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1.
R. bras. Saúde Prod. Anim. ; 19(4): 403-414, 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-19781

Resumo

We aimed to evaluate the random regression models that promote the best fit of residual variance predicting the breeding values of quail body weights and the sensitivity of its breeding values to the variations of different tryptophan:lysine ratios in the diets via reaction norms. A total of 1112 meat quails from LF1 and LF2 lines with 35 days of age were evaluated. During the period of 1 to 21 days of age, birds were fed with different tryptophan:lysine ratios (0.17, 0.20, 0.23, 0.26 and 0.29%) containing 2900 kcal ME/kg and 26.10% crude protein, followed by basal diet provided up to 35 days. The best model fit for residual variance was evaluated comparing heterogeneity (2, 3 and 4 classes) and homogeneity (1 class), including sex as fixed effect and the additive genetic effect as random. The second order Legendre polynomial was used to analyze the genotype x environment interaction using reaction norms. The model considering two classes of residual variance was the one that promoted the best fit of the data, being adopted to predict the breeding values. Thus, we observed changes in the sensitivity of the breeding values, characterized by the rearrangement of the breeding values, according to the different ratios of amino acids, suggesting the genotype x environment interaction.(AU)


Objetivou-se avaliar o modelo de regressão aleatória que promove o melhor ajuste da variância residual para a predição dos valores genéticos dos pesos corporais de codornas de corte e a sensibilidade dos seus valores genéticos às variações de diferentes relações triptofano:lisina. Foram avaliadas 1112 codornas de corte das linhagens LF1 e LF2, do nascimento aos 35 dias de idade. No período de 1 a 21 dias de idade as aves receberam alimentação com dietas de diferentes relações triptofano:lisina (0,17, 0,20, 0,23, 0,26 e 0,29%), contendo 2900 kcal EM/kg e 26,10% de proteína bruta, seguido pelo fornecimento de ração basal até os 35 dias. Foi avaliado o ajuste da variância residual comparando a homogeneidade (1 classe) e a heterogeneidade (2, 3 e 4 classes) incluindo o sexo como efeito fixo e o efeito genético aditivo como aleatório. O polinômio de Legendre de segunda ordem foi utilizado para a análise da interação genótipo x ambiente utilizando normas de reação. O modelo que considerou duas classes de variância residual foi o que promoveu o melhor ajuste dos dados e foi adotado para predição dos valores genéticos. Desta forma, foi observada alteração na sensibilidade dos valores genéticos, caracterizados pelo reordenamento dos valores genéticos, em função das diferentes relações estudadas, indicando a presença de interação genótipo x ambiente.(AU)


Assuntos
Animais , Coturnix/genética , Coturnix/metabolismo , Triptofano/administração & dosagem , Lisina/análise , Lisina/química , Heterogeneidade Genética
2.
Rev. bras. saúde prod. anim ; 19(4): 403-414, 2018. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1493787

Resumo

We aimed to evaluate the random regression models that promote the best fit of residual variance predicting the breeding values of quail body weights and the sensitivity of its breeding values to the variations of different tryptophan:lysine ratios in the diets via reaction norms. A total of 1112 meat quails from LF1 and LF2 lines with 35 days of age were evaluated. During the period of 1 to 21 days of age, birds were fed with different tryptophan:lysine ratios (0.17, 0.20, 0.23, 0.26 and 0.29%) containing 2900 kcal ME/kg and 26.10% crude protein, followed by basal diet provided up to 35 days. The best model fit for residual variance was evaluated comparing heterogeneity (2, 3 and 4 classes) and homogeneity (1 class), including sex as fixed effect and the additive genetic effect as random. The second order Legendre polynomial was used to analyze the genotype x environment interaction using reaction norms. The model considering two classes of residual variance was the one that promoted the best fit of the data, being adopted to predict the breeding values. Thus, we observed changes in the sensitivity of the breeding values, characterized by the rearrangement of the breeding values, according to the different ratios of amino acids, suggesting the genotype x environment interaction.


Objetivou-se avaliar o modelo de regressão aleatória que promove o melhor ajuste da variância residual para a predição dos valores genéticos dos pesos corporais de codornas de corte e a sensibilidade dos seus valores genéticos às variações de diferentes relações triptofano:lisina. Foram avaliadas 1112 codornas de corte das linhagens LF1 e LF2, do nascimento aos 35 dias de idade. No período de 1 a 21 dias de idade as aves receberam alimentação com dietas de diferentes relações triptofano:lisina (0,17, 0,20, 0,23, 0,26 e 0,29%), contendo 2900 kcal EM/kg e 26,10% de proteína bruta, seguido pelo fornecimento de ração basal até os 35 dias. Foi avaliado o ajuste da variância residual comparando a homogeneidade (1 classe) e a heterogeneidade (2, 3 e 4 classes) incluindo o sexo como efeito fixo e o efeito genético aditivo como aleatório. O polinômio de Legendre de segunda ordem foi utilizado para a análise da interação genótipo x ambiente utilizando normas de reação. O modelo que considerou duas classes de variância residual foi o que promoveu o melhor ajuste dos dados e foi adotado para predição dos valores genéticos. Desta forma, foi observada alteração na sensibilidade dos valores genéticos, caracterizados pelo reordenamento dos valores genéticos, em função das diferentes relações estudadas, indicando a presença de interação genótipo x ambiente.


