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1.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);41(supl.2): 103-117, oct. 2021. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1355763

ABSTRACT

Resumen | Introducción. Las rickettsiosis son enfermedades zoonóticas transmitidas por artrópodos que cumplen el papel de vectores y reservorios, y cuyos síntomas son inespecíficos, por lo que su diagnóstico clínico es difícil. La inmunofluorescencia indirecta (IFI) es el método de referencia para el diagnóstico. En Colombia, ha resurgido el interés por su estudio por los casos de rickettsiosis detectados en el norte del departamento de Caldas a partir del 2001. Objetivo. Establecer la frecuencia de anticuerpos y la seroconversión contra Rickettsia spp. en pacientes atendidos en instituciones de salud del departamento de Caldas, Colombia, entre 2016 y 2019. Materiales y métodos. Se hizo un estudio de diseño cuantitativo, observacional y descriptivo, con una muestra no probabilística de 175 pacientes atendidos en diferentes municipios de Caldas, a quienes se les realizó IFI para la detección de anticuerpos en fase aguda y convaleciente contra Rickettsia rickettsii, R. typhi y R. felis. Resultados. El promedio de edad de los pacientes fue de 31 años. Los municipios con mayor proporción de seropositivos fueron Belalcázar, Chinchiná, Filadelfia, La Dorada, La Merced y Manizales. El 66 % tenía mascotas y el 12 % reportó picaduras por artrópodos. Los signos y síntomas más frecuentes fueron cefalea (69,7 %), artromialgia (60 %), y fiebre (58,2 %). La seroprevalencia por IgG fue de 60 % para R. rickettsii, 47,9 % para R. typhi y 24 % para R. felis. Ocho pacientes presentaron seroconversión. Conclusión. Se encontró evidencia de la circulación de rickettsias del grupo de las fiebres manchadas y del grupo del tifus asociada con casos humanos en el departamento de Caldas.


Abstract | Introduction: Rickettsioses are zoonotic diseases transmitted by arthropods acting as vectors and reservoirs. Disease symptoms are nonspecific and, therefore, their clinical diagnosis is difficult. Indirect immunofluorescence (IFA) is the gold standard assay for diagnosis. The interest for conducting studies on these pathologies has resurfaced in Colombia since 2001; besides, previous studies have evidenced cases of rickettsiosis in the north of the department of Caldas. Objective: To establish the frequency of antibodies and seroconversion against Rickettsia spp. In patients consulting health institutions in Caldas, Colombia, from 2016 to 2019. Materials and methods: We conducted a quantitative, observational, and descriptive study on a non-probabilistic sample of 175 patients with symptoms compatible with rickettsiosis who consulted in different municipalities of Caldas, Colombia; IFA was performed to detect antibodies in the acute and convalescent phases against Rickettsia rickettsii, Rickettsia typhi, and Rickettsia felis. Results: The average age of the patients was 31 years. The municipalities with the highest proportion of seropositive cases were Belalcázar, Chinchiná, Filadelfia, La Dorada, La Merced, and Manizales; 66% of patients owned pets and 12% reported arthropod bites. The most frequent signs and symptoms were headache (69.7%), arthromyalgia (60%), and fever (58.2%). IgG seroprevalence was 60% for R. rickettsii, 47.9% for R. typhi, and, and 24% for R. felis. Eight patients presented seroconversion. Conclusion: We found evidence of the circulation of Rickettsia species from the spotted fever group and the typhus group associated with human cases in Caldas.


Subject(s)
Rickettsia Infections/diagnosis , Rickettsia , Rickettsia rickettsii , Rickettsia typhi , Epidemiology , Risk Factors , Rickettsia felis
2.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);40(supl.1): 37-44, mayo 2020. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1124242

