Meta-analysis of the experimental coefficient of variation in wheat using the Bayesian and Frequentist approaches

A large set of variables is assessed for progeny selection in a plant-breeding program and other agronomic fields. The meta-analysis of the coefficient of variation (CVe) produces information for researchers and breeders on the experimental quality of trials. This analysis can also be applied in the decision-making process of the experimental plan regarding the experimental design, the number of repetitions, and the treatments and plants/progenies to be measured. In this study, we evaluated the dataset distribution and the descriptive statistics of CVe through the Frequentist and Bayesian approaches, aiming to establish the credibility and confidence intervals. We submitted CVe data of ten wheat (Triticum aestivum L.) traits reported in 1,068 articles published to the Bayesian and Frequentist analyses. Sample data were analyzed via Gamma and normal models. We selected the model with the lowest Akaike Information Criterion (AIC) value, and then we tested three link functions. In the Bayesian analysis, uniform distributions were used as non-informative priors for the Gamma distribution parameters with three ranges of q~U (a,b,). Thus, the prior probability density function was given by: [formula] The Bayesian and Frequentist approaches with the Gamma model presented similar results for CVe; however, the range Bayesian credible intervals was narrower than the Frequentist confidence intervals. Gamma distribution fitted the CVe data better than the normal distribution. The credible and confidence intervals of CVe were successfully applied to wheat traits and could be used as experimental accuracy measurements in other experiments.(AU)

Components of farm milk price behavior in Brazil from 2005 to 2020

The objective of this study was to assess behavior patterns in Brazilian farm milk prices. We employed a structural time series techniques model, the Unobserved Component Model (UCM), which is part of the family of State Space models, to assess the trend, seasonality, cyclical behavior, and impacts of exogenous regressors on aggregated farm milk price behavior in Brazil from January 2005 to December 2019. We tested five alternative models with different regressors using the monthly national average prices of milk paid to farmers. The fit of the models was assessed with Akaike information criterion and Bayesian information criterion. Predictions were assessed by the root mean squared error (RMSE), mean absolute error (MAE), and mean absolute percentage error (MAPE). All models demonstrated a high degree of accuracy. Trends, seasonality, and two cycles were statistically significant, with the trend and long-period cycle contributing the most to price variation. Exogenous factors such as feed cost and international dairy product prices also had significant positive effects on the level of Brazil's farm milk prices. All models demonstrated a high degree of accuracy, which may indicate their usefulness for price forecasting and policy formulation.(AU)

Familywise type I error of ANOVA and ANOVA on ranks in factorial experiments / Erro tipo I familiar da ANOVA e da ANOVA on ranks em experimentos fatoriais

ABSTRACT: This research evaluated the importance of a preliminary general analysis of variance (ANOVA) in the interpretation of data from factorial experiments under total nullity. For this, we evaluated the familywise type I error rate (accumulated FWER) of the F test for the unfolding of factorial ANOVA and factorial ANOVA on ranks, which were compared with the FWER for the global effect of treatments. In addition, we evaluated the FWER of the Tukey's test under total nullity for factorial experiments in the presence or absence of preliminary ANOVA protection (omnibus F test). The study was conducted by simulating data from 2,000 experiments, which were separated into four representative agricultural research scenarios. For both the parametric factorial ANOVA and the non-parametric factorial ANOVA, the FWER significantly exceeded the nominal level of 5%, even under total nullity. While the tests that control the total FWER in the factorials are not being used, the factorial ANOVA should not be performed without the preliminary ANOVA F test showing a significant effect. This, of course, does not apply to tests that are not multiple comparisons, such as Bonferroni, Dunn-Sidak and others, which do not need ANOVA protection. The same recommendation applies to the factorial ANOVA on ranks.

RESUMO: Este trabalho teve como objetivo avaliar a importância da análise de variância (ANOVA) geral preliminar na interpretação dos dados de experimentos fatoriais sob nulidade total. Para isso, avaliou-se as taxas de erro tipo I familiar (FWER acumulada) do teste F para os componentes do desdobramento da ANOVA fatorial e da ANOVA fatorial on ranks, em comparação à FWER para o efeito global de tratamentos. Além disso, avaliou-se a FWER do teste de Tukey sob nulidade total para experimentos fatoriais na presença ou ausência da proteção da ANOVA preliminar (teste F global). O estudo foi conduzido a partir da simulação de dados de 2000 experimentos, separados em quatro cenários representativos da pesquisa agrícola. Tanto para a ANOVA fatorial paramétrica, quanto para a ANOVA fatorial não-paramétrica, as FWER ultrapassaram significativamente o nível nominal de 5%, mesmo sob nulidade total. Enquanto os testes que controlam a FWER total nos fatoriais não estiverem sendo utilizados, a ANOVA fatorial não deve ser realizada sem que o teste F da ANOVA preliminar acuse um efeito significativo. O mesmo, evidentemente, não se aplica aos testes que não são de comparações múltiplas, como Bonferroni, Dunn-Sidak e outros, que não precisam proteção da ANOVA. A mesma recomendação se aplica à ANOVA fatorial on ranks.

