Marine planktonic and benthic organisms: an ocean of diversity in the collections of the State of São Paulo / Organismos planctônicos e bentônicos marinhos: um oceano de diversidade nas coleções do Estado de São Paulo

Abstract Brazil is characterized as a megadiverse country, and one of the factors that guarantees the knowledge and preservation of this biodiversity is an improvement in the biological collections. They represent a country's biological, scientific, cultural, and genetic heritage and their preservation depends on a joint effort of researchers, institutions, and public authorities. Marine biological collections of invertebrates and algae of the state of São Paulo represent a high percentage of the national collections, with five biological collections deposited in state institutions. Currently, these collections safeguard the vast majority of the state's marine collection and make up one of the largest in the country. Therefore, the objective of this research is to present information on marine biological collections in the state of São Paulo, their current status, funding, and future perspectives, creating communication opportunities and considering the factors that impact their development. Support from the São Paulo Research Foundation (FAPESP) surpasses state limits, since many studies address broader areas and/or establish diverse partnerships with other institutions from outside São Paulo. This is reflected in the taxonomic and geographic scope of the biological collections in the state, since these host specimens/species from different regions of the country, or even from other countries. However, it is worth mentioning that it is not enough to invest in expeditions to enrich the collections without valuing the training of qualified personnel, both for the collections maintenance and for their taxonomic refinement.

Resumo O Brasil é caracterizado como um país megadiverso e uma das prioridades no conhecimento e conservação dessa biodiversidade é seguramente a melhoria das coleções biológicas. Estas representam patrimônio biológico, científico, cultural e genético de um país, e sua preservação depende de um esforço coletivo de pesquisadores, instituições e do poder público. Com relação às coleções biológicas marinhas de invertebrados e algas, o estado de São Paulo representa uma alta porcentagem do acervo nacional, com cinco principais coleções depositadas em instituições estaduais. Atualmente estas coleções salvaguardam a grande maioria do acervo marinho estadual e compõem um dos maiores do país. Assim sendo, o objetivo desta pesquisa é o de apresentar informações sobre as coleções biológicas marinhas do estado de São Paulo, estado atual, financiamentos e perspectivas futuras, criando oportunidades de comunicação e considerando os fatores que impactam o desenvolvimento das mesmas. O apoio financeiro da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) às instituições paulistas extravasa os limites do estado, visto que muitas pesquisas abordam áreas mais abrangentes e/ou estabelecem parcerias diversas com outras instituições não paulistas. Isso se reflete inclusive na abrangência taxonômica e geográfica das coleções biológicas do Estado, uma vez que estas mantêm espécimes/espécies de diferentes regiões do país, ou mesmo de outros países. No entanto, vale ressaltar que não basta investir em expedições de coleta para enriquecimento das coleções sem valorizar a formação de pessoal qualificado, tanto para a curadoria dos acervos quanto para o refinamento taxonômico.

Encapsulamento, crioproteção e desidratação na capacidade regenerativa de ápices caulinares de Genipa americana / Encapsulation, dehydration and cryoprotection in regenerative capacity of shoot apices of Genipa americana

Genipa americana (jenipapeiro) é uma essência florestal pertencente à família Rubiaceae, que apresenta importância econômica e ambiental, sendo valorizada para produção de alimentos, na recuperação de áreas degradadas, na composição em áreas de preservação permanentes e em sistemas agroflorestais. Objetivou-se avaliar o efeito de diferentes tempos de desidratação em câmara de fluxo laminar e tempos de imersão em solução crioprotetora (MS+0,5M de sacarose) na capacidade regenerativa de ápices caulinares da espécie para estabelecimento de futuros protocolos de criopreservação. Os ápices caulinares foram obtidos de plântulas, acesso Oiteiros, germinadas e cultivadas in vitro. Os explantes foram submetidos ao encapsulamento e a diferentes tempos de imersão em solução crioprotetora e tempos de desidratação em câmara de fluxo laminar. A crioproteção e a desidratação não alteram a viabilidade dos ápices caulinares de jenipapeiro encapsulados ou não encapsulados. A imersão por 24 horas em solução crioprotetora e a desidratação em câmara de fluxo laminar por 2 horas apresentam potencial para uso em futuros trabalhos de criopreservação por encapsulamento-desidratação.

Genipa americana (genipap) is a forest species belonging to the Rubiaceae family that has economic and environmental importance, being valued for food production, recuperation of degraded areas, in the composition in areas of permanent preservation and agroforestry. The objective of this research was to evaluate the effect of different times of dehydration in laminar flow cab and immersion time in cryoprotecting solution (MS+0.5M sucrose) on the regenerative capacity of shoot apices for establishing future cryopreservation protocols. The shoot apices were obtained from seedlings, of Oiteiros accession, germinated and cultured in vitro. Explants were subjected to encapsulation and different exposure times in cryoprotecting solution and dehydration in a laminar flow cab. The cryoprotection and dehydration does not modify the viability of the shoot apices of genipap encapsulated or unencapsulated. Immersion for 24 hours in cryoprotecting solution and the dehydration in a laminar flow cab by 2 hours have potential for use in future studies of cryopreservation by encapsulation-dehydration.

