Bibliometric revision regarding the use of survival analysis in seed germination studies / Revisão bibliométrica sobre o uso da análise de sobrevivência em estudos com germinação de sementes

ABSTRACT: Studies on seed science are developed for a wide range of purposes, being the statistical analysis of data essential for experimental reliability and evidence. Due to the characteristics of seed data, several statistical methods can be applied, among them the survival analysis stands out, in virtue of allocating censored data and describing phenomena over time. Therefore, this bibliometric study verified the use of survival analysis in studies with seed germination and to examine the applications of survival analysis in original articles from the Web of Science database for the period from 2000 to 2020. For the application of survival analysis, there was a low number of publications related to seed science, with the USA being the country with the highest number of publications mainly to studies in plant ecology and physiology. In general, the researches were most involved to the evaluation of factors influencing dormancy, physiological stresses, dispersion capacity, population differences and habitats of development which affected seed germination. Therefore, the qualitative overview demonstrates that the survival analysis is a statistical tool of great potential regarding the studies in the area.

RESUMO: Estudos em ciência de sementes são desenvolvidos frente a uma ampla gama de finalidades, sendo a análise estatística dos dados um componente imprescindível para confiabilidade e comprovação experimental. Devido às características dos dados de sementes, diversos métodos estatísticos podem ser aplicados na sua análise, dentre os quais destaca-se a análise de sobrevivência, em virtude de alocar dados censurados e descrever fenômenos ao longo do tempo. Sendo assim, este estudo bibliométrico teve por objetivo verificar o uso da análise de sobrevivência em estudos com germinação de sementes e examinar as aplicações da análise de sobrevivência em artigos originais da base de dados Web of Science para o período de 2000 a 2020. Observou-se para aplicação da análise de sobrevivência, baixo número de publicações com este método estatístico ao decorrer dos anos, sendo os Estados Unidos (EUA) o país de maior produtividade em publicações, com pesquisas relacionadas principalmente a estudos em ecologia vegetal e fisiologia. Em geral, as pesquisas foram mais voltadas para a avaliação de fatores que influenciam a dormência, estresses fisiológicos, capacidade de dispersão, diferenças populacionais e habitats de desenvolvimento que afetaram a germinação das sementes. Portanto, o panorama qualitativo demonstra que a análise de sobrevivência é uma ferramenta estatística de grande potencial em relação aos estudos na área.

Good practices in the rearing and maintenance of zebrafish (Danio rerio) in Brazilian laboratories / Boas práticas na criação e manutenção de zebrafish (Danio rerio) em laboratório no Brasil

Good Laboratory Practice (GLP) is a management quality control system that encompasses the organizational process and conditions under which non-clinical health and environmental studies are carried out. According to the World Health Organization, GLP must contain five topics: resources, characterization, rules, results, and quality control. The aim of this work is to address a review according to WHO standard to the implementation of Good Laboratory Practices in zebrafish (Danio rerio) facility. Considering that the promotion of one health (animal, human, and environmental) associated with an education plan, protocols, and records are fundamental to guarantee the safety and integrity of employees, animals and the environment as well as reliability in the results generated. In a way, Brazil still needs improvements related to the wellfare of aquatic organisms (national laws, international agreements, corporate programs, and others); especially in relation to its use in research and technological development. In this way, the implementation of GLPs provide valuable guidance for improving animal welfare and worker safety, facilitating the standardization of research.

As Boas Práticas de Laboratório (BPL) são um sistema de controle de qualidade gerencial que abrange o processo organizacional e as condições sob as quais os estudos não clínicos de saúde e meio ambiente são desenvolvidos. Conforme a Organização Mundial da Saúde (OMS) as BPL devem conter cinco tópicos: recursos, caracterização, regras, resultados e controle de qualidade. O objetivo deste trabalho foi apresentar uma revisão conforme o padrão da OMS para a implementação das BPL em biotério de zebrafish. Considerando que a promoção da saúde única (animal, humana e ambiental) associada a um plano de educação, protocolos e registros são fundamentais para garantir a segurança e a integridade dos trabalhadores/pesquisadores, animais e meio ambiente assim como confiabilidade nos resultados gerados. De certa forma o Brasil ainda necessita de melhorias relacionadas ao bem-estar de organismos aquáticos (leis nacionais, acordos internacionais, programas corporativos e outros); especialmente em relação à utilização destes na pesquisa e desenvolvimento tecnológico. Desta forma, a implementação de BPL fornece uma orientação valiosa para a melhoria do bem-estar animal, e segurança do trabalhador vindo a facilitar a padronização da pesquisa.

Validation of a one-tube nested real-time PCR assay for the detection of Cryptosporidium spp. in avian fecal samples / Validação da nested PCR em tempo real em um tubo para detecção de Cryptosporidium spp. em amostras fecais de aves

Abstract The aim of this study was to validate a one-tube nested real-time PCR assay followed by genetic sequencing to detect and identify Cryptosporidium species and genotypes in birds. A total of 443 genomic DNA extracted from avian fecal samples were analyzed by one-tube nested real-time PCR and conventional nested PCR. By one-tube nested real-time PCR, 90/443 (20.3%) samples were positive for Cryptosporidium spp. In contrast, 36/443 (8.1%) samples were positive for Cryptosporidium spp. by conventional nested PCR. The analytical sensitivity test showed that one-tube nested real-time PCR detects approximately 0.5 oocyst (2 sporozoites) per reaction. An evaluation of analytical specificity did not reveal amplification of microorganisms that commonly present nonspecific amplification with primers used for the diagnosis of Cryptosporidium spp. The repeatability analysis showed the same result in 27 out of 30 samples (90%). As for the reproducibility of one-tube nested real-time PCR, 24 of the 30 samples examined (80%) showed the same result. All the 90 samples amplified by one-tube real-time nested PCR were successfully sequenced, leading to the identification of C. baileyi, C. galli, C. meleagridis, C. proventriculi, and Cryptosporidium avian genotype I. Genetic sequencing of conventional nested PCR amplicons was successful in 10/36 (27.8%) of positive samples.

Resumo O objetivo deste trabalho foi validar um protocolo de nested PCR em tempo real em um tubo (nPCR-TR-1T) seguida de sequenciamento genético para detectar e caracterizar as espécies e genótipos de Cryptosporidium em aves. Um total de 443 amostras de DNA genômico, extraído de amostras fecais de aves, foi analisado pela nPCR-TR-1T e pela nested PCR convencional. Pela nPCR-TR-1T, foi observada positividade para Cryptosporidium spp. de 20,3% (90/443), em contraste com a nested PCR convencional, que apresentou positividade de 8,1% (36/443). O teste de sensibilidade analítica mostrou que a nPCR-TR-1T detecta aproximadamente 0,5 oocisto (2 esporozoítos) por reação. A avaliação da especificidade analítica não revelou amplificação de microrganismos que comumente apresentam amplificação inespecífica com primers utilizados para o diagnóstico de Cryptosporidium spp. O cálculo da repetibilidade evidenciou o mesmo resultado em 27 de 30 amostras (90%). Em relação à reprodutibilidade da nPCR-TR-1T, foi observado o mesmo resultado em 80% (24/30) das amostras examinadas. Foi possível realizar o sequenciamento em todas as 90 amostras amplificadas pela nPCR-TR-1T, com identificação de C. baileyi, C. galli, C. meleagridis, C. proventriculi e Cryptosporidium genótipo I em aves. O sequenciamento dos fragmentos amplificados pela nested PCR convencional foi possível em 10/36 (27,8%) das amostras positivas.

