Fenotipificación y genotipificación en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal en un centro de referencia de Colombia / Phenotyping and genotyping in patients with inflammatory bowel disease in a reference center in Colombia

RESUMEN Introducción: Se ha tratado de identificar los factores genéticos relacionados con susceptibilidad para enfermedad inflamatoria intestinal (EII), y los hallazgos actuales se inclinan por un modelo de patología complejo, sin un patrón hereditario claro. Objetivo: Realizar caracterización fenotípica y genotípica de pacientes con EII en población colombiana y describir su posible asociación con predisposición. Materiales y métodos: Serie de casos, 16 pacientes con EII por criterios clínicos y anatomopatológicos, inicio de síntomas gastrointestinales después de los 18 años. Todos tuvieron asesoramiento genético pre-test y se realizaron árboles genealógicos de mínimo tres generaciones. También, genotipificación, por medio de un panel de genes múltiples que incluía genes relacionados con EII y algunos trastornos autoinmunitarios. Finalmente, se realizó análisis genómico de variantes. Resultados: 9 mujeres y 7 hombres, con edad media de diagnóstico de EII 35 años, y 32 años para aparición de síntomas gastrointestinales. 11/16(68,75%) requirieron terapia biológica. 10/16 (62,5%) presentaron refractariedad a terapia estándar. 3/16 (18,75%) tenían antecedentes familiares positivos de EII. 100% casos presentaron al menos un single nucleotide polymorphism relacionado con riesgo de EII en más de un gen. Los genes más relacionados con colitis ulcerosa (CU), fueron CD48, CD6, y TYK2 para CU, y CD6 e ITGAM para la enfermedad de Crohn. El gen más frecuente fue CD6. Se observó en 3/16 (18,75%) presencia de hasta 5 genes, 4 en 3/16 (18,75%), y tres en 5/16 (31,25%). Conclusión: En EII hay presencia de variantes genéticas con predisposición asociada, pero sin patogenicidad confirmada, y cuya sumatoria parece contribuir en su fisiopatología.

ABSTRACT Introduction: Attempts have been made to identify the genetic factors related to susceptibility to inflammatory bowel disease (IBD), and the current conclusions are in favor of a complex pathology model, without a clear hereditary pattern. Objective: To perform phenotypic and genotypic characterization of patients with IBD in Colombian population and to describe its possible association with predisposition. Materials and methods: case series, 16 patients with IBD according to clinical and pathological criteria, onset of gastrointestinal symptoms after 18 years of age. All had pre-test genetic counseling and family trees of at least three generations were made. Also, genotyping, using a multigene panel that included genes related to IBD and some autoimmune disorders. Finally, a genomic analysis of variants was performed. Results: 9 women and 7 men, with mean age of diagnosis of IBD of 35 years, and gastrointestinal symptoms appearance of 32 years. 11/16 (68.75%) required biological therapy. 10/16 (62.5%) were refractory to standard therapy. 3/16 (18.75%) had positive family history of IBD. 100% cases presented at least one single nucleotide polymorphism related to IBD risk in more than one gene. The genes most related to ulcerative colitis (UC) were CD48, CD6, and TYK2 for UC, and CD6 and ITGAM for Crohn's disease. The most frequent gene was CD6. It was found presence of up to 5 genes in 3/16 (18.75%), 4 in 3/16 (18.75%), and three in 5/16 (31.25%). Conclusion: In IBD there is the presence of genetic variants with associated predisposition, but without confirmed pathogenicity, and whose sum seems to contribute to its pathophysiology.

Emerging Disease: A Case Series of post-COVID-19 Cholangiopathy

Introduction: Post-COVID-19 cholangiopathy is a novel condition characterized by biliary tract sclerosis and elevated alkaline phosphatase levels in critically ill patients. This case series aims to describe the experience of a Latin American reference hospital in managing this condition. Methods: This case series includes patients with confirmed coronavirus disease 2019 (COVID-19) who exhibited subsequent elevation of alkaline phosphatase levels exceeding three times the normal value. The patients also had documented bile duct abnormalities observed through cholangioresonance or endoscopic retrograde cholangiopancreatography (ERCP). The clinical presentation, imaging findings, complications, and treatment approaches are described. Results: Eight patients (56.5 ± 9.2 years old, 62.5% male) were included in the study. All patients had previously experienced severe acute respiratory syndrome coronavirus type 2 (SARS-CoV-2) pneumonia and required mechanical ventilation. Four patients (50%) received sedoanalgesia with ketamine, and all eight patients (100%) received propofol. All patients developed infections, such as cholangitis or liver abscesses, caused by gram-negative bacteria. The peak alkaline phosphatase level during follow-up averaged 1646.12 ± 611.3. Imaging findings revealed intrahepatic (100%) and extrahepatic (87.5%) bile duct dilation. In 75% of cases, bile molds with a black appearance were extracted. Seven patients experienced recurrent cholangitis, and three patients were referred for pre-liver transplant consultation. Conclusions: Post-COVID-19 cholangiopathy is characterized by severe cholestasis, intra- and extrahepatic bile duct dilation, formation of bile molds, and recurrent cholangitis. In our study, a possible association between sepsis caused by gram-negative bacteria and the use of sedative medications is hypothesized. Further studies are necessary to establish the most appropriate management strategies for these patients, as they currently face unfavorable long-term morbidity and mortality outcomes.