Parasitos de aves e mamíferos silvestres em cativeiro no estado de Pernambuco / Parasites of birds and mammals in captivity in Pernambuco state, Brazil

Os animais silvestres são hospedeiros de uma grande variedade de parasitos que podem interferir em sua conservação ex situ. O objetivo deste estudo foi identificar os parasitos gastrointestinais (PGI) e ectoparasitos dos animais do Centro de Triagem de Animais Silvestres (CETAS) do Instituto Brasileiro de Meio Ambiente e Recursos Naturais Renováveis (IBAMA) de Recife, Pernambuco, além de determinar os aspectos do manejo em cativeiro que possam estar relacionados com os parasitos identificados. Foram coletados ectoparasitos e amostras fecais de 223 aves e mamíferos, as quais foram processadas pelos métodos: microscopia direta, flutuação e sedimentação. Helmintos e/ou protozoários foram detectados em 91 (40,8%) amostras fecais, sendo 64 (70,3%) de aves e 27 (29,7%) de mamíferos. Ovos de Capillaria sp., Ascaridida, Spirurida e oocistos de Eimeria sp. foram detectados nas amostras fecais das aves, enquanto ovos de Trichuris trichiura, Strongyloides sp., Toxocara canis, Ancylostoma sp., Strongylida e oocistos de Coccídios foram encontrados nas amostras fecais de mamíferos. Os ectoparasitos identificados em aves foram Colpocephalum turbinatum, Kurodaia (Kurodaia) fulvofasciata, Halipeurus sp., Naubates sp., Saemundssonia sp., Austromenopon sp., Paragoniocotes sp., Brueelia sp., Myrsidea sp. and Pseudolynchia sp., enquanto em mamíferos os ectoparasitos identificados foram Rhipicephalus sanguineus, Amblyomma varium, A. calcaratum, A. nodosum, Ornithodoros talaje e Ctenocephalides felis felis. A. calcaratum e O. talaje são registrados pela primeira vez em Pernambuco e T. tetradactyla é apresentado como novo hospedeiro de O. talaje. Nenhum dos animais estudados apresentou sinais clínicos em decorrência da infecção/infestação parasitária. Parasitos com potencial zoonótico como T. trichiura, Strongyloides sp., T. canis e Ancylostoma sp. foram identificados em primatas não humanos e carnívoros. Precárias condições estruturais e sanitárias do CETAS-PE estão...

Wild animals are host to a variety of parasites that may interfere in their ex situ conservation. The objective of this study was to identify gastrointestinal parasites (GP) and ectoparasites of animals of Centro de Triagem de Animais Silvestres (CETAS) of Instituto Brasileiro de Meio Ambiente e Recursos Renováveis (IBAMA) in Recife/Pernambuco, Brazil, and to determine the aspects of captivity management that may be related to the parasites identified. We collected ectoparasites and fecal samples from 223 birds and mammals, which were processed by direct smear, flotation and sedimentation methods. Overall, helminthes and/or protozoa were detected in 91 (40.8%) fecal samples of 64 (70.3%) birds and 27 (29.7%) mammals. Capillaria sp., Ascaridida and Spirurida eggs and Eimeria sp. oocysts were found in fecal samples of birds, while eggs of Trichuris trichiura, Strongyloides sp., Toxocara canis, Ancylostoma sp., Strongylida and Coccidia oocysts were detected in fecal samples of mammals. Ectoparasites identified in birds were Colpocephalum turbinatum, Kurodaia (Kurodaia) fulvofasciata, Halipeurus sp., Naubates sp., Saemundssonia sp., Austromenopon sp., Paragoniocotes sp., Brueelia sp., Myrsidea sp. and Pseudolynchia sp. In mammals, the ectoparasites identified were Rhipicephalus sanguineus, Amblyomma varium, A. calcaratum, A. nodosum, Ornithodoros talaje and Ctenocephalides felis felis. A. calcaratum e O. talaje are presented for the first time in Pernambuco state and T. tetradactyla is reported as a new host of O. talaje. No animal presented clinical signs due to parasitic infection/infestation. Zoonotic parasites like T. trichiura, Strongyloides sp., T. canis and Ancylostoma sp. were identified in non-human primates and carnivores. Poor structural and sanitary conditions of CETAS-PE are related to the parasites identified in this study and should be taken into account for the adoption of appropriate control measures...