Determination of risk factors in cattle and small ruminant livestock enterprises from the perspective of animal life insurance: a case study in Turkey / [Determinação dos fatores de risco em empresas de gado e pequenos ruminantes a partir da perspectiva do seguro de vida animal: um estudo de caso na Turquia]

The objective of this study was to determine the risk factors in the production processes of cattle and small ruminant breeding enterprises, along with developing a scale that could be used during the insured breeding process in different regions of Turkey. In this study, we obtained information from 252 enterprises from different provinces (Afyonkarahisar, Aksaray, Ankara, Burdur, Karaman, and Konya) of Turkey. Reliability and validity analyses were conducted using the "Risk Assessment Form in Cattle and Small Ruminant Animal Production". The Cronbach alpha (α) coefficient was used to analyze reliability, while the exploratory factor analysis was applied to analyze the validity. About 68.7% (173) of the enterprises included cattle breeding, while the remaining 31.3% (79) involved small ruminant breeding. To determine the risk factors, twenty-four questions were directed toward the livestock enterprises, and the following six factors were determined: Economic-Political Risks, Yield/Product Losses, Enterprise Technical Risks, Credit/Financing, Workforce, Enterprise Follow-up, and Registration. In the politico-economic risk scoring, the score of enterprises already having Animal life insurance (ALI) was observed to be higher than those who did not have it, with the difference being statistically significant (p<0.05). We interpreted that producers with higher politico-economic risk factor scores preferred insurance. Although the producers could determine the risk factors well, not all producers were necessarily aware of risk measures. Thus, it was necessary to improve the farmers' perception of risks and support their efforts to manage and reduce these risks. Also, the importance of insurance practices within and out of the farm is predicted to increase gradually to develop more conscious, sustainable, and profitable breeding in agriculture and animal product markets, which are becoming more liberalized day by day.

O objetivo deste estudo foi determinar os fatores de risco nos processos de produção de bovinos e pequenos ruminantes, juntamente com o desenvolvimento de uma escala que pudesse ser utilizada durante o processo de criação segurada em diferentes regiões da Turquia. Neste estudo, obtivemos informações de 252 empresas de diferentes províncias (Afyonkarahisar, Aksaray, Ankara, Burdur, Karaman e Konya) da Turquia. As análises de confiabilidade e validade foram realizadas utilizando o "Formulário de Avaliação de Risco na Produção Bovina e de Pequenos Animais Ruminantes". O coeficiente Cronbach alfa (α) foi usado para analisar a confiabilidade, enquanto a análise exploratória de fatores foi aplicada para analisar a validade. Cerca de 68,7% (173) das empresas incluíram a criação de gado, enquanto os restantes 31,3% (79) envolveram a criação de pequenos ruminantes. Para determinar os fatores de risco, vinte e quatro perguntas foram dirigidas aos empreendimentos pecuários, e os seis fatores seguintes foram determinados: Riscos Econômico-Políticos, Rendimento Perda de Produto, Riscos Técnicos da Empresa, Crédito/Financiamento, Força de Trabalho, Acompanhamento da Empresa e Registro. Na pontuação do risco político-econômico, a pontuação das empresas que já tinham seguro de vida animal (ALI) foi observada como sendo maior do que aquelas que não tinham, sendo a diferença estatisticamente significativa (p<0,05). Interpretamos que os produtores com pontuação mais alta no fator de risco político-econômico preferiam o seguro. Embora os produtores pudessem determinar bem os fatores de risco, nem todos os produtores estavam necessariamente cientes das medidas de risco. Assim, era necessário melhorar a percepção dos agricultores sobre os riscos e apoiar seus esforços para administrar e reduzir esses riscos. Além disso, a importância das práticas de seguro dentro e fora da fazenda deve aumentar gradualmente para desenvolver uma criação mais consciente, sustentável e lucrativa na agricultura e nos mercados de produtos animais, que estão se tornando mais liberalizados a cada dia.

Methodology to filter out outliers in high spatial density data to improve maps reliability

The considerable volume of data generated by sensors in the field presents systematic errors; thus, it is extremely important to exclude these errors to ensure mapping quality. The objective of this research was to develop and test a methodology to identify and exclude outliers in high-density spatial data sets, determine whether the developed filter process could help decrease the nugget effect and improve the spatial variability characterization of high sampling data. We created a filter composed of a global, anisotropic, and an anisotropic local analysis of data, which considered the respective neighborhood values. For that purpose, we used the median to classify a given spatial point into the data set as the main statistical parameter and took into account its neighbors within a radius. The filter was tested using raw data sets of corn yield, soil electrical conductivity (ECa), and the sensor vegetation index (SVI) in sugarcane. The results showed an improvement in accuracy of spatial variability within the data sets. The methodology reduced RMSE by 85 %, 97 %, and 79 % in corn yield, soil ECa, and SVI respectively, compared to interpolation errors of raw data sets. The filter excluded the local outliers, which considerably reduced the nugget effects, reducing estimation error of the interpolated data. The methodology proposed in this work had a better performance in removing outlier data when compared to two other methodologies from the literature.

Assessment of melatonin-alpha adrenergic receptor complexes by molecular docking analysis / Avaliação dos complexos melatonina-receptores alfa-adrenérgicos por análises de docagem molecular

The pineal melatonin (N-acetyl-5-methoxytryptamine) is a molecule associated in a way or another with probably all physiological systems, aiming to fulfil its functional integrative roles in central nervous system activity, sleep and wakefulness cycles, energy metabolism and thermoregulation, immune, reproductive, endocrine, cardiovascular, respiratory and excretory systems. Within this context, the present study aimed to assess in silico the formation of complexes between ligand melatonin and other potential receptor proteins by molecular docking analyses. The main steps established in this experimental procedure were: a) search and selection of the 3D structure of the melatonin from DrugBank; b) search and selection of 3D structures of other target receptor proteins using STRING, protein BLAST and database PDB; and c) formation of the complexes between melatonin and receptors selected using AutoDock4.0 server by molecular docking analyses. High reliability score and significant similarity were only identified between type 1B melatonin and alpha-2A adrenergic receptor. Thus, molecular docking assays were carried out using ligand melatonin and crystallographic structures of the alpha-2A adrenergic receptor coupled to an antagonist (ID PDB 6kux) and a partial agonist (ID PDB 6kuy) available in the database PDB. Binding energy values of -6.79 and -6.98 kcal/mol and structural stability by non-covalent intermolecular interactions were predicted during the formation of complexes between melatonin and alpha-2A adrenergic receptor 6kux and 6kuy, respectively. In this way, the findings described in current study may indicate strong interactions between melatonin and adrenoceptors, suggesting its possible partial agonist effect on the activation of the alfa-2A adrenergic receptor.(AU)