Introducción: la colangiopatía pos-COVID-19 es una entidad nueva caracterizada por esclerosis del tracto biliar y elevación de fosfatasa alcalina en el paciente críticamente enfermo. Esta serie de casos describe la experiencia de un hospital de referencia en Latinoamérica. Métodos: serie de casos que incluye a pacientes con enfermedad por coronavirus de 2019 (COVID-19) confirmada y elevación posterior de fosfatasa alcalina > 3 veces del valor normal, asociados a anormalidades en las vías biliares documentada por colangiorresonancia o colangiopancreatografía retrógrada endoscópica (CPRE). Se describe la presentación clínica, hallazgos imagenológicos, complicaciones y tratamiento. Resultados: se incluyeron a 8 pacientes (56,5 ± 9,2 años, 62,5% hombres). Todos presentaron neumonía por coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave de tipo 2 (SARS-CoV-2) previo a desarrollo de colangiopatía, y requirieron ventilación mecánica. Cuatro pacientes (50%) recibieron sedoanalgesia con ketamina y ocho (100%) con propofol. Todos presentaron infecciones (colangitis/abscesos hepáticos) por bacterias gramnegativas. El nivel pico de fosfatasa alcalina durante el seguimiento fue en promedio 1646,12 ± 611,3. Los hallazgos imagenológicos incluyeron dilatación de la vía biliar intrahepática (100%) y extrahepática (87,5%). En el 75% se extrajo el molde biliar de apariencia negra. Siete pacientes presentaron recurrencia de colangitis y tres pacientes fueron referidos a consulta de pretrasplante hepático. Conclusiones: la colangiopatía pos-COVID-19 está caracterizada por colestasis grave con dilatación de la vía biliar intra- y extrahepática, formación de moldes biliares y colangitis recurrente. En nuestro estudio se plantea como hipótesis una posible relación con sepsis por bacterias gramnegativas y uso de medicamentos sedativos. Se requieren nuevos estudios para establecer el manejo más adecuado para estos pacientes, que hasta el momento presentan una morbimortalidad desfavorable a largo plazo.

Clinical characteristics, treatments, and outcomes of dificult biliary stones in a reference hospital in Colombia

The local experience and the success rate of different available treatments for dificult biliary stones in Colombia are poorly described. We made an observational study reporting patients treated for dificult biliary stones, at Hospital Universitario San Ignacio in Bogotá, Colombia between January 2015, and November 2021. Clinical characteristics, endoscopic retrograde cholangiopancreatography (ERCP) findings, and outcomes are presented. Additionally, the success rates of Endoscopic Sphincterotomy Plus Large Balloon Dilation (ESLBD), Mechanical Lithotripsy (ML), temporary stenting (TS), cholangioscopy-guided laser lithotripsy (CGLL), and surgery are described. A total of 146 patients were included (median age 69 years, IQR 58.5-78.5, 33.8% men). The median stone diameter was 15 mm (IQR 10 - 18 mm). One stone was presented in 39.9%, two stones in 18.2%, and ≥3 stones in the remaining stone. A 67.6% disproportion rate was observed between the stone and distal common bile duct. Successful stone extraction was achieved in 56.2% in the first procedure, 22.6% in the second, 17.1% in the third, 3.4% in the fourth, and 0.7% in the fifth procedures. The successful extraction rates were 56.8% for ESLBD, 75% for ML, 23.4% for TS, 57.7% for CGLL, and 100% for surgery. Endoscopic management of dificult stones is usually successful, although it usually requires 2 or more ERCPs procedures. The surgical requirements were low. ESLBD is an effective technique unlike TS. Few patients required advanced techniques such as ML or CGLL. Endoscopic procedures are associated with a low rate of complications.

