Caracterización de aislamientos de Klebsiella pneumoniae doble productores de carbapenemasas en un hospital universitario / Phenotypic and genotypic characterization of double carbapenemase producing Klebsiella pneumoniaeisolates in a University Hospital

La emergencia de aislamientos de Klebsiella pneumoniaedoble productores de carbapenemasas (KPC y NDM) es una de las consecuencias de la pandemia causada por SARS-CoV-2 que ha causado un impacto significativo en las tasas de resistencia a los antimicrobianos en las infecciones intrahospitalarias por esta enterobacteria. Estos aislamientos representan un desafío para los servicios de salud, por su detección y caracterización y posterior tratamiento. En este trabajo se describen los aislamientos portadores de KPC y NDM recuperados durante 2022 aislados de distintas muestras clínicas de pacientes internados en un hospital universitario de la Ciudad de Buenos Aires, se los caracteriza fenotípicamente y genotípicamente como portadores de ambas carbapenemasas y se destaca la excelente actividad in vitro de la combinación ceftazidima-avibactam y aztreonam en el tratamiento de estas infecciones en donde las alternativas terapéuticas estarían limitadas a antibióticos no ß-lactámicos con porcentajes de resistencia que superan el 70%

The emergence of double-carbapenemase (KPC and NDM) producing Klebsiella pneumoniae isolates is one of the consequences derived from the SARS CoV-2 pandemic, which has caused significant impact on the antimicrobial resistance rates in hospital acquired infections. These isolates represent a real challenge for Health Services due to their difficult detection and characterization and subsequent treatment. In the present work we describe the double carbapenemase producing isolates recovered during the year 2022 from clinical samples belonging to hospitalized patients at a University Hospital in Buenos Aires city, we report their phenotypic and genotypic characterization and the excellent "in vitro" activity of the ceftazidime-avibactam-aztreonam combination in the treatment of infections in which the therapeutical options are restricted to non ß- lactamic antimicrobials which hold resistance rates higher than 70%

Actinomyces europaeus (Gleimia europaea) asociado con absceso cerebral: comunicación de tres casos / Actinomyces europaeus (Gleimia europaea) associated with brain abscess: A reportof three cases

Resumen El absceso cerebral es una infección focal caracterizada por acumulación de pus enel parénquima cerebral; su diagnóstico es de urgencia debido a la alta mortalidad que acarrea.Presentamos tres casos de pacientes con abscesos cerebrales con foco otogénico de origen poli-microbiano, que presentaron en común el aislamiento de Actinomyces europaeus, agente nodescrito hasta el momento en esta localización. A. europaeus fue identificado por la metodo-logía convencional, por espectrometría de masas por desorción/ionización asistida por matriz(MALDI-TOF MS) y por secuenciación del gen ARNr 16S. La sensibilidad antibiótica se evaluó porel método epsilométrico. Todos los aislados presentaron sensibilidad a penicilina, vancomicinay linezolid, mientras que la sensibilidad a clindamicina y eritromicina fue variable. La iden-tificación por MALDI-TOF MS permitió arribar a nivel de especie de forma rápida y confiabley dar una respuesta oportuna y efectiva, evitando el retraso en el tratamiento, lo que sueleincrementar la morbimortalidad del cuadro clínico.

First nosocomial outbreak of SME-4-producing Serratia marcescens in South America / Primer brote nosocomial por Serratia marcescens productora de SME-4en Sudamérica

Abstract Carbapenemase-producing-Serratia marcescens isolates, although infrequent, are considered important nosocomial pathogens due to their intrinsic resistance to polymyxins, which limits therapeutic options. We describe a nosocomial outbreak of SME-4-producing S. marcescens in Buenos Aires city which, in our knowledge, represents the first one in South America.

Resumen Los aislamientos de origen nosocomial de Serratia marcescens productores de car-bapenemasa, si bien son infrecuentes, son considerados importantes patógenos debido a su resistencia intrínseca a las polimixinas, lo cual limita aún más las opciones terapéuticas. En este trabajo se describe un brote nosocomial causado por S. marcescens portadora de car-bapenemasa de tipo SME-4 en la Ciudad de Buenos Aires, el cual representaría el primero en Sudamérica.

Infección de piel y partes blandas por Vibrio vulnificus. Comunicación de un caso diagnosticado en Argentina / Vibrio vulnificus infection of the skin and soft parts. Communication of a case diagnosed in Argentina

Resumen Vibrio vulnificus es una de las especies de Vibrio más virulentas que se conocen. Es una bacteria de distribución universal. El primer caso registrado en Uruguay se produjo en 2001, y desde entonces ocurren varias infecciones por año. Recientemente, en ese país, V. vulnificus fue responsable de una infección de partes blandas de curso letal. Aunque no han sido comunicados casos de infección humana por esta especie en Argentina, se ha identificado recientemente Vibrio vulnificus en muestras asociadas con microplancton en el estuario del Río Negro. Presentamos el caso de una infección grave de piel y partes blandas por V. vulnificus a partir de una herida abierta en un paciente en contacto con medio acuático marino en la costa de Uruguay del Río de la Plata. El aislamiento de vibrios en muestras de heridas puede causar un daño en los tejidos con rápida progresión, en particular V. vulnificus, que tiene una alta mortalidad sin la precoz y apropiada intervención. En nuestro caso, la rápida identificación del microorganismo permitió avalar el tratamiento empírico utilizado, con una buena evolución clínica.

