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Diversidade haplotípica como ferramenta para acasalamento dirigido em gado de corte

WECKSLEY LEONARDO DE SOUZA.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-218300

Resumo

SOUZA, W.L. Diversidade haplotípica como ferramenta para acasalamento dirigido em gado de corte. 2021. 39 f. Dissertação (Mestrado em Ciências) Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2021. Os programas de melhoramento genético de bovinos têm experienciado grandes avanços com o advento da Seleção Genômica, devido principalmente à melhoria na acurácia dos valores genéticos estimados para os candidatos à seleção permitindo a escolha de animais em idade jovem favorecendo a diminuição do intervalo geracional. A disponibilidade de crescente dados de marcadores genéticos permite estimar a variância gamética dos indivíduos e essa pode contribuir com aumento nos ganhos genéticos na progênie futura. No presente trabalho buscamos estimar a variância gamética em dados que simulassem uma população de bovinos de corte utilizando a metodologia proposta por Santos et al. (2019). Utilizou-se o software QMSim para simular a população e os parâmetros foram estimados utilizando o software Gamevar.f90. Uma das limitações encontradas foi a falta de informações de taxa de recombinação para populações de bovinos de corte. Assim, propomos uma abordagem para detecção dos eventos de recombinação nos indivíduos. Os resultados nas estimativas da variância gamética bem como seus índices (CRV) apresentaram valores semelhantes entre os diferentes cenários, não apresentando diferenças significativas no ranqueamentos dos touros quando à variância gamética. Mais estudos em diferentes cenários simulados e em populações reais são necessários.
SOUZA, W.L. Haplotype diversity as a mating decision tool in beef cattle. 2021. 39 f. Dissertação (Mestrado em Ciências) Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade de São Paulo, Pirassununga, 2021. The cattle breeding programs have experienced great advances since the advent of Genomic Selection, mainly due to the improvement breeding values accuracies for selection candidates, allowing the choice of animals in earlier age of life, and consequently reducing the generational interval. The availability of increasing genotyping data allows estimating the gametic variance of individuals and this may contribute to an increase in genetic gains in future progeny. Here, we sought to estimate the gametic variance in simulated data that mimic a beef cattle population using the methodology proposed by Santos et al. (2019). The QMSim software was used to simulate the population and the gametic parameters were estimated using the Gamevar.f90 software. One of the limitations found was the lack of information on the recombination rate for beef cattle populations. Thus, we propose an approach for detecting individual recombination events. The results in the estimates of the gametic variance as well as its indexes (CRV) show similar values between the different scenarios, not showing significant differences in the ranking of the bulls regarding the gametic variance. More studies in different simulated scenarios and in real populations, are needed.
Biblioteca responsável: BR68.1