[Detection of microorganisms and resistance genes from positive blood cultures using the FilmArray® BCID2 panel: Experience in a pediatric hospital]. / Detección de microorganismos y genes de resistencia en hemocultivos positivos mediante FilmArray® panel BCID2: experiencia en un hospital pediátrico.

The rapid identification of microorganisms that cause bacteremia and their possible resistance markers are extremely important for the timely initiation of effective antibiotic therapy. The FilmArray® panel BCID2 (an automated rapid multiplex PCR assay) detects microorganisms and resistance genes from positive blood cultures within one hour. The aim of this study was to compare the results obtained from the FilmArray® Panel BCID2 and conventional culture in pediatric patients, as well as the reporting times of both methods. Sixty (60) FilmArray® results were included in the analysis. BCID2 showed high agreement with culture in the identification of microorganisms in monomicrobial bacteremias. However, in polymicrobial blood cultures, BCID2 detected a greater number of microorganisms compared to conventional culture, specifically,1 Staphylococcus aureus, 3 Staphylococcus epidermidis, 1 Enterococcus faecium, 2 Klebsiella oxytoca, 1 Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex, 1 Bacteroides fragilis and 1 Haemophilus influenzae. Furthermore, 88.3% (95%CI: 78.7-94.8) of the FilmArray® results coincided with conventional culture, while in polymicrobial bacteremias, BCID2 detected a greater number of microorganisms with respect to conventional culture [70% (95%CI: 39.3-91.5)]. The agreement of resistance genes was good with a few exceptions (one ESBL was not detected by FilmArray® and one S. aureus strain was characterized as methicillin-resistant by BCID2 and methicillin-sensitive by culture). When comparing the time elapsing since the blood culture was reported as positive up to the results were obtained, BCID2 had a median of 2h 50min (IQR of 1 h 58min to 9h 27min) while the conventional culture had a median of 45h 20min (IQR of 24h 57min to 63h 50min).

[COVID-19: Association of gasometric parameters at admission with in-hospital mortality]. / COVID-19: Parámetros gasométricos al ingreso y su asociación con mortalidad hospitalaria.

INTRODUCTION: At the beginning of the SARS-CoV-2 pandemic, acute respiratory failure has been the most important cause of hospitalization in patients with COVID-19, being more severe in patients with comorbidities and risk factors. In these scenarios hypoxemia has been associated with increased mortality. Our objective was to identify parameters obtained from arterial blood gases (ABG) associated with mortality in patients with COVID-19 at hospital admission. METHODS: GSA samples obtained by breathing room air (FiO2 21%) processed in the clinical laboratory were retrospectively studied in an ABL90 flex analyzer (Radiometer). RESULTS: Acute respiratory alkalosis was the predominant acid-base disturbance. Considering those patients with respiratory failure (paO2 < 60 mmHg), "silent" hypoxemia was observed in 11/176 (6%) of studied patients. In a multivariate analysis, three gasometric parameters at admission showed a positive association with hospital mortality: paO2 (p=0.053), paO2/pO2e index (which expresses the paO2 adjusted to the paO2 expected for age) (p=0.047) and fractional saturation of hemoglobin (OxiHb%) (p=0.028). DISCUSSION: GSA generate a key contribution in understanding the pathophysiology of the COVID-19 patient: in the initial evaluation, monitoring and prognosis of this disease.

Introducción: En los inicios de la pandemia por SARSCoV-2 la insuficiencia respiratoria aguda ha sido la causa más importante de hospitalización inmediata en los pacientes con COVID-19 que acudían a los servicios de urgencias, siendo mayor la gravedad en pacientes con comorbilidades y factores de riesgo preexistentes; en estos escenarios la hipoxemia ha sido asociada a mortalidad. Nuestro objetivo fue identificar parámetros obtenidos de los gases en sangre arterial (GSA) asociados a mortalidad en pacientes con COVID-19 al ingreso hospitalario. Métodos: Se estudiaron retrospectivamente muestras de GSA obtenidos respirando aire ambiente (FiO2 21%) procesadas en el laboratorio clínico en un analizador ABL90 flex (Radiometer). Resultados: La alcalosis respiratoria aguda fue el disturbio ácido base predominante. Considerando aquellos pacientes con insuficiencia respiratoria (paO2 < 60 mmHg) se observó hipoxemia "silenciosa" en 11/176 (6%) de los pacientes estudiados. En un análisis multivariado tres parámetros gasométricos al ingreso mostraron asociación positiva a mortalidad hospitalaria: paO2 (p = 0.053), índice paO2/pO2e (que expresa la paO2 ajustada a la paO2 esperada para la edad) (p = 0.047) y saturación fraccional de hemoglobina (OxiHb%) (p = 0.028). Discusión: Los GSA generan un aporte clave en la comprensión de la fisiopatología del paciente COVID-19; en la evaluación inicial, seguimiento y pronóstico de esta enfermedad.

