Serious acute respiratory syndrome: a case series in a municipality region of central Brazil / Síndrome respiratória aguda grave: série de casos em município da região central do Brasil

The influenza B virus is more stable than influenza A, with less antigenic drift and consequent immunologic stability, and does not undergo the process of antigenic shift, its participation in epidemics is minimal, being of lesser academic interest. The aim of this work was to describe the occurrence of a series of SARS cases in a municipality in the Central region of Brazil. This is a case series study with a descriptive and quantitative approach of Serious Acute Respiratory Syndrome (SARS) in institutionalized individuals and a health professional from a long-term institution in the municipality where the study was conducted. The variables studied were: age, comorbidities, vaccination status, date of symptoms onset, symptoms, occurrence of death, information regarding provided care (hospital care, exams, and medications). The study was approved by the Research Ethics Committee of the Federal University of Goiás (UFG), under opinion number 2.167.287. Case 1 was diagnosed with influenza B, treated with antibiotic therapy, with no antiviral drugs administered, and culminated in death. Cases 2 and 3 were confirmed as influenza B, being treated with antiviral drugs and discharged due to full recovery. Case 4 was confirmed as influenza B virus by epidemiological link, treated with antiviral drugs and discharged due to full recovery. An early diagnosis, adequate clinical management, transmissible disease research based on the 11 health promotion steps and actions can promote the reduction of morbimortality by influenza type B.

O vírus influenza B é mais estável que a influenza A, apresenta menor desvio antigênico, consequentemente estabilidade imunológica, e não sofre processo de desvio antigênico, não estão associados a grandes epidemias, estando, portanto, pouco associados ao interesse acadêmico. O objetivo do trabalho foi escrever a ocorrência de uma série de casos de Síndrome Respiratória Aguda Grave (SRAG) em um município da região central do Brasil. Trata-se de um estudo de série de casos com abordagem descritiva e quantitativa de SRAG, ocorridos em indivíduos institucionalizados e um profissional de saúde de uma instituição de longa permanência do município onde o estudo foi desenvolvido. As variáveis estudadas foram: idade, co-morbidades, situação vacinal, data do início dos sintomas, sintomas, ocorrência de óbito, informações referentes à assistência prestada (atendimento hospitalar, exames, medicações). O estudo foi aprovado pelo Comitê de ética em Pesquisa da Universidade Federal de Goiás (UFG), parecer número 2.167.287. O caso 1 foi diagnosticado com influenza B, tratado com antibioticoterapia, não sendo utilizado antiviral, culminando em óbito. O caso 2 e 3 foram confirmados vírus influenza B, sendo tratados com antiviral e receberam alta por cura. O caso 4 foi confirmado influenza por vírus B por vínculo epidemiológico, tratado com antiviral e recebeu alta por cura. Conclusões: Um diagnóstico precoce, manejo clínico adequado, investigação de doenças transmissíveis pautada nos 11 passos e ações de promoção da saúde, podem promover a redução da morbimortalidade por influenza tipo B.

Seropositivity diagnosis for hantavirus in Jataí, Goiás State, Brazil

Abstract INTRODUCTION: Emerging diseases are of great interest, especially those associated with high mortality rates such as hantaviruses. We aimed to conduct a seroepidemiological survey to determine the levels of hantavirus infection. METHODS: In-house enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was used to detect specific antibodies. RESULTS: Of the 429 samples collected, seropositivity of 3.9% to anti-hantavirus immunoglobulin G (IgG) was observed (CI 95%: 2.3-5.7). Moreover, in three cases, immunoglobulin M (IgM) was detected, of which two were diagnosed as hantavirus cardiopulmonary syndrome (HCPS). CONCLUSIONS: Our data indicate the considerable occurrence of previous hantavirus infections, highlighting occurrences from sub-clinical cases to HCPS.

Estudo transversal da letalidade da hantavirose no estado de Goiás, 2007-2013 / Estudio transversal de la letalidad de la infección por hantavirus en el estado de Goiás, Brasil, 2007-2013 / Cross-sectional study on case fatality rate due to hantavirus infection in Goiás State, Brazil, 2007-2013

