Microbial ex situ preservation supporting science and bioeconomy in Brazil / Preservação de microrganismos ex situ como suporte para a ciência e a bioeconomia no Brasil

Abstract One of the texts in the "Biodiversity in the State of São Paulo" series, within the FAPESP-Biota Program, was dedicated to the Infrastructure for Biodiversity Conservation, with a focus on Biological Collections and Conservation Units. From the early 1960s, when FAPESP was established, to the present day, financial resources have been invested in the preservation of the biodiversity of the national genetic heritage, besides other fields. History of years of advances in scientific knowledge was built, which can be portrayed through the projects that resulted in high-quality data of national and international impact. Microbiological collections are centers that generate technology and specialized human resources, and act (among other things) as living repositories preserving reference material and as witnesses to the history of microbial biodiversity because they preserve what may no longer exist. They have enormous potential to promote the global bioeconomy and address problems that have resulted from the misuse of natural resources. This reading brings everyone the history, advances, and future perspectives of culture collections, within the efforts of 60-year scientific activities in Brazil.

Resumo Um dos textos da série "Biodiversidade do Estado de São Paulo", dentro do Programa FAPESP-Biota, foi dedicado à Infraestrutura para Conservação da Biodiversidade, com foco nas coleções biológicas e nas unidades de conservação. Do início dos anos 60, quando a FAPESP foi criada, até os dias atuais muito foi investido em pesquisa nas mais diversas áreas, incluindo a preservação da biodiversidade do patrimônio genético nacional. Uma história de longos anos de avanços no conhecimento científico foi construída, a qual pode ser retratada através dos projetos que resultaram em dados de alta qualidade com impacto nacional e internacional. As coleções microbiológicas são centros geradores de tecnologia e recursos humanos especializados, que atuam (dentre outros) como repositórios vivos, preservando material de referência, e como testemunho da história da biodiversidade microbiana, preservando o que pode não mais existir. Possuem enorme potencial para alavancar a bioeconomia global e tratar de problemas que resultaram do mau uso dos recursos naturais. Essa leitura traz a todos o histórico, os avanços e as perspectivas futuras das coleções de microrganismos, dentro dos esforços de 60 anos de atividades científicas no Brasil.

Genetic relationships among strains of the Aspergillus niger aggregate

We analyzed the genetic relationships between 51 fungal isolates previously identified as A. niger aggregate, obtained from dried fruit samples from worldwide origin and 7 A. tubingensis obtained from Brazilian coffee beans samples. Greater fungal diversity was found in black sultanas. Aspergillus niger sensu stricto was the most prevalent species. It was found in all fruit substrates of all geographical origins. Based on Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) and β-tubulin sequences data two groups of A. niger were found. In spite of the small number of isolates from Group IV an association between extrolite patterns and molecular clustering is speculated. A. tubingensis were the second most frequent species and this species were clearly subdivided into two groups. The finding of two groups for A. tubingensis strains could not yet explain the contradictions found in the literature about the capability this species for ochratoxin production, because both of them were formed by only non-ochratoxin-producing strains.

Neste trabalho foi analisada a relação genética entre 51 isolados obtidos de amostras de frutas secas provenientes de diferentes regiões do previamente identificados como pertencentes ao agregado A. niger e 7 isolados de Aspergillus tubingensis obtidos de amostras de café do Brasil. Maior diversidade fúngica foi encontrada em uvas passas escuras. Aspergillus niger sensu stricto foi a espécie mais frequente. Esta espécie foi encontrada em todos os substratos e origens geográficas analisadas. Baseando-se nos dados de Polimorfismo de DNA Amplificado ao Acaso (RAPD) e sequências de nucleotídeos do gene da β-tubulina, dois grupos de A. niger foram observados. Apesar do pequeno número de isolados do grupo IV uma associação entre padrão de extrólitos e agrupamento molecular foi encontrada. A. tubingensis foi a segunda espécie mais frequente e foi claramente subdivida em dois grupos. Como os grupos de A. tubingensis são formados somente por linhagens não produtoras de ocratoxina A, a identificação destes grupos não explica a controvérsia encontrada na literatura sobre a capacidade desta espécie em produzir a referida toxina.