Abstract Vibrio vulnificus is one of the most virulent Vibrio species known. It is a bacterium with universal distribution. The first case registered in Uruguay occurred in 2001 and, since then, several infections have occurred per year. Recently, in this country, V. vulnificus was responsible for a fatal soft tissue infection. Although no cases of human infection with this species have been reported in Argentina, researchers have recently identified V. vulnificus in samples associated with microplankton in the Rio Negro estuary. We present the case of a severe skin and soft tissue infection by V. vulnificus from an open wound in a patient in contact with a marine aquatic environment on the coast of the River Plate, in Uruguay. Isolation of vibrios from wound specimens can cause rapidly progressing tissue damage, particularly V. vulnificus which has a high mortality rate without early and appropriate intervention. In our case, the rapid identification of the microorganism allowed us to support the empirical treatment used, which a good clinical evolution.

Empiema necessitatis por Campylobacter rectus. Identificación rápida por MALDI-TOF MS / Empyema necessitatis caused by Campylobacter rectus. Rapid identification by MALDI-TOF MS

Resumen El empiema necessitatis (EN) constituye una muy rara complicación de un empiema pleural en el cual la infección se extiende a los tejidos blandos adyacentes. La etiología por anaerobios es muy infrecuente y se da en el curso de infecciones crónicas. Se presenta el primer caso de empiema necessitatis por Campylobacter rectus. La identificación de este agente se efectuó por espectrometría de masas (MALDI-TOF MS) y su sensibilidad antimicrobiana se determinó por el método epsilométrico.

Abstract Empyema necessitatis (EN) is a very rare complication of a pleural empyema, in which the infection extends to adjacent soft tissues. Anaerobic bacteria are very rare etiologic agents of EN, which occurs in the course of chronic infections. We present the first case of empyema necessitatis caused by Campylobacter rectus. Bacterial identification was carried out by mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and antimicrobial susceptibility was determined by the epsilometer method.

Descripción de un caso de sepsis abdominal por Desulfovibrio desulfuricans / Description of a case of abdominal sepsis due to Desulfovibrio desulfuricans

Resumen Desulfovibrio spp. son bacterias anaerobias estrictas, ubicuas en la naturaleza, quepueden formar parte del tracto gastrointestinal humano o animal, pero también son bacteriasambientales presentes en el suelo y en el agua. Pueden persistir de manera asintomática enel intestino o comportarse como patógenos oportunistas, asociados con bacteriemia primariae infecciones intraabdominales. El número de infecciones por Desulfovibrio spp. puede estarsubestimado debido a su lenta velocidad de crecimiento y a que muchos laboratorios no realizancultivos en anaerobiosis de manera rutinaria. Pruebas sencillas, como el examen de la movilidaden fresco y de la morfología celular en la coloración de Gram, sumadas a la presencia de SH2en agar SIM y a la observación de una fluorescencia roja a pH alcalino bajo luz UV, seríanindicativas de Desulfovibrio spp. Se describe el caso de una bacteriemia por Desulfovibriodesulfuricans en una mujer con cuadro clínico de sepsis abdominal por apendicitis gangrenosacon fallo multiorgánico.

Abstract Desulfovibrio spp. are strict anaerobes that are ubiquitous in nature. They can reside in the human or animal gastrointestinal tract and, as they are also environmental bacteria, may be present in soil and water. They can persist asymptomatically in the intestine or behave as opportunistic pathogens associated with primary bacteremia and intraabdominal infections. Several Desulfovibrio spp. infections may be underestimated due to their slow growth rate and because many laboratories do not routinely perform anaerobic cultures. Simple tests such as motility detection on a fresh subculture, Gram stain to confirm cell morphology, presence of H2S in SIM agar and production of a red fluorescence in alkaline pH under UV light would be indicative of Desulfovibrio spp.

Dolosigranulum pigrum en absceso corneal / Dolosigranulum pigrum in corneal abscess

Resumen Dolosigranulum pigrum es un coco gram positivo, anaerobio facultativo, que forma parte de la microbiota oral y del tracto respiratorio superior. Aunque los reportes de infecciones por este microorganismo son escasos, se lo ha asociado a un amplio espectro de enfermedades infecciosas. Se describe el caso de un hombre adulto con un absceso corneal del que se aisló D. pigrum. El microorganismo fue identificado por espectrometría de masas (MALDI-TOF MS) y secuenciación del gen 16S ARNr. A su vez, se logró la identificación presuntiva mediante pruebas fenotípicas claves, como la disposición en racimos en la coloración de Gram, la prueba negativa de la catalasa, la producción de pirrolidonil arilamidasa y leucina aminopeptidasa, el crecimiento en NaCl al 6,5% y la hidrólisis de esculina. Los datos de la literatura y el presente caso respaldan la asociación del microorganismo con infecciones oculares, a menudo de curso destructivo, principalmente en pacientes de edad avanzada.