ABSTRACT

Introducción. Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SARM) es un microorganismo que coloniza las fosas nasales y diferentes partes del cuerpo, lo cual se considera un factor de riesgo para adquirir infecciones invasivas, especialmente en pacientes sometidos a cirugía cardiovascular. Objetivo. Determinar la colonización nasal por SARM y establecer las características clínicas en pacientes programados para cirugía cardiovascular. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo entre febrero y diciembre de 2015. Se incluyeron pacientes adultos programados para cirugía cardiovascular en el Hospital Universitario San Ignacio de Bogotá. La colonización se identificó mediante reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase Chain Reaction, PCR) en tiempo real en muestras obtenidas mediante hisopados nasales. Los pacientes fueron descolonizados con mupirocina al 2,0 % intranasal dos veces al día y baños con gluconato de clorhexidina al 4 % del cuello hacía abajo durante cinco días, al cabo de lo cual se hizo una PCR de control. Resultados.Se incluyeron 141 pacientes, 52 hospitalizados y 89 ambulatorios. Del total, 19 (13,4 %) tenían colonización nasal por SARM, correspondientes a 9 (17,3 %) de los 52 hospitalizados y 10 (11,2 %) de los 89 ambulatorios. Todos los pacientes sometidos a descolonización tuvieron resultado negativo en la PCR al final del proceso y ninguno presentó infección del sitio operatorio por S. aureus. Conclusiones.Se demostró colonización nasal por SARM tanto en los pacientes hospitalizados como en los ambulatorios. La descolonización con mupirocina fue efectiva para erradicar el estado de portador a corto plazo, lo que podría tener efecto en las tasas de infección del sitio operatorio en las cirugías cardiovasculares.


Introduction: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a microorganism that colonizes nostrils and different parts of the body, which is considered a risk factor to acquire invasive infections, especially in cardiovascular surgery patients. Objective: To determine the frequency of nasal colonization by MRSA and to establish the clinical characteristics in patients scheduled for cardiovascular surgery. Materials and methods: This was a descriptive study conducted between February and December, 2015. We included adult patients scheduled for cardiovascular surgery at the Hospital Universitario San Ignacio in Bogotá, Colombia. Colonization was identified by real-time PCR from nasal swabs. Colonized patients were treated with mupirocin 2.0% intranasally twice a day and bathed with chlorhexidine 4% from the neck downwards for five days. At the end of this treatment, PCR control was carried out. Results: We included 141 patients with a percentage of nasal colonization of 13.4% (19/141). There were 52 hospitalized patients and 89 outpatients with a percentage of nasal colonization of 17.3% (9/52), and 11.2% (10/89), respectively. All colonized patients who received treatment had a negative PCR at the end of the regime and none of the participating patients had a surgical site infection by S. aureus at the end of the study. Conclusions: Nasal colonization was observed both in hospitalized patients and outpatients. Decolonization treatment with mupirocin was effective to eradicate the carrier state in the short term, which could impact the rates of surgical wound infection associated with cardiovascular surgery.


Subject(s)
Cross Infection , Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus , Surgical Wound Infection , Carrier State , Mupirocin , Nasal Mucosa
3.
Infectio ; 20(2): 97-100, abr.-jun. 2016. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: lil-777005

ABSTRACT

El tifus murino es una enfermedad infecciosa de carácter zoonótico causada por Rickettsia typhi . Se presenta el caso de una paciente femenina de 13 años edad, procedente del área urbana de la ciudad de Cali, quien presentó un cuadro febril asociado a taquipnea y exantema maculopapular generalizado en tronco y extremidades. Durante las primeras 48 h en la UCI pediátrica desarrolló rápido deterioro clínico, fiebre persistente, aumento de reactantes de fase aguda, presencia de infiltrados pulmonares intersticiales bilaterales y derrame pleural, requiriendo ventilación mecánica no invasiva. Se inició tratamiento con doxiciclina frente a la sospecha de una posible infección por agentes rickettsiales. Veinticuatro horas más tarde la paciente presentó mejoría clínica, resolución del exantema y retiro de la ventilación no invasiva. Por medio de la prueba de inmunofluorescencia indirecta se evidenciaron títulos de 1:512 frente al grupo del tifus, constatando el diagnóstico probable de tifus murino.


Murine typhus is a zoonotic infectious disease caused by Rickettsia typhi . We report a case of a 13-year old female patient from the urban area of the city of Cali, who presented with fever, associated with tachypnoea and generalised maculopapular exanthema on the trunk and limbs. During the first 48 h in the paediatric ICU, she rapidly deteriorated, with persistent fever, increased acute phase reactants, bilateral interstitial pulmonary infiltrates and pleural effusion requiring noninvasive ventilation. Treatment with doxycycline was initiated due to a suspected infection by rickettsial agents. Twenty-four hours later the patient presented clinical improvement and resolution of the exanthema, thus the non-invasive ventilation was withdrawn. By means of a indirect immunofluorescence test, titres of 1:512 were shown against the typhus group, leading to the probable diagnosis of murine typhus.