Mapping wood volume in seasonally dry vegetation of Caatinga in Bahia State, Brazil

The Caatinga biome in Brazil comprises the largest and most continuous expanse of the seasonally dry tropical forest (SDTF) worldwide; nevertheless, it is among the most threatened and least studied, despite its ecological and biogeographical importance. The spatial distribution of volumetric wood stocks in the Caatinga and the relationship with environmental factors remain unknown. Therefore, this study intends to quantify and analyze the spatial distribution of wood volume as a function of environmental variables in Caatinga vegetation in Bahia State, Brazil. Volumetric estimates were obtained at the plot and fragment level. The multiple linear regression techniques were adopted, using environmental variables in the area as predictors. Spatial modeling was performed using the geostatistical kriging approach with the model residuals. The model developed presented a reasonable fit for the volume m3 ha with r2 of 0.54 and Root Mean Square Error (RMSE) of 10.9 m3 ha­1. The kriging of ordinary residuals suggested low error estimates in unsampled locations and balance in the under and overestimates of the model. The regression kriging approach provided greater detailing of the global wood volume stock map, yielding volume estimates that ranged from 0.01 to 109 m3 ha­1. Elevation, mean annual temperature, and precipitation of the driest month are strong environmental predictors for volume estimation. This information is necessary to development action plans for sustainable management and use of the Caatinga SDTF in Bahia State, Brazil.(AU)

Artificial neural networks for the management of poultry industry: a simulation based on the broiler production chain / Redes neurais artificiais para o gerenciamento da indústria avícola: uma simulação baseada na cadeia de produção de frangos de corte

The aim of this study was to predict production indicators and to determine their potential economic impact on a poultry integration system using artificial neural networks (ANN) models. Forty zootechnical and production parameters from broiler breeder farms, one hatchery, broiler production flocks, and one slaughterhouse were selected as variables. The ANN models were established for four output variables: "saleable hatching", "weight at the end of week 5," "partial condemnation," and "total condemnation" and were analyzed in relation to the coefficient of multiple determination (R2), correlation coefficient (R), mean error (E), mean squared error (MSE), and root mean square error (RMSE). The production scenarios were simulated and the economic impacts were estimated. The ANN models were suitable for simulating production scenarios after validation. For "saleable hatching", incubator and egg storage period are likely to increase the financial gains. For "weight at the end of the week 5" the lineage (A) is important to increase revenues. However, broiler weight at the end of the first week may not have a significant influence. Flock sex (female) may influence the "partial condemnation" rates, while chick weight at first day may not. For "total condemnation", flock sex and type of chick may not influence condemnation rates, but mortality rates and broiler weight may have a significant impact.

O objetivo deste trabalho foi predizer os indicadores de produção e determinar o seu potencial impacto econômico em um sistema de integração utilizando as redes neurais artificiais (RNA). Quarenta parâmetros zootécnicos e de produção de granjas de matrizes e de frango de corte, um incubatório e um abatedouro foram selecionados como variáveis. Os modelos de RNA foram estabelecidos para quatro variáveis de saída ("eclosão vendável", "peso ao final da quinta semana", "condenações parciais" e "condenações totais") e foram analisados em relação ao coeficiente de determinação múltipla (R2), coeficiente de correlação (R), erro médio (E), erro quadrático médio (EQM) e raiz do erro quadrático médio (REQM). Os cenários produtivos foram simulados e os impactos foram estimados. Os modelos de RNA gerados foram adequados para simular diferentes cenários produtivos após o treinamento. Para "eclosão vendável", o modelo de incubadora e o período de incubação aumentaram os ganhos financeiros. Para "peso ao final da quinta semana", a linhagem também demonstrou influencia no retorno financeiro, o que não aconteceu com o peso ao final da primeira semana. O sexo do lote possui influência nas taxas de "condenação parcial", ao contrário do peso do frango no primeiro dia. As taxas de mortalidade e o peso do frango apresentaram influência na "condenação total", mas o sexo do lote e o tipo de pinto não tiverem influência.

Payment for ecosystem services (PES): a holistic tool for sustainable forest management-a case study from Pakistan

Abstract Economic valuation of ecosystem services is a new concept in forest management. Economic valuation provides basis for payment for ecosystem services (PES). Therefore, objective of this study was to evaluate eco-tourism and carbon stock services of the Maindam valley, District Swat, Pakistan. For the carbon stock calculation, a sample size of 155 plots of 0.1 hectare (Ha) was taken using preliminary survey at 95% confidence interval and 10% allowable error. The data for tourism services was collected from owners of all the hotels, 100 tourists and key informants of the area at 10% sampling intensity on pretested questionnaire for twenty years period (1997-2017). Results showed that Miandam valley has carbon stock worth US$ 16,306,000 while the value of eco-tourism was US$ 1,578,458 on annual basis. The results also showed that trend of tourism has drastically declined after the 9/11 incident for foreigners and locals and the situation was further deteriorated during the era of Talibanization or militancy from 2008-2011. This study recommends implementation of PES strategy at the rate of 5%, thus a total of US$ 78,922 can be earned from eco-tourism and carbon crediting in the study area annually, which could play important role in sustainable forest management.

Resumo A valoração econômica dos serviços ecossistêmicos é um novo conceito no manejo florestal. A avaliação econômica fornece base para o pagamento por serviços ecossistêmicos (PES). Portanto, o objetivo deste estudo foi avaliar o ecoturismo e os serviços de estoque de carbono do vale de Miandam, distrito Swat, Paquistão. Para o cálculo do estoque de carbono, um tamanho de amostra de 155 parcelas de 0,1 hectare (ha) foi tirado, usando pesquisa preliminar com intervalo de confiança de 95% e erro admissível de 10%. Os dados para serviços de turismo foram coletados de proprietários de todos os hotéis, 100 turistas e informantes-chave da área em 10% de intensidade de amostragem em questionário pré-testado para um período de 20 anos (1997-2017). Os resultados mostraram que o vale de Miandam tem estoque de carbono no valor de US$ 16.306.000, enquanto o valor do ecoturismo foi de US$ 1.578.458 anualmente. Os resultados também mostraram que a tendência do turismo diminuiu drasticamente para estrangeiros e locais após o incidente de 11 de Setembro, e a situação se agravou ainda mais durante a era da talibanização ou militância de 2008-2011. Este estudo recomenda a implementação da estratégia de PES na taxa de 5%, portanto um total de US$ 78.922 pode ser ganho com ecoturismo e crédito de carbono na área de estudo anualmente, o que pode desempenhar um papel importante no manejo florestal sustentável.