Abstract Dolosigranulum pigrum is a gram-positive, facultatively anaerobic coccus, which is part of the oral and upper respiratory tract microbiota. Although reports of infections by this microorganism are scarce, it has been associated with a wide spectrum of infectious diseases. The case of an elderly man with a lower corneal abscess, in which Dolosigranulum pigrum was isolated, is described. The microorganism was identified by mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and by the sequencingof the 16S rRNAgene. Furthermore, the presumptive identification of the causative agent was achieved by using key phenotypic tests such as the cluster arrangement in Gram stain, the negative catalase test, the production of pyrrolidonyl arylamidase and leucine aminopeptidase activity, the growth in 6.5% NaCl and esculin hydrolysis. The data from the literature (and the present case) support the association of the microorganism with ocular infections, which often take a destructive course, mainly in elderly patients.

Neisseria meningitidis aislada de muestras de hombres que tienen sexo con hombres / Neisseria meningitidis isolated from patients in men who have sex with men

Resumen En los períodos 2000-2004 y 2014-2015 se investigó la presencia de Neisseria meningitidis en 1.143 y 544 hombres que tienen sexo con hombres respectivamente, atendidos en el marco de un programa de enfermedades de transmisión sexual. Se determinó la prevalencia de este agente, su distribución en serogrupos y su sensibilidad a los antimicrobianos. Se obtuvieron hisopados faríngeos, rectales y uretrales, que se sembraron en medio selectivo Thayer Martin modificado. La identificación se realizó mediante pruebas bioquímicas convencionales y por espectrometría de masas (MALDI-TOF). En el segundo período estudiado, sobre 85 aislamientos procedentes de faringes se investigaron los serogrupos B, C, W e Y mediante PCR. Se determinó la CIM de penicilina, ceftriaxona, rifampicina, azitromicina y ciprofloxacina en 66 aislamientos obtenidos en el primer período y en 102 logrados en el segundo. La prevalencia de N. meningitidis fue del 17,8% en el primer período y del 28,1% en el segundo; este microorganismo se aisló más frecuentemente de fauces. Los serogrupos hallados fueron B (31,5%), Y (7,6%) y W (3,3%), con un 9,8% de aislamientos no capsulados; los restantes corresponderían a otros serogrupos. El 34,8% y el 63,7% de los aislados estudiados correspondientes al primer y segundo período, respectivamente, tuvieron sensibilidad intermedia a la penicilina, y un 11,8% de los evaluados en el segundo período fueron resistentes a dicho antibiótico. Todos los aislados estudiados fueron sensibles a ceftriaxona y a ciprofloxacina (excepto 3, con CIM entre 0,25 y 0,5(g/ml), el 3% fueron resistentes a rifampicina y el 2% fueron no sensibles a azitromicina. La portación de N. meningitidis en hombres que tienen sexo con hombres fue elevada y hubo un alto porcentaje de cepas no sensibles a penicilina. El serogrupo B fue prevalente.

Abstract During the periods 2000-2004 and 2014-2015, Neisseria meningitidis was investigated in men who have sex with men, 1143 and 544 respectively, who consulted in the sexually-transmitted disease program. Prevalence, serogroup distribution and susceptibility to antibiotics were determined. Pharyngeal, rectal and urethral swabs were cultivated on selective Thayer-Martin modified medium. The identification was performed by biochemical tests and mass spectrometry by MALDI-TOF. Serogroups B, C, W and Y were investigated by PCR in 85 isolates recovered from the pharynx belonging to the second period. MICs of penicillin, ceftriaxone, rifampicin, azithromycin and ciprofloxacin were determined for 66 and 102 isolates from periods 1 and 2 respectively, according to CLSI. The prevalence of N. meningitidis was 17.8% and 28.1%, in periods 1 and 2 respectively; the isolates were mainly recovered from the pharynx. The distribution of serogroups was B 31.5%; Y 7.6%; W 3.3% and 9.8% non-capsulated and the rest would belong to other serogroups. Isolates classified as intermediate to penicillin were 34.8% and 63.7% (first and second periods, respectively); moreover, 11.8% of the isolates from the second period were resistant. All isolates were susceptible to ceftriaxone, to ciprofloxacin (except 3 isolates with MIC values between 0.25 and 0.5(g/ml), 3% were resistant to rifampicin and 2% were not susceptible to azithromicin. The prevalence of N. meningitidis carriage in men who have sex with men was high with a high rate of penicillin non-susceptible isolates. B was the prevalent serogroup.

Miasis por Cochliomyia hominivorax en la Argentina / Myiasis by Cochliomyia hominivorax in Argentina

Miasis es la infestación de humanos y animales por larvas de dípteros ciclorrafos con invasión y destrucción tisular. Cochliomyia hominivorax es responsable del 80% de las miasis en la Argentina. Es importante realizar el diagnóstico etiológico específico debido a la agresividad de las larvas de esta especie, las que pueden provocar cuadros clínicos graves. Presentamos cuatro casos de miasis por C. hominivorax. Dos de los pacientes residían en la ciudad de Buenos Aires y trabajan en zona rural, y los otros dos residían en el Gran Buenos Aires.