Assuntos
Animais , Coturnix/genética , Coturnix/metabolismo , Lisina/análise , Lisina/química , Triptofano/administração & dosagem , Heterogeneidade Genética
3.
Semina Ci. agr. ; 35(5): 2843-2858, set.-out. 2014. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: vti-28811

Resumo

Objetivou-se estimar parâmetros genéticos para peso corporal, ganho em peso diário (GPD) ecaracterísticas morfométricas em tilápias do Nilo da variedade GIFT por meio de modelos de regressãoaleatória. Foram testados modelos com ordens 2, 3 e 4 do polinômio de Legendre para o efeito genéticoaditivo, e ordens 2 e 3 para a idade, efeitos de ambiente permanente e de família. Testaram-se aindamodelos com variância residual homogênea e heterogênea. Para os efeitos de ambiente permanente ede família, os polinômios de terceira ordem proporcionaram melhor ajuste em todas as características,bem como para o efeito genético para peso, GPD, comprimento e largura. Para altura e tamanho decabeça foram necessários polinômios de quarta ordem. Para ganho em peso, altura e cabeça o melhormodelo foi o que considerou variância residual homogênea para largura, variância heterogênea com trêsclasses de idade e para peso e comprimento, variância heterogênea com nove classes de idade. A maiorherdabilidade para peso foi 0,34 entre 240 e 311 dias, e para GPD foi 0,69 aos 311 dias. Para cabeça ecomprimento a maior herdabilidade ocorreu aos 270 dias, sendo igual a 0,27 e 0,21, respectivamente.A maior herdabilidade para o comprimento foi 0,20 aos 254 dias e para largura a maior herdabilidadefoi 0,54 aos 311 dias. Uma vez que as maiores herdabilidades foram para GPD e largura aos 311 dias,a seleção baseada nestas características nestas idades levaria as maiores ganhos genéticos. As altascorrelações genéticas entre idades superiores aos 200 dias de idade denotam a possibilidade de seutilizar como critério de seleção, idades pouco menores que as usuais (300 dias) sem diminuir o ganhogenético. Como a largura apresentou herdabilidade de média magnitude na maior parte do períodoavaliado, a seleção baseada na largura em qualquer idade levaria a um ganho genético satisfatório nessacaracterística no final do período de cultivo. (AU)


The aim of the current study was to estimate the genetic parameters for weight gain and bodymeasurements in the GIFT (Genetically Improved Farmed Tilapia) strain of Nile tilapia by randomregression models. Several orders of Legendre polynomials were tested for random effects and modeledwith 1, 3, 6 and 9 classes of residual variance. For the effects of permanent environmental and family,third-order polynomials were adjusted in all traits, as well as for the genetic effects of weight, weightgain, length and width. For genetic effects of height and head, fourth-order polynomials were required.To gain weight, height and head, the best model was one that considered the homogenous residualvariance; however for width and weight, heterogeneous variance with 3 and 9 age classes was required,respectively. The highest heritability for weight was 0.34 at 240–311 days, and for weight gain it was0.69 at 311 days. For head and length, the highest heritability was around 270 days at 0.27 and 0.21,respectively. The highest heritability found for length was 0.20 at 254 days, 0.2 at 254 days for height,and for width the heritability was 0.54 at 311 days. Since the largest heritabilities were found for weightgain and width at 311 days, selection at these ages, based on these traits, would lead to greater geneticgains. Genetic correlations were higher between adjacent ages and, in general, selections at ages ofless than 200 days did not lead to genetic gain correlated with traits at 300 days. The exception wasfor width, because high correlations were obtained between final and initial ages and the heritabilitywas median in the majority of the period. Thus, selection based on the width at any age would lead tosatisfactory genetic gain in this trait at the end of the growing season.(AU)


Assuntos
Animais , Ciclídeos/anatomia & histologia , Ciclídeos/crescimento & desenvolvimento , Peso Corporal , Aumento de Peso/genética , Hereditariedade , Análise de Regressão , Estudos Longitudinais
4.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-207107

Resumo

Objetivou-se com este trabalho avaliar qual modelo apresenta melhor ajuste da variância residual (homogênea ou heterogênea) e a sensibilidade dos valores genéticos de codornas de corte às mudanças gradativas no ambiente. A variação ambiental foi ponderada quanto a diferentes relações de triptofano: lisina na dieta, avaliando pesos, características de carcaça e qualidade da carne através de normas de reação. Foram avaliadas duas linhagens de codornas de corte, LF1 e LF2, pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético da Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM), alimentadas com dietas contendo cinco relações de triptofano: lisina (0,17, 0,20, 0,23, 0,26 e 0,29%) na fase inicial de crescimento, de 1 a 21dias de idade, e até o abate com ração basal. Foram avaliados pesos corporais aos 14, 21, 28 e 35 dias de idade, peso pré-abate, peso e rendimentos da carcaça, peito, coxa+sobrecoxa e os rendimentos de carcaça. O modelo de regressão aleatória que melhor se ajustou foi o que considerou heterogeneidade com duas classes de variância residual na maioria das características estudadas, utilizado para estimar os componentes de variância, parâmetros genéticos e valores genéticos dos pesos corporais, das características de carcaça das codornas nas diferentes idades. A sensibilidade dos valores genéticos foi mensurada por modelos de regressão aleatória através de normas de reação, utilizando o programa WOMBAT, considerando o efeito fixo de sexo e efeito aleatório para o valor genético aditivo direto como funções das relações triptofano: lisina da dieta, modelados usando polinômios de Legendre de segunda ordem, admitindo-se heterogeneidade de variância residual de duas classes, como efeito da interação genótipo X ambiente. A maior parte das características estudadas apresentaram coeficientes de regressão do intercepto (0) maior que o coeficientes de regressão aleatório (1). Os valores de herdabilidade variaram conforme as características estudadas. Foi observada interação entre genótipo e ambiente na maior parte das características estudadas, caracterizado pela sensibilidade dos valores genéticos aditivos para as relações dos níveis de triptofano: lisina avaliadas. Concluiu-se que a seleção deva ser realizada após a definição do nível do aminoácido triptofano na dieta das aves.