Growth of Aspergillus ochraceus, A. carbonarius and A. niger on culture media at different water activities and temperatures

Esporos de A. ochraceus, A. carbonarius e A. niger foram inoculados em três meios de cultura: Agar extrato de levedura Czapeck (CYA), Agar Glicerol 18per center com dicloran (DG18), Agar Extrato de levedura e malte com 40 per center de glicose (MY40G). As placas foram incubadas em 5 temperaturas diferentes: 8, 25, 30, 35 e 41ºC. O crescimento dos fungos foi avaliado medindo o diâmetro da colônia a cada 24h. O objetivo deste trabalho foi determinar a influência de três meios de cultura com atividade de água diferente tempo de incubação e temperaturas, sobre o crescimento de A. ochraceus, A. carbonarius and A. niger. Nenhuma das espécies cresceu à 8ºC em nenhum dos meios de cultura. Para A. carbonarius, 30ºC foi a melhor temperatura para o seu crescimento enquanto para A. niger temperaturas acima de 30ºC foram melhores em todos os meios de cultura. A. ochraceus apresentou bom crescimento a 25 e 30ºC em todos os meios de cultura, enquanto seu crescimento à 35ºC foi mais lento, especialmente no meio CYA. A 41ºC, A. ochraceus não cresceu em nenhum dos meios de cultura estudados e A. carbonarius foi significantemente inibido. A. niger cresceu à temperatura de 41ºC e apresentou-se como o fungo mais xerofílico, comparado com A. carbonarius e A. ochraceus.

Efeito do processamento sobre a ocratoxina A, em café / Effect of the processing about the ocratoxina A, in coffee

A presente revisão trata do efeito do processamento na destruição da ocratoxina A. Foram abordados os principais processos relacionados ao café como secagem, armazenamento, transporte, torração e obtenção da bebida, produção de solúvel e descafeinização. Foram discutidas também a incidência de ocratoxina A em alimentos e café, a tolerância diária de OTA, a legislação vigente e os programas de prevenção.

Efeito da fosfina sobre a produçäo de aflatoxinas em amendoim armazenado com elevado teor de umidade / Effect of phosphine on aflatoxin production in peanuts stored with high moisture content

Amendoim recém-colhido, descascado, reumedecido até 0,89 de atividade de água (15,6 por cento de teor de umidade em base úmida) foi exposto a 0,0, 0,5, 1,0 e 1,5 mg/l de fosfina durante 3,7 e 14 dias a 30 por cento e aproximadamente 85 por cento de umidade relativa. As concentraçöes de CO2 foram determinadas após cada período de exposiçäo. Análises das aflatoxinas B1 e G1 foram conduzidas inicialmente e após tratamento. Os teores de CO2 obtidos indicaram que a fosfina nas doses de 1,0 e 1,5 mg/l impediu o desenvolvimento fúngico durante todo o período estudado (14 dias), enquanto a concentraçäo de 0,5 mg/l foi eficiente até 7 dias de estocagem. As 3 doses estudadas controlaram a produçäo de aflatoxinas B1 e G1. O período de proteçäo oferecido pelo fumigante no controle do desenvolvimento fúngico e na produçäo dessas micotoxinas foi relacionado com as doses utilizadas

Bolores produtores de toxinas em queijos: ocorrência e significado / Moulds producer of toxins in cheese: occurrence and significance

A ocorrência de bolores toxigênicos em queijos, bem como as micotoxinas encontradas säo revistas. É comentada a toxicidade de Pinicillum roqueforti e Penicillium camemberti utilizados na elaboraçäo de alguns tipos de queijos. Também é discutida a produçäo e estabilidade de várias micotoxinas no queijo e finalmente algumas recomendaçöes práticas säo sugeridas para a prevençäo da contaminaçäo fúngica e produçäo de micotoxinas em queijos

Bolores produtores de patulina em maçä e suco industrializado / Patulin producing moulds in apple and industrialized juice

Três variedades de maça - Anna, Ohio Beauty e Brasil - produzidas no Estado de Säo Paulo foram analisadas quanto à sua microbiota fúngica. Imediatamente após a colheita, os seguintes fungos foram isolados: Cladosporium sp., Phoma sp., Fusarium sp., Trichoderma sp., Alternaria sp., Phompsia sp., Penicillium sp., além de leveduras e outros bolores näo identificados. As cepas da Penicilina sp. isoladas näo eram produtoras de patulina. Após 1 mês de armazenamento a 4-C, duas cepas de Penicilliu expansum produtoras de patulina foram isoladas, a partir das maças Ohio Beauty e Brasil. A produçäo de patulina por uma dessas cepas foi estudada em meio de cultura a 7-C, 25-C e 35-C, durante um período de 7 a 42 dias e, em maças armazenadas a 4-C e 25-C, durante um período de 30 a 120 dias e 10 a 30 dias, respectivamente. A 7-C, em meio de cultura, a produçäo variou de 933 a 10.000*g/l; a 25-C a produçäo variou de 472 a 144.444*g/l; e a 35-C a produçäo foi entre 53,3 e 400*g/l. A temperatura de 25-C, a produçäo de toxina foi de 150 a 311*g/l e a 4-% de patulina