Mathematical models to describe the growth curves of Vietnamese Ri chicken

Abstract Ri chicken is the most popular backyard chicken breed in Vietnam, but little is known about the growth curve of this breed. This study compared the performances of models with three parameters (Gompertz, Brody, and Logistic) and models containing four parameters (Richards, Bridges, and Janoschek) for describing the growth of Ri chicken. The bodyweight of Ri chicken was recorded weekly from week 1 to week 19. Growth models were fitted using minpack.lm package in R software and Akaikes information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), and root mean square error (RMSE) were used for model comparison. Based on these criteria, the models having four parameters showed better performance than the ones with three parameters, and the Richards model was the best one for males and females. The lowest and highest value of asymmetric weights () were obtained by Bridges and Brody models for each of sexes, respectively. Age and weight estimated by the Richard model were 8.46 and 7.51 weeks and 696.88 and 487.58 g for males and for females, respectively. Differences in the growth curves were observed between males and female chicken. Overall, the results suggested using the Richards model for describing the growth curve of Ri chickens. Further studies on the genetics and genomics of the obtained growth parameters are required before using them for the genetic improvement of Ri chickens.

Resumo O frango Ri é a raça de frango de quintal mais popular do Vietnã, mas pouco se sabe sobre a curva de crescimento dessa raça. Este estudo comparou o desempenho de modelos com três parâmetros (Gompertz, Brody e Logistic) e modelos contendo quatro parâmetros (Richards, Bridges e Janoschek) para descrever o crescimento do frango Ri. O peso corporal do frango Ri foi registrado semanalmente da semana 1 à semana 19. Os modelos de crescimento foram ajustados usando o pacote minpack.lm no software R e o critério de informação de Akaike (AIC); critério de informação bayesiano (BIC) e erro quadrático médio (RMSE) foram usados para comparação de modelos. Com base nesses critérios, os modelos com quatro parâmetros apresentaram melhor desempenho do que os com três parâmetros, sendo o modelo de Richards o melhor para homens e mulheres. O menor e o maior valor dos pesos assimétricos () foram obtidos pelos modelos Bridges e Brody para cada um dos sexos, respectivamente. A idade e o peso estimados pelo modelo de Richard foram de 8,46 e 7,51 semanas e 696,88 e 487,58 g para homens e mulheres, respectivamente. Diferenças nas curvas de crescimento foram observadas entre frangos machos e fêmeas. No geral, os resultados sugeriram o uso do modelo de Richards para descrever a curva de crescimento de frangos Ri. Mais estudos sobre a genética e genômica dos parâmetros de crescimento obtidos são necessários antes de usá-los para o melhoramento genético de frangos Ri.

Accuracy evaluation of two portable blood glucose meters in feline patients using whole blood samples / Avaliação da acurácia de dois glicosímetros portáteis em amostras de sangue total de pacientes felinos

ABSTRACT: Using portable blood glucose meters (PBGMs) to measure blood glucose (BG) concentration is a common procedure in veterinary practice. Our objective was to evaluate the analytical and clinical accuracy of a human PBGM (Accu-Chek Performa®), (AC) and a veterinary PBGM (GlucoCalea®), (GC) in feline patients. Central venous blood samples were collected from 48 cats at a Brazilian Veterinary teaching hospital. Two devices from each model were used and compared to a reference method (RM). Analytical accuracy was assessed according to ISO 15197:2013 requirements for human PBGMs. Data were compared using Wilcoxon's nonparametric test and represented by Bland-Altman plots. Hematocrit's effect on BG measurements was evaluated by the Spearman correlation coefficient. Clinical accuracy was determined using error grid analysis (EGA). Values of BG were significantly higher in all PBGMs compared to the RM. Although ISO's analytical accuracy requirements could not be met by any of the devices, AC meters were more accurate than GC meters. All AC measurements - but not GC ones - were within zones A and B of the EGA, meeting ISO requirements for clinical accuracy. Significant hematocrit interference was observed in all devices. Therefore, AC showed greater accuracy compared to GC using feline whole blood samples.

RESUMO: O uso de glicosímetros portáteis (GPs) para aferição da glicemia é um procedimento comum na rotina clínica veterinária. O objetivo deste trabalho é avaliar a acurácia analítica e clínica de um GP humano (Accu-Chek Performa®), (AC) e um GP veterinário (GlucoCalea®), (GC) em gatos. Amostras de sangue venoso central foram coletadas de 48 gatos atendidos em um hospital veterinário-escola no Brasil. Foram utilizados dois GPs de cada modelo e comparados a um método de referência (MR). A acurácia analítica foi avaliada de acordo com os requisitos estipulados pela ISO 15197:2013 para GPs de uso humano. Os dados foram comparados pelo teste não-paramétrico de Wilcoxon e representados em gráficos de Bland-Altman. O efeito do hematócrito sobre os valores de glicemia foi avaliado pelo coeficiente de correlação de Spearman. A acurácia clínica foi avaliada pela análise da grade de erros (AGE). Em comparação com o MR, os valores de glicemia foram maiores em todos os GPs avaliados. Nenhum deles atendeu aos requisitos da ISO quanto à acurácia analítica, mas o AC mostrou-se mais acurado que o GC. Todos os valores de glicemia obtidos pelos GPs humanos - mas não pelos GPs veterinários - estiveram dentro das zonas A e B da AGE, demonstrando acurácia clínica de acordo com as exigências da ISO. A interferência do hematócrito da amostra mostrou-se significativa em todos os aparelhos testados. Portanto, o AC apresentou maior acurácia quando comparado ao GC em amostras de sangue total em felinos.

