Inferência bayesiana aplicada à estimação de herdabilidades dos parâmetros da curva de crescimento de fêmeas da raça Nelore / Bayesian inference applied to the estimation of heritability of growth curve parameters of Nellore females

Objetivou-se estimar parâmetros genéticos, utilizando inferência Bayesiana, para as estimativas dos parâmetros individuais de peso à maturidade (Â) e taxa de crescimento (K), obtidos pela função de crescimento Brody. O arquivo estava constituído de 14.563 registros de pesos e idades referentes a 1.158 fêmeas da raça Nelore, participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore. Para a análise das estimativas dos parâmetros da curva, via inferência bayesiana, foi proposto um modelo animal unicaráter, que incluiu como fixo o efeito de grupo contemporâneo (animais nascidos no mesmo estado, no mesmo trimestre do ano, mesmo ano e mesmo regime alimentar) e como aleatórios os efeitos genético direto e residual. Nessa análise, foram utilizados dois diferentes tamanhos para as cadeias geradas pelo algoritmo de amostragem de Gibbs, de 550 e 1.100 mil ciclos, com períodos de descarte amostral de 50 e 100 mil ciclos, respectivamente, e amostragens a cada 500 e 1.000 ciclos, respectivamente. As médias posteriores da variância genética aditiva e residual foram próximas, tanto para  quanto para a K, mesmo quando implementados diferentes tamanhos para as cadeias geradas pelo algoritmo de amostragem de Gibbs. Os coeficientes de herdabilidade estimados para Â, variaram de 0,44 a 0,46, amplitude semelhante aos 0,46 a 0,48 obtidos para as estimativas de K. Essas magnitudes indicam que a seleção pode ser usada como instrumento para alterar a forma da curva de crescimento desses animais. Entretanto, o uso das informações obtidas, visando à alteração da curva de crescimento dos animais, deve ser feito com grande cautela, uma vez que as características a serem trabalhadas na modificação do formato da curva de crescimento, de acordo com resultados da literatura especializada, são negativamente correlacionadas.

The objective of this study was to estimate genetic parameters using Bayesian inference for the estimates of individual parameters of mature weight (Â) and growth rate (K), obtained by Brody growth function. The file consisted of 14,563 records relating to weights and ages of 1,158 Nelore females, participants in the Genetic Improvement Program of the Nellore. For the estimates analysis of the curve parameters via Bayesian inference, it was used an univariated animal model that included as fixed effect of contemporary group (animals born on the same state, in the same quarter of the year, the same year and feedlot) and random as the direct genetic and residual. In this analysis it was used two different sizes for the chains generated by Gibbs sampling algorithm, 550 and 1.1 million cycles, with initial discarding of 50 000 and sample of 100 000 cycles, respectively, and sampled every 500 cycles and 1000, respectively. The mean posterior and residual additive genetic variance showed a small variation to both  and K, even when implemented in different sizes for the chains generated by Gibbs sampling algorithm. The heritability estimates for Â, ranged from 0.44 to 0.46, similar to the range 0.46 to 0.48 obtained for the estimates of K. These magnitudes indicate that the selection can be used as a tool to change the shape of the growth curve of these animals. However, the use of the information to amend the growth curve of animals, must be done with great care, since the traits to be worked in the modification of the shape of the growth curve according to the literature results are negatively correlated.

Genotype by environment interaction in Nelore cattle from five Brazilian states

Records from 75,941 Nelore cattle were used to determine the importance of genotype by environment interaction (GEI) in five Brazilian states. (Co)variance components were estimated by single-trait analysis (with yearling weight, W450, considered to be the same trait in all states) and multiple-trait analysis (with the record from each state considered to be a different trait). The direct heritability estimates for yearling weight were 0.51, 0.39, 0.44, 0.37 and 0.41 in the states of Goiás, Mato Grosso, São Paulo, Mato Grosso do Sul and Minas Gerais, respectively. The across-state genetic correlation estimates between Goiás and Mato Grosso, Goiás and Minas Gerais, São Paulo and Minas Gerais, and Mato Grosso do Sul and Minas Gerais ranged from 0.67 to 0.75. These estimates indicate that GEIs are biologically important. No interactions were observed between Goiás and São Paulo, Goiás and Mato Grosso do Sul, Mato Grosso and São Paulo, Mato Grosso and Mato Grosso do Sul, Mato Grosso and Minas Gerais, or São Paulo and Mato Grosso do Sul (0.82 to 0.97). Comparison of single and multiple-trait analyses showed that selection based on the former was less efficient in the presence of GEI, with substantial losses (up to 10 percent) during selection.