Miasis is the infestation of man and animals by larvae of flies belonging to the order Diptera, suborder Cyclorrapha. Eighty percent of miasis in Argentina is caused by Cochliomyia hominivorax, a species that induces pronounced tissue invasion and destruction, and results in severe clinical forms. Because of the aggressiveness of its larvae, it is important to reach a specific etiological diagnosis. We present four cases of miasis by C. hominivorax in two patients living in the city of Buenos Aires but working in a rural area and two patients living in the Greater Buenos Aires.

Diversity of Achromobacter species recovered from patients with cystic fibrosis, in Argentina / Diversidad de las especies de Achromobacter recuperadas de pacientes con fibrosis quística en Argentina

Abstract Different phenotype-based techniques and molecular tools were used to describe the distribution of different Achromobacter species in patients with cystic fibrosis (CF) in Argentina, and to evaluate their antibiotic resistance profile. Phenotypic identification was performed by conventional biochemical tests, commercial galleries and MALDI-TOF MS. Genetic approaches included the detection of A. xylosoxidans specific marker blaoxa-114, the amplificaron and sequencing of the 16S rRNA gene, nrdA and blaOXA complete sequence, and MLST analysis. Phenotypic approaches, even MALDI-TOF, rendered inconclusive or misleading results. On the contrary, concordant results were achieved with the nrdA sequencing or sequence type (ST) analysis, and the complete blaOXA sequencing, allowing a reliable discrimination of different Achromobacter species. A. xylosoxidans accounted for 63% of Achromobacter infections and A. ruhlandii accounted for 17%. The remaining species corresponded to A. insuavis, A. dolens, A. marplatensis and A. pulmonis. Antimicrobial susceptibilities were determined by the agar dilution method according to CLSI guidelines. Piperacillin, piperacillin/tazobactam and car-bapenems were the most active antibiotics. However, the emergence of carbapenem-resistant isolates was detected. In conclusion, prompt and accurate identification tools were necessary to determine that different Achromobacter species may colonize/infect the airways of patients with CF. Moreover, antimicrobial therapy should be administered based on the susceptibility profile of individual Achromobacter sp. isolates. © 2019 Asociación Argentina de Microbiología. Published by Elsevier España, S.L.U. This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Resumen Se emplearon diversas técnicas fenotípicas y moleculares para describir la distribución de diferentes especies del género Achromobacter en pacientes con fibrosis quística (FQ) en Argentina, y se evaluó el perfil de resistencia a los antibióticos. Se realizó la identificación fenotípica por pruebas bioquímicas convencionales, galerías comerciales y MALDI-TOF MS. El enfoque genético incluyó la detección del marcador especie-específico de A. xylosoxidans bla[PRESERVECIRC]tu, la amplificación y la secuenciación de los genes ARNr 16S, nrdA y secuencia completa de blaOXA, y el análisis por MLST. Los enfoques fenotípicos, incluso la técnica de MALDI-TOF, proporcionaron resultados no concluyentes o erróneos. Por el contrario, se obtuvieron resultados concordantes entre la secuenciación del gen nrdA o el análisis de secuenciotipos (ST) y la secuenciación completa de blaOXA, lo que permitió una discriminación confiable de las diferentes especies de Achromobacter. A. xylosoxidans representó el 63% de las infecciones por Achromobacter y A. ruhlandii representó el 17%. Las especies restantes correspondieron a A. insuavis, A. dolens, A. marplatensis y A. pulmonis. Se determinó la sensibilidad a antimicrobianos por el método de dilución en agar de acuerdo al CLSI. Los antibióticos más activos fueron piperacilina, piperacilina/tazobactam y carbapenemes. Sin embargo, se detectó la emergencia de aislamientos resistentes a carbapenemes. En conclusión, resultaron necesarias herramientas de identificación rápida y precisas para determinar las diferentes especies del género Achro-mobacter capaces de colonizar/infectar las vías respiratorias de los pacientes con FQ. Asimismo, la terapia antimicrobiana debería llevarse a cabo en función del perfil de sensibilidad de los aislamientos individuales de Achromobacter spp. © 2019 Asociacion Argentina de Microbiología. Publicado por Elsevier Espana, S.L.U. Este es un artículo Open Access bajo la licencia CC BY-NC-ND (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Desarrollo y evaluación de una base de datos in house para la identificación rápida de Burkholderia contaminons por EM MALDI-TOF / Development and evaluation of an in-house database for quick identification of Burkholderia contaminans by MALDI-TOF MS

La espectrometría de masas (EM) (matrix assisted laser desorption ionization-time of flight) MALDI-TOF demostró ser una herramienta robusta para la identificación de numerosos grupos taxonómicos. No obstante, presenta limitaciones. Una ventaja clave de la técnica es la flexibilidad para la incorporación de espectros proteicos de microorganismos ausentes en la base de datos comercial. Dada la prevalencia de Burkholderia contaminans en los pacientes fibroquísticos en Argentina, y a que en ellos es crucial el diagnóstico microbiológico rápido y confiable, la EM MALDI-TOF surge como una herramienta estratégica. El objetivo del trabajo fue desarrollar una base de datos adicional con espectros peptídicos de aislamientos de referencia de B. contaminans. La misma demostró ser exitosa para la identificación del 97% de los aislamientos analizados. Por lo cual la EM MALDI-TOF con la base de datos extendida resultó ser una herramienta útil para la identificación y diferenciación de otras especies relacionadas a B. contaminans.

MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption ionization-time of flight) mass spectrometry (MS) proved to be a robust tool for the identification of numerous taxonomic groups. However, it has limitations. A key advantage of this technique is the flexibility for the incorporation of protein profiles of microorganisms not included in the commercial database. Due to the prevalence of Burkholderia contaminans in fibrocystic patients in Argentina and the fact that rapid and reliable microbiological diagnosis is crucial in them, MALDI-TOF MS emerges as a strategic tool. The aim of this work was to develop an additional database with peptide spectra of reference isolates of B. contaminans. This database demonstrated to be successful for the identification of 97% of the isolates analyzed. Therefore, MALDI-TOF MS with the extended database was a useful tool for the identification and differentiation of other related species to B. contaminans.

Análisis microbiológico del tracto genital materno y de la sangre del cordón umbilical en relación con el daño neonatal / Microbiological analysis of the maternal genital tract and umbilical cord blood and its association with neonatal damage

La etiología que conduce al daño neonatal es multifactorial, y los procesos infecciosos pueden estar implicados en él. El objetivo de este estudio fue identificar microorganismos del tracto genital materno asociados con el daño neonatal, a fin de prevenir futuras complicaciones perinatológicas. Se estudiaron 711 embarazadas que concurrieron entre enero de 2010 y julio 2013 al consultorio externo de Obstetricia del Hospital de Clínicas de la UBA para sus controles prenatales, y cuyos partos también tuvieron lugar en dicho nosocomio. En la sangre del cordón umbilical se investigó la presencia de Ureaplasma urealyticum y Mycoplasma hominis mediante el cultivo con sustratos metabólicos (Micofast-Biomerieux), y la de Trichomonas vaginalis por PCR, con primers específicos. El estudio microbiológico del contenido vaginal se efectuó en 288 de las embarazadas en la semana 35 a 37. Se empleó la metodología convencional, a la que se agregó el cultivo en tioglicolato modificado para T. vaginalis. Se investigó la presencia de estreptococos grupo B (EGB) en hisopado anorrectaly de introito vaginal, utilizando enriquecimiento en caldo selectivo y posterior siembra en medio cromogénico. Se utilizaron los test de χ² Yates y de Fisher para muestras independientes, considerándose significativo p < 0,05. La vaginosis bacteriana (VB) se relacionó significativamente con el daño neonatal (p = 0,02), al igual que la presencia de M. hominis (p = 0,03) y de T. vaginalis (p = 0,03) en la sangre del cordón umbilical. Las complicaciones predominantes fueron el parto pretérmino, la rotura prematura de membrana (RPM), el bajo peso y un valor de Apgar <7. No se asoció al daño neonatal la presencia de U. urealyticum (p = 0,35) en el cordón umbilical, ni la de Candidaspp. (p = 0,94) o EGB (p = 0,18) en el tracto genital de las madres. Dado que ciertas alteraciones en la microbiota del tracto genital materno se relacionaron con el dano neonatal, consideramos de fundamental importancia realizar el estudio microbiológico del contenido vaginal durante el embarazo, para prevenir posibles complicaciones maternas y perinatológicas.

The etiology leading to neonatal damage is multifactorial, being genital infections one of the causes. The objective of the study was to identify microorganisms of the maternal genital tract that are associated with neonatal damage, in order to prevent future perinatal complications. Seven hundred and eleven pregnant patients attended their prenatal control during the period January 2010-July 2013. Ureaplasma urealyticum and Mycoplasma hominis presence was investigated in umbilical cord blood by metabolic substrates (Micofast-Biomerieux) and that of T. vaginalis, by PCR using specific primers. The microbiological study of the vaginal contents of 288 pregnant patients at weeks 35 to 37 was performed by conventional methods, adding the modified thioglycolate culture for T. vaginalis. Group B streptococcus (GBS) was investigated in anorectal and vaginal introitus swabs, using selective broth enrichment and subsequent isolation in chromogenic medium. The χ² Yates test and Fisher's test were used for independent samples. A p value <0.05 was considered statistically significant. The pathogens significantly related to neonatal damage were M. hominis (p = 0.03), T. vaginalis (p = 0.03), and BV (p = 0.02). Main complications were preterm birth, premature rupture of membranes (PRM), low weight and Apgar score <7. U. urealyticum (p = 0.35), Candidaspp. (p = 0.94) and GBS (p = 0.18) were not related to neonatal damage. Since different microorganisms of the maternal genital tract were related to neonatal damage, it is very important to perform the microbiological study of vaginal contents during pregnancy to prevent possible maternal and perinatal complications.