Objective with this evaluative work model presents a better fit of the residual variance (homogeneous or heterogeneous) and a sensitivity of the genetic values of quails to the gradual changes in the environment. The environmental variation was weighted for different travel relationships: lysine in the diet, evaluating weights, carcass characteristics and meat quality through reaction standards. Two lines of cutting quails, LF1 and LF2, belonging to the Genetic Improvement Program of the Federal University of the Jequitinhonha and Mucuri Valleys (UFVJM) were evaluated, fed diets containing five tryptophan: lysine ratios (0.17, 0.20 0.23, 0.26 and 0.29%) in the initial growth phase, from 1 to 21 days of age, and until slaughter with basal diet. The weights were evaluated at 14, 21, 28 and 35 days of age, pre-slaughter weight, carcass weight, carcass yield, breast, thigh+overcook and carcass rents. The random regression model that best fit was the one that considered heterogeneity with two classes of residual variance most of the time of the studied characteristics, used to estimate the components of variance, genetic and genetic values of body weights, carcass characteristics quail at different ages. The sensitivity of the genetic values and measured by random regression models through reaction norms, using the WOMBAT program, considering the fixed effect of sex and random effect to the direct additive genetic value as functions of the tryptophan: diet lysine ratios, modeled polynomials of Legendre of second order, admitting heterogeneity of residual variance of two classes, as effect of interaction genotype X environment. Most of the studied characteristics presented regression coefficients of the intercept (0) greater than the random regression coefficient (1). Heritability values varied according to the characteristics studied. Interaction between genotype and environment was observed in most of the characteristics studied, characterized by the sensitivity of the additive genetic values for the relationships of tryptophan: lysine levels evaluated. It was concluded that it is a selection to be created by a definition of amino acid input tryptophan in the diet of birds.

5.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-206110

Resumo

A interação genótipo x ambiente é aspecto importante que deve ser considerado nas avaliações genéticas de populações sob seleção. Modelos de norma de reação são frequentemente utilizados para o estudo da interação genótipo x ambiente e podem ser aplicados em populações que possuem o fenótipo de um grupo de indivíduos aparentados medido ao longo de um gradiente ambiental. Muitos pesquisadores assumem que a norma de reação de determinado genótipo ao longo do gradiente ambiental deve ser linear. Entretanto, impor um modelo linear como mais adequado para descrever o comportamento de determinada característica implica em aplicar restrições que impedem acompanhar seu progresso genético, ou seja, sua evolução ao longo dos diferentes ambientes. De modo geral, para compreender a evolução da característica ao longo do gradiente ambiental os parâmetros genéticos estimados via modelos de norma de reação devem ser analisados de forma complementar. Nesta dissertação, objetivou-se estudar a interação genótipo x ambiente em duas linhagens de codornas de corte na fase final de crescimento criadas sob diferentes níveis de metionina+cistina digestível aparente. Para tal, mensurou-se o ganho de peso dos 21 aos 35 dias de vida das aves. Os níveis testados foram 0,60; 0,70; 0,80; 0,90 e 1,00% de metionina+cistina digestível nas aves da linhagem EV1 e 0,61; 0,71; 0,81; 0,91 e 1,01% de metionina+cistina digestível nas aves da linhagem EV2. Foram utilizados modelos de norma de reação com polinômios de Legendre variando de ordem um a cinco para o ajuste dos efeitos fixos e aleatórios e considerou-se heterogeneidade de variância residual. Os modelos que melhor se ajustaram para cada linhagem diferiram entre si quanto a ordem do polinômio de Legendre utilizado para descrever a trajetória média, sendo necessários polinômios de quarta ordem para a linhagem EV1 e de primeira ordem para a linhagem EV2. Em relação ao ajuste dos efeitos genéticos aditivos, polinômios de quarta ordem foram necessários para a modelagem nas duas linhagens. Ainda, para as duas linhagens modelos que consideraram heterogeneidade de variância residual com cinco classes foram os que melhor se ajustaram. Após determinar o modelo que melhor se ajustou para descrever o ganho de peso ao longo dos níveis de metionina+cistina digestível nas duas linhagens, os parâmetros genéticos foram estimados. As estimativas de correlação e as normas de reação dos genótipos em função dos níveis indicaram que há interação genótipo x nível de aminoácido fornecido às aves para ganho de peso na fase final de crescimento. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,37 a 0,72 ao longo dos ambientes da linhagem EV1 e de 0,20 a 0,75 ao longo dos ambientes da linhagem EV2. Além disso, foram observados altos valores de coeficiente de variação genético aditivo, variando de 0,09 a 0,17 na linhagem EV1 e 0,11 a 0,19 na linhagem EV2. Os resultados obtidos indicam que há variabilidade genética para o ganho de peso em codornas das duas linhagens e que a característica em estudo apresenta boa capacidade em evoluir ao longo das gerações por meio da seleção.


The genotype x environment interaction is an important aspect that should be considered in the genetic evaluations of populations under selection. Reaction norms models are often used for the study of the genotype x environment interaction and can be applied to populations that have the phenotype of a group of related individuals measured along an environmental gradient. Many researchers assume that the reaction norm of a given genotype along the environmental gradient should be linear. However, imposing a linear model as more adequate to describe the behavior of a certain characteristic implies applying restrictions that prevent its genetic progress, that is, its evolution throughout the different environments. In general, in order to understand the evolution of the characteristic along the environmental gradient, the genetic parameters estimated through models of reaction norm must be analyzed in a complementary way. In this dissertation, we aimed to study the interaction genotype x environment in two lines of European quails in the final stage of growth created under different levels of methionine + cystine digestible apparent. For this, the weight gain was measured from 21 to 35 days old of the quails. The levels tested were 0.60; 0.70; 0.80; 0.90 and 1.00% methionine + cysteine digestible in the quails of the EV1 strain and 0.61; 0.71; 0.81; 0.91 and 1.01% methionine + cystine digestible in quails of the EV2 strain. Legendre polynomial ranging from one to five orders were used for the adjustment of fixed and random effects and heterogeneity of residual variance was considered. The models that fit best for each strain differed according to the order of the Legendre polynomial used to describe the mean trajectory. Four-order polynomials for the EV1 and first-order polynomials for the EV2 strain were required. In relation to the adjustment of the additive genetic effects, fourth-order polynomials were required for modeling both strains. Also, for both strains models that considered heterogeneity of residual variance with five classes showed best fit. After determining the model that best described the weight gain along the levels methionine + cystine digestible in both strains, genetic parameters were estimated. Correlation estimates and reaction norms of the genotypes as a function of levels of the environment gradient indicated interaction between genotype and the amino acid level supplied to the quails for weight gain in the final stage of growth. Heritability estimates ranged from 0.37 to 0.72 throughout the environments in EV1 strain and from 0.20 to 0.75 throughout the environments in EV2 strain. In addition, high values of coefficient of additive genetic variation were observed, ranging from 0.09 to 0.17 in the EV1 strain and 0.11 to 0.19 in the EV2 strain. The results indicate that there is genetic variability for weight gain in quails of both strains and that the characteristic in study can evolve over the generations through selection.