Persistência na lactação para vacas da raça Holandesa criadas no Estado do Rio Grande do Sul via modelos de regressão aleatória / Lactation persistency for Holstein cows raised in the State of Rio Grande do Sul using a random regression model

Foram utilizados 21.702 registros de produção de leite no dia do controle de 2.429 vacas primíparas da raça Holandesa, filhas de 233 touros, coletados em 33 rebanhos do Estado do Rio Grande do Sul, entre 1992 e 2003, para estimar parâmetros genéticos, para três medidas de persistência (PS1, PS2 e PS3) e para a produção de leite até 305 dias (P305) de lactação. Os modelos de regressão aleatória ajustados aos controles leiteiros entre o sexto e o 300o dia de lactação incluíram o efeito de rebanho-ano-mês do controle, a idade da vaca ao parto e os parâmetros do polinômio de Legendre de ordem quatro, para modelar a curva média da produção de leite da população e os parâmetros do mesmo polinômio, para modelar os efeitos aleatórios genético-aditivo direto e de ambiente permanente. As estimativas de herdabilidade obtidas foram 0,05, 0,08 e 0,19, respectivamente, para PS1, PS2 e PS3 e 0,25, para P305 sugerindo a possibilidade de ganho genético por meio da seleção para PS3 e para P305. As correlações genéticas entre as três medidas de persistência e P305, variaram de -0,05 a 0,07, indicando serem persistência e produção, características determinadas por grupos de genes diferentes. Assim, consequentemente, a seleção para P305, geralmente praticada, não promove progresso genético para a persistência.

There were used 21,702 test day milk yields from 2,429 first parity Holstein breed cows, daughters of 2,031 dams and 233 sires, distributed over 33 herds in the state of Rio Grande do Sul, from 1992 to 2003. Genetic parameters for three measures of lactation persistency (PS1, PS2 e PS3) and for milk production to 305 days (P305) were evaluated. A random regression model adjusted by fourth order Legendre polynomial was used. The random regression model adjusted to test day between the sixth and the 305th lactation day included the herd-year-season of the test day, the age of the cow at the parturition effects and the order fourth Legendre polinomial parameters, for modeling the milk production average curve of the population, and parameters of the same polinomial for modeling the random additive genetic and permanent environmental effects. The estimated heritabilities were 0.05, 0.08 and 0.19, respectively to PS1, PS2 and PS3, and 0.25 to P305, suggesting the possibility of a genetic gain by selection for PS3 and P305. The genetic correlations between persistency measurements and P305 ranged from -0.05 to 0.07, suggesting being, persistency and milk yield, characteristics determined by different gene groups, and that the selection for P305, usually done, do not promote genetic progress for persistency.

Genetic trends in the expected progeny difference of the asymptotic weight of Nelore females

There are few studies on weight covering the full life cycle of Zebu cattle, and there is no entire growth description or mean growth pattern for animals belonging to this breed. In order to provide such data, 1,158 Nelore females born between 1985 and 1995 were weighed 14,563 times from birth to full growth maturity, in ten herds spread over seven Brazilian states. The Von Bertalanffy, Brody, logistic and Gompertz non-linear models were used to obtain the asymptotic weights (A) and the maturation rates (K). The (co)variance and breeding value components for A and K were obtained by using the multiple trait derivative free restricted maximum likelihood method under the animal model. Genetic trends were calculated in function of the mean expected progeny differences (EPD) for the trait (A or K) divided by the number of animals according to their year of birth. The genetic trends of the expected progeny difference with reference to the date of birth of the cows were, on average, -6.5g y-1 for A and 2.0g y-1 for K, close to zero as confirmed by the low (0.0023 to 0.003) coefficient of regression values. The curve parameters are recommended as a selection criterion to reach precocity and avoid adult weight increase in the female herd.

