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Diversidade genética e estrutura de populações das variedades de ovinos Morada Nova com marcadores microssatélites e mitocondriais / Genetic diversity and population structure of varieties of Morada Nova sheep with microsatellite markers and mtDNA

Ferreira, Joelima Santuza Brito.
Mossoró; s.n; 01/08/2012. 53 p. ilus, tab.
Tese em Português | VETINDEX | ID: biblio-1505041

Resumo

O objetivo desse trabalho foi analisar a diversida de genética e estrutura de população das variedades Branca (N=40), Vermelha (N=32) e Neg ra (31) da raça ovina Morada Nova, em rebanhos do semiarido nordestino Brasileiro através do uso de 17 marcadores nucleares microssatélites e duas regiões do DNA mitocondrial (mtDNA), o gene ND5 e a região controle (D- loop). A análise da variabilidade intrapopulacional demons trou que a variedade Branca apresentou maiores valores de diversidade, enquanto a Vermelha apresentou os menores valores. A análise bayesiana para avaliar a estrutura genética populacional permitiu diferenciar entre as variedades Branca, Vermelha e Negra e uma tendência de subestruturação relacionada aos rebanhos da variedade Branca. Os resultados das Análises de Variância Molecular (AMOVA) evidenciaram que a maior estruturação genética foi observada quando se compararam rebanhos ao invés de variedades (8,59% versus 6,64% da variação total observada, P < 0,001). Tanto a análise de Coordenadas Principais como o dendrograma, por meio da distância genética Dtl, mostraram à formação de dois grupos principais, um composto por indivíduos brancos e outro por indivíduos vermelhos e Negros. Seis haplótipos foram encontrados para região D-loop e dois para o gene ND5. Um haplótipo exclusivo para variedade vermelha e outro para variedade Negra foram encontrados na região D-loop e um haplótipo exclusi vo para variedade Negra no gene ND5, mas as frequências destes foram baixas e, portanto existe necessidade de validação adicional. Os resultados obtidos reforçam a existência de diferen ças significativas entre as variedades Vermelha e Branca da raça e poderão ser utilizados para o aperfeiçoamento de programas de conservação e uso de recursos genéticos.
Genetic diversity and population structure of varieties of Morada Nova sheep with microsatellite markers and mtDNA. 2012.48f. Master Science in Animal Production: Characterization, Conservation and Breeding of Local Resources - Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA), Mossoró-RN, 2012. ABSTRACT: The aim of this study was to analyze the genetic diversity and population structure of varieties White ( N = 40) , Red ( N = 32) and Black (31) of Morada Nova breed of sheep , herds in the northeastern Brazilian semiarid through the use of 17 nuclear microsatellite markers and two regions in the mitochondrial DNA (mtDNA ), the ND5 gene and the control region ( D - loop). The analysis of intra- population demonstrated that the variety White had higher diversity , while Red had the lowest values . The Bayesian analysis to assess the population genetic structure allowed differentiation between varieties White , Red and Black and a tendency to sub- structuring related to the flocks of White variety . The results of analyzes of molecular variance ( AMOVA) showed that the greatest genetic structure was found when comparing herds rather than varieties (8.59 % versus 6.64% of the total variation , P < 0.001). Both the analysis of the dendrogram as Principal Coordinates, through genetic distance Dtl , showed the formation of two main groups , one composed of whites and another for blacks and reds individuals . Six haplotypes were found for D- loop region and two for the ND5 gene . A haplotype unique to other red variety to variety and Black were found in the D- loop region and a variety haplotype unique to the Black ND5 gene , but these frequencies were low and therefore there is need for further validation . The results support the existence of significant differences between the varieties Red and White breed and can be used for the improvement of conservation programs and use of genetic resource.
Biblioteca responsável: BR68.1
Localização: BR68.1