A melatonina pineal (N-acetil-5-metoxitriptamina) é uma molécula associada de um modo ou outro com provavelmente todos os sistemas fisiológicos, visando cumprir seus papéis funcionais integradores na atividade do sistema nervoso central, ciclos de sono e vigília, metabolismo energético e termorregulação, sistemas imunológico, reprodutivo, endócrino, cardiovascular, respiratório e excretor. Assim, o presente estudo objetivou avaliar in silico a formação de complexos entre o ligante melatonina e outras proteínas potenciais receptoras por meio de análises de docagem molecular. As principais etapas estabelecidas neste procedimento experimental foram: a) busca e seleção da estrutura 3D da melatonina a partir do banco de dados DrugBank; b) busca e seleção de estruturas 3D de outras proteínas receptoras-alvo utilizando STRING, proteína BLAST e o banco de dados PDB; e c) avaliação da formação dos complexos entre melatonina e receptores selecionados a partir do servidor AutoDock4.0 para análises de docagem molecular. Alto escore de confiabilidade e similaridade significativa foram identificados apenas entre a melatonina do tipo 1B e o receptor alfa-2A adrenérgico. Valores de energia de ligação de -6,79 e -6,98 kcal/mol e estabilidade estrutural pela presença de interações intermoleculares não covalentes foram preditos durante a formação de complexos entre o ligante melatonina e os receptores adrenérgico alfa-2A 6kux e 6kuy, respectivamente. Dessa forma, os achados descritos no presente estudo podem indicar fortes interações entre melatonina e adrenoceptores, sugerindo seu possível efeito agonista parcial na ativação do receptor alfa-2A adrenérgico.(AU)

Psychometric properties of the Brazilian version of the Canine Brief Pain Inventory (CBPI) for dogs with clinical signs of osteoarthritis and preliminary evidence of its clinical utility / Propriedades psicométricas da versão brasileira do Breve Inventário de Dor Canina (BIDC) em cães com sinais clínicos de osteoartrite e evidências preliminares da sua utilização clínica

This study aimed to determine the psychometric properties and clinical use of the Brazilian version of the Canine Brief Pain Inventory (CBPI) in dogs with hip dysplasia (HD). Forty-three dogs with HD and 16 clinically normal dogs were enrolled. The HD dogs were treated daily with 4.4mg/kg carprofen (GT = 21) or placebo (GP = 19), for four weeks. Owners completed the CBPI at two weeks (W-2) and immediately before the start of the treatment (W0), two (W2) and four (W4) weeks during treatment, and two weeks (W6) after the end of treatment. The internal structure was accessed, and the Cronbach's alpha coefficient was 0.97, indicating the high internal consistency of the instrument. Principal Component Analysis (PCA) suggested the retention of one component, which accounted for 78% of the variability. The ROC curve analysis concluded that the score 3 has an excellent performance to discriminate between normal and possible HD dogs (AUC of 0.973). There was no difference between dogs treated with carprofen versus placebo. The instrument in Portuguese showed construct and criterion validity and reliability to be used in dogs with HD.

Objetivou-se determinar as propriedades psicométricas e a utilidade clínica do Breve Inventário de Dor Canina na língua portuguesa, em cães com displasia coxofemoral (DCF). O inventário foi preenchido por tutores de 43 animais com DCF e por 16 tutores de cães saudáveis. Os animais com DCF foram tratados com carprofeno 4,4mg/kg (GT = 21) ou placebo (GP =19), administrados uma vez ao dia durante quatro semanas. As avaliações foram realizadas duas semanas e imediatamente antes do tratamento, duas e quatro semanas durante o tratamento e após duas semanas do término do tratamento. A estrutura interna calculada pelo alfa de Cronbach = 0,97 indicou alta consistência dos dados. A análise dos componentes principais identificou a retenção de apenas um componente responsável por 78% da variabilidade dos dados. A análise da curva ROC indicou que o escore 3 discrimina cães saudáveis de cães com possível DCF (ASC de 0,973). Não houve diferença entre os cães tratados com carprofeno daqueles que receberam placebo. O questionário apresentou validade de constructo e critério e confiabilidade e pode-se empregá-lo para avaliar a dor crônica em cães com osteoartrite em países de língua portuguesa.

Desenvolvimento de plataforma informatizada para o gerenciamento da inspeção e análise laboratorial de produtos de origem animal fornecidos ao exército brasileiro / Development of a computerized platform for inspection management and laboratory analysis of animal products supplied to the Brazilian army

O trabalho propôs o desenvolvimento de plataforma informatizada para apoio ao gerenciamento da inspeção e análise laboratorial de produtos de origem animal fornecidos à tropa do Exército Brasileiro. A pesquisa aplicada corresponde à modalidade de produção tecnológica, em três fases. A fase I foi realizada por meio do levantamento dos arquivos de Laudos Fiscais dos artigos de origem animal, impressos e emitidos pelo LIAB (Laboratório de Inspeção de Alimentos e Bromatologia) do 12º Batalhão de Suprimento, durante o período de janeiro a novembro de 2021, e dos arquivos referentes aos Boletins Técnicos do Exército Brasileiro (BT30.404- EB). A fase II correspondeu ao projeto e desenvolvimento da "Plataforma Alimentar - Rastreabilidade e Confiabilidade Garantida". Toda a programação desenvolvida foi armazenada em um servidor web terceirizado e pode ser acessada pelos LIABs pelo link: www.pmppa.com.br/alimentar. A plataforma informatizada utilizou a linguagem PHP (Hypertext Preprocessor) associada às linguagens CSS (Cascading Style Sheet), HTML (Hyper Text Markup Language), JS (Java script) e bootstrap. A fase III consistiu na realização do teste de Caixa Preta. Os módulos disponíveis para inclusão das informações no sistema são: "cadastro dos artigos de origem animal"; "lançamento das análises"; "cadastro de Boletim Técnico" e "relatórios", os quais permitem atribuir ao artigo de origem animal a qualidade satisfatória ou insatisfatória para o consumo seguro da tropa, de acordo com a avaliação laboratorial das amostras. Houve, com eficácia, o desenvolvimento da plataforma, garantindo ao oficial médico veterinário uma ferramenta segura para apoio ao gerenciamento de qualidade dos produtos destinados à alimentação da tropa do Exército Brasileiro.