Análise florística comparativa da arborização urbana nos campi universitários do Brasil / A comparative floristic analysis of the urban arborization in university campi in Brazil

As instituições acadêmicas podem contribuir para uma adequada arborização urbana por meio do emprego de espécies apropriadas, embora em algumas universidades seja encontrado predomínio de espécies exóticas do Brasil. O objetivo deste trabalho foi realizar uma análise comparativa das espécies arbóreas e arbustivas utilizadas em campi universitários do Brasil para os quais há levantamentos disponíveis na literatura. Cada espécie teve sua origem (nativa ou exótica do Brasil) investigada. De posse dessas informações e dos dados de ocorrência das espécies, foram conduzidas análises exploratórias e confirmatórias. Apesar do uso predominante de espécies nativas (344 ­ 57,43% do total de espécies presentes na compilação), o número de exóticas (255 ­ 42,57% do total) foi elevado se considerarmos a diversidade ímpar da flora brasileira. O uso de espécies nativas e exóticas diferiu entre os levantamentos (χ2 =132,2, p < 0,0001); sete campi utilizaram significativamente (p ≤ 0,05) mais nativas do que exóticas e três campi, mais exóticas. Uma das espécies mais frequentes foi o pau-brasil (Caesalpinia echinata Lam.), classificada como "Em Perigo" pela Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas. A similaridade florística entre os levantamentos foi em geral baixa, mas foi mais alta entre levantamentos situados geograficamente mais próximos (Mantel, r = -0,4459, p = 0,0020), sugerindo que campi sob diferentes contextos locais e regionais tendem a utilizar diferentes espécies. A maioria das espécies indicadoras foi nativa, mas as melhores indicadoras (Valor Indicador mais alto) foram exóticas. Recomenda-se que espécies nativas, particularmente as autóctones, sejam cada vez mais utilizadas nos espaços urbanos, principalmente onde se gera e difunde conhecimento, ou seja, nas universidades.

Academic institutions can contribute to an adequate urban forestry through the use of appropriate species, although in some of the university campi it is found predominance of exotic species. The aim of this paper was performing a comparative analysis of the tree and shrub species used in university campi in Brazil which surveys are available in the literature. Each species was investigated on this origin (Brazilian native or exotic). With this information and the data of species occurrence, it was conducted exploratory and confirmatory analyses. Although the predominant use of native species (344 ­ 57.43% of the total found in the compilation), the number of exotic ones (255 ­ 42.57% of the total) was high if we take in account the unique diversity of the Brazilian flora. The use of native and exotic species differed between the surveys (χ2 =132.2, p < 0.0001); seven campi used significantly (p < 0.05) more native than exotic species and three of them, more exotic. The most frequent species was "pau-brasil" (Caesalpinia echinata Lam.), classified as "In dangerous" by the Red List of Threatened Species. The floristic similarity between the surveys was low in general, but it was higher between surveys closer in space (Mantel, r = -0,4459, p = 0,0020), suggesting that campi under different local and regional contexts tend to use different species. The majority of indicator species (those with the highest Indicator Values) was native, but the best ones were exotic. It is recommended a more intensive employment of native species (especially the autochthone ones) in urban space, manly where knowledge is generated and diffused, i.e. in the universities.

Agentes osmóticos e temperatura na conservação in vitro de sempre-viva / Osmotic agents and temperature on in vitro conservation of sempre-viva

A conservação in vitro é uma estratégia de conservação ex situ que garante a manutenção da integridade genética e biológica das espécies. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito de agentes osmóticos e temperatura na conservação in vitro de Syngonanthus mucugensis Giul. subsp. mucugensis. Os brotos foram inoculados em meio de cultura MS ½ contendo 7g L-1 de ágar e suplementado com 60g L-1 de sacarose, e com as concentrações de sacarose 15, 30 e 45g L-1 combinados com 0 e 15g L-1 de sorbitol ou manitol. As culturas foram mantidas em duas temperaturas (18 e 25°C). A porcentagem de sobrevivência das plantas foi avaliada mensalmente e ao final de 180 dias foram analisados o comprimento da parte aérea e da raiz, a porcentagem de folhas verdes, a porcentagem de explantes com brotos, o número de brotos por explante e o comprimento dos brotos. Os agentes osmóticos promoveram um decréscimo no crescimento das plantas, no entanto reduziram a sua viabilidade. Os resultados observados nos experimentos mantidos a 18°C foram significativamente superiores aos encontrados a 25°, para todas as variáveis analisadas. A conservação de S. mucugensis subsp. mucugensis pode ser feita à 18°C em meio de cultura MS ½ contendo 15g L-1 de sacarose, por até 180 dias, sem subcultivo.

