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1.
Article in Portuguese | LILACS-Express | LILACS, INDEXPSI | ID: biblio-1515348

ABSTRACT

A partir da apresentação do atendimento de um jovem autista no âmbito de um dispositivo que utiliza seu interesse pela música e sons em geral, os autores se esforçam para mostrar como se pode orientar a cura a partir de noções de riscado (testemunho da recusa que a pessoa autista remete ao outro), arranhão (primeira inscrição da descontinuidade operada no real) e assinatura (transformação do arranhão permitindo uma apresentação do sujeito autista no mundo do Outro).


Resumos From the presentation of the care of a young autistic patient within the framework of a device using his interest in music and sounds in general, the authors endeavor to show how one can orient the cure from notions of scratch (witness of the refusal that person with autism sends back to the other), graze (first inscription of the discontinuity operated in the chaos) and signature (transformation of the scratch allowing a presentation of the autistic subject in the world of Other)


À partir de la présentation de la prise en charge d'un jeune patient autiste dans le cadre d'un dispositif qui utilise son intérêt pour la musique et les sons en général, les auteurs s'attachent à montrer comment on peut guider la cure à partir des notions de rayure (témoignage du refus que l'autiste remet à l'autre), d'égratignure (première inscription de la discontinuité opérée dans le réel) et de signature (transformation de l'égratignure permettant une présentation du sujet autiste dans le monde de l'Autre).


A partir de la presentación de la atención a un joven autista en el marco de un dispositivo que utiliza su interés por la música y los sonidos en general, los autores pretenden mostrar cómo se puede orientar la cura desde nociones de la raya (testigo de la negativa que el autista devuelve al otro), rasguño (primera inscripción de la discontinuidad operada en lo real) y firma (transformación del rasguño que permite una presentación del sujeto autista en el mundo del Otro).

2.
São Paulo; s.n; 2020. 99 p. figuras, tabelas.
Thesis in Portuguese | LILACS, Inca | ID: biblio-1102465

ABSTRACT

A síndrome do Xeroderma Pigmentoso (XP) ocorre frente à herança monogênica e bialélica de variantes germinativas patogênicas de perda ou redução de função em genes das vias de reparo por excisão de nucleotídeos ou síntese translesão. Consequentemente, é estabelecida deficiência na correção de lesões induzidas, principalmente por radiação ultravioleta, favorecendo alta sensibilidade à radiação solar e risco aumentado para o desenvolvimento de múltiplas lesões cutâneas pré-malignas e malignas. Visto que a heterogeneidade na manifestação clínica da síndrome é uma questão em discussão na literatura, para investigar este aspecto propusemos avaliar o perfil de variantes germinativas e variantes somáticas de tumores cutâneos e não cutâneos de indivíduos portadores de XP. Foi realizado o sequenciamento de alto desempenho utilizando a plataforma NextSeq (Illumina) para avaliar as regiões codificantes de 114 genes selecionados pela sua relevância em desordens dermatológicas, tumorigênese e fisiologia cutânea e resposta de dano ao DNA. Seis pacientes com fenótipo clínico da síndrome do XP e portadores de variantes germinativas clinicamente relevantes nos genes XPC ou POLH/XPV foram avaliados no estudo. Variantes germinativas de significado incerto foram identificadas, em heterozigose, no DNA de leucócito de cinco dos seis pacientes avaliados ocorrendo nos genes DNAH11, PCDHB3, RGS22, SLC27A5, TTN e UGT2B10 e nenhuma das variantes identificadas apresentou perda de heterozigose do alelo selvagem nos tecidos tumorais. O polimorfismo de risco para carcinoma basocelular de pele (CBC) rs3769823[A] no gene CASP8 não foi identificado em apenas um caso do estudo, o qual desenvolveu o menor número de tumores. O polimorfismo de risco rs1126809[A] no gene TYR foi detectado apenas no caso que apresentou o maior número de CBC. Amostras de DNA de nove CBCs de tecido armazenado em parafina e duas amostras de tumor gástrico de uma mesma peça cirúrgica, de tecido armazenado em parafina e congelado a fresco, foram avaliadas de forma pareada com o DNA de leucócito correspondente, para pesquisa de variantes somáticas. Variantes somáticas não foram identificadas na amostra de CBC da paciente XP-C com fenótipo menos agressivo da síndrome. O total de 235 variantes missense e 29 variantes de perda de função foram identificadas em 71 genes para sete amostras de CBC, mínimo de 11 e máximo de 127 variantes por amostra, com 85,2% destas apresentando frequência alélica ≥20%. Com exceção de um CBC, mais de 95% das variantes somáticas identificadas representam alterações tipicamente fotoinduzidas (C:G>T:A e G:C>T:A). Embora pacientes XP acumulem maior número de mutações devido deficiência no mecanismo de reparo, não observamos carga mutacional diferente do observado em CBCs esporádicos. Vinte e sete genes apresentaram variantes somáticas em mais de uma amostra de CBC. Nenhum gene foi compartilhado entre as sete amostras de CBC. Entre os genes alterados em maior número de tumores estão incluídos genes drivers de CBC (LATS1, NOTCH2, PTCH1, PTPN14 e TP53), bem como genes não clássicos na carcinogênese do CBC (APC, FLG e TTN). Uma variante driver em SMO foi recorrente em três CBCs de um mesmo paciente. Duas variantes somáticas foram identificadas no tumor gástrico de tecido congelado a fresco ocorrendo nos genes GLI3 e RB1, não sendo as mesmas detectadas no tecido armazenado em parafina. Nesse trabalho, ressalta-se a heterogeneidade na manifestação clínica da síndrome do XP e a identificação de dois polimorfismos de risco, bem como destaca-se o papel central das vias Sonic Hedgehog e Hippo na carcinogênese do CBC de pacientes XP (AU)