Does soybean sample size impact Tukey's test for non-additivity? / O tamanho de amostra em soja impacta o teste de não aditividade de Tukey?

ABSTRACT: This study analyzed the interference of sample size on Tukey's test for non-additivity and found the sample size to optimize the test for soybean grain yield. Six experiments were conducted in a completely randomized block design with either 20 or 30 cultivars and three repetitions of each treatment. Grain yield was determined per plant, totaling 9,000 sampled plants. Next, sample scenarios up to 100 plants were simulated, estimating F statistic for a degree of freedom of the error in each scenario. After that, the optimal sample size was defined via power models and maximum curvature point. Results showed the number of sampled plants per experimental unit influences the estimates of Tukey's test for non-additivity. Also, the sampling of 14 to 19 plants per experimental unit allows for maintaining the accuracy of the test.

RESUMO: Os objetivos deste estudo foram analisar a interferência do tamanho amostral no teste de não aditividade de Tukey e encontrar o tamanho de amostra para otimizar o teste para a produtividade de grãos em soja. Seis experimentos em delineamento de blocos ao acaso foram conduzidos com 20 ou 30 cultivares de soja em três repetições de cada tratamento. A produtividade de grãos foi definida por planta, totalizando 9.000 plantas amostradas. A seguir, foram simulados cenários amostrais de até 100 plantas, estimando a estatística F para um grau de liberdade do erro em cada cenário. Após, foi definido o tamanho amostral ótimo via modelos de potência e pontos de máxima curvatura. Os resultados mostram que o número de plantas amostradas por unidade experimental influencia as estimativas do teste de não aditividade de Tukey. Além disso, a amostragem de 14 a 19 plantas por unidade experimental possibilita manter a acurácia do teste.

Does soybean sample size impact Tukey's test for non-additivity? / O tamanho de amostra em soja impacta o teste de não aditividade de Tukey?

This study analyzed the interference of sample size on Tukey's test for non-additivity and found the sample size to optimize the test for soybean grain yield. Six experiments were conducted in a completely randomized block design with either 20 or 30 cultivars and three repetitions of each treatment. Grain yield was determined per plant, totaling 9,000 sampled plants. Next, sample scenarios up to 100 plants were simulated, estimating F statistic for a degree of freedom of the error in each scenario. After that, the optimal sample size was defined via power models and maximum curvature point. Results showed the number of sampled plants per experimental unit influences the estimates of Tukey's test for non-additivity. Also, the sampling of 14 to 19 plants per experimental unit allows for maintaining the accuracy of the test.

Os objetivos deste estudo foram analisar a interferência do tamanho amostral no teste de não aditividade de Tukey e encontrar o tamanho de amostra para otimizar o teste para a produtividade de grãos em soja. Seis experimentos em delineamento de blocos ao acaso foram conduzidos com 20 ou 30 cultivares de soja em três repetições de cada tratamento. A produtividade de grãos foi definida por planta, totalizando 9.000 plantas amostradas. A seguir, foram simulados cenários amostrais de até 100 plantas, estimando a estatística F para um grau de liberdade do erro em cada cenário. Após, foi definido o tamanho amostral ótimo via modelos de potência e pontos de máxima curvatura. Os resultados mostram que o número de plantas amostradas por unidade experimental influencia as estimativas do teste de não aditividade de Tukey. Além disso, a amostragem de 14 a 19 plantas por unidade experimental possibilita manter a acurácia do teste.

AgroReg: main regression models in agricultural sciences implemented as an R Package

Regression analysis is highly relevant to agricultural sciences since many of the factors studied are quantitative. Researchers have generally used polynomial models to explain their experimental results, mainly because much of the existing software perform this analysis and a lack of knowledge of other models. On the other hand, many of the natural phenomena do not present such behavior; nevertheless, the use of non-linear models is costly and requires advanced knowledge of language programming such as R. Thus, this work presents several regression models found in scientific studies, implementing them in the form of an R package called AgroReg. The package comprises 44 analysis functions with 66 regression models such as polynomial, non-parametric (loess), segmented, logistic, exponential, and logarithmic, among others. The functions provide the coefficient of determination (R2), model coefficients and the respective p-values from the t-test, root mean square error (RMSE), Akaike's information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), maximum and minimum predicted values, and the regression plot. Furthermore, other measures of model quality and graphical analysis of residuals are also included. The package can be downloaded from the CRAN repository using the command: install.packages("AgroReg"). AgroReg is a promising analysis tool in agricultural research on account of its user-friendly and straightforward functions that allow for fast and efficient data processing with greater reliability and relevant information.

Path analysis and near-infrared spectroscopy in canola crop / Análise de trilha e espectroscopia no infravermelho próximo na cultura da canola

ABSTRACT: This study measured the effect of the association between agronomic traits related to the yield of canola grains grown at different sowing dates through path analysis. Another objective was to obtain a method to predict the oil content in the grains, fitting a multivariate model through near-infrared (NIR) spectroscopy analysis. The experiment was conducted in the field using a randomized block design in plots subdivided by time, with four plots (sowing dates), six subplots (canola hybrids), and four replicates. In each hybrid, phenological observations were performed, and the grain yield was determined. The data were subjected to analysis of variance in the R environment using the F test at 5% probability. The oil content in the grains was determined by the traditional chemical method, and based on the NIR spectral signature of the grain samples, partial least squares regression (PLS-R) was established to estimate the oil content in the canola grains. The sowing dates influenced the production components and oil content of the grains of all hybrids. The trait number of grains in five plants (0.6857) and their height (0.4943) had greater estimates of positive correlations with grain yield, as well as higher values of positive direct effects on yield (0.2494 and 0.1595, respectively). The NIR technique combined with PLS-R was able to predict the oil content in the grains, resulting in good predictive models (R2 of 0.86 and root mean square error (RMSE) of 1.56 in external validation).