The study proposed the development of a computerized platform to support the inspection management and laboratory analysis of animal products supplied to the Brazilian Army troops. The applied research corresponds to the modality of technological production in three phases. Phase I consisted in survey from Fiscal Report Files of animal products, which was printed and issued by the FIBL (Food Inspection and Bromatology Laboratory) from the 12th Supply Battalion, from January to November 2021, and the Brazilian Army's Technical Bulletins (BT30.404-EB) Files. Phase II corresponded to design and development of the "Food Platform - Guaranteed Traceability and Reliability". All the developed programming stored at an outsourced web server by accessing the FIBLS through the link: www.pmppa.com.br/alimentar. The supportive computerized platform used the PHP (Hypertext Preprocessor) language associated with the CSS (Cascading Style Sheet), HTML (Hyper Text Markup Language), JS (Java script) and bootstrap. Phase III consisted in performing a Black Box testing. The available modules for information inclusion in the system are the following issues: "Animal products registration"; "Analyses release"; "Technical Bulletin registration" and "Reports", which allow attributing the satisfactory or unsatisfactory quality to the animal products providing safe consumption for the troops, according to the evaluation of laboratory samples. The platform was effectively developed, guaranteeing the veterinary officer a safe tool to support the quality management of products intended for feeding the Brazilian Army troops.

Citrus orchards under formation evaluated by UAV-Based RGB Imagery

Few studies have investigated the biometric attributes of citrus orchards under formation that use RGB sensors on board unmanned aerial vehicles (UAV) and the challenges are great. This study aimed to develop and validate a method of using aerial UAV images by automated routines to evaluate the biometric attributes of a crop of 'Tahiti' acid lime under formation. We used a multirotor UAV, programmed to capture images at three different map scales, with a frontal and side overlap of 80 %. Geoprocessing was carried out both with and without ground control points on each scale. An automated routine was developed in an open-source environment, consisting of three processing phases: i) Estimation of the plant biometric attributes, ii) Statistical analysis, and iii) Statistical Report Map (SRM). The use of the developed routine allowed to delimit and estimate the crown projection area with an accuracy of more than 95 % as well as identify and quantify the plants with an accuracy of over 97 %. The use of ground control points during the processing stage does not increase accuracy in estimating the biometric attributes under evaluation. On the other hand, map scale is strongly correlated with the quality of the estimates, especially plant height. The results allowed to define a method for the acquisition and analysis of aerophotogrammetric data using a UAV, which can be used to measure the plant biometric attributes under analysis and the method can be easily adapted to perennial crops.

Economic impact of chronic pleural lesions and consequent disqualification of carcasses for export during inspection in swine slaughterhouses / Impacto econômico de lesões pleurais crônicas e consequente desqualificação de carcaças para exportação durante inspeção em frigoríficos de suínos

Chronic pleuritis is the main reason for sending pig carcasses to the Department of Final Inspection (DIF), condemnation and led to economic losses to industries and producers. Most pleura lesions detected after slaughter are sequelae from bacterial infections by agents that do not pose risks to pork consumers. The objective of the present study was to generate science-based information for decision making in the evaluation and destination of chronic pleuritis by the Federal Inspection Service (SIF). Therefore, 200 carcasses, with and without pleurisy, from a swine slaughterhouse with SIF were assessed following the visual classification of the inspection agent. The study was carried out in two stages. In stage 1, 50 carcasses with pneumonic lesions adjacent to chronic pleuritis and 50 carcasses with only chronic pleuritis lesions were evaluated, through macroscopy, histopathology, and bacterial culture. In stage 2, 50 swine carcasses with chronic pleuritis and 50 without this lesion were sampled in the parietal pleura region to bacterial culture and PCR. The economic impact of not exporting these carcasses with chronic pleuritis was also assessed. Considering the stages of evolution of the lesions, the macroscopic examination showed high correlation with the histological examination. There was no bacterial isolation through pleural swabs, regardless of the presence or not of adjacent pulmonary lesions. Isolation was restricted to the adjacent pulmonary lesions of 70% samples, with Pasteurella multocida type A found in 48% of them, followed by P. multocida type D and Streptococcus suis in 12%, and Actinobacillus pleuropneumoniae in 3%. Only Streptococcus suis DNA was detected in 5/100 samples, with no correspondence to the isolation of viable bacteria. The reliability demonstrated in the macroscopic evaluation carried out during inspection, the absence of viable bacteria in the chronic pleural lesions, and the negative economic impact suggest that carcasses with chronic pleuritis can be submitted to pleura removal, with no need of sending to DIF.

Pleurite crônica é a principal causa do desvio de carcaças de suínos para o Departamento de Inspeção Final (DIF), podendo causar condenação e prejuízos econômicos às indústrias e produtores. A maioria das lesões de pleura detectadas após o abate são sequelas de infecções bacterianas por agentes que não oferecem riscos aos consumidores de carne suína. O objetivo do presente estudo foi gerar informações científicas para a tomada de decisão na avaliação e destino da pleurite crônica pelo Serviço de Inspeção Federal (SIF). Para tanto, 200 carcaças, com e sem pleurisia, provenientes de um frigorífico de suínos com SIF foram avaliadas seguindo a classificação visual do agente fiscalizador. O estudo foi realizado em duas etapas. No estágio 1, 50 carcaças com lesões pneumônicas adjacentes à pleurite crônica e 50 carcaças apresentando somente lesões de pleurite crônica foram avaliadas macroscopicamente, por histopatologia e cultura bacteriana. No estágio 2, 50 carcaças suínas com pleurite crônica e 50 sem esta lesão foram amostradas na região da pleura parietal para cultura bacteriana e PCR. O impacto econômico de não exportar essas carcaças com pleurite crônica também foi avaliado. Considerando os estágios de evolução das lesões, o exame macroscópico apresentou alta correlação com o exame histológico. Não houve isolamento bacteriano por meio de swabs pleurais, independentemente da presença ou não de lesões pulmonares adjacentes. O isolamento foi restrito às lesões pulmonares adjacentes de 70% das amostras, sendo Pasteurella multocida tipo A encontrado em 48% delas, seguido por P. multocida tipo D e Streptococcus suis em 12%, e Actinobacillus pleuropneumoniae em 3%. Apenas DNA de Streptococcus suis foi detectado em 5/100 amostras, sem correspondência com o isolamento de bactérias viáveis. A confiabilidade demonstrada na avaliação macroscópica realizada durante a inspeção, a ausência de bactérias viáveis nas lesões pleurais crônicas e o impacto econômico negativo sugerem que carcaças com pleurite crônica podem ser submetidas à remoção da pleura, sem necessidade de envio para DIF.