6.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-203481

Resumo

O consumo alimentar residual (CAR) tem sido estudado em bovinos de corte como alternativa de mensurar a eficiência alimentar desses animais. Neste contexto, objetivou-se com este trabalho analisar o desempenho, as características de carcaça in vivo e a seletividade dos nutrientes da ração pelos tourinhos da raça Guzerá estratificados por meio do consumo alimentar residual e verificar se há correlação entre estas características. Foram avaliados 38 animais divididos em duas provas: primeira prova (1) composta por 19 animais com idade média inicial de 15 meses e a segunda prova (2) composta por 19 animais com idade média inicial de 11 meses. Os tourinhos foram submetidos a um período de 20 dias de adaptação e 70 dias de período experimental em baias individuais. Ao início, no 35º dia e ao final das provas, os animais foram pesados e as medidas de altura e ultrassonografia em tempo real coletadas. O delineamento foi inteiramente casualizado e os valores preditos de consumo de matéria seca, estimativas de consumo alimentar residual, mensurações de desempenho e qualidade de carcaça, analisados por análise de variância. Foram incluídos no modelo estatístico os efeitos fixos de classes de consumo alimentar residual (baixo, médio e alto), prova (1 e 2), idade inicial como covariável linear e interação entre os efeitos principais (prova*classes de consumo alimentar residual). A comparação de médias foi realizada pelo teste Duncan a 5% de significância e as correlações pelo método de Pearson entre consumo alimentar residual e as características estudadas. Observou-se amplitude de 2,89 kg/dia e desvio padrão de 0,63 kg/dia para consumo alimentar residual. Os animais mais eficientes apresentaram menor ingestão de matéria seca (1,41 kg/dia), porém não houve diferença significativa no ganho de peso, na eficiência e conversão alimentar, no consumo de nutrientes digestíveis totais e na altura dos animais das diferentes classes de consumo alimentar residual. O efeito de prova apresentou diferença significativa (p<0,01) para peso aos 433 dias, peso aos 506 dias, ganho médio diário inicial, ganho médio diário final, eficiência alimentar, conversão alimentar, consumo de nutrientes digestíveis totais e altura final; demonstrando que a dieta pode interferir no resultado final das provas. Portanto, esta variável deve ser considerada no modelo estatístico. Quanto às características de carcaça e a seletividade dos nutrientes da ração, não foram observadas diferenças significativas entre os grupos baixo, médio e alto consumo alimentar residual e não houve correlação destas características com o consumo alimentar residual. De acordo com os resultados deste trabalho, conclui-se que a avaliação da eficiência alimentar baseada no consumo alimentar residual, permite identificar animais que consomem menos alimento sem alterar o desempenho, as características de carcaça e a seletividade dos nutrientes da ração.


The residual feed intake (RFI) has been studied in beef cattle as an alternative to measure the feed efficiency of the animals. In this context, the aim of this study was to analyze the performance, the in vivo carcass characteristics and the selectivity of nutrients from feed for young bulls Guzerá stratified by means of residual feed intake and check for correlation between these characteristics. A total of 38 animals divided into two parts: first round (1) composed of 19 animals with initial age of 15 months and the second test (2) composed of 19 animals with initial age of 11 months. The bulls were subjected to a period of 20 days of adaptation and 70 days trial in individual stalls. At the beginning, on the 35th day and the end of the tests, the animals were weighed and the height and ultrasound measurements in real time collected. The design was completely randomized and the predicted values of dry matter intake, residual feed intake estimates, performance measurements and quality housing, analyzed by analysis of variance. They were included in the statistical model fixed effects of residual feed intake classes (low, medium and high), race (1 and 2), early age as a linear covariate and interaction between the main effects (proof * of residual feed intake classes). The comparison of means was performed by Duncan test at 5% significance and correlations by the method of Pearson between residual feed intake and the characteristics studied. There was a range of 2.89 kg / day and standard deviation of 0.63 kg / day for residual feed intake. The most efficient animals had lower dry matter intake (1.41 kg / day), but there was no significant difference in weight gain and feed conversion efficiency in the consumption of total digestible nutrients and height of animals of different classes of residual feed intake. The proof effect significantly different (p <0.01) for weight at 433 days, weight at 506 days, initial average daily gain, final average daily gain, feed efficiency, feed conversion, total digestible nutrients and final height; demonstrating that the diet can interfere with the outcome of the tests. Therefore, this variable must be considered in the statistical model. As for the carcass characteristics and the selectivity of the feed nutrients, no significant differences were observed between the groups low, medium and high residual feed intake and there was no correlation of these traits with residual feed intake. According to our results, it is concluded that the evaluation of feed efficiency based on residual feed intake, allows identifying animals that consume less food without altering the performance, carcass characteristics and the selectivity of the feed nutrients.