RESUMO: Objetivou-se mensurar o efeito da associação entre caracteres agronômicos relacionados à produtividade de grãos de canola cultivada em diferentes épocas de semeadura, através da análise de trilha. Assim como também objetivou-se obter um método para predizer o teor de óleo nos grãos, ajustando um modelo multivariado através da análise por espectroscopia na região do infravermelho próximo. O experimento foi conduzido em campo, utilizando-se o delineamento de blocos ao acaso, em parcelas subdivididas no tempo, sendo quatro parcelas (épocas de semeadura) e seis subparcelas (híbridos de canola), com quatro repetições. Em cada híbrido foram realizadas observações fenológicas e determinada a produtividade de grãos. Os dados foram submetidos à análise de variância em ambiente R pelo teste F, a cinco de probabilidade. O teor de óleo nos grãos foi determinado pelo método químico tradicional, e com base na assinatura espectral no infravermelho próximo de amostras dos grãos foi estabelecida regressão dos mínimos quadrados parciais (PLS-R) para estimar o teor de óleo nos grãos de canola. As épocas de semeadura influenciaram os componentes de produção e o teor de óleo dos grãos de todos híbridos. Os caracteres número de grãos em cinco plantas (0,6857) e altura (0,4943) apresentaram maiores estimativas de correlação positiva com a produtividade de grãos, assim como os maiores valores de efeito direto positivo sobre a produtividade, 0,2494 e 0,1595 respectivamente. Entretanto, o ciclo total (-0,7848), juntamente com dias em florescimento (-0,4520) apresentou correlação significativa negativa com a produtividade. A técnica NIR associada à PLS-R foi capaz de predizer o teor de óleo nos grãos, resultando em bons modelos preditivos (R2 de 0,86 e RMSE de 1,56 na validação externa) que podem ser usados com sucesso na análise da qualidade das amostras após colheita e nos programas de melhoramento genético.

Evaluating tree survival and modeling initial growth for Atlantic Forest restoration / Avaliação da sobrevivência e modelagem do desenvolvimento inicial de árvores para restauração da Mata Atlântica

ABSTRACT: Ecological restoration has become an important complementary practice to protect natural resources and preserve biodiversity. However, native species may be used in restoration programs in ways that do not optimize their performance. This research evaluated the survival and to model the initial growth of 15 native tree species planted in "filling" and "diversity" lines in the post-planting phase of a restoration experiment in the subtropics of the Brazilian Atlantic Forest. We measured survival rate (%) one year after planting and collar diameter (mm), total height (m), crown projection area (m²) and crown volume (m³) in the first 48 months after planting. Growth modeling for each variable and species was based on the non-linear mathematical Logistic, Gompertz, and Chapman-Richards models. Model selection for each variable/species was supported by the Akaike Information Criterion, standard error of the estimate, and coefficient of determination. The highest survival rates were reported for Cordia americana, Gochnatia polymorpha, Inga uruguensis, Peltophorum dubium, Prunus sellowii e Zanthoxylum rhoifolium (91.7%) and for Solanum mauritianum (90.3%). The species with faster growth were, by increasing order, Mimosa scabrella, Trema micrantha, Solanum mauritianum and Croton urucurana. With a better understanding of the initial developmental potential of tree species, it is possible to increase the species and functional diversity of the filling group. There was no single model capable of describing the variables analyzed and different models were needed to describe different characteristics and species.

RESUMO: A restauração ecológica tornou-se uma importante atividade complementar para proteger os recursos naturais e conservar a biodiversidade. No entanto, as espécies nativas podem estar a ser utilizadas em programas de restauração de formas que não otimizam as suas características. O objetivo deste trabalho foi avaliar a sobrevivência e modelar o desenvolvimento inicial de 15 espécies arbóreas nativas plantadas em linhas de "preenchimento" e "diversidade" na fase de pós-plantio numa experiência de restauração nos subtrópicos da Mata Atlântica Brasileira. Avaliou-se a taxa de sobrevivência (%) um ano após o plantio e o diâmetro do colo (mm), a altura total (m), a área de projeção de copa (m²) e o volume de copa (m³) nos primeiros 48 meses após o plantio. A modelagem de crescimento para cada variável e espécie foi baseada nos modelos matemáticos não lineares: Logístico, Gompertz e Chapman-Richards. A seleção do modelo para cada variável/espécie teve como base o Critério de Informação de Akaike, erro padrão da estimativa e coeficiente de determinação. Os percentuais de sobrevivência mais altos foram para Cordia americana, Gochnatia polymorpha, Inga uruguensis, Peltophorum dubium, Prunus sellowii e Zanthoxylum rhoifolium (91,7%) e para Solanum mauritianum (90,3%). As espécies de crescimento mais rápido, por ordem crescente, foram: Mimosa scabrella, Trema micrantha, Solanum mauritianum e Croton urucurana. Com o conhecimento do potencial de desenvolvimento inicial das espécies, é possível aumentar a diversidade de espécies e funcional do grupo de preenchimento. Não houve um modelo único capaz de descrever todas as variáveis de desenvolvimento analisadas. Foram necessários diferentes modelos para descrever as diferentes características e as diferentes espécies.