Subject(s)
Humans , Female , Adolescent , Respiratory Insufficiency , Typhus, Endemic Flea-Borne , Typhus, Epidemic Louse-Borne , Urban Area , Noninvasive Ventilation , Respiration, Artificial , Rickettsia typhi , Intensive Care Units, Pediatric , Zoonoses , Doxycycline , Colombia , Fever , Clinical Deterioration , Alphaproteobacteria
4.
Infectio ; 19(1): 47-48, ene.-mar. 2015.
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: lil-742603

ABSTRACT

Hemos leído con gran interés el reporte de caso descrito por Hidrón-Botero et al. 1 en la reciente publicación de la revista Infectio , en el cual se resalta la importancia de la ehrlichiosis monocítica humana como un diagnóstico diferencial que debe ser tenido en cuenta dentro del contexto del síndrome febril agudo en pacientes procedentes de zona rural y/o con posibles exposiciones zoonóticas.


We have read with great interest the case report described by Hidrón-Botero et al.1 in the recent publication of the journal Infectio , which highlights the importance of human monocytic ehrlichiosis as a differential diagnosis that should be taken into account in the context of acute febrile syndrome in patients from rural areas and/or with possible zoonotic exposures.


Subject(s)
Humans , Animals , Syndrome , Ehrlichiosis , Tick-Borne Diseases , Publications , Rural Areas , Colombia , Diagnosis, Differential , Research Report
6.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);33(supl.1): 9-13, set. 2013. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-695791

ABSTRACT

Rickettsia felis es el agente etiológico de la fiebre manchada transmitida por pulgas, cuyo principal vector y reservorio es Ctenocephalides felis . Típicamente, la enfermedad se presenta como fiebre aguda asociada a cefalea, astenia, exantema máculo-papular generalizado y, en algunos casos, con escara de inoculación. En los últimos años, R. felis ha venido adquiriendo un papel importante en la etiología del síndrome febril agudo, calificándola como una enfermedad emergente y subdiagnosticada. La inmunofluorescencia indirecta es actualmente el método diagnóstico de referencia. Sin embargo, esta técnica presenta limitaciones relacionadas con la reacción cruzada que existe entre las diferentes especies del género Rickettsia . En el presente reporte se describe el caso de un paciente de 16 años con síndrome febril agudo secundario a infección probable por R. felis .


Rickettsia felis is the etiologic agent of flea-borne spotted fever, with Ctenocephalides felis as its main vector and reservoir. Typically, the disease presents as acute fever associated with headache, asthenia, generalized maculo-papular rash, and in some cases, an inoculation eschar. In recent years, R. felis has acquired an important role in the etiology of the acute febrile syndrome; it is indeed an emerging infectious disease, albeit underdiagnosed. Indirect immunofluorescence assay (IFA) is currently the reference diagnostic method. However, this technique has limitations related to the cross reactivity among different species of rickettsiae. Herein, we describe a case of a 16 year-old patient with an acute febrile syndrome secondary to probable infection with R. felis.


Subject(s)
Adolescent , Animals , Cats , Dogs , Humans , Male , Ctenocephalides/microbiology , Rickettsia Infections/diagnosis , Rickettsia felis/isolation & purification , Antibodies, Bacterial/blood , Diagnosis, Differential , Dengue/diagnosis , Environmental Exposure , Horses , Immunoglobulin G/blood , Leukopenia/etiology , Rickettsia Infections/blood , Rickettsia Infections/transmission , Rickettsia felis/immunology , Thrombocytopenia/etiology
7.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);33(supl.1): 161-178, set. 2013. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-695807

ABSTRACT

Las rickettsiosis son entidades clínicas de tipo zoonótico, causadas por bacterias intracelulares estrictas de los géneros Rickettsia y Orientia, pertenecientes a la familia Rickettsiaceae. Su ecología está determinada por factores ambientales y la presencia de vectores específicos que condicionan el establecimiento y la epidemiología en diferentes regiones del mundo. En las Américas, durante el siglo XX, únicamente eran reconocidas tres de estas enfermedades: la fiebre manchada de las Montañas Rocosas, el tifus epidémico y el tifus endémico, Sin embargo, a partir del año 2000 se han descrito mas de 10 especies diferentes previamente desconocidas en este continente, tanto en artrópodos como en casos clínicos, hecho que permite clasificarlas como entidades clínicas emergentes y reemergentes. Dadas las manifestaciones clínicas de las enfermedades causadas por rickettsias, siendo la gran mayoría inespecíficas y, por lo mismo, compartidas con otras enfermedades infecciosas, especialmente virales y bacterianas, han sido enmarcadas entre los diagnósticos diferenciales del síndrome febril agudo, tanto en áreas urbanas como tropicales. En la actualidad, se cuenta con métodos diagnósticos directos e indirectos, que son útiles en la identificación del agente infeccioso, en este caso, causante de rickettsiosis.