COVID-19: parámetros gasométricos al ingreso y su asociación con mortalidad hospitalaria / COVID-19: Association of gasometric parameters at admission with in-hospital mortality

Resumen Introducción : En los inicios de la pandemia por SARS-CoV-2 la insuficiencia respiratoria aguda ha sido la causa más importante de hospitalización inmediata en los pacientes con COVID-19 que acudían a los servicios de urgencias, siendo mayor la gravedad en pacientes con comorbilidades y factores de riesgo preexistentes; en estos escenarios la hipoxemia ha sido asociada a mortalidad. Nuestro objetivo fue identificar parámetros obtenidos de los gases en sangre arterial (GSA) asocia dos a mortalidad en pacientes con COVID-19 al ingreso hospitalario. Métodos : Se estudiaron retrospectivamente muestras de GSA obtenidos respirando aire ambiente (FiO2 21%) procesadas en el laboratorio clínico en un analizador ABL90 flex (Radiometer). Resultados : La alcalosis respiratoria aguda fue el dis turbio ácido base predominante. Considerando aquellos pacientes con insuficiencia respiratoria (paO2 < 60 mmHg) se observó hipoxemia "silenciosa" en 11/176 (6%) de los pacientes estudiados. En un análisis multivariado tres parámetros gasométricos al ingreso mostraron asocia ción positiva a mortalidad hospitalaria: paO2 (p = 0.053), índice paO2/pO2e (que expresa la paO2 ajustada a la paO2 esperada para la edad) (p = 0.047) y saturación fraccional de hemoglobina (OxiHb%) (p = 0.028). Discusión : Los GSA generan un aporte clave en la comprensión de la fisiopatología del paciente COVID-19; en la evaluación inicial, seguimiento y pronóstico de esta enfermedad.

Abstract Introduction : At the beginning of the SARS-CoV-2 pandemic, acute respiratory failure has been the most important cause of hospitalization in patients with COVID-19, being more severe in patients with comorbidi ties and risk factors. In these scenarios hypoxemia has been associated with increased mortality. Our objective was to identify parameters obtained from arterial blood gases (ABG) associated with mortality in patients with COVID-19 at hospital admission. Methods : GSA samples obtained by breathing room air (FiO2 21%) processed in the clinical laboratory were retrospectively studied in an ABL90 flex analyzer (Radi ometer). Results : Acute respiratory alkalosis was the predomi nant acid-base disturbance. Considering those patients with respiratory failure (paO2 <60 mmHg), "silent" hypox emia was observed in 11/176 (6%) of studied patients. In a multivariate analysis, three gasometric parameters at admission showed a positive association with hos pital mortality: paO2 (p=0.053), paO2/pO2e index (which expresses the paO2 adjusted to the paO2 expected for age) (p=0.047) and fractional saturation of hemoglobin (OxiHb%) (p=0.028). Discussion : GSA generate a key contribution in un derstanding the pathophysiology of the COVID-19 pa tient: in the initial evaluation, monitoring and prognosis of this disease.

Miositis aguda asociada a infección por virus influenza. Serie de casos en un hospital pediátrico / Acute myositis associated with influenza infection. Case series in a pediatric hospital

La miositis aguda benigna asociada a influenza es una complicación esporádica. En Argentina, en el año 2022, hubo un aumento temprano de la circulación de influenza y del número total de las notificaciones, con la aparición de miositis secundarias. Serie clínica retrospectiva de nueve pacientes pediátricos que consultaron por dolor e impotencia funcional de extremidades inferiores, y enzimas musculares elevadas, en el hospital Pedro de Elizalde de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires, entre agosto y octubre del 2022. En todos se detectó infección por virus influenza y se recuperaron sin secuelas. La miositis aguda benigna es una entidad infrecuente en la infancia, cuyo diagnóstico es predominantemente clínico y de recuperación ad integrum. Debe ser sospechada en pacientes con clínica compatible en contexto de alta circulación viral. La vigilancia epidemiológica aporta herramientas para identificar los virus circulantes y sus posibles complicaciones.

Benign acute myositis associated with influenza is a sporadic complication. In Argentina, in 2022, there was an early increase in influenza circulation and the total number of notifications, with the appearance of secondary myositis. Retrospective clinical series of nine pediatric patients who consulted for pain and functional impotence of the lower extremities, and elevated muscle enzymes, at the Pedro de Elizalde hospital in the Autonomous City of Buenos Aires, between August and October 2022. In all of them, infection by influenza virus and recovered without sequelae. Benign acute myositis is a rare entity in childhood, whose diagnosis is predominantly clinical and recovery ad integrum. It should be suspected in patients with compatible symptoms in a context of high viral circulation. Epidemiological surveillance provides tools to identify circulating viruses and their possible complications.