Mathematical models to describe the growth curves of Vietnamese Ri chicken / Modelos matemáticos para descrever as curvas de crescimento do frango Ri vietnamita

Ri chicken is the most popular backyard chicken breed in Vietnam, but little is known about the growth curve of this breed. This study compared the performances of models with three parameters (Gompertz, Brody, and Logistic) and models containing four parameters (Richards, Bridges, and Janoschek) for describing the growth of Ri chicken. The bodyweight of Ri chicken was recorded weekly from week 1 to week 19. Growth models were fitted using minpack.lm package in R software and Akaike’s information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), and root mean square error (RMSE) were used for model comparison. Based on these criteria, the models having four parameters showed better performance than the ones with three parameters, and the Richards model was the best one for males and females. The lowest and highest value of asymmetric weights (α) were obtained by Bridges and Brody models for each of sexes, respectively. Age and weight estimated by the Richard model were 8.46 and 7.51 weeks and 696.88 and 487.58 g for males and for females, respectively. Differences in the growth curves were observed between males and female chicken. Overall, the results suggested using the Richards model for describing the growth curve of Ri chickens. Further studies on the genetics and genomics of the obtained growth parameters are required before using them for the genetic improvement of Ri chickens.

O frango Ri é a raça de frango de quintal mais popular do Vietnã, mas pouco se sabe sobre a curva de crescimento dessa raça. Este estudo comparou o desempenho de modelos com três parâmetros (Gompertz, Brody e Logistic) e modelos contendo quatro parâmetros (Richards, Bridges e Janoschek) para descrever o crescimento do frango Ri. O peso corporal do frango Ri foi registrado semanalmente da semana 1 à semana 19. Os modelos de crescimento foram ajustados usando o pacote minpack.lm no software R e o critério de informação de Akaike (AIC); critério de informação bayesiano (BIC) e erro quadrático médio (RMSE) foram usados para comparação de modelos. Com base nesses critérios, os modelos com quatro parâmetros apresentaram melhor desempenho do que os com três parâmetros, sendo o modelo de Richards o melhor para homens e mulheres. O menor e o maior valor dos pesos assimétricos (α) foram obtidos pelos modelos Bridges e Brody para cada um dos sexos, respectivamente. A idade e o peso estimados pelo modelo de Richard foram de 8,46 e 7,51 semanas e 696,88 e 487,58 g para homens e mulheres, respectivamente. Diferenças nas curvas de crescimento foram observadas entre frangos machos e fêmeas. No geral, os resultados sugeriram o uso do modelo de Richards para descrever a curva de crescimento de frangos Ri. Mais estudos sobre a genética e genômica dos parâmetros de crescimento obtidos são necessários antes de usá-los para o melhoramento genético de frangos Ri.

Phyllochron estimates on agronomic potential and physiological quality of millet / Estimativas do filocrono no potencial agronômico e na qualidade fisiológica do milheto

Millet is largely explored for a diversity of applications. The use of millet high-quality seeds is essential to increase grain yield. Accordingly, the purposeof this studywas to evaluate the yield variability of milletplants from higher and lower-quality seeds in the expression of dry matter yield parameters. The studywas conducted in the experimental and didactic area of IFRS -campusIbirubá, Rio Grande do Sul, Brazil, with a completely randomized design. The treatments were plants from seeds of higher (HQS) and lower (LQS) quality and two season crops (2015/16 and 2017/18) in eight replications. Theemergence speed was appliedto identify plants from seeds of different qualities. The phyllochron, leaf number, height, stem diameter, number of nodes, and dry mass yield were the agronomic components evaluatedfor this study. Meteorological information was used to calculate phyllochron, water deficit, and average temperature. The collected data were submitted for analysis of variance and the Tukey test at a 5% probability of error. The HQS expressed lower phyllochron and most significant agronomic components. Furthermore, the 2015/16 crop had the lowest water deficit and obtained the best results.(AU)

O milheto é amplamente explorado para uma diversidade de aplicações. O uso de sementes de milheto de alta qualidade é essencial para aumentar a produtividade de grãos. Nesse sentido, o propósito deste estudo foi avaliar a variabilidade da produtividade de plantas de milheto provenientes de sementes de melhor e de menor qualidade na expressão dos parâmetros de produção de matéria seca. O estudo foi realizado na área experimental e didática do IFRS - campus Ibirubá, Rio Grande do Sul, Brasil, com delineamento inteiramente casualizado. Os tratamentos foram plantas provenientes de sementes de qualidade superior (SAS) e inferior (SQI) e duas safras (2015/16 e 2017/18) em oito repetições. A velocidade de emergência foi aplicada para identificar plantas a partir de sementes de diferentes qualidades. O filocrono, número de folhas, altura, diâmetro do caule, número de nós e rendimento de massa seca foram os componentes agronômicos avaliados para este estudo. As informações meteorológicas foram utilizadas para calcular o filocrono, o déficit hídrico e a temperatura média. Os dados coletados foram submetidos à análise de variância e ao teste de Tukey a 5% de probabilidade de erro. O SQS expressou menor filocrono e componentes agronômicos mais significativos. Ainda, a safra 2015/16 apresentou o menor déficit hídrico e obteve os melhores resultados.(AU)

Growth Curve of Brazilian Creole Chickens (Canela-Preta Breed) Raised in Two Different Rearing Systems under Tropical Climate

The objective of this study was to describe the growth curve of Brazilian Creole chickens of the Canela-Preta breed raised in two different rearing systems using non-linear growth models. A total of 400 birds were divided into two groups of 200 animals (of both genders), which were kept in confined or semi-confined systems. The confined birds were housed in an experimental masonry shed and the semi-confined animals were housed in another shed with access to pasture from 29 days of age. Birds were individually weighed every seven days during six months for determination of the growth curves of body weight using 10 non-linear models. The parameters of the models were estimated using the Gauss Newton method. The performance of the models was assessed using mean squared error (MSE), coefficient of determination (R2), percentage of convergence, and residual mean absolute deviation (MAD). With the exception of the Inverse Polynomial, all the other models had R2 values close to one. Therefore, the best models were chosen based on the lowest MSE and MAD values, with the Richards model ranking first followed by the Von Bertalanffy model. Gender and rearing system effects significantly influenced (p<0.05) some parameters of the Richards model. In conclusion, the Richards model was the most adequate to describe the growth of Canela-Preta chickens. Gender and rearing system significantly influenced the growth of the birds. The growth rates observed indicated that management strategies can be performed to increase the production efficiency of Canela-Preta chickens.(AU)