OBJETIVO: descrever o perfil epidemiológico e clínico da hantavirose e analisar fatores associados à letalidade em Goiás, Brasil. MÉTODOS: foi conduzido um estudo transversal com dados do Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Sinan), referentes ao período de 2007 a 2013, no estado de Goiás. Regressão logística foi empregada para estimar razões de chances (OR) com intervalos de confiança de 95% (IC95%). RESULTADOS: foram notificados 1.171 casos suspeitos de hantavirose e 73 (6,2%) confirmados. Entre os confirmados, observou-se maior frequência entre homens (n=50), febre como sintoma mais frequente (n=70) e elevada proporção de hospitalizações (n=68). A taxa de letalidade foi de 57,5%. Foram fatores associados ao óbito: insuficiência respiratória aguda (IRpA) (OR=3,6; IC95%1,2;10,6), hemoconcentração (OR=3,3; IC95%1,1;7,9) e não uso do respirador mecânico (OR=3,4; IC95%1,3;9,1). Após ajuste, a IRpA permaneceu associada ao óbito (OR=3,4; IC95%1,0;11,6). CONCLUSÃO: foi identificada alta taxa de letalidade, associada principalmente com insuficiência respiratória.

OBJETIVO: evaluar el perfil clínico y epidemiológico del hantavirus y los factores asociados con su letalidad en Goiás, Brasil. MÉTODOS: estudio transversal usando datos del Sistema de Información de Enfermedades de Declaración Obligatoria (Sinan), referentes al periodo 2007-2013, en el estado de Goias. Usamos regresión logística para calcular odds ratio (OR) con intervalos de confianza al 95%. RESULTADOS: fueron reportados 1.171 casos sospechosos de hantavirus 73 fueron confirmados (6,2%). Entre los confirmados la frecuencia fue mayor entre hombres (n=50), fiebre fue síntoma más común (n=70), 68 fueron hospitalizados, la tasa de letalidad fue 57,5%. Variables asociadas con letalidad: insuficiencia respiratoria aguda (IRpA) (OR=3,6 IC95% 1,2; 10,6), hemoconcentración (OR=3.3 IC95% 1,1; 7,9) y no usar respirador mecánico (OR=3,4 IC95% 1,3; 9,1). Sólo IRpA se mantuvo asociado en modelos multivariados (OR=3,4 IC95% 1,0; 11,6). CONCLUSIÓN: identificamos una alta tasa de letalidad asociada principalmente con insuficiencia respiratoria.

OBJECTIVE: to describe the epidemiological and clinical profile of hantavirus infection and to analyze factors associated with case-fatality in Goiás, Brazil. METHODS: this was a cross-sectional study on case fatality due to hantavirus infection from 2007 to 2013 using data from the Notifiable Diseases Information System (SINAN) for Goiás State. Logistic regression analysis was performed to estimate odds ratios (OR) with 95% confidence intervals (95%CI). RESULTS: 1,171 suspected cases were reported, of which 73 (6.2%) were confirmed. Among the confirmed cases, greater frequency was found among males (n=50), fever was the most common symptom (n=70), and there was a high proportion of hospitalization (n=68). The case-fatality rate was 57.5% . The following factors were associated with death: acute respiratory failure (ARF) (OR=3.6; 95%CI 1.2;10.6), hemoconcentration (OR=3.3; 95%CI 1.1;7.9) and not using a mechanical ventilator (OR=3.4; 95%CI 1.3;9.1). After adjustment, the ARF was still associated with death (OR=3.4; 95%CI 1.0;11.6). CONCLUSION: the case-fatality rate was high, primarily associated with respiratory failure.

Hantavirus cardiopulmonary syndrome: a report of two cases / Síndrome cardiopulmonar por hantavírus: relato de dois casos

Infection with hantavirus, from the family Bunyaviridae, causes hantavirus cardiopulmonary syndrome (HCPS) in the Americas. This highly lethal anthropozoonosis afflicts preferentially individuals in rural areas and is transmitted by aerosol of excreta from infected wild rodents. The aim of this study is to report the almost simultaneous occurrence of two cases of HCPS in the municipality of Jataí, state of Goiás, Brazil.

A infecção por hantavírus, família Bunyaviridae, provoca a síndrome cardiopulmonar por hantavírus (SCPH) nos países da América. Ela é uma antropozoonose, de elevada letalidade, que tem acometido preferencialmente indivíduos em contato com o meio rural, sendo transmitida por aerossóis a partir das excretas dos roedores silvestres infectados. O objetivo deste estudo foi relatar a ocorrência, quase que simultânea, de dois casos de SCPH ocorridos no município de Jataí, Estado de Goiás, Brasil.

