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Efeito da Inclusão de Tortas da Amazônia no Consumo, Digestibilidade, Metabólitos séricos, Desempenho e Emissão de Metano em Ovinos Confinados. Estratégias de Conservação, Extração e Sequenciamento de DNA para Avaliação de Perfil Microbiano Ruminal.

JULIANA CRISTINA DE CASTRO BUDEL.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-217918

Resumo

Dois estudos distintos foram conduzidos em momentos e locais diferentes. No primeiro, 3 realizado em Castanhal, Pará, Brasil, avaliou-se os efeitos de dietas contendo tortas 4 Amazônicas (TA) sobre o consumo, digestibilidade, metabólitos séricos, desempenho e 5 emissão de metano em ovinos Dorper-Santa Inês, castrados. Vinte e oito animais foram 6 distribuídos em gaiolas metabólicas, em delineamento inteiramente casualizado, com 7 quatro tratamentos e sete repetições. Cada grupo de animais recebeu dieta composta por 8 silagem de milho (400 g/kg com base na matéria seca (MS)) e concentrado (600 g/kg 9 MS). Os tratamentos foram: controle (CON40), sem adição de torta amazônica e com 40 10 g/kg de extrato etéreo (EE) na MS da dieta total; cupuaçu (Theobroma grandiflorum) 11 (CUP), com inclusão de torta de cupuaçu e 70 g/kg de EE; tucumã (Astrocaryum vulgare 12 Mart.) (TUC), com inclusão de torta de tucumã e 70 g/kg de EE; controle (CON80), sem 13 adição de torta amazônica e com 80 g/kg de EE. As tortas de cupuaçu e tucumã, ao serem 14 incluídas às dietas de ovinos confinados apresentaram efeitos diferentes sobre o consumo, 15 desempenho e emissão de metano. A inclusão de 450 g/kg de cupuaçu em substituição ao 16 milho e ao farelo de soja possibilita consumo e desempenho mais interessantes, inferiores 17 aos tratamentos controle, porém superiores ao observado na inclusão de 309 g/kg de 18 tucumã. No segundo, conduzido em Mosgiel, no Instituto de Pesquisa AgResearch, Nova 19 Zelândia, investigou-se o uso de soluções (solução A, B e C) como métodos alternativos 20 de conservação e extração de DNA ruminal de ovinos para investigação do perfil 21 microbiano, através da técnica genotyping by sequencing (GBS). A qualidade e 22 integridade do DNA e a composição da comunidade microbiana ruminal foram 23 verificadas nos métodos propostos e comparados à um método controle. Amostras 24 ruminais de 151 ovelhas foram coletadas, via tubo estomacal, em dois períodos, com 25 intervalo de duas semanas entre elas (n=302), para determinar a repetibilidade dos 26 métodos. O rendimento, qualidade e integridade do DNA ruminal conservados e extraídos 27 pelos quatro métodos variaram (p < 0,0001), sendo as maiores médias observadas no 28 método controle, Solução B e A. O número de leitura por amostra, da mesma forma, foi 29 influenciado pelo método usado (p < 0,0001). A abundância relativa também foi 30 influenciada pelo método utilizado, no entanto observou-se um padrão na 31 representatividade entre os 61 táxons investigados. A partir dos métodos de conservação 32 e extração de DNA testados neste estudo, foi possível eliminar a etapa de preparação de 33 amostras ruminais utilizada no método controle e obter, com exceção da Solução C, DNA 34 com rendimentos e de qualidades satisfatórias para análises subsequentes.
Two different studies were carried out at different times and locations. In the first one, 45 carried out at Castanhal, Pará, Brazil, the effects of diets containing Amazon cake (AC) 46 on intake, digestibility, serum metabolites, performance and methane emission in 47 castrated Dorper-Santa Inês sheep were evaluated. Twenty-eight animals were distributed 48 in metabolic cages, in a completely randomized design, with four treatments and seven 49 repetitions. Each group of animals received a diet composed of corn silage (400 g/kg as 50 dry matter (DM) basis and concentrate (600 g/kg DM). The treatments were: control 51 (CON40), with no Amazon cake added and with 40 g/kg of ether extract (EE) in the DM 52 of the total diet; cupuaçu (Theobroma grandiflorum) (CUP), cupuaçu cake added and 70 53 g/kg EE; tucumã (Astrocaryum vulgare Mart.) (TUC), tucumã cake added and 70 g/kg 54 EE; control (CON80), with no Amazon cake added and with 80 g/kg EE. Cupuaçu and 55 tucumã pies, when added to sheep diets, had different effects on intake, performance and 56 methane emission. The inclusion of 450 g/kg of cupuaçu to replace corn and soybean 57 meal allows more interesting consumption and performance, lower than the control 58 treatments, but higher than that observed in the inclusion of 309 g/kg of tucumã. In the 59 second, conducted in Mosgiel, at the AgResearch Research Institute, New Zealand, 60 Solutions (solution A, B and C) were investigated as alternative methods of preserving 61 and extracting ruminal sheep DNA for investigating the microbial profile, through of the 62 genotyping by sequencing technique (GBS). The DNA quality and integrity and the 63 composition of the ruminal microbial community were verified in the proposed methods 64 and compared to a control method. Rumen samples from 151 sheep were collected, via 65 stomach tube, in two periods, with an interval of two weeks between them (n = 302), to 66 determine the repeatability of the methods. The yield, quality and integrity of ruminal 67 DNA conserved and extracted by the four methods varied (p <0.0001), with the highest 68 averages observed in the control method, Solution B and A. The number of readings per 69 sample, likewise, was influenced by the method used (p <0.0001). The relative abundance 70 was also influenced by the method used, however there was a pattern in 71 representativeness among the 61 taxa investigated. From the DNA conservation and 72 extraction methods tested in this study, it was possible to eliminate the ruminal samples 73 preparation used in the control method and obtain, with the exception of Solution C, DNA 74 with satisfactory yields and qualities for subsequent analyzes.
Biblioteca responsável: BR68.1