Rickettsioses are a group of zoonotic diseases caused by strict intracellular bacteria of the genus Rickettsia and Orientia which belong to the Rickettsiaceae family. Their ecology is influenced by environmental factors and the presence of specific vectors that determine the establishment and epidemiology in different world regions. In America, during the 20 th century, only three of these diseases were recognized: Rocky Mountain spotted fever, epidemic typhus and endemic typhus. However, since 2000, more than 10 different species that had previously been unknown in this continent have been described, both in arthropods and in clinical cases, fact that classifies them as emerging and re-emerging diseases. Given the clinical manifestations of the diseases caused by rickettsias, being the majority unspecific and, therefore, shared with other infectious diseases, especially viral and bacterial, they have been framed within the differential diagnoses of acute febrile syndrome in urban and tropical areas. Nowadays, there are direct and indirect diagnostic methods, which are useful in the definition of the infectious agent, in this case, the cause of rickettsioses.


Subject(s)
Animals , Humans , Rickettsia Infections/epidemiology , Tick-Borne Diseases/epidemiology , Americas/epidemiology , Arachnid Vectors/microbiology , Blotting, Western , Communicable Diseases, Emerging , Disease Reservoirs/parasitology , Polymerase Chain Reaction , Rickettsia Infections/classification , Rickettsia Infections/diagnosis , Rickettsia Infections/transmission , Rickettsia/classification , Rickettsia/isolation & purification , Species Specificity , Staining and Labeling , Scrub Typhus/epidemiology , Scrub Typhus/transmission , Serologic Tests/methods , Tick Bites/microbiology , Tick Infestations/epidemiology , Tick Infestations/veterinary , Tick-Borne Diseases/diagnosis , Ticks/microbiology
8.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);31(1): 124-131, mar. 2011. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-617500

ABSTRACT

Introducción. Streptococcus pneumoniae es un agente comúnmente implicado en enfermedad invasora. Los macrólidos constituyen un tratamiento alternativo para las infecciones por S. pneumoniae resistente a los beta-lactámicos. Sin embargo, la resistencia a macrólidos se ha incrementado a nivel mundial. Objetivo. Determinar la frecuencia de la resistencia a la eritromicina de S. pneumoniae en 15 años de vigilancia y caracterizar fenotípica y genotípicamente los aislamientos resistentes. Materiales y métodos. Se analizaron los datos demográficos de los pacientes, la sensibilidad antimicrobiana y los serotipos de los aislamientos resistentes a la eritromicina, recuperados entre 1994 y 2008. Se determinaron los fenotipos por la técnica del doble disco, y los genotipos, por PCR y PFGE. Todos los aislamientos se recuperaron de enfermedad invasiva y fueron proporcionados por los laboratorios nacionales de salud pública. Resultados. Se recuperaron 3.241 aislamientos invasores; 136 (4,2 %) presentaron resistencia a la eritromicina. La resistencia a la eritromicina se incrementó entre 1994-1996 y 2006-2008, de 2,4 % a 6,9 % en menores de 6 años y, de 3,3 % a 5,7 %, en adultos. Los serotipos más frecuentes fueron 6B (36,8 %), 14 (16,9 %) y 6A (17,6 %). El fenotipo constitutivo cMLSB se determinó en 87 aislamientos; 82 tenían el gen ermB. El fenotipo M se determinó en 46; 45 tenían el gen mefA, tres aislamientos expresaron fenotipo inducible (iMLSB) y un aislamiento presentaba el gen ermB. Por PFGE, se determinó que 50 aislamientos estaban relacionados con clones internacionales, de los cuales, 58 % eran España6B ST90, 26 % eran España9V ST156, 8 % eran Colombia23F-ST338 y 8 % eran España23F-ST81. Conclusiones. Se observó incremento en la resistencia a la eritromicina, relacionada principalmente con el mecanismo de metilación ribosómica y con el clon España6B-ST90 que ha circulado en Colombia desde 1994.


