In silico analysis of the Dof transcription factor family in Coffea canephora / Análise in silico de fatores de transcrição da família Dof em Coffea canephora
Garcia, Vinícius; Ribas, Alessandra Ferreira; Vieira, Luiz Gonzaga Esteves; Santos, Tiago Benedito dos.
Colloq. agrar.;
14(4): 99-111, out.-dez. 2018. ilus, tab, graf
Artigo
em Inglês
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| ID: vti-741756
Resumo
The Dof family (DNA-binding with One Finger) is a group of transcription factors that are involved in a variety of functions of importance for different biological processes in plants, such as plant growth, development and response to biotic and abiotic stresses. The Dof genes have been identified and characterized in many plant species, but so far there is no information about these genes in coffee species. In the present study, we identified 24 Dof members in Coffea canephora using the Coffee Genome Hub database. Systematic bioinformatics analyses were performed to characterize all CcDof genes, including complete genome sequence, conserved protein domains, subcellular locations, phylogenetic relationships and gene expression profiles in different tissues. The results obtained here provide new insights into the CcDof gene family, allowing the design of future experiments for the molecular characterization of these genes in coffee plants.(AU)A família Dof (DNA-binding with One Finger) é um grupo de fatores de transcrição que desempenham papéis importantes no crescimento, desenvolvimento e na resposta das plantas aos estresses bióticos e abióticos. Os genes Dof foram identificados e caracterizados em várias espécies de plantas; entretanto até o presente momento não há informações sobre esses genes em café. No presente estudo foram identificados 24 membros da família Dof no genoma de C. canephora depositados no banco de dados Coffee Genome Hub. Análises sistemáticas de bioinformática foram realizadas para caracterizar os genes Dof em C. canephora, incluindo a análise de sequências genômicas, domínios proteicos conservados, localizações subcelulares, relações filogenéticas e perfis de expressão gênica em diferentes tecidos. Os resultados obtidos fornecem uma melhor compreensão sobre a família dos genes CcDof permitindo projetar experimentos futuros para caracterização molecular desses genes no cafeeiro.(AU)
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BR68.1
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