7.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-200753

Resumo

Objetivou-se estimar componentes de covariância e parâmetros genéticos, para pesos e ao longo da curva de crescimento, usando modelos bicaracterísticos (BC) e modelos de regressão aleatória (MRA), para bovinos Nelore Mocho, na região Nordeste do Brasil. Foram utilizados20.727 registros de pesos, dos 60 dias aos 653 dias de idade, de 3.626 animais Nelore Mocho, provenientes da Associação Brasileira de Criadores de Zebu (ABCZ). Os componentes de covariância foram estimados com o Método de Máxima Verossimilhança Restrita. Nas análises de modelos bicaracterísticos(BC),foram utilizados pesos ajustados aos 205(P205), 365(P365) e 550 (P550) dias de idade.As análises de regressão aleatória (MRA) foram realizadas utilizando polinômio ortogonal de Legendre de até quarta ordem; o resíduo foi modelado, considerando uma a seis classes, e as diferentes ordens de ajustes para os polinômios foram comparadas utilizando três critérios: Logaritmo da Função de Verossimilhança, os Critérios de Informação Bayesiano de Schwarz e Critério de Informação de Akaike. Nas análises de modelos bicaracterísticos, a variância aditiva direta foi crescente de P205(97,90), P365 (274,07) e P550 (543,30). A variância materna cresceu variando de 59,46 a 61,67. Na variância de ambiente permanente materno, observou-se queda de P205 a P365, com posterior aumento em P550, no qual se observou maior valor 48,88. A variância fenotípica aumentou conforme o aumento das idades, variando de 451,24 a 1398,30. A herdabilidade direta para os pesos foi P205(0,21±0,01; P365(0,38±0,00) e P550(0,39±0,00). As estimativas de herdabilidades maternas diminuíram ao longo dos pesos, variando de P205(0,13±0,00), P365(0,08±0,19) e P550(0,05±0,19). As correlações genéticas diretas, genética materna e de ambiente permanente maternoentre os pesos foram superiores a 0,91. As correlações fenotípicas entre os pesos variaram de moderadas a altas (0,50 a 0,87±0,00), diminuindo conforme o aumento da distância entre as idades.Nas análises por modelos de regressão aleatória (MRA), o modelo de melhor ajuste foi de ordem quatro, para o efeito genéticodireto; e ordem dois,para os efeitos de ambiente permanente animal, genético aditivo materno e ambiente permanente materno e com variância residual com seis classes de idades.Para as análises via MRA, as estimativas de variância aditiva direta e variância fenotípica foram crescentes, com acentuado crescimento após 543 dias. As variâncias de ambiente permanente animal e maternas apresentaram valores próximos a zero em toda a curva de crescimento. As estimativas de herdabilidades diretas,obtidas via MRA, foram maiores ao final do período, variando de 0,31 a 0,77. As estimativas de herdabilidades maternas foram próximas a zero em todas as idades. As correlações genéticas diretas,entre os pesos (P205, P365, P450 e P550), foram de magnitude moderada a alta (0,60 a 0,97). As correlações genéticas maternas e de ambiente permanente materno entre os pesos apresentaram valores próximos à unidade. O monitoramento dos parâmetros genéticos do desenvolvimento ponderal para animais Nelore Mocho do Nordeste se apresenta como procedimento importante para nortear e definirestratégias,visando aumentar os ganhos genéticos de forma consistente.


This study aimed to estimate covariance components and genetic parameters for weights and along the growth curve, using bi-trait models (BT) and random regression models (RRM) for Polled Nellore cattle in northeastern Brazil. 20,727 records were used weights, from 60 days to 653 days of age, 3,626 animals Polled Nelore catlle, from the Brazilian Association of Zebu Breeders (ABCZ). The covariance components were estimated with the Maximum Restricted Likelihood method. In the bi-trait analysis models (BT) weights were used to set 205 (P205), 365 (P365) and 550 (P550) days of age. The random regression analysis (RRM) were performed using orthogonal polynomial up to fourth order Legendre, the residue was modeled considering a six classes and different orders of adjustments for polynomials were compared using three criteria, logarithmic likelihood function, the Bayesian Information Criteria Schwarz and Akaike Information Criterion. In the analysis of bi-trait models the direct additive variance was growing P205 (97.90), P365 (274.07) and P550 (543.30). Maternal variance grew ranging from 59.46 to 61.67. The variance of maternal permanent environment observed fall of P205 to P365 with subsequent increase in P550, when there was greater value 48.88. The phenotypic variance increased with increasing age ranging from 451.24 to 1398.30. The direct heritability for P205 (0.21±0.01), P365 (0.38±0.00) and P550 (0.39±0.00). Estimates of maternal heritability decreased over the weights ranging from P205 (0.13±0.00), P365 (0.08±0.19) and P550 (0.05±0.19). The direct genetic correlations, maternal genetic and maternal permanent environment between the weights were greater than 0.91. Phenotypic correlations between weights ranged from moderate to high (.50 to .87±0.00) decreases as the distance increases between the ages. In the analysis by random regression models (RRM), the best model was four order for genetic direct effect and order two for the purposes of animal permanent environmental maternal additive genetic and maternal permanent environment and residual variance with six classes for ages.For analysis via RRM estimates of direct additive variance and phenotypic variance were increasing, with strong growth after 543 days. The animal and maternal permanent environmental variance showed values close to zero throughout the growth curve. Estimates of direct heritability obtained via RRM were higher at the end of the period, ranging from 0.31 to 0.77. Estimates of maternal heritability were near zero throughout the study period. The direct genetic correlations among pesos (P205, P365, P450 and P550) were of moderate magnitude to high (0.60 to 0.97). Maternal genetic correlations and maternal permanent environment between weights showed values close to unity. Monitoring of genetic parameters of weight development for Polled Nellore catlle animals in the northeastern, is presented as an important procedure to guide and define strategies to increase the genetic gains consistently. Keywords:

8.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-201174

Resumo

Objetivou-se avaliar a influência da estrutura de grupos de contemporâneos (GC) e da conexidade de dados na avaliação genética de peso ao desmame padronizado para 210 dias de idade em bovinos da raça Nelore. Foram utilizados 713.474 registros de pesos de animais Nelore provenientes de 3.066 rebanhos das regiões Centro-Oeste e Norte do Brasil. Os dados fazem parte do Serviço de Registro Genealógico das Raças Zebuínas (SRGRZ) disponibilizados pela Associação Brasileira dos Criadores de Zebu ABCZ. Os GC foram formados com os efeitos de rebanho, condição de criação, regime alimentar, sexo, data de pesagem, ano e estação de nascimento. Os GC e as classes de idade da vaca ao parto concatenada com sexo da progênie foram definidos como efeitos sistemáticos, a idade do animal na data de pesagem foi considerada como covariável (linear e quadrática). Foram utilizados três níveis de desvios-padrão em relação à média para remoção de outliers (2, 2,5 e 3,5) e GC que continham pelo menos 3, 7 e 15 animais, que possibilitou a combinação de nove diferentes estruturas de dados. A conexidade entre os dados foram mensuradas e avaliados considerando o número total de ligações genéticas diretas entre GC (NTLGD). Foram consideradas 5, 10 e 15 ligações entre os GC, L5, L10 e L15, respectivamente. Empregou-se o modelo animal unicaracterístico via inferência Bayesiana para estimação dos valores e parâmetros genéticos. A estrutura de dados com 3,5 desvios-padrão e GC com no mínimo 15 animais apresentou maior valor de variância genética aditiva (82,65±2,8575). A estrutura de dados com 2 desvios-padrão e GC com no mínimo 15 animais apresentou menor valor de variância residual (206,86±1,451), e o maior valor foi verificado para estrutura de dados com 3,5 desvios-padrão e GC com no mínimo 3 animais (276,42±1,4902). O maior valor de herdabilidade (0,18±0,006) foi estimado ao considerar a estrutura com 2,5 desvios-padrão e GC com no mínimo 15 animais. As estruturas com 3,5 desvios-padrão e mínimo de 15 animais por GC proporcionaram maiores ganhos genéticos, de 5,04 e 3,34 kg para os 1% dos machos e 20% das fêmeas e para 5% dos machos e 40% das fêmeas, respectivamente. Ao avaliar a conexidade de dados, não verificou-se diferença entre as estruturas de dados com as diferentes ligações genéticas, sendo a conexidade acima de 99% em todas as estruturas. Ao considerar a conexidade, os valores encontrados para as estimativas dos parâmetros genéticos nas diferentes estruturas de dados foram iguais aos encontrados na avaliação sem considerar a conexidade entre os dados. A alta conexidade entre os GC é reflexo da alta qualidade na estrutura de dados, justificada pela intensa comercialização de sêmen de touros provados e troca de material genético entre os rebanhos. Os diferentes critérios para formação de grupos de contemporâneos influenciaram na avaliação genética. O uso de critérios para remoção de outliers com 2 desvios-padrão e grupos de contemporâneos com mínimo de 3 animais proporcionaram menores estimativas de herdabilidade. O uso de critérios para remoção de outliers com 2,5 e 3,5 desvios-padrão e grupos de contemporâneos com mínimo de 15 animais proporcionaram maiores estimativas de herdabilidade, porém resulta em maior perda de registros. Os dados apresentam boa qualidade na estrutura em função da alta conexidade existente entre os grupos de contemporâneos.


We aimed to evaluate the influence of contemporary groups (CG) structure and data connectivity in the genetic evaluation for body weight at weaning standardized for 210 days of age in Nellore cattle. A total of 713,474 records from 3,066 herds located at Middle West and North of Brazil were used. These herds are included at Genealogical Records Service of Zebu Breeds (SRGRZ) provided by Brazilian Association of Zebu Breeders ABCZ. The CG were formed according herd, handling condition, diet, sex, date of weighting, year and birth season effects. Contemporary groups and classes of cow age at calving concatenated with offspring gender were defined as systematic effects, and the animal age at weighting was considered as covariate (linear and quadratic). Three standard deviations from the average (2, 2.5 and 3.5) were used for outliers removal, and CG with at least 3, 7 and 15 animals were included, thus allowing the formation of nine different data structures. Connectivity across the data was measured considering the total direct genetic linkage between CG (NTLGD). Five, ten and fifteen linkages between CG, L5, L10 and L15, respectively, were considered. Genetic evaluation was performed using a single trait animal model under a Bayesian approach to estimate the breeding values and genetic parameters. Data structure with 3.5 standard deviations and CG with at least 15 animals presented higher additive genetic variance values (82.65±2.8575). Data structure with 2 standard deviations and CG with at least 15 animals presented lower residual variance values (206.86±1.451), and the higher value (276.42±1.4902) was verified for the data structure with 3.5 standard deviations and CG with at least 3 animals. The higher heritability value (0.18±0.006) was estimated when considering the structure with 2.5 standard deviations and CG with at least 15 animals. Structures with 3.5 standard deviations and least 15 animals per CG had the highest genetic gains, 5.04 and 3.34 kg for the 1% of the males and 20 % of the females and 5% of the males and 40% of the females, respectively. The evaluation the data connectivity snowed no difference between structures with different genetic linkage, resulting in more than 99% of connectivity for all considered structures. Genetic parameters estimates values of different data structures considering the data connectivity were the same as those without consider the data connectivity. The high connectivity between CG is due the good quality of the data structure explained by the intense marketing of proven bulls semen and genetic material exchange between herds. The different criteria for CG formation influenced the data structure and genetic evaluation. Criteria usage for removing outliers with 2 standard deviations and CG with at least 3 animals had the lowest heritability estimates. The criteria used for removing outliers with 2.5 and 3.5 standard deviation and CG with at least 15 animals had the highest heritability estimates, but lead to a higher records loss. Data presents a good structure quality due the high existing connectivity between CG.

9.
Ciênc. anim. bras. (Impr.) ; 7(4): 365-371, 2006.
Artigo em Português | LILACS-Express | VETINDEX | ID: biblio-1474008

Resumo

Adjusted weights at 120 (P120) and 240 (P240) days of age from 8,084 Nellore calves of both sexes were used to obtain estimate of (co)variance components and predictions of breeding values. Calves were born between 1987 and 1997 and raised on pasture in 31 herds. The complete mixed model for each trait included the fixed effects of contemporary group (herd-year-season-sex-management group) and six cow age at calving classes (2, 3, 4, 5, 6 to 9, and 10 years and older cows), and random additive genetic effects of animal (direct and maternal), maternal permanent environmental, sire x maternal grandsire interaction (PAM) and residual. Inclusion of PAM interaction explained between 2.8 and 3.1 % of the phenotypic variance, and caused a reduction in direct and maternal variances and an increase in direct-maternal covariances. Direct heritabilities diminished from 0.24 to 0.20 (P120), and from 0.24 to 0.19 (P240). Corresponding maternal heritabilities decreased from 0.17 to 0.13 and from 0.20 to 0.16. Direct-maternal genetic correlations increased from 0.05 to 0.29 (P120), and from -0.12 to 0.01 (P240), indicating no antagonism. Figures of annual breeding value means showed scarce or any progress during the analyzed period, particularly on maternal ability. Intensive use of few sires could be a major factor contributing to these results. The PAM interaction effect and the genetic tre