Introduction. Streptococcus pneumoniae is a commonly implicated agent in invasive disease. For infections of S. pneumoniae resistant to beta-lactam, macrolides are an alternative treatment. However, resistance to macrolides has increased worldwide as well. Objective. The frequency of resistance to erythromycin was determined for S. pneumoniae over a 15-year surveillance period, and the resistant isolates were characterized phenotypically and genotypically. Materials and methods. Demographic data of the patients, antimicrobial susceptibility and serotypes were analyzed for 3,241 S. pneumoniae isolates recovered between 1994 and 2008. The phenotypes were determined by the double-disc technique and genotypes by PCR (polymerase chain reaction) and PFGE (pulsed field gel electrophoresis). Isolates were recovered from invasive diseases and were provided by national public health laboratories. Results. Of the 3,241 isolates, 136 were resistant to erythromycin. In the 12-year period between 1994-1996 and 2006-2008, resistance in each 2-year sampling had increased from 2.4% to 6.9% in children under 6 years and from 3.3% to 5.7% in adults. The most common serotypes were 6B (36.8%), 14 (16.9%) and 6A (17.6%). Constitutive phenotype cMLSB was determined in 87 isolates; 82 of these expressed the ermB gene. Phenotype M was determined in 46 isolates; 45 had the mefA gene. An additional three isolates expressed the inducible phenotype (iMLSB), and one expressed the ermB gene. By PFGE, 50 of the isolates were found to be related to international clones--58% were Spain6B-ST90, 26% Spain9V-ST156, 8% Colombia23F-ST338 and 8% Spain23F-ST81. Conclusion. The increase in erythromycin resistance was primarily related to the mechanism of ribosomal methylation. More than half the cases were congeneric with the clone Spain6B-ST90 that has been circulating in Colombia since 1994.


Subject(s)
Drug Resistance , Epidemiologic Surveillance Services , Erythromycin , Streptococcus pneumoniae , Genotype , Phenotype
9.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 106(1): 117-118, Feb. 2011. tab
Article in English | LILACS | ID: lil-578827

ABSTRACT

Rocky Mountain spotted fever (RMSF) is a tick-borne disease caused by the obligate intracellular bacterium Rickettsia rickettsii. Although RMSF was first reported in Colombia in 1937, it remains a neglected disease. Herein, we describe the investigation of a large cluster of cases of spotted fever rickettsiosis in a new area of Colombia.


Subject(s)
Humans , Antibodies, Bacterial/blood , Disease Outbreaks , Rickettsia rickettsii/immunology , Rocky Mountain Spotted Fever , Colombia , Fluorescent Antibody Technique, Indirect , Immunohistochemistry , Immunoglobulin G/blood , Immunoglobulin M/blood , Rocky Mountain Spotted Fever
10.
Rev. MVZ Córdoba ; 15(1): 2013-2015, ene.-abr. 2010.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-621946

ABSTRACT

Las proteobacterias del orden Rickettsiales están divididas en las familias Rickettsiaceae, Ehrlichiaceae y “Holosporaceae”. Las enfermedades ocasionadas por rickettsias y ehrlichias son clínicamente similares, pero epidemiológica y etiológicamente diferentes; son zoonosis transmitidas por artrópodos incluyendo garrapatas, pulgas y piojos (1-4). Las rickettsiosis comprenden enfermedades como las fiebres manchadas (exantemáticas o petequiales) y el tifo(epidémico y murino). Estos son síndromes febriles agudos que pueden ser llegar a ser fatales si no hay un tratamiento antibiótico oportuno y adecuado(4-6).


Subject(s)
Bacteria , Fever , Rickettsiaceae Infections
11.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);28(2): 284-294, jun. 2008. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-503161