Association of GH and IGF-1 polymorphisms with growth traits in a synthetic beef cattle breed

The Canchim beef cattle (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) has been selected for meat production in Brazil since late 1950. In the present work the effects of growth hormone (GH) and insulin-like growth factor 1 (IGF-1) polymorphisms were investigated in 688 animals born between 1998 and 2000. These animals belonged to two genetic groups, i.e., traditional and new lineages. Genotype effects on expected breeding values for birth weight (BW), weaning weight (WW) and yearling weight (YW) were investigated by the least square method. Significant effects were found for GH genotype on YW (p < 0.05), with positive effects associated with the LV (leucine/valine) genotype. For IGF-1 genotypes, significant effects were found on BW (p < 0.01) and YW (p < 0.01). Average substitution effects for IGF-1 alleles estimated by regression analysis suggested a positive effect of the IGF-1 225 bp allele on BW and of the 229 bp allele on YW.

Efeito da idade sobre a fertilidade de éguas inseminadas com sêmen fresco diluído / Aging effects on fertility in mares inseminated with diluted fresh semen

Noventa e um ciclos estrais de sessenta éguas foram analisados com o objetivo de estudar o efeito da idade sobre a fertilidade de éguas inseminadas com sêmen fresco diluído. As éguas foram rufiadas e inseminadas às segundas, quartas e sextas-feiras, apresentando um folículo maior que 3,0 cm de diâmetro, com sêmen de apenas um garanhão de fertilidade comprovada, diluído para um volume inseminante de 10 mL com diluidor de mínima contaminação. De acordo com a idade, o resultado de cada ciclo foi agrupado nas seguintes faixas etárias: 4 a 6 anos, 7 a 10 anos, 11 a 14 anos e 15 a 16 anos de idade. As taxas de concepção ao primeiro ciclo foram, respectivamente, 72,73 por cento (8/11); 62,50 por cento (10/16); 66,67 por cento (12/18); 63,64 por cento (7/11) (P>0,05) e, após quatro ciclos, de 64,29 por cento (9/14); 60,71 por cento (17/28); 44,83 por cento (13/29); 50,00 por cento (10/20) (P>0,05). Conclui-se que nas condições utilizadas neste experimento, a idade da égua não influenciou a fertilidade quando da utilização de sêmen fresco diluído.

Efeito genéticos e näo genéticos sobre características ponderais de duas populaçöes da raça Nelore / Genetic and non-genetic effects on weight traits in two Nellore herds

Estudaram-se os pesos ao nascer (PN), aos 210 (PD) e 365 dias de idade (PA), de 3628 animais da raça Nelore, criados em três manejos diferentes de alimentaçäo (pasto, semi-estabulaçäo e estabulaçäo), em duas fazendas nos municípios de Naviraí (MS) e Uberaba (MG), no período 1976-1987. As análises estatísticas foram feitas de acordo com o método dos quadrados mínimos. As médias ajustadas e respectivos erros padräo para PN, PD e PA, foram 29,03 ñ 0,26; 178,61 ñ 1,55 e 258,34 ñ 3,31 kg, com valores de herdabilidade de 0,19 ñ 0,04 (PN);0,14 ñ 0,04 (PD) e 0,16 ñ 0,06 (PA). As estimativas de correlaçöes genéticas, fenótipicas e ambientes entre os pesos estudados foram, respectivamente, 0,28 ñ 0,22, 0,29 e 0,29 (PN-PD); 0,14 ñ 0,30, 0,24 e 0,26 (PN-PA) e 0,81 ñ 0,16, 0,67 e 0,66 (PD-PA). Os efeitos de reprodutor, sexo, mês e ano de nascimento foram significativos sobre todos os pesos, o efeito de fazenda näo foi significativo sobre o PN e o manejo nutricional mostrou significância sobre PD e PA

Efeitos genéticos e näo genéticos sobre a idade ao primeiro parto e o intervalo entre partos de duas populaçöes da raça Nelore / Genetic and non-genetic effects on age at first calving and calving interval in two Nellore herds