Comparación de los valores de glucosa en caninos obtenidos con glucómetros portátiles y la prueba estándar de laboratorio / Comparação dos valores de glicose em caninos obtidos com glicômetros portáteis e o teste laboratorial padrão / Comparison of glucose values in dogs obtained with portable glucometers and the standard laboratory test

La medición de glucosa en caninos es un procedimiento habitual en la clínica diaria, actualmente este valor se puede obtener mediante dispositivos portátiles y pruebas laboratoriales. Se realizó esta investigación con el fin de aportar mayor conocimiento sobre la importancia de la medición de glucosa, ya que en los últimos años ha perdido valor entre las pruebas hematológicas a considerar debido a que solo se relaciona con determinadas patologías como la diabetes u otras enfermedades metabólicas. El presente trabajo tiene como objetivo comparar los valores de glucosa en caninos obtenidos mediante un glucómetro portátil de uso humano (Accu-chek® Active, Roche Diagnostic, Mannheim, Alemania); veterinario (aLcose® Vet Glu, jjPlus Corporation, New Taipei, Taiwán) y la prueba estándar de laboratorio, esto nos indicará la fiabilidad de los resultados obtenidos mediante estos métodos. Se realizó la toma de muestras de sangre de 50 caninos clínicamente sanos, de los cuales se obtuvo el resultado de glucemia mediante estos tres métodos. Los resultados de nuestra investigación evidenciaron que las tres formas de evaluación de la glucosa sanguínea en perros brindaban resultados estadísticamente diferentes (p < 0.05). Se obtuvo valores de glucosa diferentes entre los tres métodos de medición, teniendo como promedios finales 84.14 mg/dL, 101.12 mg/dL y 91.12 mg/dL correspondientes al glucómetro portátil de uso humano, veterinario y a la prueba estándar de laboratorio respectivamente. En conclusión, los glucómetros portátiles de uso humano subestiman los valores reales de glucosa, mientras que los de uso veterinario lo sobreestiman, comparados con la prueba estándar de laboratorio.

A medição de glicose nos cães é um procedimento habitual realizado no atendimento clínico. Atualmente este valor pode ser obtido por meio de dispositivos portáteis e testes laboratoriais. Esta pesquisa foi realizada com a finalidade de destacar a importância da medição de glicose, visto que nos últimos anos esta avaliação não tem sido muito valorada entre os testes hematológicos, sendo considerada relevante apenas em relação a patologias como a diabetes e outras doenças metabólicas. O presente estudo teve como objetivo comparar os valores de glicose em cães obtidos com glicômetro portátil de uso humano; veterinário e o teste padrão de laboratório. Esta comparação poderá indicar a confiabilidade dos resultados obtidos mediante os métodos avaliados. Foi realizada a amostragem do sangue de 50 caninos clinicamente sadios os quais foram submetidos a avaliação de glicose mediante os três métodos. Os resultados de nossa investigação evidenciaram que as três formas de avaliação da glicose sanguínea têm resultados estatisticamente diferentes (p < 0,05). Os valores de glicose tiveram medias finais de 84,14 mg/dL, 101,12 mg/dL e 91,12 mg/dL para o glicômetro portátil de uso humano (Accu-chek® Active, Roche Diagnostic, Mannheim, Alemanha), veterinário (aLcose® Vet Glu, jjPlus Corporation, Nova Taipei, Taiwan) e o teste padrão de laboratório, respectivamente. Ao concluir, os glicômetros portáteis de uso humano subestimam os valores reais de glicose e os de uso veterinário os superestimam quando comparados com o teste padrão de laboratório.

The measurement of glucose in canines is a common procedure in daily clinical practice. Currently this value can be obtained by use of portable devices and laboratory tests. This research was carried out in order to provide more knowledge about the importance of glucose measurement, since in recent years it has lost value among the hematological tests to be considered because it is only related to certain pathologies such as diabetes or other metabolic diseases. The present study aimed to compare the glucose values in dogs obtained with a portable glucometer for human use, veterinarian use, and the standard laboratory test. This comparison may indicate the reliability of the results obtained through the evaluated methods. A blood sampling of 50 clinically healthy canines was taken and submitted to glucose evaluation using the three methods. Our investigation showed that the three ways of assessing blood glucose have statistically different results (p < 0.05). Glucose values had final averages of 84.14 mg/dL, 101.12 mg/dL, and 91.12 mg/dL for the portable glucometer for human use (Accu-chek® Active, Roche Diagnostic, Mannheim, Germany), veterinary (aLcose® Vet Glu, jjPlus Corporation, New Taipei, Taiwan) and the standard laboratory test, respectively. In conclusion, portable glucometers for human use underestimate the glucose values, and those for veterinary use overestimate them compared to the standard laboratory test.

Development and validation of a simulator for teaching minimally invasive thoracic surgery in Brazil

ABSTRACT Purpose To develop and validate a chest cavity simulator for teaching video-assited thoracic surgery (VATS). Methods The first phase of the study consisted of developing a chest cavity simulator. A quasi-experimental study was performed in the second phase, and 25 surgeons and residents participated in a three-stage pulmonary suture experiment. The videos were recorded and timed. Generalized linear regression models for repeated measures were used to analyze the outcome change over time. Results The chest cavity simulator consists of a console simulating the left hemithorax. Among the participants, 96% rated the design, visual aspect, positioning ergonomics, and triangulation of the portals as very good or excellent (face validity). There was a decrease in suturing time in step 1 from 435.7 ± 105 to 355.6 ± 76.8 seconds compared to step 3 (p = 0.001). The evaluation of the simulation effectiveness and performance (content validity) was rated as very good or excellent by 96% ofparticipants. The most experienced surgeon showed significant reduction in procedure time (p = 0.021) (construct validity). Conclusions The thoracic cavity simulator is realistic, showing content and construct validity, and can be used in VATS training. The simulation model allowed skill gain in the endoscopic suture.

Integrative taxonomy: combining molecular and morphological characteristics to identify Lymnaea (Galba) cubensis, intermediate host of Fasciola hepatica / Taxonomia integrativa: combinando características moleculares e morfológicas para identificar Lymnaea (Galba) cubensis, hospedeiro intermediário de Fasciola hepatica

Abstract Despite the epidemiological importance of the Lymnaeidae family regarding transmission of Fasciola hepatica, knowledge about the diversity and distribution of these molluscs and the role of each species in the expansion of fasciolosis remains sparse. Classical morphological (n=10) identification was performed in lymneids from Lagoa Santa, a municipality in the state of Minas Gerais, Brazil, along with molecular and phylogenetic analysis (n=05) based on the partial nucleotide sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene (COI mtDNA) and ribosomal internal transcribed spacer II (ITS-2 rDNA). The shell morphology made it possible to distinguish the lymneids of Lagoa Santa from Pseudosuccinea columella. Differences found in the penile complex and prostate shape allowed this species to be distinguished from Galba truncatula. However, the homogeneity of reproductive tract characteristics among Lymnaea (Galba) cubensis, L. viator and L. neotropica confirmed that these characteristics show low taxonomic reliability for identifying cryptic species. Genetic divergence analysis for the COI mtDNA gene and ITS-2 region of rDNA revealed greater similarity to Lymnaea (Galba) cubensis. Thus, correct species differentiation is important for monitoring the epidemiological risk of fasciolosis in the state of Minas Gerais, where cases of the disease have increased over recent years.