Accuracy evaluation of two portable blood glucose meters in feline patients using whole blood samples / Avaliação da acurácia de dois glicosímetros portáteis em amostras de sangue total de pacientes felinos

Using portable blood glucose meters (PBGMs) to measure blood glucose (BG) concentration is a common procedure in veterinary practice. Our objective was to evaluate the analytical and clinical accuracy of a human PBGM (Accu-Chek Performa®), (AC) and a veterinary PBGM (GlucoCalea®), (GC) in feline patients. Central venous blood samples were collected from 48 cats at a Brazilian Veterinary teaching hospital. Two devices from each model were used and compared to a reference method (RM). Analytical accuracy was assessed according to ISO 15197:2013 requirements for human PBGMs. Data were compared using Wilcoxon's nonparametric test and represented by Bland-Altman plots. Hematocrit's effect on BG measurements was evaluated by the Spearman correlation coefficient. Clinical accuracy was determined using error grid analysis (EGA). Values of BG were significantly higher in all PBGMs compared to the RM. Although ISO's analytical accuracy requirements could not be met by any of the devices, AC meters were more accurate than GC meters. All AC measurements - but not GC ones - were within zones A and B of the EGA, meeting ISO requirements for clinical accuracy. Significant hematocrit interference was observed in all devices. Therefore, AC showed greater accuracy compared to GC using feline whole blood samples.

O uso de glicosímetros portáteis (GPs) para aferição da glicemia é um procedimento comum na rotina clínica veterinária. O objetivo deste trabalho é avaliar a acurácia analítica e clínica de um GP humano (Accu-Chek Performa®), (AC) e um GP veterinário (GlucoCalea®), (GC) em gatos. Amostras de sangue venoso central foram coletadas de 48 gatos atendidos em um hospital veterinário-escola no Brasil. Foram utilizados dois GPs de cada modelo e comparados a um método de referência (MR). A acurácia analítica foi avaliada de acordo com os requisitos estipulados pela ISO 15197:2013 para GPs de uso humano. Os dados foram comparados pelo teste não-paramétrico de Wilcoxon e representados em gráficos de Bland-Altman. O efeito do hematócrito sobre os valores de glicemia foi avaliado pelo coeficiente de correlação de Spearman. A acurácia clínica foi avaliada pela análise da grade de erros (AGE). Em comparação com o MR, os valores de glicemia foram maiores em todos os GPs avaliados. Nenhum deles atendeu aos requisitos da ISO quanto à acurácia analítica, mas o AC mostrou-se mais acurado que o GC. Todos os valores de glicemia obtidos pelos GPs humanos - mas não pelos GPs veterinários - estiveram dentro das zonas A e B da AGE, demonstrando acurácia clínica de acordo com as exigências da ISO. A interferência do hematócrito da amostra mostrou-se significativa em todos os aparelhos testados. Portanto, o AC apresentou maior acurácia quando comparado ao GC em amostras de sangue total em felinos.

Relationship between body weight and scrotal circumference in growing Pelibuey sheep raised under tropical conditions / Relação entre o peso corporal e a circunferência escrotal em ovinos Pelibuey em crescimento criados em condições tropicais

The body weight (BW) of an animal is a vital economic trait that might help in decision-making in the handling of animals. The objective of the present study was to develop equations for the prediction of BW in Pelibuey sheep using scrotal circumference (SC). The BW (23.40 ± 6.96 kg) and SC (20.25 ± 6.19 cm) have been recorded in 405 male Pelibuey at the Southeastern Center for Ovine Integration, Mexico. Linear, logarithmic, quadratic, exponential, cubic, and power regression models were used for data analysis. Pearson correlation (R), Coefficient of determination (R2), Adjusted coefficient of determination (Adj.R2) Root mean square error (RMSE), Akaike information criterion (AIC), and Bayesian information criterion (BIC) were used to select the best model. Power regression model showed the highest R (0.93), R2 (0.86), Adj.R2 (0.86) and lowest RMSE (0.02), AIC (-989.44) and BIC (-981.44). The current study suggests that SC might be used as the only predictor for BW of growing Pelibuey sheep raised under tropical conditions.

O peso corporal (PC) do animal é uma característica econômica importante, que pode auxiliar na tomada de decisões no manejo dos animais. O objetivo do presente estudo foi desenvolver equações para a predição do PC em ovinos Pelibuey por meio da circunferência escrotal (CE). O PC (23,40±6,96kg) e a CE (20,25±6,19cm) foram registrados em 405 ovinos machos da raça Pelibuey no Centro de Integração Ovina da Região Sudeste do México. Os modelos lineares, logarítmicos, quadráticos, exponenciais, cúbicos e de regressão de potência foram utilizados para a análise dos dados. A correlação de Pearson (R), o coeficiente de determinação (R2), o coeficiente de determinação ajustado (Adj.R2), o erro do quadrado médio (EQM), o critério de informação de Akaike (AIC) e o critério de informação bayesiano (BIC) foram usados para selecionar o melhor modelo. O modelo de regressão de potência apresentou maiores R (0,93), R2 (0,86), Adj.R2 (0,86) e menores EQM (0,02), AIC (-989,44) e BIC (-981,44). O estudo atual sugere que a CE pode ser usada como um único preditor para o PC de ovinos Pelibuey em crescimento criadas em condições tropicais.