ABSTRACT

Introducción. Las fluoroquinolonas son antibióticos de amplio espectro comúnmente utilizados en el manejo de infecciones. Objetivo. Determinar los patrones de resistencia a fluoroquinolonas en aislamientos colombianos de Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, estafilococos coagulasa negativa y enterococos de centros hospitalarios colombianos, recolectados entre 1994 y 2004. Materiales y métodos. Se realizó la determinación de concentraciones inhibitorias mínimas frente a ciprofloxacino, moxifloxacino y gatifloxacino a 270 aislamientos clínicos de S. pneumoniae, 348 de S. aureus, 176 de estafilococos coagulasa negativa y 123 de enterococos. Para los aislamientos de S. aureus resistentes a la meticilina se determinó la concentración inhibitoria mínima frente a levofloxacino y para aislamientos de S. pneumoniae se realizó la prueba de difusión en agar con discos de ofloxacino y levofloxacino. Resultados. Doscientos sesenta y nueve (99,6 por ciento) aislamientos de S. pneumoniae fueron susceptibles a gatifloxacino y moxifloxacino; para levofloxacino y ofloxacino la resistencia fue del 1,5 por ciento y 8,9 por ciento, respectivamente. El 15,9 por ciento de S. pneumoniae tuvo una concentración inhibitoria mínima ³ ³³ ³³4 µg/ml frente a ciprofloxacino. Las prevalencias de resistencia para ciprofloxacino, gatifloxacino y moxifloxacino en los 348 aislamientos de S. aureus fueron 55,4 por ciento, 54,9 por ciento y 52,6 por ciento, y en S. aureus resistentes a meticilina, fueron 92,3 por ciento, 91,3 por ciento y 87,5 por ciento y 91,8 por ciento para levofloxacino. En estafilococos coagulasa negativa y enterococos susceptibles a vancomicina se observaron tasas de resistencia entre 25,6 por ciento y 31,8 por ciento. Todos los aislamientos de enterococos resistente a vancomicina fueron resistentes a los compuestos evaluados. Conclusión. Los aislamientos colombianos de S. pneumoniae mantienen susceptibilidad a las fluoroquinolonas de última generación. La...


Subject(s)
Enterococcus , Fluoroquinolones , Gram-Positive Cocci , Staphylococcus aureus , Streptococcus pneumoniae , Drug Resistance, Microbial
12.
Infectio ; 12(1): 237-246, mar. 2008. ilus, tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-503118

ABSTRACT

Objetivo: caracterización de un brote de infección por Acinetobacter baumannii y determinación de los factores asociados. Diseño: estudio de casos y controles anidado en una cohorte de pacientes críticos entre octubre de 2003 y marzo de 2004. Criterios de inclusión: haber estado hospitalizado en la unidad de cuidados intensivos en el mismo periodo y ser sometidos a procedimientos invasivos. Se excluyeron los pacientes que fallecieron en las primeras 24 horas de haber ingresado a la unidad de cuidados intensivos o que habían sido remitidos de otras instituciones. Se evaluó edad, sexo, antecedentes de enfermedad crónica, índice de intervención terapéutica (therapeutic index score system, TISS), tiempo de uso de dispositivos invasivos, tipo de nutrición, exposición previa a antibióticos, procedimiento quirúrgico, tiempo de uso de exposición y estancia. La investigación epidemiológica de los aislamientos incluyó la tipificación molecular mediante electroforesis en gel de campo pulsado. Resultados: los aislamientos de A baumannii provenientes de los pacientes infectados y de los cultivos de vigilancia fueron resistentes a múltiples antibióticos. Los aislamientos se encontraron relacionados genéticamente con un porcentaje de similitud mayor del 97 por ciento. Se encontró asociación estadísticamente significativa entre la infección de A. baumannii y un mayor puntaje de intervención terapéutica durante la hospitalización (p=0,030), uso de nutrición parenteral (0=0,030) y tiempo de exposición (p=0,02 super índice 2). Conclusiones: la infección por A baumannii, Se asoció a un mayor índice de intervención terapeútica, al uso de nutrición parenteral y al tiempo de exposición. Los aislamientos se encontraron relacionados genéticamente.


Subject(s)
Humans , Critical Care , Acinetobacter Infections , Risk Factors , Parenteral Nutrition
13.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);24(3): 324-331, sept. 2004. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-422495