Resumo Apesar da importância epidemiológica da família Lymnaeidae na transmissão de Fasciola hepatica, o conhecimento sobre a diversidade e a distribuição desses moluscos e o papel de cada espécie, na expansão da fasciolose, ainda é escasso. Realizou-se a identificação morfológica clássica (n=10) em limneídeos de Lagoa Santa, município do estado de Minas Gerais, Brasil, juntamente com a análise molecular e filogenética (n=05), baseada nas sequências parciais de nucleotídeos do gene mitocondrial da subunidade I do citocromo c oxidase (COI mtDNA) e espaçador interno, transcrito do DNA ribossomal II (ITS-2 rDNA). A morfologia da concha possibilitou distinguir os limneídeos de Lagoa Santa de Pseudosuccinea columella. As diferenças encontradas no complexo peniano e na forma da próstata permitiram que essa espécie fosse distinta de Galba truncatula. No entanto, a homogeneidade das características do trato reprodutivo entre Lymnaea (Galba) cubensis, L. viator e L. neotropica confirmou que essas características apresentam baixa confiabilidade taxonômica para a identificação de espécies crípticas. A análise da divergência genética para o gene COI mtDNA e região ITS-2 do rDNA revelou maior similaridade entre os limneídeos de Lagoa Santa com Lymnaea (Galba) cubensis.

Accuracy and reliability of two body weight estimators based on linear measurements in horses / Acurácia e confiabilidade de dois estimadores de peso corporal baseados em mensurações lineares em equídeos

Estimation methods are routinely used to determine the body weight of a horse when a scale is not available. However, it is important to evaluate the accuracy and reliability of these predictions since nutritional management and drug dosage, among others, require knowledge of the animal’s weight. The objective of this study was to evaluate the accuracy and reliability of estimated weights of horses using two prediction models, and to discuss the effect of the predictions on animal management. Seventy-one adult male animals (40 mules and 31 horses) were weighed on a precision scale (control weight). Chest circumference and body length were measured and used to estimate body weight using the two models. Accuracy was evaluated by analysis of fit indices, comparison of squared prediction errors, delta Akaike’s information criterion, and decomposition of the mean squared error of prediction. For economic evaluation, three production scenarios were established: simple (worming + forage), traditional (worming + forage + concentrate mixture), and traditional with supplementation (worming + forage + concentrate mixture + supplementation). Economic values were collected through a pricing survey carried out in the Midwest region of Brazil and converted to US dollars. Percent differences in costs were evaluated using Fisher’s exact test. The most suitable model for the morphometric profile of the animals was that using a combination of chest circumference and body length. The differences in economic values between production scenarios were significant (P<0.05). Losses using the inadequate model are 10% higher compared to control; thus, in a facility with 20 equids that uses this model, the losses are ≈ US$ 10,000/year. When investment in a scale is not possible, it is fundamental to evaluate which model is more compatible with the body biotype of the herd since all types of management that depend on the body weight of the animals may result in significant economic losses.

Estimativas para determinar o peso corporal de um equino são rotineiramente usadas quando uma balança não está disponível. Todavia, é fundamental realizar um diagnóstico da acurácia e confiabilidade das predições destes estimadores, pois o manejo nutricional, dosificação de fármacos, entre outros, exigem o conhecimento do peso. Assim, objetivou-se avaliar a acurácia e confiabilidade de predições de peso estimado de equídeos utilizando dois modelos de cálculos e discutir o reflexo das predições no manejo dos animais. Foram pesados 71 equídeos machos (40 Muares e 31 Equinos) com idade adulta, em balança de precisão (peso controle). Medidas de perímetro torácico e comprimento corporal foram realizadas e utilizadas para estimar o peso corporal usando os modelos. A acurácia foi avaliada via análise do índice de adequação, comparação entre o quadrado do erro de predição, critério de informação Delta Akaike's e decomposição do erro quadrático médio da predição. Para avaliação econômica, criaram-se três cenários de produção: simples (vermifugação + volumoso), tradicional (vermifugação + volumoso + concentrado) e tradicional com suplementação (vermifugação + volumoso + concentrado + suplementação). Valores econômicos foram verificados em pesquisa de preço na região Centro Oeste do Brasil e convertidos em dólar. Avaliou-se as diferenças de percentagem dos custos utilizando teste de Fisher. O modelo mais adequado para o perfil morfométrico dos animais foi o que usa combinação entre perímetro torácico e comprimento corporal. Foram significativas (P<0,05) as diferenças para os valores econômicos nos cenários de produção. Prejuízos usando o modelo inadequado são 10% superiores em relação ao controle, assim em um estabelecimento com 20 equídeos que usa este modelo, os prejuízos são ≈ 10 mil dólares/ano. Na ausência da balança, é fundamental avaliar qual modelo de cálculo será mais compatível com biotipo corporal do rebanho, pois todo tipo de manejo que depende do peso corporal dos animais, pode gerar prejuízos econômicos significativos.

Accuracy and reliability of two body weight estimators based on linear measurements in horses / Acurácia e confiabilidade de dois estimadores de peso corporal baseados em mensurações lineares em equídeos

Estimation methods are routinely used to determine the body weight of a horse when a scale is not available. However, it is important to evaluate the accuracy and reliability of these predictions since nutritional management and drug dosage, among others, require knowledge of the animals weight. The objective of this study was to evaluate the accuracy and reliability of estimated weights of horses using two prediction models, and to discuss the effect of the predictions on animal management. Seventy-one adult male animals (40 mules and 31 horses) were weighed on a precision scale (control weight). Chest circumference and body length were measured and used to estimate body weight using the two models. Accuracy was evaluated by analysis of fit indices, comparison of squared prediction errors, delta Akaikes information criterion, and decomposition of the mean squared error of prediction. For economic evaluation, three production scenarios were established: simple (worming + forage), traditional (worming + forage + concentrate mixture), and traditional with supplementation (worming + forage + concentrate mixture + supplementation). Economic values were collected through a pricing survey carried out in the Midwest region of Brazil and converted to US dollars. Percent differences in costs were evaluated using Fishers exact test. The most suitable model for the morphometric profile of the animals was that using a combination of chest circumference and body length. The differences in economic values between production scenarios were significant (P<0.05). Losses using the inadequate model are 10% higher compared to control; thus, in a facility with 20 equids that uses this model, the losses are ≈ US$ 10,000/year. When investment in a scale is not possible, it is fundamental to evaluate which model is more compatible with the body biotype of the herd since all types of management that depend on the body weight of the animals may result in significant economic losses.(AU)

