Association of the ABCB1 C3435T gene polymorphism (SNPs) with the response to neoadjuvant chemotherapy in women with breast cancer in northeastern Brazil / Associação do polimorfismo (SNPs) do gene ABCB1 C3435T, com a resposta à quimioterapia neoadjuvante, em mulheres com câncer de mama do Nordeste do Brasil

Introduction: breast cancer (BC) is the most common tumor and the leading cause of cancer-related death among the female population worldwide. Polymorphisms genetics of ABCB1 gene contributed to breast cancer susceptibility and interindividual differences in chemotherapy response. Objectives: to evaluate the association between the ABCB1 C3435T gene polymorphism (SNPs) with the response to neoadjuvant chemotherapy in women with breast cancer. Methodology: this study included 32 female patients who received neoadjuvant chemotherapy. The polymorphisms were genotyped through real-time allele-specific polymerase chain reaction (PCR). The statistical analysis was performed using the Fisher's exact test or Pearson's chi-square test in the Statistical Package for Social Sciences (SPSS) version 20.0 software. Results: the genotypes found for the C3435T polymorphism were in Hardy-Weinberg equilibrium and their genotypic distributions were CC= 10 (31.1%), CT= 14 (43.8%), and TT= 08 (25.0%) with χ2: 0.86 and p-value > 0.05. Allele frequencies were C = 0.54 and T = 0.46. There were no significant statistical differences between genotypes considering the response to neoadjuvant chemotherapy and immunohistochemistry; the presence of the T allele was associated with worsen axillary status response to neoadjuvant chemotherapy. Conclusion: no definite association between the presence of C3435T polymorphism and the response to neoadjuvant chemotherapy was observed. Further studies in Brazil involving larger samples will contribute to validating the results of this study.

Introdução: o câncer de mama (CM) é o tumor mais comum e a principal causa de morte relacionada ao câncer na população feminina em todo o mundo. Polimorfismos genéticos do gene ABCB1 contribuem para a suscetibilidade ao câncer de mama e diferenças interindividuais na resposta à quimioterapia. Objetivos: avaliar a associação entre o polimorfismo (SNPs) do gene ABCB1 C3435T com a resposta à quimioterapia neoadjuvante em mulheres com câncer de mama. Metodologia: estudo com 32 pacientes do sexo feminino, que utilizaram quimioterapia neoadjuvante. A genotipagem dos polimorfismos foi feita por reação da polimerase em cadeia (PCR) em tempo real alelo específica. A análise estatística foi realizada mediante o teste exato de Fisher ou Qui-quadrado de Pearson, utilizando o software SPSS (Statistical Package for the Social Sciences) vs20.0. Resultados: os genótipos encontrados para o polimorfismo C3435T estavam em equilíbrio de Hardy-Weinberg e suas distribuições genotípicas foram respectivamente CC= 10 (31,1%), CT= 14 (43,8%), TT= 08 (25,0%) sendo, X2: 0.86 e p-value> 0,05. As frequências alélicas foram de C= 0,54 e T= 0,46. Não ocorreram diferenças estatísticas entre os genótipos, considerando a resposta a quimioterapia neoadjuvante e a imunohistoquímica, sendo a presença do alelo T associada a pior resposta do status axilar à quimioterapia neoadjuvante. Conclusão: não foi possível correlacionar a presença do polimorfismo C3435T com a resposta à quimioterapia neoadjuvante, sendo necessária a realização de novos estudos no Brasil envolvendo casuísticas maiores para a validação dos resultados.

In silico analysis of mismatches in RT-qPCR assays of 177 SARS-CoV-2 sequences from Brazil

Abstract INTRODUCTION: Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) can detect the severe acute respiratory syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) in a highly specific manner. However, a decrease in the specificity of PCR assays for their targets may lead to false negative results. METHODS: Here, 177 high-coverage complete SARS-CoV-2 genome sequences from 13 Brazilian states were aligned with 15 WHO recommended PCR assays. RESULTS: Only 3 of the 15 completely aligned to all Brazilian sequences. Ten assays had mismatches in up to 3 sequences and two in many sequences. CONCLUSION: These results should be taken into consideration when using PCR-based diagnostics in Brazil.