Principais parâmetros biológicos avaliados em erros na fase pré-analítica de laboratórios clínicos: revisão sistemática / Main biological parameters evaluated in pre-analytical phase errors at clinical laboratories: a systematic review

O diagnóstico laboratorial passou por várias mudanças devido à automatização. Além do aparelhamento, a adoção de um programa de garantia de qualidade (PGQ) está resultando em maior precisão nos exames. Para fins de controle em qualidade, o processamento de uma amostra biológica é didaticamente dividido em três fases: pré-analítica, analítica e pós-analítica. Na fase pré-analítica ocorre a maioria dos erros; a divulgação dessas falhas e sua discussão corroboram para a eficiência dos PGQs. No presente estudo, descrevemos as principais variações biológicas encontradas na fase pré-analítica em laboratórios clínicos, por meio de uma revisão sistemática. Fizeram parte dessa revisão 14 artigos. Os parâmetros biológicos descritos na revisão foram, principalmente, glicose, colesterol, triglicérides, enzimas e hormônios. Um erro frequente na punção venosa foi o uso prolongado do torniquete e entre as principais causas de erros observadas foram tempo de armazenamento, tempo de torniquete, técnicas de flebotomia, falta de informações aos pacientes, relação incorreta sangue/anticoagulante, tubos inadequados, amostras contaminadas, medicamentos e alterações interlaboratoriais. Nossos achados são similares aos encontrados em outras pesquisas, mas não encontramos estudos que avaliassem especificamente as alterações na fase pré-analítica decorrentes do uso de medicamentos. Concluímos que os parâmetros biológicos mais avaliados coincidiram com os exames de rotina e uma das formas de evitar às inexatidões laboratoriais é pôr em prática um eficiente PGQ e a produção de trabalhos que explanem o assunto a pacientes e profissionais da saúde.

Laboratory diagnosis has undergone several changes due to automation. Both equipment supplying and the introduction of quality assurance programs (QAP) have led to higher precision in tests. With the aim to promote quality control, the processing of biological samples comprises three phases: pre-analytical, analytical and post-analytical. Most errors occur in the pre-analytical phase. Thus, their determination and corresponding assessment maximize QAP efficiency. In this study, by means of a systematic review, which comprised 14 articles, we describe the main biological variations found in the pre-analytical phase at clinical laboratories. The biological parameters described in the review included glucose, cholesterol, triglycerides, enzymes and hormones. As far as venipuncture is concerned, a common error was the prolonged use of tourniquet. The main error causes were the following: storage time, tourniquet time, phlebotomy techniques, insufficient information to patients, incorrect blood/anticoagulant ratio, inadequate tubes, contaminated samples, medication and interlaboratory alterations. Our results corroborated other studies, although we did not find other investigations that specifically evaluated changes in the pre-analytical phase due to the use of medication. The most assessed biological parameters coincided with clinical tests. Accordingly, both the implementation of an efficient QAP and the development of professional awareness may prevent laboratory inaccuracies.

Síndrome pulmonar e cardiovascular por hantavírus: aspectos clínicos de uma doença emergente no sudeste brasileiro / Pulmonary and cardiovascular syndrome due to hantavirus: clinical aspects of an emerging disease in southeastern Brazil

A síndrome pulmonar e cardiovascular por hantavírus é doença causada pela aspiração de aerossóis dos dejetos de roedores silvestres contaminados por vírus da família Bunyaviridae. Estudamos manifestações clínicas e laboratoriais de 70 casos ocorridos de 1998 a 2007 na região de Ribeirão Preto, SP. A freqüência de sintomas foi dispnéia (87 por cento), febre (81 por cento), tosse (44 por cento), cefaléia (34 por cento), taquicardia (81 por cento), hipotensão arterial (56 por cento), hipóxia (49 por cento), acidose metabólica (57 por cento), linfocitopenia (51 por cento), hematócrito >45 por cento (70 por cento), leucocitose com desvio à esquerda (67 por cento), creatinina (51 por cento) e uréia (42 por cento) séricas elevadas. A letalidade (54,3 por cento) ocorreu principalmente no 4o dia. Insuficiência respiratória, hipotensão arterial e choque ocorreu 24-48 horas; o hematócrito elevado e a plaquetopenia são sinais fortemente sugestivos da doença. A hipótese diagnóstica de pneumonia atípica associada a bom prognóstico (p:0,0136); a infusão hídrica >2.000ml e hipotensão arterial associadas a mau prognóstico (p:0,0286 e p:0,0453).