ABSTRACT

El género Cryptococcus comprende, al menos, 38 especies, pero sólo 3 se han informado como patógenas para el hombre y los animales: Cryptococcus laurentii, Cryptococcus albidus y Cryptococcus neoformans; esta última es la más frecuente. La infección se adquiere por la inhalación de los propágulos infectantes del medio ambiente. Los estudios del hábitat se han realizado con técnicas de extracción con soluciones tampón y cultivos en medios selectivos. El objetivo del trabajo fue evaluar varias técnicas de extracción del ADN de Cryptococcus spp . a partir de muestras ambientales. Como controles se emplearon aislamientos de C. neoformans, C. albidus, C. laurentii y Paracoccidiodes brasiliensis. Se emplearon vermiculitas, suelos contaminados en el laboratorio con 10 a 10 6 blastoconidias/g y muestras naturalmente colonizadas con C. neoformans. El ADN se extrajo con métodos físicos, químicos y con un estuche comercial, y se purificó usando bloques de agarosa y columnas de sílica. Para la amplificación con PCR se emplearon los iniciadores CN4-CN5 específicos para C. neoformans. Sólo el estuche comercial permitió extraer y purificar el ADN de las muestras de suelos contaminados hasta una concentración de 10 blastoconidias/g de suelo y de una de las muestras naturalmente colonizadas. Con este trabajo se logró la extracción y amplificación de ADN de Cryptococcus spp. a partir de muestras ambientales lo cual constituye una herramienta importante para delimitar las áreas ecológicas de C. neoformans en nuestro país


Subject(s)
Cryptococcus/genetics , DNA , Environmental Microbiology , Polymerase Chain Reaction
14.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);23(2): 208-212, jun. 2003. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-356769

ABSTRACT

: En 1998 se inició en Colombia la inmunización de niños menores de un año de edad con la vacuna conjugada contra Haemophilus influenzae, serotipo b. En el 2000, el programa de vigilancia del Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud informó una disminución de 40 por ciento de los casos de meningitis por este microorganismo, la cual se atribuyó a la vacunación. En este programa de vigilancia se utiliza de rutina la técnica estandarizada de aglutinación en l mina para la tipificación capsular de H. influenzae. El objetivo de este trabajo fue establecer la concordancia entre la prueba de aglutinación en l mina y la técnica de PCR. Se estudiaron con ambas técnicas 146 aislamientos clínicos invasores de H. influenzae, obtenidos de niños menores de 5 años, recolectados a partir de 1999 hasta 2002, identificados y serotipificados por el laboratorio de referencia como parte de la vigilancia de la meningitis bacteriana aguda y la infección respiratoria aguda. Nuestros resultados mostraron una correlación de 93 por ciento en la tipificación capsular de H. influenzae, serotipo b, y de 92 por ciento con respecto al resto de serotipos. La técnica de aglutinación en lámina realizada con un estricto control de calidad continúa siendo una herramienta sensible y específica para la serotipificación de H. influenzae.


Subject(s)
Haemophilus influenzae , Polymerase Chain Reaction , Agglutination Tests/methods
15.
Biomédica (Bogotá) ; Biomédica (Bogotá);22(3): 272-279, sep. 2002.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-330481

ABSTRACT

Shigellosis is an acute diarrhoeal disease that is the main cause of morbidity and mortality in developing countries. In 1997, the Colombian Instituto Nacional de Salud Microbiology Group organized a network surveillance program with the country's Public Health Laboratories (PHLs) to monitor the principal etiological agents responsible for acute diarrhoeal disease. In May, 2001, the PHL of the state of Cundinamarca reported a food poisoning outbreak involving an elementary school community. The main goal of the Microbiology Group involvement was to establish the molecular relationships among the isolates from the outbreak by phenotypic and genotypic methods of characterization. Stool cultures were obtained from 22 of 195 affected individuals. The Microbiology Group confirmed the identification of the isolates by biochemical and serological probes. The antimicrobial susceptibilities were tested against the following battery of antibiotics: chloramphenicol, trimehoprim-sulfamethozazole, cefotaxime, gentamicin, ampicillin and ciprofloxacin. The isolates were subjected to pulsed field gel electrophoresis (PFGE) using the following CDC (U.S. Centers for Disease Control) protocols: Xbal restriction enzyme, Shigella sonnei CDC F2353 as the reference standard, and lambda phage as a molecular weight marker. In 15 of 22 (68) stool cultures Shigella was recovered, all isolates were identified as Shigella flexneri serotype 6 biotype Newcastle with the same antimicrobial susceptibility profile. PFGE showed that 3 (20) isolates were identical (100 genetic similarity) and the other 12 (80) were very closely related (genetic similarity between 86-98). The network system permitted the INS ready access to the isolates and the implementation of the PFGE permitted a quantitative characterization of the clonal relationship among the isolates from the outbreak.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child, Preschool , Child , Disease Outbreaks , Dysentery, Bacillary , Shigella flexneri , Acute Disease , Colombia , Genotype , Phenotype , Schools , Shigella flexneri
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