Identificación y sensibilidad a los antimicrobianos de aislados de estreptococos del grupo viridans provenientes de pacientes internados en un hospital universitario de la ciudad de Buenos Aires / Identification and antibiotic susceptibility of viridans group streptococci isolates recovered from patients hospitalized at a teaching hospital in Buenos Aires City

Los estreptococos del grupo viridans (EGV) son agentes causales de infecciones localizadas e invasivas. Dada la gravedad de las infecciones producidas por EGV sumada a las escasas comunicaciones actuales en nuestro país, los objetivos de este trabajo fueron la identificación y el estudio de la sensibilidad a los antibióticos de aislados caracterizados como EGV, recuperados de pacientes internados, para actualizar el conocimiento sobre el perfil de resistencia y la epidemiología de las infecciones ocasionadas por EGV. Se recuperaron 132 aislados de EGV en el Hospital de Clínicas «José de San Martín¼ en el período 2011-2015. La identificación se realizó mediante pruebas convencionales y espectrometría de masas (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization - Time of Flight Mass Spectrometry). El grupo Streptococcus anginosus fue el más frecuente (42%) seguido por el grupo Streptococcus mitis (33%). Dentro del grupo S. mitis se excluyó a Streptococcus pneumoniae. El 100% de los aislados fue sensible a ertapenem, linezolid y vancomicina; el 96,9% a cef-triaxona y cefepima. Se encontró un 25,8% de resistencia a penicilina (I+R) fundamentalmente en aislados de grupo S. mitis. La resistencia a tetraciclina fue del 27,2% y solo 2/132 aislados fueron resistentes a levofloxacina. Los valores de CIM de gentamicina oscilaron entre 0,5 y 32 -og/ml. El 17,4% de los aislados presentó resistencia a eritromicina sin diferencia significativa en la distribución de fenotipos M y MLS. Los resultados muestran la importancia de la vigilancia continua de las infecciones producidas por estos microorganismos con el fin de generar aportes para la elección de la terapia antibiótica adecuada.

Members of the viridans group streptococci (VGS) are the cause of local and invasive infections. Due to the severity of these infections and taking into account that reports regarding epidemiological aspects are scarce, the aims of this work were the identification and the study of the antibiotic susceptibility profiles of the isolates recovered from patients that were hospitalized in order to find out about the resistance level and the epidemiology of infections in which VGS are involved. A hundred and thirty two isolates identified as VGS were isolated at Hospital de Clínicas «José de San Martín¼ during the period 2011-2015. The identification was performed by biochemical test and mass spectrometry by Matrix Assisted Laser Desorption Ionization -Time of Flight Mass Spectrometry. Streptococcus anginosus group was prevalent (42%) followed by Streptococcus mitis group (33%). In the latter, isolates of Streptococcus pneumoniae were excluded. All the VGS isolates were susceptible to ertapenem, meropenem, linezolid and vancomycin; 25.8% were resistant (I+R) to penicillin, being prevalent in the S. mitis group. Regarding ceftriaxone and cefepime 96.9% of the isolates were susceptible. Only two isolates were resistant to levofloxacin, 27.2% to tetracycline and it was not found high level resistance to gentamycin (MIC range 0.5-32 µg/ml). Resistance to erythromycin was 17.4% with no significant difference between M and MLS phenotypes. The most active antibiotics were in addition to ceftriaxone and cefepime, vancomycin, ertapenem, meropenem and linezolid. These results highlight the importance of the continuous surveillance of the infections caused by VGS in order to predict a correct antibiotic therapy.

Bifidobacterium scardovii aislado de 2 muestras consecutivas de orina / Bifidobacterium scardovii isolated from 2 consecutive urine samples

La especie Bifidobacterium scardovii está constituida por bacilos gram positivos anaerobios facultativos, cuyo desarrollo es estimulado por el CO2 y la anaerobiosis. Excepcionalmente se la ha asociado a infecciones humanas. Se presenta el caso de un paciente anoso con infección urinaria por B. scardovii y Enterococcus faecalis, ambos microorganismos aislados en 2 urocultivos consecutivos. El bacilo no desarrolló en los medios de cultivo habituales, pero sí en agar chocolate en CO2 y en agar Brucella suplementado, incubados durante 72 h a 35°C. La coloración de Gram alertó acerca de su presencia al observarse abundantes bacilos gram positivos irregulares con extremos bifurcados en forma de Y, y escasos cocos gram positivos. Es importante la coloración de Gram en orinas con piuria y la siembra en medios enriquecidos por tiempos prolongados. En este caso, sin el resultado del Gram y con el desarrollo de E. faecalis, no hubiésemos advertido la presencia del agente mayoritario.

Bifidobacterium scardovii species consists of facultative anaerobic gram-positive rods whose growth is stimulated by CO2 and anaerobiosis. Exceptionally it has been associated with infections in humans. An elderly male patient with a urinary tract infection due to B. scardovii and Enterococcus faecalis is presented here; both microorganisms were isolated from two consecutive urine samples. The bacillus did not grow on standard media, but on chocolate agar incubated in CO2 and on supplemented Brucella agar in an anaerobic atmosphere, incubated for 72 h at 35°C. Gram staining with abundant irregular gram-positive rods with Y-shaped ends and some gram-positive cocci alerted to its presence. The importance of the Gram stain test in urine samples with pyuria and the growth on enriched media for long periods is highlighted here. In this case, if we had not had the Gram stain test results, and had considered only the E. faecalis growth, we would have lost the major etiologic agent.

