em que todos os animais tinham paternidade conhecida foi utilizado como grupo controle. A partir deste, três cenários foram criados em que 30; 50 ou 70% dos indivíduos foram aleatoriamente assumidos como animais com paternidade desconhecida. As estratégias consideradas de grupos genéticos aditivos foram: safra de nascimento do animal com paternidade desconhecida; fazenda de nascimento do animal com paternidade desconhecida; ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e um grupo controle negativo que manteve os animais com pais desconhecidos. A estratégia adequada de grupo genético aditivo foi escolhida como sendo aquela que resultou em um maior coeficiente de regressão e com valor genético aditivo mais próximos ao predito para os animais do grupo controle. Os resultados que incluíram a estratégia de grupo genético aditivo nos modelos de predição dos valores genéticos mostraram maior coerência com o grupo controle, frente a não inclusão destes nas análises. Dentre as estratégias propostas, ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e apenas ano de nascimento do animal com paternidade desconhecida obtiveram os melhores resultados.
Assuntos
Animais , Bovinos , Bovinos/genética , Comportamento Aditivo/genética , Modelos Lineares , Desmame , Modelos GenéticosResumo
Thirteen microsatellite loci were isolated and characterized in Microglanis cottoides. Of these, two were monomorphic and 11 were polymorphic. These polymorphic loci tested on 24 individuals from a wild population produced a total of 108 different alleles, with levels of variability high, ranging from 2 to 20, with an average of 8.3 alleles per locus. The observed and expected heterozygosity ranged from 0.125 to 0.958 and from 0.119 to 0.931, respectively. A high combined probability of paternity exclusion value and a low probability combined genetic identity value obtained show that the set of loci described herein displays good suitability for paternity studies and differentiation of M. cottoides. Additionally, all thirteen microsatellite primers developed for M. cottoides were tested in four other Pseudopimelodidae species and successful cross-species amplification was achieved for the majority of loci.(AU)
Treze loci microssatélites foram isolados e caracterizados em Microglanis cottoides. Destes, dois foram monomórficos e 11 foram polimórficos. Estes loci polimórficos foram testados em 24 indivíduos de uma população selvagem e produziram um total de 108 alelos diferentes, com níveis de variabilidade alta, variando de 2 a 20, com uma média de 8,3 alelos por locus. A heterozigosidade observada e esperada variou de 0,125 a 0,958 e 0,119 a 0,931, respectivamente. Um elevado valor de exclusão de paternidade e um baixo valor de identidade genética foram obtidos, demostrando que o conjunto de loci descritos no presente trabalho exibe boa aplicabilidade no estudo de parentesco e diferenciação populacional em M. cottoides. Adicionalmente, os treze primers de microssatélites desenvolvidos para M. cottoides foram testados em outras quatro espécies de Pseudopimelodidae e a transferabilidade foi obtida para a maioria dos loci.(AU)