Foram utilizados pesos padronizados aos 120 (P120) e 240 (P240) dias de idade, de 8.084 bezerros Nelore, de ambos os sexos, criados a pasto, nascidos entre 1987 e 1997 em 31 rebanhos, para estimar componentes de (co)variância e obter predições de valores genéticos. O modelo animal misto completo para cada caráter incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo (rebanho-ano-época-sexo-grupo- manejo) e seis classes de idade da vaca ao parto em anos (2, 3, 4, 5, 6 a 9, 10 e mais), e os efeitos aleatórios genéticos aditivos do animal (direto e maternal), ambiental permanente maternal, interação pai avô-materno (PAM) e residual. O efeito da interação PAM explicou entre 2,8% e 3,1 % da variância fenotípica, e determinou redução das variâncias direta e maternal e aumento da covariância entre efeitos direto e maternal. As herdabilidades diretas diminuíram de 0,24 a 0,20 (P120), e 0,24 a 0,19 (P240), e as correspondentes herdabilidades maternais de 0,17 a 0,13 e 0,20 a 0,16, respectivamente. As correlações entre efeitos genéticos direto e maternal aumentaram de 0,05 a 0,29 (P120), e -0,12 a 0,01 (P240), não indicando antagonismo. A evolução das médias anuais dos valores genéticos indicou escasso ou nenhum progresso no período analisado, especialmente na habilidade maternal. O uso intensivo e por vários anos de poucos touros aponta-se como causa importante desse resultado. O efeito da

10.
Jaboticabal; s.n; 24/11/2008. 84 p.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-4508

Resumo

Parâmetros genéticos para o fluxo lácteo medido no dia do controle (FLDC) de primeiras lactações de vacas da raça Holandesa foram estimados utilizando modelos de dimensão finita (TDM) e modelos de regressão aleatória. Para os TDM foram analisadas 10 características por meio de modelos uni e bi e multi-características e de repetibilidade, que continham como aleatórios, o efeito genético aditivo e o efeito residual e, como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos e as covariáveis idade da vaca ao parto. A variável número de dias em lactação foi incluída somente no modelo de repetibilidade. Para os MRA, foram considerados os efeitos aleatórios genético aditivo direto, de ambiente permanente e o residual. Foram considerados como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos, os efeitos linear e quadrático da covariável idade da vaca ao parto e a curva média de lactação da população, modelada por meio de polinômios ortogonais de Legendre de quarta ordem. Os efeitos aleatórios genético aditivo e de ambiente permanente foram modelados por meio de regressão aleatória sobre polinômios ortogonais de Legendre e por meio de funções b-splines. Diferentes estruturas de variâncias residuais foram testadas, por meio de classes contendo 1, 7, 10, 20 e 43 variâncias residuais, para os MRA modelados por meio de polinômios de Legendre. Já, para os MRA modelados por funções b-splines, a estrutura residual foi considerada heterogênea, contendo 7 classes de variâncias. Os MRA foram comparados usando o teste de razão de verossimilhança, o critério de informação de Akaike e o critério de informação de Bayesiano de Schwarz. As estimativas de herdabilidade (h2) para os FLDC variaram de 0,23 a 0,32 nas análises unicaracterísticas, de 0,24 a 0,32 nas bi-características e de 0,28 a 0,37 nas multicaracterísticas. Os valores de h2 estimados variaram no decorrer da...


Flow milk genetic parameters to the first lactation test-day milk yields of Holstein cattle were estimated using Test-day models (TDM) and Random regression models (RRM). Ten TDM differents traits were analyzed using uni, bi and multi-trait and repeatability animal models, that included the additive genetic as random effect and the fixed effects of contemporary group, age of cow (linear and quadratic) as covariables. The days in milk (linear) variable was included only at repeatability model. To RRM were included the additive genetic, permanent environmental and residual as random effects, the fixed effects of contemporary group, age of cow as covariable (linear and quadratic effects) and a 4th-order Legendre orthogonal polynomials of days in milk, to model the mean trend. The additive genetic and permanent environmental effects were fitted by Legendre orthogonal polynomials and b-splines functions. Different structures of residual variances were used, through the variances classes containing 1, 7, 10, 20, and e 43 residual variances, to the models fitted by Legendre orthogonal polynomials. Moreover, for the RRM fitted by b-splines-functions, the residual estructure was considered heterogeneous, having 7 variance classes. The RRM were compared by Likelihood ratio test, Bayesian and Akaike´s information criteria. The heritability estimated ranged from 0.23 to 0.32 by uni-trait analyses, from 0.24 to 0.32 by bi-traits analyses and from 0.28 to 0.37 by multi-trait analyses. The h2 estimates varied during the lactation being the highest estimate at the fourth month. The estimate obtained by the repeatability model was 0.27, and a repeatability estimate of 0.66. For the MRA fitted by Legendre orthogonal polynomials, related to the residual variance, the best model the one that deemed 7 residual classes. For the additive and permanent environmental effects, the having 3th-order...