Estimativas para determinar o peso corporal de um equino são rotineiramente usadas quando uma balança não está disponível. Todavia, é fundamental realizar um diagnóstico da acurácia e confiabilidade das predições destes estimadores, pois o manejo nutricional, dosificação de fármacos, entre outros, exigem o conhecimento do peso. Assim, objetivou-se avaliar a acurácia e confiabilidade de predições de peso estimado de equídeos utilizando dois modelos de cálculos e discutir o reflexo das predições no manejo dos animais. Foram pesados 71 equídeos machos (40 Muares e 31 Equinos) com idade adulta, em balança de precisão (peso controle). Medidas de perímetro torácico e comprimento corporal foram realizadas e utilizadas para estimar o peso corporal usando os modelos. A acurácia foi avaliada via análise do índice de adequação, comparação entre o quadrado do erro de predição, critério de informação Delta Akaike's e decomposição do erro quadrático médio da predição. Para avaliação econômica, criaram-se três cenários de produção: simples (vermifugação + volumoso), tradicional (vermifugação + volumoso + concentrado) e tradicional com suplementação (vermifugação + volumoso + concentrado + suplementação). Valores econômicos foram verificados em pesquisa de preço na região Centro Oeste do Brasil e convertidos em dólar. Avaliou-se as diferenças de percentagem dos custos utilizando teste de Fisher. O modelo mais adequado para o perfil morfométrico dos animais foi o que usa combinação entre perímetro torácico e comprimento corporal. Foram significativas (P<0,05) as diferenças para os valores econômicos nos cenários de produção. Prejuízos usando o modelo inadequado são 10% superiores em relação ao controle, assim em um estabelecimento com 20 equídeos que usa este modelo, os prejuízos são ≈ 10 mil dólares/ano. Na ausência da balança, é fundamental avaliar qual modelo de cálculo será mais compatível com biotipo corporal do rebanho, pois todo tipo de manejo que depende do peso corporal dos animais, pode gerar prejuízos econômicos significativos.(AU)

Sequence analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region of rDNA for identifying Trichogramma species and evaluating genetic diversity / Análise de sequência do rDNA da região espaçadora do transcrito interno 2 (ITS2) para identificar espécies de Trichogramma e avaliar a diversidade genética

Species of Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammtidae) are frequently used as biological control agents against Lepidoptera, but practical application of these egg endoparasitoids are complicated because of their complex taxonomy. This study aimed to compare sequences of internal transcribed spacer regions of ribosomal DNA (ITS2-rDNA) of Trichogramma accessions with those deposited in GenBank in order to access the reliability of the ITS2 as a barcode for discriminating species and evaluating the genetic diversity. ITS2-rDNA sequences obtained from seventeen specimens of Trichogramma confirmed previous identifications based on morphological characteristics. Multiple sequence alignment revealed the existence of highly conserved regions in ITS2 sequences while the neighbour-joining dendrogram indicated that the specimens formed three clusters comprising T. manicobai and T. marandobai (group I), T. galloi (group II) and T. pretiosum (group III). The ITS2 marker was shown to be a powerful DNA barcode for discriminating Trichogramma species and could be used to complement the morphological approach.(AU)

Espécies de Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammatidae) são freqüentemente usadas como agentes de controle biológico contra Lepidoptera, esses endoparasitóides de ovos apresentam taxonomia complexa, o que dificulta sua aplicação prática. Este estudo teve como objetivo comparar seqüências de regiões espaçadoras internas transcritas de DNA ribossômico (ITS2-rDNA) de acessos de Trichogramma com aquelas depositadas no GenBank, a fim de avaliar a confiabilidade do ITS2 barcode para discriminar espécies e avaliar a diversidade genética. As seqüências de ITS2-rDNA obtidas de dezessete espécimes de Trichogramma confirmaram identidades anteriores com base em características morfológicas. O alinhamento de múltiplas sequências revelou a existência de regiões altamente conservadas nas sequências ITS2, enquanto o dendrograma indicou que os espécimes formavam três grupos compreendendo T. manicobai e T. marandobai (grupo I), T. galloi (grupo II) e T. pretiosum (grupo III). O marcador ITS2 mostrou ser um poderoso DNA barcode para discriminar espécies de Trichogramma podendo ser usado como complemento da abordagem morfológica.(AU)

Models for optimizing selection based on adaptability and stability of cotton genotypes / Modelos para otimizar a seleção baseada em adaptabilidade e estabilidade de genótipos de algodão

In multi-environment trials (MET), large networks are assessed for results improvement. However, genotype by environment interaction plays an important role in the selection of the most adaptable and stable genotypes in MET framework. In this study, we tested different residual variances and measure the selection gain of cotton genotypes accounting for adaptability and stability, simultaneously. Twelve genotypes of cotton were bred in 10 environments, and fiber length (FL), fiber strength (FS), micronaire (MIC), and fiber yield (FY) were determined. Model selection for different residual variance structures (homogeneous and heterogeneous) was tested using the Akaike Information Criterion (AIC) and Bayesian Information Criterion (BIC). The variance components were estimated through restricted maximum likelihood and genotypic values were predicted through best linear unbiased prediction. The harmonic mean of relative performance of genetic values (HMRPGV) were applied for simultaneous selection for adaptability, stability, and yield. According to BIC heterogeneous residual variance was the best model fit for FY, whereas homogeneous residual variance was the best model fit for FL, FS, and MIC traits. The selective accuracy was high, indicating reliability of the prediction. The HMRPGV was capable to select for stability, adaptability and yield simultaneously, with remarkable selection gain for each trait.(AU)

Em ensaios multi-ambientes, grandes redes experimentais são utilizadas para a avaliação de genótipos, tentando contornar o efeito que a interação genótipo por ambiente desempenha na seleção genotípica. Neste estudo, objetivamos testar diferentes estruturas de variância residual e medir o ganho de seleção de genótipos de algodão, baseados em produtividade, adaptabilidade e estabilidade, simultaneamente. Doze genótipos de algodão foram plantados em 10 ambientes, sendo determinados o comprimento da fibra (CF), a resistência da fibra (RF), a micronaire (MIC) e produtividade de fibras (PF). A seleção do modelo para diferentes estruturas de variância residual (homogênea e heterogênea) foi testada usando o Critério de Informação de Akaike (AIC) e o Critério de Informação Bayesiano (BIC). Os componentes de variância foram estimados através de máxima verossimilhança restrita e os valores genotípicos foram preditos através da melhor predição linear não viesada. A média harmônica do desempenho relativo dos valores genéticos (HMRPGV) foram aplicadas para seleção simultânea para adaptabilidade, estabilidade e produtividade. De acordo com o BIC, a estrutura residual heterogênea apresentou o melhor ajuste para a característica PF, enquanto a estrutura residual homogênea apresentou o melhor ajuste para as características CF, RF e MIC. A acurácia seletiva foi alta, indicando confiabilidade da predição. O método HMRPGV foi capaz de selecionar para estabilidade, adaptabilidade e produtividade, simultaneamente, com notável ganho de seleção para cada característica.(AU)