Patogenicidade de um isolado de Trypanosoma evansi em ratos inoculados com o parasito em sangue in natura e criopreservado / Trypanosoma evansi pathogenicity strain in rats inoculated with parasite in fresh and cryopreserved blood

O objetivo deste estudo foi investigar a patogenicidade do isolado de Trypanosoma evansi (LPV-2005), em ratos (Rattus norvergicus), sob influência da imunidade passiva, de diferentes concentrações e de meios de conservação. Para tanto, foram utilizados 36 Rattus norvergicus, fêmeas, separados em seis grupos homogêneos. Os roedores dos grupos A e B foram infectados com 10(5) T. evansi, e os animais dos grupos C e D foram infectados com 10(6) tripomastigotas/animal. Os grupos E e F foram utilizados como grupo controle negativo, isto é, inoculados com sangue in natura e criopreservado sem o parasito, respectivamente. O grupo A foi formado por ratos filhos de fêmeas infectadas com protozoário, mas curadas após tratamento. Os grupos B, C e D continham roedores que nunca tiveram contato com o isolado LPV-2005. Os grupos B e C diferiram quanto à dose inoculada do flagelado mantida em cultura viva (ratos Wistar). Já os ratos do grupo D foram infectados com sangue criopreservado em nitrogênio líquido. A patogenicidade do isolado foi avaliada a partir do período pré-patente, da evolução da parasitemia e da longevidade dos animais. O grupo D apresentou um período pré-patente superior aos demais grupos. Em relação à longevidade dos animais de cada grupo, foi verificada diferença estatística significativa (P<0,05). O grupo D apresentou um período de vida de 27,8 dias, e o grupo C, de apenas 4,8 dias. Os ratos de ambos os grupos controle mantiveram-se vivos por 50 dias, quando foram eutanasiados. Portanto, a preservação do inóculo testado e a dose infectante de T. evansi influenciam a patogenicidade do isolado LPV-2005 para ratos. A presença de anticorpos maternos em ratos não impede a infecção e mortalidade por T. evansi.

This study aimed to evaluate the Trypanosoma evansi strain pathogenicity (LPV-2005) in rats under passive immunity influence, of different concentrations and media preservation. Thirty six adult female Rattus norvergicus were separated in six equal groups. Groups A and B were inoculated with 10(5) T. evansi and groups C and D with 10(6) blood trypomastigotes per animal. Groups E and F were used as negative control in which the animals were inoculated with fresh and cryopreserved blood, without the parasite. Group A were composed of T. evansi infected born rats and cured females. Groups B, C and D were composed with animals never exposed to the LPV-2005 strain. All groups B and C animals received different doses of blood trypomastigotes kept in Wistar rats, while animals from group D were infected with cryopreserved blood kept in liquid nitrogen. The the strain pathogenicity was estimated by prepatency evaluation period, levels of parasitemia and animals longevity. Group D showed a longer prepatency period in comparison with other groups. The longevity of group D (27.8 days) was significantly different (P<0.05) from group C (4.8 days). Rats of the control group were euthanized 50 days postinfection. In conclusion, the tested inoculum-preservation methods and the infective dose of T. evansi influenced the pathogenicity of the LPV-2005 strain in rats. The presence of maternal antibodies did not prevent the infection and mortality of the rats by T. evansi.

Colonização intradomiciliar de Panstrongylus megistus (Hemiptera, Reduviidae, Triatominae) em São José do Cerrito, SC: primeiro relato / Colonization by Panstrongylus megistus (Hemiptera, Reduviidae, Triatominae) inside homes in São José do Cerrito, SC: first report

Em resposta a uma denúncia da existência de triatomíneos em uma cabana de pesca as margens do Rio Caveiras no município de São José do Cerrito-SC, foi feita a investigação na cabana e em outros ecótopos vizinhos ao achado inicial. Foram encontrados 15 exemplares de Panstrongylus megistus sendo que nenhum deles encontrava-se infectado. O local do ecótopo é visitado ocasionalmente por capivaras, gambás, tatus e ratos.

In response to complaints of the presence of triatomines in a fishing hut on the banks of the Caveiras river, in the municipality of São José do Cerrito, State of Santa Catarina, an investigation was conducted in this hut and in other ecotopes neighboring the initial finding. Fifteen specimens of Panstrongylus megistus were found and none of them were infected. The locality of this ecotope is visited occasionally by capybaras, opossums, armadillos and rats.