11.
Ci. Anim. bras. ; 7(4): 365-371, 2006.
Artigo em Português | VETINDEX | ID: vti-713713

Resumo

Adjusted weights at 120 (P120) and 240 (P240) days of age from 8,084 Nellore calves of both sexes were used to obtain estimate of (co)variance components and predictions of breeding values. Calves were born between 1987 and 1997 and raised on pasture in 31 herds. The complete mixed model for each trait included the fixed effects of contemporary group (herd-year-season-sex-management group) and six cow age at calving classes (2, 3, 4, 5, 6 to 9, and 10 years and older cows), and random additive genetic effects of animal (direct and maternal), maternal permanent environmental, sire x maternal grandsire interaction (PAM) and residual. Inclusion of PAM interaction explained between 2.8 and 3.1 % of the phenotypic variance, and caused a reduction in direct and maternal variances and an increase in direct-maternal covariances. Direct heritabilities diminished from 0.24 to 0.20 (P120), and from 0.24 to 0.19 (P240). Corresponding maternal heritabilities decreased from 0.17 to 0.13 and from 0.20 to 0.16. Direct-maternal genetic correlations increased from 0.05 to 0.29 (P120), and from -0.12 to 0.01 (P240), indicating no antagonism. Figures of annual breeding value means showed scarce or any progress during the analyzed period, particularly on maternal ability. Intensive use of few sires could be a major factor contributing to these results. The PAM interaction effect and the genetic tre


Foram utilizados pesos padronizados aos 120 (P120) e 240 (P240) dias de idade, de 8.084 bezerros Nelore, de ambos os sexos, criados a pasto, nascidos entre 1987 e 1997 em 31 rebanhos, para estimar componentes de (co)variância e obter predições de valores genéticos. O modelo animal misto completo para cada caráter incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo (rebanho-ano-época-sexo-grupo- manejo) e seis classes de idade da vaca ao parto em anos (2, 3, 4, 5, 6 a 9, 10 e mais), e os efeitos aleatórios genéticos aditivos do animal (direto e maternal), ambiental permanente maternal, interação pai avô-materno (PAM) e residual. O efeito da interação PAM explicou entre 2,8% e 3,1 % da variância fenotípica, e determinou redução das variâncias direta e maternal e aumento da covariância entre efeitos direto e maternal. As herdabilidades diretas diminuíram de 0,24 a 0,20 (P120), e 0,24 a 0,19 (P240), e as correspondentes herdabilidades maternais de 0,17 a 0,13 e 0,20 a 0,16, respectivamente. As correlações entre efeitos genéticos direto e maternal aumentaram de 0,05 a 0,29 (P120), e -0,12 a 0,01 (P240), não indicando antagonismo. A evolução das médias anuais dos valores genéticos indicou escasso ou nenhum progresso no período analisado, especialmente na habilidade maternal. O uso intensivo e por vários anos de poucos touros aponta-se como causa importante desse resultado. O efeito da

12.
Semina ciênc. agrar ; 35(5): 2843-2858, 2014. tab, graf
Artigo em Inglês | VETINDEX | ID: biblio-1499705

Resumo

Objetivou-se estimar parâmetros genéticos para peso corporal, ganho em peso diário (GPD) ecaracterísticas morfométricas em tilápias do Nilo da variedade GIFT por meio de modelos de regressãoaleatória. Foram testados modelos com ordens 2, 3 e 4 do polinômio de Legendre para o efeito genéticoaditivo, e ordens 2 e 3 para a idade, efeitos de ambiente permanente e de família. Testaram-se aindamodelos com variância residual homogênea e heterogênea. Para os efeitos de ambiente permanente ede família, os polinômios de terceira ordem proporcionaram melhor ajuste em todas as características,bem como para o efeito genético para peso, GPD, comprimento e largura. Para altura e tamanho decabeça foram necessários polinômios de quarta ordem. Para ganho em peso, altura e cabeça o melhormodelo foi o que considerou variância residual homogênea para largura, variância heterogênea com trêsclasses de idade e para peso e comprimento, variância heterogênea com nove classes de idade. A maiorherdabilidade para peso foi 0,34 entre 240 e 311 dias, e para GPD foi 0,69 aos 311 dias. Para cabeça ecomprimento a maior herdabilidade ocorreu aos 270 dias, sendo igual a 0,27 e 0,21, respectivamente.A maior herdabilidade para o comprimento foi 0,20 aos 254 dias e para largura a maior herdabilidadefoi 0,54 aos 311 dias. Uma vez que as maiores herdabilidades foram para GPD e largura aos 311 dias,a seleção baseada nestas características nestas idades levaria as maiores ganhos genéticos. As altascorrelações genéticas entre idades superiores aos 200 dias de idade denotam a possibilidade de seutilizar como critério de seleção, idades pouco menores que as usuais (300 dias) sem diminuir o ganhogenético. Como a largura apresentou herdabilidade de média magnitude na maior parte do períodoavaliado, a seleção baseada na largura em qualquer idade levaria a um ganho genético satisfatório nessacaracterística no final do período de cultivo.


The aim of the current study was to estimate the genetic parameters for weight gain and bodymeasurements in the GIFT (Genetically Improved Farmed Tilapia) strain of Nile tilapia by randomregression models. Several orders of Legendre polynomials were tested for random effects and modeledwith 1, 3, 6 and 9 classes of residual variance. For the effects of permanent environmental and family,third-order polynomials were adjusted in all traits, as well as for the genetic effects of weight, weightgain, length and width. For genetic effects of height and head, fourth-order polynomials were required.To gain weight, height and head, the best model was one that considered the homogenous residualvariance; however for width and weight, heterogeneous variance with 3 and 9 age classes was required,respectively. The highest heritability for weight was 0.34 at 240–311 days, and for weight gain it was0.69 at 311 days. For head and length, the highest heritability was around 270 days at 0.27 and 0.21,respectively. The highest heritability found for length was 0.20 at 254 days, 0.2 at 254 days for height,and for width the heritability was 0.54 at 311 days. Since the largest heritabilities were found for weightgain and width at 311 days, selection at these ages, based on these traits, would lead to greater geneticgains. Genetic correlations were higher between adjacent ages and, in general, selections at ages ofless than 200 days did not lead to genetic gain correlated with traits at 300 days. The exception wasfor width, because high correlations were obtained between final and initial ages and the heritabilitywas median in the majority of the period. Thus, selection based on the width at any age would lead tosatisfactory genetic gain in this trait at the end of the growing season.


Assuntos
Animais , Aumento de Peso/genética , Ciclídeos/anatomia & histologia , Ciclídeos/crescimento & desenvolvimento , Hereditariedade , Peso Corporal , Análise de Regressão , Estudos Longitudinais
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