La tasa de éxito de diferentes tratamientos de Cálculo Biliar Difícil (CBD) en Colombia no está descrita. Hemos realizado un estudio descriptivo observacional sobre el tratamiento de CBD en el Hospital Universitario San Ignacio en Bogotá, Colombia entre enero 2015 y noviembre 2021. Se presentan las características clínicas, hallazgos en la Colangiopancreatografía Retrógrada Endoscópica (CPRE) y desenlaces asociados. Adicionalmente, se describe la tasa de éxito de los pacientes tratados mediante esfinterotomía asociada a dilatación endoscópica con balón grande (EDEBG), litotripsia mecánica (LM), stent temporal (ST), litotripsia con láser guiada por colangioscopia (LLGC) y cirugía. 146 pacientes fueron incluidos (Mediana de edad 69 años, RIC 58,6-78,5). 33,8% eran hombres. La mediana del tamaño del CBD fue de 15 mm (RIC 10-18 mm). 39,9% tenían un solo cálculo, 18,2% tenían 2 y el resto ≥3 cálculos. 67,6% tenían desproporción entre el cálculo y el colédoco distal. La extracción exitosa se logró en 56,2% en el primer procedimiento, 22,6% en el segundo, 17,1% en el tercero, 3,4% en el cuarto y 0,7% en el quinto procedimiento. La tasa de extracción exitosa fue de 56,8% con EDEBG, 75% con LM, 23,4% con ST, 57,7% con LLGC y 100% con cirugía. El manejo endoscópico del CBD es usualmente exitoso. Sin embargo, requiere usualmente ≥2 CPRE. El tratamiento quirúrgico no es común. EDEBG es una técnica efectiva a diferencia del ST. Pocos pacientes requirieron técnicas avanzadas como LM o LLGC. Los métodos endoscópicos presentan una baja tasa de complicaciones.

Caracterización de los trastornos manométricos esofágicos en pacientes con enfermedad por reflujo gastroesofágico refractario con síntomas esofágicos / Characterization of esophageal motility disorders in refractory gastroesophageal reflux disease patients with esophageal symptoms

Resumen Introducción: La enfermedad por reflujo gastroesofágico (ERGE) refractaria puede conducir a complicaciones potenciales como la esofagitis persistente, estenosis esofágica, anillo de Schatzki y esófago de Barrett. Este estudio describe la motilidad en pacientes con ERGE refractaria y su relación con síntomas esofágicos. Método: Se realizó un estudio observacional analítico a partir de una cohorte retrospectiva en pacientes con diagnóstico de ERGE refractaria y síntomas esofágicos a quienes se les realizó manometría esofágica de alta resolución más impedanciometría. Se describen las características clínicas y demográficas, y la asociación entre los trastornos manométricos y los síntomas esofágicos. Resultados: Se incluyeron 133 pacientes (edad promedio: 54,1 ± 12,5 años). La pirosis y regurgitación (69,2 %) y la disfagia esofágica (13,5 %) fueron los síntomas más comunes. La motilidad normal (75,2 %), el aclaramiento completo del bolo (75,2 %) y la motilidad esofágica inefectiva (MEI) (18 %) fueron los hallazgos manométricos más frecuentes. La unión gastroesofágica tipos II y IIIb estuvieron presentes en el 35,3% y 33,8 % de los casos, respectivamente. La aperistalsis (3,8 %) y el esófago en martillo neumático (Jackhammer; 0,8 %) fueron infrecuentes. El aclaramiento incompleto del bolo se asoció con disfagia esofágica (p = 0,038) y a MEI (p = 0,008). Ningún síntoma esofágico se relacionó significativamente con trastornos de motilidad. Conclusiones: Los resultados de nuestro estudio sugieren que los trastornos de motilidad son infrecuentes en los pacientes con ERGE refractaria. Adicionalmente, sugieren que la presencia de alteraciones de motilidad esofágica no se relaciona con la presencia de síntomas esofágicos y, por tanto, que el tipo de síntoma presentado no permite predecir la existencia de dichos trastornos.

