Resistance mutations of NS3 and NS5b in treatment-naïve patients infected with hepatitis C virus in Santa Catarina and Rio Grande do Sul states, Brazil.

Hepatitis C virus (HCV) infection is a worldwide health problem. Nowadays, direct-acting antiviral agents (DAAs) are the main treatment for HCV; however, the high level of virus variability leads to the development of resistance-associated variants (RAVs). Thus, assessing RAVs in infected patients is important for monitoring treatment efficacy. The aim of our study was to investigate the presence of naturally occurring resistance mutations in HCV NS3 and NS5 regions in treatment-naïve patients. Ninety-six anti-HCV positive serum samples from blood donors at the Center of Hematology and Hemotherapy of Santa Catarina State (HEMOSC) were collected retrospectively in 2013 and evaluated in this study. HCV 1a (37.9%), 1b (25.3%), and 3a (36.8%) subtypes were found. The frequency of patients with RAVs in our study was 6.9%. The HCV NS5b sequencing reveled 1 sample with L320F mutation and 4 samples with the C316N/R polymorphism. The analysis of the NS3 region revealed the D168A/G/T (3.45%), S122G (1.15%), and V55A (2.3%) mutations. All samples from genotype 3a (36.8%) presented the V170 I/V non-synonymous mutation. In conclusion, we have shown that mutations in NS3 and NS5b genes are present in Brazilian isolates from therapy-naïve HCV patients.

One-step real-time PCR assay for detection and quantification of RNA HCV to monitor patients under treatment in Brazil

O Serviço de Saúde Pública do Brasil fornece αPEG-IFN gratuitamente para tratar pacientes infectados pelo HCV. O objetivo principal da terapia com HCV é a eliminação a longo prazo do HCV do sangue para reduzir o risco de complicações e morte associadas ao HCV. A viremia do paciente afeta a duração e a resposta do tratamento, influenciando assim as decisões clínicas. Desenvolvemos um método de alto rendimento para realizar a quantificação da carga do vírus do RNA da hepatite C (HCV) em amostras de plasma para monitorar pacientes em tratamento. O método baseia-se na detecção duplex, em um teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa, e foi validado de acordo com as regras estabelecidas pela agência reguladora oficial do Brasil (ANVISA). Esse novo método foi comparado a um kit comercial (Teste Cobas / Taqman HCV v2.0 - Roche), mostrando resultados de carga de vírus com correlação significativa entre eles (p = 0,012) usando painéis comerciais e clínicos. Além disso, foram analisadas 611 amostras de pacientes tratados com interferon alfa peguilado (αPEG-IFN) de diferentes regiões do Brasil. Nosso teste de RT-PCR em tempo real de uma etapa demonstrou bom desempenho na medição da carga viral e no monitoramento do curso do tratamento, com valores aceitáveis ​​de sensibilidade e especificidade.

Molecular identification of bartonella henselae in a seronegative cat scratch disease patient with AIDS in Rio de Janeiro, Brazil / Identificação molecular de bartonella henselae em paciente com SIDA soronegativo para doença da arranhadura do gato no Rio de Janeiro, Brasil

Bartonella henselae está associada a um amplo espectro de manifestações clínicas, incluindo a doença da arranhadura de gato, endocardite, e meningoencefalite, em pacientes imunocompetentes e imunocomprometidos. Relatamos o primeiro caso confirmado por método molecular de B. henselae em um paciente com SIDA no estado do Rio de Janeiro, Brasil. Apesar da sequência de DNA de B. henselae ser detectada pela reação em cadeia da polimerase em uma biópsia do linfonodo, soros das fases aguda e convalescente foram não reativos.