ABSTRACT
OBJECTIVE: To determine genetic relatedness of clone Colombia5 ST289 with invasive Streptococcus pneumoniae serotype 5 isolates recovered in nine Latin American countries. METHODS: Forty-four invasive S. pneumoniae serotype 5 isolates recovered from children under 5 years of age in Bolivia, Chile, Dominican Republic, Ecuador, Nicaragua, Panama, Paraguay, Peru, and Venezuela were studied. Pulsed-field gel electrophoresis patterns of DNA treated with SmaI restriction enzyme were classified using Tenover's criteria and analyzed with the Fingerprinting II program to determine their genetic relatedness with the Colombian clone. RESULTS: All isolates had a genetic similarity of 78.5 percent or more with the Colombian clone. Thirteen electrophoretic subtypes derived of pattern A were identified, and five of them (A5, A6, A8, A13, A27) comprised 61.4 percent of the isolates. CONCLUSIONS: Clone Colombia5 ST289 is disseminated in Latin America. This is important because S. pneumoniae serotype 5 frequently causes invasive disease in the region and is associated with trimethoprim-sulfamethoxazole resistance.
OBJETIVO: Determinar la relación genética del clon Colombia5 ST289 con los aislamientos invasores de Streptococcus pneumoniae serotipo 5 provenientes de nueve países latinoamericanos. MÉTODOS: Se estudiaron 45 aislamientos invasores de Streptococcus pneumoniae serotipo 5 procedentes de niños menores de 5 años de Bolivia, Chile, Ecuador, Nicaragua, Panamá, Paraguay, Perú, República Dominicana y Venezuela. Los patrones en electroforesis en gel de campo pulsante del ADN tratado con la enzima de restricción SmaI se clasificaron mediante el criterio de Tenover y se analizaron con el programa Fingerprinting II para determinar su relación genética con el clon colombiano. RESULTADOS: Todos los aislamientos tuvieron una similitud genética de 78,5 por ciento o mayor con el clon colombiano. Se identificaron 13 subtipos electroforéticos derivados del patrón A y cinco de ellos (A5, A6, A8, A13 y A27) constituyeron 61,4 por ciento de los aislamientos. CONCLUSIONES: El clon Colombia5 ST289 está diseminado por América Latina. Esto es importante ya que S. pneumoniae serotipo 5 es causa frecuente de enfermedades invasoras en la Región y está asociado con la resistencia a trimetoprim-sulfametoxazol.
Subject(s)
Humans , Streptococcus pneumoniae/genetics , Streptococcus pneumoniae/isolation & purification , Colombia , Latin AmericaABSTRACT
Streptococcus pneumoniae es uno de los principales patógenos causantes de infecciones respiratorias e invasivas, por lo que es importante identificar rápidamente este microorganismo y determinar la susceptibilidad a los antibióticos frecuentemente utilizados, para la realización de terapias adecuadas. Con este fin se realizó la identificación de 32 aislamientos de Streptococcus pneumoniae, a partir de pacientes con infecciones respiratorias e invasivas; para su identificación se utilizaron métodos microbiológicos convencionales y como pruebas confirmatorias, métodos moleculares por reacción en cadena de la polimerasa (PCR), amplificando regiones de los genes lyt A y ply y métodos serológicos para la determinación del antígeno capsular. Se realizaron antibiogramas para determinar la susceptibilidad a Penicilina y Eritromicina. Los resultados revelaron, un mayor número de aislamientos en menores de 10 años y en mayores de 49 años y en relación a épocas estacionales, de aislamientos un mayor número durante los meses de invierno. En las pruebas de susceptibilidad a los antibióticos se encontró una sensibilidad disminuida a Penicilina (SDP) de 46.88 %; resistencia a eritromicina de 6.25 % y resistencia intermedia de 15,63%. Realizando un análisis estadístico de los tres métodos como pruebas de reconfirmación, se observó una correlación baja, por lo que la prueba de la optoquina con fines de reconfirmación para Streptococcus pneumoniae, es inferior a las pruebas serológica y molecular.
Streptococcus pneumoniae is one of the main pathogens that cause breathing and invasive infections, that is why is important a quick identification of this microorganism and determine the sensitivity of the frequently used antibiotics, to execute appropriate therapies. With this purpose the identification of 32 isolates of Streptococcus pneumoniae from patients with breathing and invasive infections were carried out, conventional microbiological tests were applied for identification and for confirmation were used molecular techniques based on the chain reaction of polymerase (PCR), amplifying the regions of lyt A and ply genes and serological methods for the determination of the capsular antigen. Antibiograms were carried out in order to determinate the sensitivity to penicillin and erythromycin. The results showed a higher amount of isolates in children under 10 and adults over 49, and according to seasons, more isolates on winter months. Regarding sensitivity to antibiotics, we found a drop of 46.88% to penicillin, a drop of 6.25 to erythromycin and an intermediate drop of 15.63%. The statistical analysis among the three techniques used for reconfirmation revealed there is a low correlation among them. Therefore, optochin, used as a re-confirmation method, is lower than serological and molecular tests.