Un caso inusual de quiste sebáceo infectado por Dermabacter hominis / Unusually infected sebaceous cyst by Dermabacter hominis

La especie Dermabacter hominis está constituida por bacilos gram positivos corineformes, anaerobios facultativos, que forman parte de la microbiota residente de la piel. Excepcionalmente se ha asociado a estos microorganismos con infecciones en pacientes inmunocomprometidos o muy debilitados. Se describe el caso de una mujer adulta joven, inmunocompetente, con un quiste sebáceo en el cuello, infectado por D. hominis como único agente etiológico. Se logró la identificación fenotípica del agente causal mediante pruebas simples basadas en el esquema originalmente propuesto por Funke y Bernard, factibles de ser realizadas en un laboratorio hospitalario de microbiología. Características fenotípicas como la morfología cocoide, el olor acre/espermático, la hidrólisis de la esculina, la producción de pirrolidonil arilamidasa y de lisina y ornitina descarboxilasas son pruebas claves en la identificación de D. hominis. La espectrometría de masas (MALDI-TOF MS) confirmó la identificación fenotípica.

Dermabacter hominis species is constituted by Gram positive facultative anaerobic coryneform rods being part of the resident microbiota human skin, and exceptionally associated to infections in immunocompromised or severely debilitated patients. An immunocompetent young adult woman with a neck sebaceous cyst infected by D. hominis as unique etiologic agent is presented. Phenotypic identification of the causative agent was achieved through simple tests, based on the originally scheme proposed by Funke and Bernard, and feasible to be performed in a hospital Microbiology Laboratory. Phenotypic characteristics as coccoid morphology, the acrid/spermatic odor, esculin hydrolysis, the production of pyrrolidonyl-arylamidase, lysine and ornithine decarboxylase, are key tests to identify D. hominis. The matrix-asisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) confirmed the phenotypic identification.

Estado actual de la gonorrea / Current state of gonorrhea

La gonorrea es una infección de transmisión sexual conocida desde la antigüedad que se ha perpetuado en el tiempo. Su agente etiológico, Neisseria gonorrhoeae, fue adquiriendo resistencia a la mayoría de los antimicrobianos utilizados para su tratamiento empírico. Las resistencias emergentes en los últimos años son a fluorquinolonas, macrólidos y cefalosporinas orales y parenterales. Hay aislamientos multirresistentes que plantean un desafío para su tratamiento. En países donde estos hallazgos ocurrieron precedentemente, la experiencia de tratamientos con antibióticos no convencionales, por ejemplo aminoglucósidos, es limitada y también emergieron cepas resistentes. Una de las estrategias utilizadas frente a la sensibilidad disminuida a ceftriaxona es aumentar la dosis o utilizar tratamientos combinados. En el marco actual de la multirresistencia de este microorganismo es importante promover la prevención de la infección, realizar vigilancia epidemiológica y buscar nuevas estrategias para su tratamiento.

Gonorrhea is a sexually transmitted infection known since antiquity that has been perpetuated over time. Its etiologic agent, Neisseria gonorrhoeae, was becoming resistant to most antimicrobials agents used for empiric therapy. Emerging resistance in recent years are fluoroquinolones, macrolides, oral and parenteral cephalosporins. There are multiresistant isolates that represent a challenge for its treatment. In countries where these findings occurred previously, the experience with unconventional treatments such as aminoglycosides is limited and resistant strains have emerged. One of the strategies used against the reduced susceptibility to ceftriaxone is to increase the dose or use combined treatments. In the current context of multidrug resistance of this organism it is important to promote the prevention of infection, epidemiological surveillance and look for new strategies for treatment.

Enterobacterias portadoras de KPC en un hospital universitario / KPC-producing Enterobacteriaceae in a university hospital

La resistencia a carbapenemes en enterobacterias representa una situación de alto impacto clínico debido a las limitadas opciones terapéuticas disponibles para el tratamiento de las infecciones causadas por estos microorganismos multirresistentes que cursan con altas tasas de morbilidad y mortalidad. En nuestro país, en los últimos 5 años, se observó la diseminación de aislamientos de Klebsiella pneumoniae portadores de carbapenemasa de tipo KPC pertenecientes al ST258, clon diseminado mundialmente. En nuestro hospital la incidencia de episodios fue aumentando, especialmente la infección del sitio quirúrgico y las bacteriemias. En el último bienio se observó la diseminación del mecanismo de resistencia a otras enterobacterias y probablemente a otros secuenciotipos de K pneumoniae con mayor sensibilidad a antibióticos no ß-lactámicos. Se hace necesario instaurar las correctas medidas de prevención y control para evitar la diseminación de estos patógenos.