Pulmonary and cardiovascular syndrome due to hantavirus is a disease caused by inhalation of aerosols from the excreta of wild rodents contaminated by viruses of the Bunyaviridae family. We studied the clinical and laboratory manifestations of 70 cases that occurred in the region of Ribeirão Preto, SP, Brazil, between 1998 and 2007. The frequency of symptoms was as follows: dyspnea (87 percent), fever (81 percent), coughing (44 percent), headache (34 percent), tachycardia (81 percent), low arterial blood pressure (56 percent), metabolic acidosis (57 percent), lymphocytopenia (51 percent), hematocrit > 45 percent (70 percent), leukocytosis with left deviation (67 percent), creatinine (51 percent) and urea (42 percent). Mortality (54.3 percent) occurred mainly on the fourth day. Respiratory insufficiency, low arterial blood pressure and shock occurred after 24 to 48 hours. High hematocrit and decreased platelet levels were signs strongly suggestive of the disease. The diagnostic hypothesis of atypical pneumonia was associated with a good prognosis (p = 0.0136). Fluid infusion greater than 2,000 ml and arterial hypotension were associated with a poor prognosis (p = 0.0286 and p = 0.0453).

Detection of Brazilian hantavirus by reverse transcription polymerase chain reaction amplification of N gene in patients with hantavirus cardiopulmonary syndrome

We report a nested reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay for hantavirus using primers selected to match high homology regions of hantavirus genomes detected from the whole blood of hantavirus cardiopulmonary syndrome (HCPS) patients from Brazil, also including the N gene nucleotide sequence of Araraquara virus. Hantavirus genomes were detected in eight out of nine blood samples from the HCPS patients by RT-PCR (88.9 percent positivity) and in all 9 blood samples (100 percent positivity) by nested-PCR. The eight amplicons obtained by RT-PCR (P1, P3-P9), including one obtained by nested-PCR (P-2) and not obtained by RT-PCR, were sequenced and showed high homology (94.8 percent to 99.1 percent) with the N gene of Araraquara hantavirus. Although the serologic method ELISA is the most appropriate test for HCPS diagnosis, the use of nested RT-PCR for hantavirus in Brazil would contribute to the diagnosis of acute hantavirus disease detecting viral genomes in patient specimens as well as initial genomic characterization of circulating hantaviruses.

Brazilian Flavivirus phylogeny based on NS5

In this work, a comprehensive phylogenetic study based on 600 base pair nucleotide and on putative 200 amino acid sequences of NS5 was carried out in order to establish genetic relationships among 15 strains of 10 Brazilian flaviviruses: Bussuquara, Cacipacore, dengue type 1, 2 and 4, Iguape, Ilheus, Rocio, Saint Louis encephalitis (SLE), and yellow fever. Phylogenetic trees were created by neighbor-joining and maximum parsimony methods. These trees showed Brazilian flaviviruses grouped into three main branches: yellow fever branch, dengue branch subdivided in types 1, 2 and 4 branches, and Japanese encephalitis virus (JEV) complex branch including SLE virus strains, Cacipacore, Iguape, Rocio, Ilheus and Bussuquara. Viruses transmitted by Aedes mosquitoes, such as dengue and urban yellow fever, that are also the only Flavivirus causing hemorrhagic fevers in Brazil, were grouped in the same cluster. Encephalitis associated viruses, transmitted by Culex mosquitoes such as JEV complex branch including SLE virus strains, Cacipacore, Iguape, Rocio, Ilheus and Bussuquara were also grouped in the same clade

Análise das seqüências de nucleotídios da regiäo 5' näo codificadora e dos genes das proteínas estruturais dos Flavivirus / Nucleotide sequence alignement of the 5' non coding and structural protein regions of the genome of Flaviviruses

Neste trabalho, analisaram-se comparativamente as seqüências de nucleotídios dos genes das proteínas estruturais C, prM e E de todos os Flavivirus, incluindo, também, a regiäo 5' näo codificadora, de 21 Flavivirus. Utilizou-se para a análise o programa de microcomputador DNAsis (Hitachi, Japäo) e construiu-se uma árvore filogenética, incluindo os vinte e um (21) vírus, após alinhamento de suas seqüências de nucleotídios. Na árvore filogenética obtida, observou-se uma ramificaçäo inicial, separando os vírus transmitidos por carrapatos daqueles transmitidos por mosquitos. Também, agruparam-se, em diferentes ramos, os vírus do dengue, os da febre amarela, e os da encefalite japonesa. Observou-se uma evidente relaçäo entre a árvore filogenética e os subgrupos e tipos virais, reconhecidos com base em relacionamento antigênico.