Comparison of antigen test and polymerase chain reaction for SARS-CoV-2 in children younger than 12 years. / Comparación del test de antígeno y la reacción en cadena de polimerasa para SARS-CoV-2 en niños menores de 12 años.

Stopping the spread of coronavirus disease 2019 (COVID-19) is critical and can be achieved through rapid and effective detection techniques. Our objective was to compare the diagnostic accuracy of rapid antigen tests (RAgT) and reverse transcriptionquantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and to describe amplification cycle thresholds (Cts). Participants were children aged 1 month to 11 years with symptoms for less than 7 days, who did not have a detectable result in the past 90 days, and were immunocompetent. A total of 1855 patients were included; the prevalence of COVID-19 was 4.7%. For the RAgT, overall sensitivity was 60.2% and specificity, 99.8%; in children older than 5 years, values were 69.8% and 99.8%, respectively. Ct values for discordant samples were higher. To conclude, the diagnostic accuracy indicated that the specificity of RAgT is similar to that of RT-qPCR, but its sensitivity is notably lower, especially in children younger than 5 years.

Frenar la propagación de la enfermedad por el coronavirus 2019 (COVID-19, por su sigla en inglés) es fundamental, y se puede realizar mediante técnicas de detección rápidas y efectivas. El objetivo fue comparar la precisión diagnóstica de un test rápido de antígeno (TRAg,) con la reacción en cadena de polimerasa con retrotranscripción (RT-qPCR, por su sigla en inglés) y describir los umbrales de amplificación (Ct, por su sigla en inglés). Participaron niños de 1 mes a 11 años que tuvieran menos de 7 días de síntomas, sin resultado detectable en los últimos 90 días, e inmunocompetentes. Se incluyeron 1855 pacientes con una prevalencia de COVID-19 del 4,7 %. La sensibilidad global del TRAg fue del 60,2 % y su especificidad, del 99,8 %; en niños mayores de 5 años los valores fueron de 69,8 % y 99,8 %, respectivamente. Los valores de Ct de las muestras discordantes fueron más altos. En conclusión, la precisión diagnóstica muestra que TRAg tiene una especificidad similar a la RT-qPCR, pero una sensibilidad considerablemente menor, sobre todo en niños de menos de 5 años.

Comparación del test de antígeno y la reacción en cadena de polimerasa para SARS-CoV-2 en niños menores de 12 años / Comparison of antigen test and polymerase chain reaction for SARS-CoV-2 in children younger than 12 years

Frenar la propagación de la enfermedad por el coronavirus 2019 (COVID-19, por su sigla en inglés) es fundamental, y se puede realizar mediante técnicas de detección rápidas y efectivas. El objetivo fue comparar la precisión diagnóstica de un test rápido de antígeno (TRAg,) con la reacción en cadena de polimerasa con retrotranscripción (RT-qPCR, por su sigla en inglés) y describir los umbrales de amplificación (Ct, por su sigla en inglés). Participaron niños de 1 mes a 11 años que tuvieran menos de 7 días de síntomas, sin resultado detectable en los últimos 90 días, e inmunocompetentes. Se incluyeron 1855 pacientes con una prevalencia de COVID-19 del 4,7 %. La sensibilidad global del TRAg fue del 60,2 % y su especificidad, del 99,8 %; en niños mayores de 5 años los valores fueron de 69,8 % y 99,8 %, respectivamente. Los valores de Ct de las muestras discordantes fueron más altos. En conclusión, la precisión diagnóstica muestra que TRAg tiene una especificidad similar a la RT-qPCR, pero una sensibilidad considerablemente menor, sobre todo en niños de menos de 5 años.

Stopping the spread of coronavirus disease 2019 (COVID-19) is critical and can be achieved through rapid and effective detection techniques. Our objective was to compare the diagnostic accuracy of rapid antigen tests (RAgT) and reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and to describe amplification cycle thresholds (Cts). Participants were children aged 1 month to 11 years with symptoms for less than 7 days, who did not have a detectable result in the past 90 days, and were immunocompetent. A total of 1855 patients were included; the prevalence of COVID-19 was 4.7%. For the RAgT, overall sensitivity was 60.2% and specificity, 99.8%; in children older than 5 years, values were 69.8% and 99.8%, respectively. Ct values for discordant samples were higher. To conclude, the diagnostic accuracy indicated that the specificity of RAgT is similar to that of RT-qPCR, but its sensitivity is notably lower,especially in children younger than 5 years.