The in vitro conservation is an ex situ conservation strategy that ensures the maintenance of genetic and biological integrity of species. The present study evaluated the effects of, osmotic agents and different temperature regimes on the in vitro conservation of Syngonanthus mucugensis Giul. subsp. mucugensis. The shoots were inoculated into half salt strength Murashige and Skoog culture medium (MS ½) containing 7g L-1 of agar. The culture medium was supplemented with 60gL-1 sucrose and with the sucrose concentrations 15, 30 and 45g L-1 combined with 0 and 15g L-1 of sorbytol or mannitol. Two different temperatures were used in these experiments (18 and 25°C). The percentage of plant survival was evaluated monthly and at 180 days were analyzed length of shoot and root, the percentage of green leaves, the percentage of explants with shoots and number of shoots per explants and shoot length. The addition of osmotic agents resulted in decreased growth of the plants and therefore reduced their viability. The averages observed in the experiments undertaken at 18°C were significantly superior to those observed at 25°C for all of the variables analyzed. S. mucugensis subsp. mucugensis can be cultured at 18°C in MS½ culture medium containing 15g L-1 of sucrose, for up to 180 days, without subculturing.

Germinação de espécies arbóreas de floresta estacional decidual do vale do rio Paranã em Goiás após três tipos de armazenamento por até 15 meses / Germination of tropical dry forest tree species of Paranã river basin, Goiás state, after three types of storage and up to 15 months

Em florestas deciduais a dispersão de sementes ocorre principalmente na estação seca e a germinação no início da estação chuvosa. O atraso das primeiras chuvas e a ocorrência de veranicos são importantes causas de mortalidade de sementes e plântulas. Armazenar sementes e plantá-las na estação chuvosa poderia aumentar a germinação e a sobrevivência de plântulas. Para isso é necessário verificar se as sementes mantêm sua germinabilidade após armazenamento. No presente estudo, investigamos se sementes de espécies arbóreas de floresta decidual alteram sua germinabilidade após i) serem armazenadas em condições naturais por três e 15 meses, e ii) em banco de germoplasma a -20 e -196 ºC. Coletamos sementes de 19 espécies de florestas estacionais deciduais do vale do rio Paranã, Goiás, nos meses de agosto a outubro de 2005. Um lote foi separado para a realização do teste de germinação, logo após a coleta. Uma quantidade deste lote permaneceu em câmaras a -20 ºC e outra foi imersa em nitrogênio liquido por 72 horas. Outros dois lotes foram armazenados em condições naturais por três e 15 meses antes do teste de germinação. Após três meses de armazenamento, apenas duas espécies, Cordia trichotoma (73 para 38 por cento) e Copaifera langsdorffii (85 para 65 por cento), reduziram sua germinabilidade. Após 15 meses, três espécies reduziram significativamente sua germinabilidade, Cordia trichotoma (73 para 5 por cento), Cavanillesia arborea (77 para 12 por cento) e Anadenanthera colubrina (93 para 76 por cento), e duas espécies, Aspidosperma pyrifolium e Tabebuia impetiginosa, perderam completamente sua germinabilidade. As temperaturas -20 e -196ºC reduziram a germinabilidade de uma espécie cada, Tabebuia impetiginosa (90 para 70 por cento) e Aspidosperma pyrifolium (90 para 43 por cento), respectivamente. O ambiente natural e o armazenamento a -20 e -196ºC se mostraram eficazes quanto à preservação das qualidades fisiológicas de sementes de grande parte...

Seed dispersal in tropical deciduous forests occurs mostly in the dry season and germination at the onset of the rainy season. The delay of the first rains and dry spells are major mortality factors in dry forest regions. Storing seeds to plant during the constant rains could increase germination and seedling survival. We investigated the germination percentage of deciduous forest tree species after being stored i) at -20 ºC and -196 ºC (liquid nitrogen), and ii) at natural conditions for three and 15 months. Seeds of 19 tree species of deciduous forests of Paranã river basin, Goiás state, were collected from August to October 2005. Two experiments were run: i) storage for three and 15 months in brown bags at environmental temperature, ii) storage for 72 hours at -20 ºC cameras, liquid nitrogen (-196 ºC) and a control. Storage at environmental temperature decreased germination of only two species after three months, Cordia trichotoma (73 to 38 percent) and Copaifera langsdorffii (85 to 65 percent). Three species decreased germination after 15 months (Cordia trichotoma, 73 to 5 percent; Cavanillesia arborea, 77 percent to 12 percent; and Anadenanthera colubrina, 93 percent to 76 percent) and two species, Aspidosperma pyrifolium and Tabebuia impetiginosa, lost completely their germination. Temperatures -20 and -196 ºC decreased germination of only one species each, Tabebuia impetiginosa (90 to 70 percent) and Aspidosperma pyrifolium (90 to 43 percent), respectively. In general, environmental temperature storage up to 15 months and -20 and -196 ºC storage were efficient to preserve seed germinability of many dry forest tree species from Paranã river basin. These are feasible options to ex situ conservation and to increase germination for direct seeding strategies of restoration.