Abstract Introduction: Refractory gastroesophageal reflux disease (GERD) can lead to potential complications such as persistent esophagitis, esophageal stricture, Schatzki ring, and Barrett's esophagus. This study describes motility in patients with refractory GERD, and its association with esophageal symptoms. Materials and methods: An analytical observational study was carried out in a retrospective cohort of patients diagnosed with refractory GERD and esophageal symptoms who underwent high-resolution esophageal manometry and impedance testing. Clinical characteristics, demographics, and the association between motility disorders and esophageal symptoms are described. Results: 133 patients were included (mean age 54.1 ± 12.5 years). Heartburn and regurgitation (69.2%), and esophageal dysphagia (13.5%) were the most common symptoms. Normal motility (75.2%), complete bolus clearance (75.2%), and ineffective esophageal motility (IEM) (18%) were the most frequent manometric findings. Type II and IIIb gastroesophageal junction were observed in 35.3% and 33.8% of the cases, respectively. Esophageal aperistalsis (3.8%) and Jackhammer esophagus (0.8%) were rare findings. Incomplete bolus clearance was associated with esophageal dysphagia (p=0.038) and IEM (p=0.008). No esophageal symptoms were significantly related to motility disorders. Conclusions: The results of the present study suggest that motility disorders are rare in patients with refractory GERD. They also suggest that esophageal motility disorders are not associated with the presence of esophageal symptoms and, therefore, the type of symptom experienced does not allow predicting the existence of such disorders.

Actualización en la interpretación de la medición del pH e impedanciometría / Updated interpretation of Impedance-pH monitoring

Resumen La enfermedad por reflujo gastroesofágico (ERGE) se define como el tránsito anormal del contenido gástrico hacia el esófago, que se da por una alteración de la barrera antirreflujo, causando síntomas o complicaciones. Para su correcto diagnóstico y abordaje terapéutico, se requiere de la integración de hallazgos clínicos, endoscópicos y monitorización del pH esofágico en 24 horas con o sin impedanciometría, la cual debe ser realizada con especificaciones técnicas, y su interpretación debe basarse en la mejor evidencia clínica disponible, con el objetivo de tener diagnósticos precisos que permitan tomar las mejores decisiones con los pacientes. Recientemente, en el Consenso de Lyon se han incorporado nuevas directrices para el diagnóstico de ERGE por monitorización de pH esofágico, las cuales se revisan en este artículo.

Abstract Gastroesophageal reflux disease (GERD) is defined as the abnormal transit of gastric contents into the esophagus. It is caused by an alteration of the anti-reflux barrier, causing multiple symptoms or complications. In order to achieve accurate diagnosis and proper therapeutic approach, integration of clinical findings, endoscopic findings and 24-hour esophageal pH monitoring, with or without impedancometry, is required. These tests must be performed following technical specifications and their interpretation must be based on the best clinical evidence available to obtain accurate diagnoses that allow making the best decisions to the benefit of patients. Recently, the Lyon Consensus incorporated new guidelines for the diagnosis of GERD by esophageal pH monitoring, which are reviewed in this paper.

Diagnostic challenge between Crohn's disease and intestinal tuberculosis in chronic diarrhea with ulcerated jejunal stenosis: a case report / Desafío diagnóstico entre la enfermedad de Crohn y la tuberculosis intestinal en la diarrea crónica con estenosis yeyunal ulcerada: reporte de un caso

ABSTRACT Intestinal tuberculosis and Crohn's disease are a diagnostic challenge because of the clinical, radiological and endoscopic similarity. The histological and microbiological findings are positive in less than 50%, which delays the correct treatment, putting the patient at risk. We reported a 34-year-old immunocompetent patient with 4 years of malabsorptive diarrhea, weight loss, nocturnal diaphoresis, abdominal pain and an ulcer with stenosis in the jejunum was found; she received empirical anti- tuberculosis treatment with clinical improvement. Later the culture was positive for M. tuberculosis.

RESUMEN La tuberculosis intestinal y la enfermedad de Crohn son un desafío diagnóstico debido a la similitud clínica, radiológica y endoscópica. Los hallazgos histológicos y microbiológicos son positivos en menos del 50%, lo que retrasa el correcto tratamiento, poniendo en riesgo al paciente. Reportamos un paciente de 34 años inmunocompetente con 4 años de diarrea malabsortiva, pérdida de peso, diaforesis nocturna, dolor abdominal y se encontró una úlcera con estenosis en yeyuno; recibió tratamiento empírico antituberculoso con mejoría clínica. Posteriormente el cultivo fue positivo para M. tuberculosis.

Cómo realizar e interpretar una manometría anorrectal de alta resolución / How to perform and interpret high resolution anorectal manometry

Resumen La manometría anorrectal es la técnica más utilizada para evaluar la función anorrectal y así detectar las anormalidades funcionales del esfínter anal y de coordinación anorrectal. En nuestro laboratorio de fisiología realizamos aproximadamente 15 estudios de manometría anorrectal de alta resolución a la semana, por lo que consideramos que es de vital importancia realizarlo de forma adecuada y tener una correcta interpretación. Mediante este artículo deseamos compartir nuestro protocolo de realización de manometría anorrectal de alta resolución con base en la literatura más relevante.

