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MODELAGEM DE SOBREVIVÊNCIA COM FRAGILIDADE APLICADA A DADOS DE CAPRINOS DA RAÇA ANGLO-NUBIANA

CLEIDE MAYRA MENEZES LIMA.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219158

Resumo

Os caprinos da raça Anglonubiana apresentam-se rústicos com adaptabilidade a ambiente tropical, onde sua exploração ocorre geralmente em pasto. Entretanto, condições climáticas desses ambientes favorecem tambem o endoparasitismo, implicando num aspecto negativo se a sensibilidade a verminoses interferir reduzindo a duração da vida reprodutiva de fêmeas, pois a permanência delas no rebanho é uma característica de grande importância para a maior eficiência da caprinocultura. Nesse contexto, o objetivo geral desta tese é apresentar a metodologia de análise de sobrevivência como alternativa para estudos relacionados ao tempo de permanência de fêmeas no rebanho utilizando-se dados de desempenho e sanidade de caprinos da raça Anglonubiana. Esta metodologia pode combinar registros completos de animais que não estão mais no rebanho ou que completaram seu ciclo de vida útil e dados censurados de animais ainda em reprodução. Nesse estudo foram considerados registros de cabras nascidas no período de 2009 a 2014, perte ncentes ao Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Piauí (UFPI), localizado em Teresina-Piauí. As características avaliadas, presentes no banco de dados são: Idade ao primeiro parto, idade da mãe ao parto, estação de nascimento, tipo de nascimento, escore da condição corporal, famacha, ovos por grama de fezes, estado fisiológico e peso ao nascer. O modelo de riscos proporcionais de Cox-Gompertz foi utilizado para verificar o efeito de fatores que possam influenciar no tempo permanência de cabras no rebanho, relacionando a saída da fêmea por morte, tendo a verminose como a principal causa em relação outras formas de descarte. Esse modelo considera que os tempos de vida dos animais são independentes e que o riscos de falhas são proporcionais. Para considerar possíveis associações entre os tempos de sobrevivências para animais pertencentes a um mesmo grupo ou família foi aplicado o modelo de fragilidade compartilhada Gama-Gompertz. Esse modelo representa uma extensão do modelo de riscos proporcionais de Cox, sendo caracterizado pela utilização de um efeito aleatório, ou seja, de uma variável aleatória não observável, que representa as informações que não podem ou não foram observadas tais como fatores ambientais ou genéticos, como também, informações que, por algum motivo, não foram consideradas no planejamento do estudo. O modelo de mistura padrão Gama-Gompertz foi usado para modelar o tempo de sobrevida de cabras diagnósticadas com OPG positivo. Uma vantagem importante desse modelo é a possibilidade de considerar conjuntamente a heterogeneidade entre os animais por suas fragilidades e a presença de uma fração de animais não susceptíveis ao evento de interesse.
Anglo-Nubian goats are rustic and highly adaptable to tropical environments, where they are usually kept in pastures. However, climatic conditions in these environments also favor endoparasitism, a negative aspect when animals are sensitive to worms, which shortens the reproductive life of females, since their permanence in the herd is a characteristic of great importance for the efficiency of goat farming. In this context, the general objective of this thesis is to present the survival analysis method as an alternative for studies related to the time of stay of females in the herd using performance and health data from Anglo-Nubian goats. This method can combine complete records of animals that are no longer in the herd or that have completed their life cycle and censored data of animals that are still breeding. This study considered records of goats born in the period from 2009 to 2014, belonging to the Center for Agricultural Sciences of Federal University of Piauí (UFPI), located in Teresina, Piauí. The characteristics evaluated, present in the database, are: age at first delivery, mothers age at delivery, season of birth, type of birth, body condition score, Famacha score, eggs per gram of feces, physiological status and birth weight. The Cox-Gompertz proportional hazards model was used to verify the effect of factors that may influence the time that goats remain in the herd, relating the females exit due to death, with worms as the main cause in relation to other reasons for disposal. This model considers that the animals lifetimes are independent and that the risk of failure is proportional. To consider possible associations between survival times for animals belonging to the same group or family, the Gamma-Gompertz shared frailty model was applied. This model is an extension of Coxs proportional hazards model, and is characterized by the use of a random effect, that is, an unobservable random variable, which represents information that cannot or has not been observed such as environmental or genetic factors, as well as information that for some reason was not considered in the study planning. The standard Gamma-Gompertz mixture model was used to model the survival time of goats diagnosed with positive OPG. An important advantage of this model is the possibility to jointly consider the heterogeneity between animals due to their weaknesses and the presence of a fraction of animals not susceptible to the event of interest.
Biblioteca responsável: BR68.1