The Xeroderma Pigmentosum (XP) syndrome occurs on base of biallelic inheritance of pathogenic germline variants of loss of function or function reduction in genes that plays role in nucleotide excision repair and translesion synthesis. Consequently, patients are deficient in correct DNA lesions mainly induced by ultraviolet radiation, present high sensitivity to solar radiation and increased risk for the development of multiple premalignant and malignant skin lesions. Since the heterogeneity in the clinical manifestation is under constantly discussion in the literature, to investigate it we proposed to explore the profile of germline variants and somatic variants in skin and non-skin tumors from XP patients. High-performance sequencing using the NextSeq (Illumina) platform was performed to assess the coding regions of 114 genes selected for their relevance in dermatological disorders, skin carcinogenesis, cutaneous physiology and DNA damage response. Six patients with clinical phenotype of XP syndrome and carriers of clinically relevant germline variants in the XPC or POLH/XPV genes were evaluated in the study. Heterozygous germline variants of uncertain significance were identified in the leukocyte DNA from five of the six patients occurring in DNAH11, PCDHB3, RGS22, SLC27A5, TTN and UGT2B10 genes. None of the identified variants showed loss of heterozygosity of the wild allele in tumor tissues. The CASP8 risk polymorphism for basal cell carcinoma of the skin (BCC) rs3769823[A] was not identified in only one case of the study which developed the minor number of tumors. The TYR risk polymorphism rs1126809[A] was detected only in the case with the highest number of BCC. Somatic variants were investigated in DNA from nine samples of BCCs (tissue stored in paraffin) and two samples of gastric tumor from the same surgical (tissue stored in paraffin and fresh frozen), all paired with the corresponding leukocyte DNA. Somatic variants were not identified in the BCC sample of XP-C patient with a less aggressive syndrome phenotype. A total of 235 missense variants and 29 loss of function variants were identified in 71 genes for seven BCC samples. A minimum of 11 and a maximum of 127 variants per sample were detected, with 85.2% showing an allelic frequency ≥20%. Except for one BCC, more than 95% of the identified somatic variants represented typically photoinduced mutations (C:G>T:A and G:C>T:A). Although XP patients accumulate a greater number of mutations due to deficiency in the repair mechanism, we did not observe different mutational load compared with sporadic BCCs. Twenty-seven genes showed somatic variants in more than one BCC sample. Genes shared between the seven BCC samples were not found. Among the altered genes in a greater number of tumors, it was identified BCC driver genes (LATS1, NOTCH2, PTCH1, PTPN14 and TP53), as well as genes non-classical for BCC carcinogenesis (APC, FLG and TTN). A driver variant in SMO was recurrent in three BCCs from the same patient. Two somatic variants in GLI3 and RB1 genes were identified occurring only in the fresh frozen tissue of gastric tumor, not in the tissue stored in paraffin. In this work, the heterogeneous clinical manifestation of XP syndrome is highlighted, as well as the identification of two risk polymorphisms. In addition, this work emphasizes the central role of the Sonic Hedgehog and Hippo pathways in BCC carcinogenesis of XP patients.