Producción de leche real vs la calculada a partir de la ENL estimada por el algoritmo de análisis de imágenes red-green-blue de gramíneas / Produção real de leite vs produção de leite calculada a partir da energía líquida de lactação estimada pelo algoritmo para análise de imagens vermelho-verde-azul de gramíneas

Knowledge about the net lactation energy (NLE) contained in the dry matter of grasses is necessary to make decisions about forage and the balance of diets for grazing cattle. Its determination is made in laboratories using wet or dry chemistry methods, which are costly, delayed, and sometimes present sampling- or process-related reliability problems. An algorithm, which analyzes the red-green-blue (RGB) images of grasses taken by drone, has been developed as a technological alternative. This has allowed us estimating the NLE level, reducing costs, and changing the sampling system and analysis method. The objective of the present study was to compare the milk production, which was calculated from the NLE and estimated using the algorithm for analysis of RGB images of grasses (included in the TaurusWebs® software), vs the actual milk production. The study was conducted in 15 dairy farms belonging to the dairy control system of the Colácteos dairy cooperative, which are located in the upper tropical region (Department of Nariño, Colombia). The prairies evaluated were composed of mixtures of Kikuyo (Pennisetum clandestinum), Raigrás (Lolium spp), and False Poa (Holcus lanatus). The result was analyzed using a linear regression model (R²=0.86; R=0.93). In the Student´s t-test, the actual and estimated milk production averages were equal (P>0.05). In conclusion, the NLE calculated using the algorithm satisfactorily explains the study livestock production, and the information generated by the algorithm can be used to calculate the NLE of grasses.(AU)

O conhecimento sobre a energia líquida de lactação (NLE) contida na matéria seca das gramíneas é necessário para a tomada de decisões sobre forragem e o equilíbrio das dietas para pastagem. Sua determinação é feita em laboratórios usando métodos de química úmida ou seca, que são dispendiosos, atrasados e às vezes apresentam problemas de confiabilidade relacionados a amostras ou processos. Um algoritmo, que avalia as imagens vermelho-verde-azul (RGB) de gramíneas tiradas por drone, foi desenvolvido como uma alternativa tecnológica. Isso nos permitiu estimar o nível de NLE, reduzir custos e alterar o sistema de amostragem e o método de análise. O objetivo do presente estudo foi comparar a produção de leite, calculada a partir do NLE e estimada usando o algoritmo para análise de imagens RGB de gramíneas (incluídas no software TaurusWebs®) versus a produção real de leite. O estudo foi realizado em 15 fazendas leiteiras pertencentes ao sistema de controle de laticínios da cooperativa de laticínios Colácteos, localizada na região tropical superior (Departamento de Nariño, Colômbia). As pradarias avaliadas foram compostas por misturas de Kikuyo (Pennisetum clandestinum), Raigrás (Lolium spp) e False Poa (Holcus lanatus). O resultado foi analisado usando um modelo de regressão linear (R² = 0,86; R = 0,93). No teste t de Student, as médias reais e estimadas de produção de leite foram iguais (P> 0,05). Em conclusão, o NLE calculado usando o algoritmo explica satisfatoriamente a produção animal estudada, e as informações geradas pelo algoritmo podem ser usadas para calcular o NLE das gramíneas.(AU)

Soybean productivity, stability, and adaptability through mixed model methodology / Produtividade, estabilidade e adaptabilidade da soja por meio de metodologia de modelo misto

The genotype × environment (G×E) interaction plays an essential role in phenotypic expression and can lead to difficulties in genetic selection. Thus, the present study aimed to estimate genetic parameters and to compare different selection strategies in the context of mixed models for soybean breeding. For this, data referring to the evaluation of 30 genotypes in 10 environments, regarding the grain yield trait, were used. The variance components were estimated through restricted maximum likelihood (REML) and genotypic values were predicted through best linear unbiased prediction (BLUP). Significant effects of genotypes and G×E interaction were detected by the likelihood ratio test (LRT). Low genotypic correlation was obtained across environments, indicating complex G×E interaction. The selective accuracy was very high, indicating high reliability. Our results showed that the most productive soybean genotypes have high adaptability and stability.(AU)

A interação genótipo × ambiente (G × E) desempenha um papel essencial na expressão fenotípica e pode provocar dificuldades na seleção genética. Assim, o presente estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos e comparar diferentes estratégias de seleção no contexto de modelos mistos para melhoramento da soja. Para isso, foram utilizados dados referentes à avaliação de 30 genótipos em dez ambientes, referentes à característica produtividade de grãos. Os componentes de variância foram estimados pela máxima verossimilhança restrita (REML) e os valores genotípicos foram preditos pela melhor previsão imparcial linear (BLUP). Efeitos significativos dos genótipos e interação G × E foram detectados pelo teste da razão de verossimilhança (LRT). Correlação genotípica baixa foi obtida entre os ambientes indicando interação G × E do tipo complexa. A acurácia seletiva foi muito alta, indicando alta confiabilidade. Os resultados mostraram que os genótipos de soja mais produtivos apresentam alta adaptabilidade e estabilidade.(AU)

A standard area diagram set for assessing severity of eucalyptus bacterial blight caused by Erwinia psidii / Uma escala diagramática para a avaliação da severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii

This study aimed to develop and validate a standard area diagram (SAD) set to estimate the severity of bacterial blight of eucalyptus caused by Erwinia psidii. For this purpose, an eight-level SAD was developed and validated by ten inexperienced raters. Accuracy and precision of the estimates by each rater, with and without the SAD, were determined based on Lin's concordance correlation coefficient. The proposed SAD improved the accuracy and precision of the estimates. The SAD set studied here is a useful tool in assessments of bacterial blight of eucalyptus for epidemiological research and breeding programs.(AU)

Este trabalho objetivou o desenvolvimento de uma escala para estimar a severidade da seca-de-ponteiros do eucalipto causada por Erwinia psidii. Para isso, uma escala de oito níveis foi desenvolvida e validada por dez avaliadores inexperientes. A acurácia e precisão das estimativas de cada avaliador, com e sem a escala, foram determinadas baseadas no coeficiente de correlação concordante de Lin. A escala proposta melhorou a acurácia e a precisão das estimativas. A escala estudada se mostrou uma ferramenta útil na avaliação da seca-de-ponteiros do eucalipto para estudos epidemiológicos e em programas de melhoramento.(AU)