The presence of carbapenem -resistant Enterobacteriaceae in clinical settings represents a concerning issue due to the limited therapeutic options available for the treatment of the infections caused by these multi-drug resistant bacteria which usually have high mortality rates. The spread of Klebsiella pneumoniae isolates belonging to ST258 was observed in the last 5 years in our country. In our hospital the number of episodes has grown with the years and the most prevalent infections were the surgical site and bacteremia. In the last 2 years KPC spread to other Enterobacteriaceae and probably to other STs in K pneumoniae which showed different susceptibility patterns to non ß-lactamic antimicrobials. We believe that it is vital to install the appropriate measures to prevent and control the dissemination of these microorganisms.

Actividad in vitro de ampicilina-ceftriaxona frente a aislamientos de Enterococcus faecalis recuperados de infecciones invasivas / In vitro activity of ampicillin-ceftriaxone against Enterococcus faecalis isolates recovered from invasive infections

Se evaluó la actividad in vitro de la asociación entre ampicilina y ceftriaxona frente a 30 aislamientos de Enterococcus faecalis obtenidos de infecciones invasivas de pacientes atendidos en el Hospital de Clínicas José de San Martín, Ciudad Autónoma de Buenos Aires. Las sinergias entre ampicilina y ceftriaxona se determinaron mediante la técnica de dilución en caldo Müeller-Hinton con el agregado de diferentes concentraciones subinhibitorias de ceftriaxona o sin este. La asociación fue sinérgica en 22/30 aislamientos. En 14/30 aislamientos la asociación disminuyó los valores de concentración inhibitoria mínima (CIM) y de concentración bactericida mínima (CBM); en 6/30 se observó solamente una disminución de la CIM, mientras que en 2 solo se determinó una reducción de la CBM. La actividad bactericida de la asociación fue mayor a bajas concentraciones de ampicilina (menor de 1µg/ml). Se demostró la sinergia in vitro entre ampicilina-ceftriaxona; se confirmó así la utilidad de esta asociación en el tratamiento de infecciones severas causadas por E. faecalis

In vitro activity of the combination of ampicillin- ceftriaxone against 30 Enterococcus faecalis isolates recovered from invasive infections in patients admitted to Hospital de Clínicas José de San Martin in the city of Buenos Aires was assessed. Ampicillin- ceftriaxone synergies were determined by microdilution in Müeller-Hinton (MH) broth with and without subinhibitory concentrations of ceftriaxone. Synergy was detected in 22/30 isolates. A decrease in both minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) was observed in 14/30 isolates, whereas in 6/30 isolates the decrease was observed in the MIC value and only in the MBC value in the 2 remaining isolates. The bactericidal activity of the combination showed to be higher at low concentrations of ampicillin (< 1µg/ml). We detected in vitro synergy using the ampicillin-ceftriaxone combination and thus, its efficacy was confirmed in the treatment of severe infections by E. faecalis

Frecuencia de aislamiento y resistencia a los antimicrobianos de Acinetobacter spp. recuperadas de pacientes atendidos en un hospital universitario de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires / Frequency and antimicrobial resistance of Acinetobacter species in a university hospital of Buenos Aires city

Se analizaron 200 aislamientos de Acinetobacter correspondientes a igual cantidad de pacientes atendidos en el Hospital de Clínicas José de San Martín entre marzo de 2013 y junio de 2014. La identificación se realizó mediante espectrometría de masa y se confirmó con métodos moleculares. La sensibilidad a los antimicrobianos se determinó mediante el sistema Vitek-2. La correlación entre la identificación obtenida con la espectrometría de masa y las técnicas moleculares fue del 94 %. Acinetobacter baumannii multirresistente fue la genoespecie predominante (92,6 %) en la infección intrahospitalaria, y la frecuencia de aislamiento de Acinetobacter pitti y de Acinetobacter nosocomialis fue de 3,5 % y 0,5 %, respectivamente. En la infección extrahospitalaria se observó una mayor presencia de otras genoespecies. Acinetobacter johnsonii y A. baumannii fueron las más frecuentes y juntas representaron el 45,9 % de los hallazgos. La resistencia a carbapenems y a minociclina solo se observó en A. baumannii. La espectrometría de masa resultó ser una herramienta útil en la identificación de las diferentes genoespecies

Two-hundred Acinetobacter isolates belonging to 200 patients admitted to Hospital de Clínicas José de San Martín during the period March 2013-June 2014 were analyzed. The identification was performed by mass spectrometry and was confirmed by molecular methods. Susceptibility to antimicrobials was studied by the Vitek-2 system. A 94% correlation of both identification methods was found. Multidrug resistant Acinetobacter baumannii was the predominant genomic species (92.6%) in hospital-acquired infections, whereas Acinetobacter pitti and Acinetobacter nosocomialis accounted for 3.5% and 0.5% of the isolates recovered, respectively. In community-acquired infections a major predominance of the different genomic species was observed. Acinetobacter johnsonii and A. baumannii are the most frequent species, accounting for 45.9% of the isolates recovered. Resistance to carbapenems and minocycline was only observed in A. baumannii. Mass spectrophotometry was an effective tool for the identification of the different genomic species