Estudaram-se a idade ao primeiro parto (n=749) e o intervalo entre partos (n=3285) de fêmeas da raça Nelore, criadas em duas fazendas, situadas nos municípios de Naviraí (MS) e Uberaba (MG), no período de 1964-1987. As análises estatísticas foram feitas de acordo com o método dos quadrados mínimos. As médias ajustadas e os erros padräo para a idade ao primeiro parto (IPP) e o intervalo entre partos (IEP) foram, respectivamente, 35,84 ñ 0,57 meses e 13,63 ñ0,09 meses, com valores de herdabilidade de 0,46 ñ 0,12 e 0,04 ñ 0,03, nesta ordem. A repetibilidade do intervalo entre partos foi de 0,13 ñ 0,02. As correlaçöes genética, fenotípica e ambiente entre a IPP e o primeiro IEP foram de 0,47 ñ 0,39; -0,01 e -0,28, respectivamente. Os efeitos de pai da novilha, fazenda, mês e ano de nascimento foram significativos sobre a IPP. Pai da vaca, vaca dentro de pai, ano e ordem de parto foram significativos sobre o IEP

Efeito da endogamia sobre a idade ao primeiro parto e o intervalo entre partos em uma populaçäo de elite da raça Nelore / Effect of inbreeding on age at first calving and calving intervals in a elite herd of Nelore cattle

Objetivou-se quantificar os efeitos da endogamia sobre a idade ao primeiro parto e intervalo entre partos de um rebanho de elite, da raça Nelore, explorado na Chácara Zebulândia, Estado de Säo Paulo. A amostra analisada constituiu-se de 792 registros genealógicos de fêmeas nascidas no período de 1960 a 1981. O modelo utilizado na análise de variância da idade ao primeiro parto incluiu os efeitos de ano e mês de nascimento da novilha como variáveis de classificaçäo de endogamia como covariável. Para os intervalos entre partos, o modelo incluiu os efeitos de mês, ano e ordem de pariçäo covariável. O modelo MTY 01, do método dos quadrados mínimos com números desiquais nas sub-classes, foi o adotado. O coeficiente médio de endogamia da populaçäo de vacas foi de 4,77 ñ 7,48%. As médias ajustadas e desvios padr*es da idade ao primeiro parto, do primeiro intervalo entre partos e do conjunto de intervalo entre partos foram 1248,73 ñ 178,59; 497,45 ñ 99,68 e 453,17 ñ 99,06 dias, respectivamente. O efeito da endogamia, estudado pela regressäo linear, foi signifcativo (P < 0,05) sobre a idade ao primeiro parto e primeiro intervalo entre partos. A cada 1% de aumento no coeficiente de endogamia correspondeu a um aumento de 2,36 ñ 0,95 e 1,59 ñ 0,62 dias nessas duas características. Nos intervalos subsequentes a endogamia näo exerceu efeito significativo, possivelmente pelo descarte precoce de vacas mais endogâmicas

Intervalo entre geraçoes e tendência do peso aos 365 dias de idade em um rebanho da raça Nelore / Generation interval and annual genetic trend of weight at 365 days of age Nellore cattle

Estimaram-se o intervalo entre geraç*es e a tendências genética anual do peso, aos 365 dias de idade, em um rebanho da raça Nelore. Os dados, colhidos entre 1969 e 1984, foram obtidos dos registros de controle zootécnico da chácara Zebulândia no Estado de Säo Paulo . O intervalo entre geraç*es estimado foi 7,00 ñ 2,48 anos, baseado na idade de pais de 3932 bezerros desmamados. As idades médias dos touros e das vacas foram 6,68 e 7,32 anos, respectivamente. A estimativa de tendência genética foi baseada em duas amostra: a primeira de registros individuais de 777 bezerros filhos de 12 touros utilizados em, pelo menos, três anos e com mínimo de três filhos por ano, durante o período de 1976 a 1984. A segunda de 1035 observaç*es de 24 touros utilizados em, pelos menos, dois anos, no mesmo período. Empregou-se o método do uso de touros repetidos em anos sucessivos, utilizando a análise de variância por quadrados mínimos. Estimativas de tendências genéticas, fenotípica e ambiente para as amostras com 12 e 24 touros foram, respectivamente, -1,28 e -1,64 kg/ano, 2,58 e 3,86 kg/ano