Sampling sufficiency, correlation and path analysis in showy rattlebox / Suficiência amostral, correlação e análise de trilha em crotalária spectabilis

It is important to adequately size the number of plants that should be evaluated to allow precise inferences about the traits under evaluation. The study of the linear relations among traits provides important information, especially in the identification of traits for indirect selection. So, the objectives of this work were to determine the sample size (number of plants) to estimate the mean of Crotalaria spectabilis traits and investigate the relations among traits. Were randomly selected 200 and 110 plants of C. spectabilis in the experiments conducted, respectively, in 2019/2020 and 2020/2021. In these 310 plants, the following traits were evaluated: plant height, stem diameter, number of nodes, number of leaves, leaf fresh matter, stem fresh matter, shoot fresh matter, leaf dry matter, stem dry matter and shoot dry matter. The sample size was calculated to estimate the mean of these traits, based on Student's t-distribution, and the relations among traits were investigated through correlation and path analysis. To estimate the mean of these ten traits of C. spectabilis, with a maximum error of 10% of the mean and 95% confidence level, 64 plants are needed. In an experiment, to estimate the mean of each treatment with 10% precision, 64 plants per treatment must be evaluated. The number of leaves has a positive linear relation with the amount leaf, stem and shoot fresh and dry matter.

É importante dimensionar adequadamente o número de plantas que devem ser avaliadas para possibilitar inferências precisas sobre os caracteres em avaliação. O estudo das relações lineares entre caracteres fornece informações importantes, especialmente, na identificação de caracteres para seleção indireta. Assim, os objetivos deste trabalho foram determinar o tamanho de amostra (número de plantas) necessário para a estimação da média de caracteres de Crotalaria spectabilis e investigar as relações entre os caracteres. Foram selecionadas, aleatoriamente, 200 e 110 plantas de C. spectabilis, nos experimentos conduzidos, respectivamente, em 2019/2020 e 2020/2021. Nessas 310 plantas avaliaram-se os caracteres altura de planta, diâmetro de caule, número de nós, número de folhas, matéria fresca de folhas, matéria fresca de caule, matéria fresca de parte aérea, matéria seca de folhas, matéria seca de caule e matéria seca de parte aérea. Foi calculado o tamanho de amostra para a estimação da média desses caracteres, com base na distribuição t de Student e investigada a relação entre os caracteres por meio de análises de correlação e de trilha. Para a estimação da média, desses dez caracteres de C. spectabilis, com erro máximo de 10% da média e grau de confiança de 95%, são necessárias 64 plantas. Em um experimento, para a estimação da média de cada tratamento com 10% de precisão, devem ser avaliadas 64 plantas por tratamento. O número de folhas tem relação linear positiva com a quantidade de matérias fresca e seca de folhas, do caule e de parte aérea.

Mathematical models to describe the growth curves of Vietnamese Ri chicken / Modelos matemáticos para descrever as curvas de crescimento do frango Ri vietnamita

Ri chicken is the most popular backyard chicken breed in Vietnam, but little is known about the growth curve of this breed. This study compared the performances of models with three parameters (Gompertz, Brody, and Logistic) and models containing four parameters (Richards, Bridges, and Janoschek) for describing the growth of Ri chicken. The bodyweight of Ri chicken was recorded weekly from week 1 to week 19. Growth models were fitted using minpack.lm package in R software and Akaikes information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), and root mean square error (RMSE) were used for model comparison. Based on these criteria, the models having four parameters showed better performance than the ones with three parameters, and the Richards model was the best one for males and females. The lowest and highest value of asymmetric weights (α) were obtained by Bridges and Brody models for each of sexes, respectively. Age and weight estimated by the Richard model were 8.46 and 7.51 weeks and 696.88 and 487.58 g for males and for females, respectively. Differences in the growth curves were observed between males and female chicken. Overall, the results suggested using the Richards model for describing the growth curve of Ri chickens. Further studies on the genetics and genomics of the obtained growth parameters are required before using them for the genetic improvement of Ri chickens.(AU)

O frango Ri é a raça de frango de quintal mais popular do Vietnã, mas pouco se sabe sobre a curva de crescimento dessa raça. Este estudo comparou o desempenho de modelos com três parâmetros (Gompertz, Brody e Logistic) e modelos contendo quatro parâmetros (Richards, Bridges e Janoschek) para descrever o crescimento do frango Ri. O peso corporal do frango Ri foi registrado semanalmente da semana 1 à semana 19. Os modelos de crescimento foram ajustados usando o pacote minpack.lm no software R e o critério de informação de Akaike (AIC); critério de informação bayesiano (BIC) e erro quadrático médio (RMSE) foram usados para comparação de modelos. Com base nesses critérios, os modelos com quatro parâmetros apresentaram melhor desempenho do que os com três parâmetros, sendo o modelo de Richards o melhor para homens e mulheres. O menor e o maior valor dos pesos assimétricos (α) foram obtidos pelos modelos Bridges e Brody para cada um dos sexos, respectivamente. A idade e o peso estimados pelo modelo de Richard foram de 8,46 e 7,51 semanas e 696,88 e 487,58 g para homens e mulheres, respectivamente. Diferenças nas curvas de crescimento foram observadas entre frangos machos e fêmeas. No geral, os resultados sugeriram o uso do modelo de Richards para descrever a curva de crescimento de frangos Ri. Mais estudos sobre a genética e genômica dos parâmetros de crescimento obtidos são necessários antes de usá-los para o melhoramento genético de frangos Ri.(AU)