Subject(s)
Humans , Male , Middle Aged , Skin Neoplasms , Stomach Neoplasms , Xeroderma Pigmentosum , Carcinoma, Basal Cell , DNA Repair , High-Throughput Nucleotide Sequencing , Ultraviolet Rays
3.
São Paulo; s.n; s.n; 2019. 110 p. graf, tab.
Thesis in English | LILACS | ID: biblio-1023378

ABSTRACT

Metabolic Syndrome (MetS) is a combination of diseases interrelated and associated with increased mortality and risk of cardiovascular events. Among the elucidated molecular mechanisms of MetS, there are several genes regulated by miRNAs - small non-coding RNAs. A large number of transcriptomic studies in public databases integrated with new analysis methods can generate new insights. Therefore, this study aimed to identify circulating miRNAs and their target genes in MetS using a Systems Biology approach. For this, we used GEO-NCBI to download and analyse 26 microarray transcriptome studies of MetS and obesity. After preprocessing, the data underwent differential expression (LIMMA method), gene co-expression (CEMiTool), and enrichment (GSEA, Reactome) analyses. We retrieved a gene expression signature for subcutaneous adipose tissue (SAT) for obese individuals that included 291 consistent differentially expressed genes (DEG). This signature had a positive normalized enrichment score (NES) for adaptive immune system activation responses, and negative NES for metabolic pathways. The consensus co-expression network of SAT revealed 3 communities (CM) of densely interconnected genes. These CMs had a high number of up regulated genes and a consistent positive NES among the studies. The co-expressed genes of these 3 CMs were related to neutrophil degranulation, infiltration of immune system cells, and inflammatory processes. Also, a small brazillian cohort (6 individuals with MetS and 6 controls) underwent a seric miRNA profiling using PCR array. From the 222 miRNAs detected in serum, the differential expression analysis identified 4 upregulated miRNAs (miR-30c-5p, miR-421, miR-542-5p and miR-574) in MetS patients (p<0.01). The integrative miRNAs-mRNAs analysis revealed that the circulating upregulated miRNAs had 12 targets in the SAT, 3 targets in the liver; and no targets in the muscle and blood. Many of these target genes are known modulators of proinflammatory pathways. In conclusion, the use of Systems Biology in the analysis of gene networks and circulating miRNAs identified some potential molecular and pathophysiological mechanisms of the Metabolic Syndrome. The circulating miRNAs identified in this study are potential biomarkers and/or therapeutic targets. However, further studies are needed to validate these miRNAs and their target mRNA


A Síndrome Metabólica (MetS) é um conjunto de doenças inter-relacionadas e associadas ao aumento de mortalidade e risco de eventos cardiovasculares. Entre os mecanismos moleculares elucidados da MetS, existem muitos genes regulados por miRNAs - RNAs pequenos não codificadores. O grande número de estudos transcriptômicos em banco dados públicos integrado a novos métodos de análise podem gerar novas descobertas. Deste modo, o objetivo deste estudo foi identificar miRNAs circulantes e genes alvos na MetS usando a abordagem de Biologia de Sistemas. Para isso, GEO-NCBI foi usado para obter e analisar 26 estudos de transcriptoma por microarray de MetS e obesidade. Após o pré-processamento, realizamos análises de expressão diferencial (método LIMMA), co-expressão gênica (CEMiTool), e enriquecimento (GSEA, Reactome). Identificamos uma assinatura de expressão gênica do tecido adiposo subcutâneo (SAT) de indivíduos obesos, composta por 291 genes consistentemente diferencialmente expressos (DEG). Essa assinatura teve um escore de enriquecimento normalizado (NES) positivo para ativação de respostas do sistema imune adaptativo, e NES negativo para vias de metabolismo. A rede consenso de co-expressão do SAT revelou 3 comunidades (CM) de genes densamente interconectadas. Essas CMs continham muitos genes regulados positivamente e com consistência de NES positivo entre os estudos. Os genes co-expressos dessas 3 comunidades pertenciam a vias de a degranulação de neutrófilos, infiltração de células do sistema imune e processos inflamatórios. Além disso, uma pequena coorte brasileira (6 indivíduos com MetS e 6 controles) foi submetida à dosagem sérica de miRNAs por PCR array. Dos 222 miRNAs detectados no soro, a análise de expressão diferencial identificou 4 miRNAs regulados positivamente (miR-30c-5p, miR-421, miR-542-5p e miR-574) nos pacientes com MetS (p<0.01). A análise integrativa miRNAs-mRNAs revelou que osmiRNAs circulantes superexpressos tinham 12 alvos no SAT, 3 alvos no fígado; e nenhum alvo no músculo e no sangue. Muitos desses alvos são moduladores de vias ró-inflamatórias. Em conclusão, a utilização da Biologia de Sistemas na análise de redes gênicas e miRNAs circulantes identificou alguns potenciais mecanismos moleculares e fisiopatológicos da Síndrome Metabólica. Os miRNAs circulantes identificados neste trabalho são potenciais biomarcadores e/ou alvos terapêuticos. Entretanto, mais estudos são necessários para validar esses miRNAs e seus mRNAs alvos