Abstract Anorectal manometry is the most commonly used technique to evaluate anorectal functioning and coordination and detect functional abnormalities of the anal sphincter. In our physiology laboratory we perform approximately 15 high resolution anorectal manometry studies each week. We consider that proper performance and correct interpretation are vitally important. We want to share our high resolution anorectal manometry protocol based on the most relevant literature through this article.

Actualización con la clasificación de Londres en la interpretación de la manometría anorrectal de alta resolución / Update of high-resolution anorectal manometry interpretation using the London classification

Resumen La manometría anorrectal de alta resolución es una prueba diagnóstica utilizada para los trastornos motores y sensitivos anorrectales. Consta de una medición del tono basal y de contracción anal; también valora la maniobra de pujo, reflejo rectoanal inhibitorio (RIAR) y parámetros sensitivos rectales. La interpretación convencional de la manometría anorrectal se enfoca en describir aisladamente la región anatómica disfuncional. Sin embargo, con la clasificación de Londres se busca estandarizar el informe de estos resultados, agrupándolos en trastornos mayores, menores y hallazgos no concluyentes, similar a la clasificación de Chicago para trastornos motores esofágicos.

Abstract High resolution anorectal manometry is a diagnostic test, used for anorectal motor and sensory disorders. It consists of measurement of basal tone, anal contraction and squeeze, the rectoanal inhibitory reflex (RAIR), and rectal sensory parameters. The conventional interpretation of anorectal manometry focuses on describing the dysfunctional anatomical region in isolation. However, the London classification seeks to standardize the report of these results, grouping them into major, minor and inconclusive findings in a manner similar to the Chicago classification for esophageal motor disorders.

Cómo realizar e interpretar una manometría esofágica de alta resolución usando la clasificación de Chicago 3. 0 / How to perform and interpret a high resolution esophageal manometry using the Chicago 3.0 classification

Resumen Con la introducción de la manometría esofágica de alta resolución se revelaron patrones no identificados previamente de la función esofágica. De igual forma, este método diagnóstico adiciona patrones de presión topográfica de la presión esofágica, lo que lleva al desarrollo de nuevas herramientas para el análisis y clasificación de desórdenes motores esofágicos. En la actualidad, la clasificación de Chicago 3.0 es la herramienta de análisis de los diferentes trastornos motores esofágicos. En Colombia, cada día se ve el crecimiento en la realización de este estudio. El artículo propone hacer una revisión de cómo realizar e interpretar una manometría esofágica de alta resolución y clasificar los diferentes trastornos de la motilidad esofágica según la última actualización de la clasificación de Chicago 3.0.

Abstract The introduction of high resolution esophageal manometry has led to the revelation of previously unidentified patterns of esophageal function. Similarly, this diagnostic method has revealed topographic patterns of esophageal pressure which has led to the development of new tools for analysis and classification of esophageal motility disorders. Currently, the Chicago 3.0 classification has become a tool for analysis of the various esophageal motility disorders. In Colombia, the use of this study is spreading and growing. This article reviews of how to perform and interpret high resolution esophageal manometry and shows how to classify esophageal motility disorders according to the latest update of Chicago 3.0.

Cómo realizar e interpretar una manometría esofágica de alta resolución / How to Perform and Interpret High-resolution Esophageal Manometry

Con la introducción de la manometría esofágica de alta resolución se revelaron patrones no identificados previamente de la función esofágica normal así como hallazgos anormales. De igual forma, adiciona patrones de presión gráficos y topografía de la presión esofágica, lo que lleva al desarrollo de nuevas herramientas para el análisis y clasificación de desórdenes motores esofágicos. En la actualidad la clasificación de Chicago es el método diagnóstico de análisis de los diferentes trastornos motores esofágicos; en Colombia, día a día vemos el crecimiento en la realización de este estudio. El artículo propone hacer una revisión de cómo realizar e interpretar una manometría esofágica de alta resolución.

The introduction of high-resolution esophageal manometry allowed physicians to identify both previously unidentified normal esophageal functions and patterns and various abnormalities. The creation of new charts of pressure patterns and the topography of esophageal pressure has led to the development of new tools for analysis and classification of esophageal motor disorders. At present, the Chicago classification is the diagnostic method of analysis used for various esophageal motor disorders. In Colombia, we see the use of high-resolution esophageal manometry growing on a daily basis. In this article we review how to perform and interpret high-resolution esophageal manometry.