Subject(s)
Metabolic Syndrome/diagnosis , MicroRNAs/analysis , Systems Biology/instrumentation , RNA, Messenger/analysis , Gene Regulatory Networks , Obesity/classification
4.
Neotrop. ichthyol ; 16(2): [e170045], jun. 2018. mapas, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-948168

ABSTRACT

Two sympatric species of marine mullets, Mugil curema and M. liza, use the rio Tramandaí Estuary as nursing grounds. When two closely related species are sympatric, various mechanisms may permit their coexistence, including spatial or temporal segregation that results in the divergent use of the resources for which they compete. To investigate the spatial segregation, we used otolith chemistry inferred through laser ablation-inductively coupled plasma mass spectrometry. Our results indicate that in the rio Tramandaí Estuary, M. curema is associated with high salinity waters and can be classified as a Marine Migrant in the Marine Estuarine-opportunist subcategory. Mugil liza is associated with lower salinity and can be classified as a Marine Migrant in the Estuarine Dependent subcategory. The intra-specific variation in estuarine habitat use indicates that the migratory behaviors in mullets are far more complex than previously known.(AU)


Duas espécies de tainha simpátricas, Mugil curema e M. liza, usam o estuário do Rio Tramandaí como zona de berçário. Quando espécies do mesmo gênero são simpátricas, vários mecanismos podem permitir sua coexistência, incluindo segregação espacial ou temporal que resultam no uso distinto dos recursos pelos quais elas competem. Para investigar a segregação espacial nós usamos a análise de elementos químicos em otólitos inferidos por espectrometria de massas através de plasma indutivamente acoplado com amostras extraídas a laser (LA-ICPMS). Mugil curema está associada a águas de alta salinidade podendo ser classificada como Marinho Migrante sub-categoria Marinha estuarina-oportunista. Mugil liza está associada a águas menos salinas, devendo ser classificada como Marinha Migrante sub-categoria Estuarina Dependente. A variação intraespecífica no uso do habitat estuarino indica um comportamento migratório mais complexo que o previsto em tainhas.


Subject(s)
Animals , Behavior, Animal , Ecosystem , Smegmamorpha/classification
5.
Rev. bras. mastologia ; 18(3): 132-136, jul.-set. 2008.
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-550148

ABSTRACT

A heterogeneidade nas apresentações clínica e morfológica do câncer de mama é em grande parte decorrente da sua expressão gênica. O comportamento da neoplasia depende de complexa relação entre centenas ou milhares de genes distintos, atuando por meio de suas respectivas proteínas sobre diferentes etapas do funcionamento celular. A possibilidade de estudo da expressão de múltiplas variáveis, de maneira simultânea, por métodos como microarranjos de DNA e RT-PCR, inaugurou uma nova etapa de conhecimento e manejo do câncer de mama. Quatro grandes classes de câncer mamário nasceram de vários estudos: luminal-A, luminal-B, HER2 e basal-símile. As pesquisas que se seguiram procuraram por padrões de expressão genética relacionados a comportamentos biológicos mais especificos, como o risco de recorrência a distância. Os dados obtidos a partir destes testes potencializam as informações obtidas por meio de variáveis clínicas e anatomopatológicas clássicas. Estudos clínicos prospectivos, alguns em andamento, decidirão quanto à incorporação definitiva destes testes no planejamento terapêutico.


The clinical and morphologic heterogeneity of breast cancer is driven to a large extent by abnormal gene expression within tumors. The behavior of the neoplasia depends on complex relation between hundreds or thousands of distinct genes, acting through its respective proteins on different stages of the cellular functions. The possibility of studying multiple variables simultaneously through methods as DNA microarray and RT-PCR inaugurated a new stage if knowledge and management of the breast cancer. Four major molecular classes of breast cancer emerged from several studies: luminal-A, luminal-B, HER2 and basal-like. The following researches looked fir genetic profile related to more specific biological behavior such as the risk of distant recurrence. The data gathered from these tests augment standard diagnostic and prognostic information obtained from traditional clinical pathological variables. Prospective clinical trials, some in progress, will decide about the definitive incorporation of these tests in the therapeutic planning.


Subject(s)
Humans , Female , Gene Expression , Gene Expression Regulation, Neoplastic , Breast Neoplasms/genetics , Oligonucleotide Array Sequence Analysis , Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction , DNA, Complementary , DNA, Neoplasm , Genetic Predisposition to Disease , Genetic Techniques , Prognosis , RNA, Messenger
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