Mapeo epidemiológico en la detección de reservorios de infecciones asociadas a la salud / Epidemiological mapping in the detection of reservoirs of health-associated infections

La presencia de infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) se han constituido en un problema de salud para todos los establecimientos salud, siendo los reservorios uno de los factores más importantes en su presencia y continuidad hospitalaria. Por lo que es necesario una serie de mecanismos para su identificación y control respectivo, siendo uno de ellos el mapeo epidemiológico que permite de por medio de herramientas técnicas la identificación de reservorios en un ambiente hospitalario geográfico específico para toma de acciones preventivas

The presence of associated health care infections (IAAS) have become a health problem for all health programs, with reservoirs that are of the most important factors in their presence and hospital continuity. Therefore, a series of mechanisms are necessary for their respective identification and control; one of them are the epidemiological mapping that allows, through technical tools, the identification of reservoirs in a specific geographic hospital environment for taking preventive actions.

Búsqueda de reservorios potenciales de infecciones asociadas a la atención en salud por medio de termografía / Search for potential reservoirs of health care-associated infections by thermography

La termografía constituye una herramienta de detección de temperaturas en distintas superficies con el fin de tomar medidas en caso que estas estén alteradas. La misma se ha aplicado en distintas ramas de la ingeniera como medida de prevención de riesgos en el campo laboral como de construcción. En el campo hospitalario estas tomaron gran importancia no solo en aspecto estructural sino en el médico ya que los cambios de temperatura son uno de los indicadores de potencial crecimiento de reservorios de microrganismos que pueden producir infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) sobre todo en las superficies de equipos e insumos médicos de un determinado ambiente hospitalario. Es decir, que esta herramienta que forma parte del sistema de vigilancia activa y mapeo epidemiológico coadyuvaría en gran medida en la búsqueda de estos reservorios, para tomar de acciones preventivas dentro de sus aspectos microbiológicos y de gestión del paciente dentro de las instituciones en salud.

Thermography constitutes a tool for detecting temperatures on different surfaces in order to take measures if these are altered. The same has been applied in different branches of engineering as a risk prevention measure in the labor field as well as in construction. In the field of hospitals these will take on great importance in the soil in a structural aspect, but in the doctor as temperature changes are one of the indicators of potential growth of microorganism reservoirs that can produce health care associated infections (HAI) above all on the surfaces of equipment and medical supplies in a given hospital environment. It is clear that this tool, which forms part of the active surveillance system and epidemiological mapping, would greatly help in the search for these reservoirs, in order to take preventive action in terms of microbiological aspects and patient management within health institutions.

Prevalencia de Dientamoeba fragilisy otros protozoários intestinales en porcinos de una granja en la región Andina de Colombia / Prevalence of Dientamoeba fragilis and other intestinal protozoa from a swine farm at the Andean region of Colombia

RESUMEN Dientamoeba fragilis es un protozoário que parasita el intestino grueso del hombre y animales domésticos. Hasta el momento, aún no son claros aspectos de su ciclo de vida, como el rango de hospedadores, reservorios, mecanismo de infección, entre otros. Se postula que el cerdo es un hospedador natural para este protozoario y que, debido a su cercanía con el humano, podría facilitar una transmisión zoonótica. En Colombia no existen a la fecha estudios sobre la presencia de D. fragilis en hospedadores animales, incluidos los cerdos, y los datos sobre la prevalencia de otros protozoarios intestinales en estos animales son escasos. El objetivo fue determinar la frecuencia de protozoarios intestinales, incluyendo D. fragilis, en cerdos de una granja tecnificada de una zona rural de Medellín (región Andina de Colombia). Se recolectaron muestras de materia fecal de 70 cerdos en etapa de preceba, que fueron evaluadas mediante examen directo, tinción tricrómica y Ziehl-Neelsen modificado. Se realizaron análisis univariados con medidas de frecuencia relativa y tendencia central y análisis bivariados para la exploración de factores de riesgo. Se detectó la presencia de D. fragilis en un 13% de las muestras y de otros parásitos como Entamoeba spp. (66%), Blastocystis spp. (64%), Balantioides coli (36%), Cryptosporidium spp. (36%), Iodamoeba butschlii (17%), coccidias (4%) y Giardia spp. (1,4%). En este primer reporte de D. fragilis en cerdos en Colombia se observó la alta prevalencia de otros protozoarios patógenos, lo que corrobora el papel de los cerdos como importantes reservorios de infecciones humanas. Estudios sobre la presencia de este protozoario tanto en cerdos como en el personal encargado de su manejo contribuirían al conocimiento sobre su dinámica de transmisión.

ABSTRACT Dientamoeba fragilis is a protozoan that parasitizes the large intestine of humans and domestic animals. To date, some aspects regarding D. fragilis life cycle, including hosts, reservoirs, infection mechanism, among others, are not yet clear. Swine are considered natural hosts for this protozoan, therefore their close contact with humans promotes its zoonotic transmission. In Colombia there are no studies on the presence of D. fragilis in animal hosts, including pigs, and data about other intestinal protozoa are scarce. The objective was to determine the prevalence of intestinal protozoan, including D. fragilis, in pigs raised in a farm from a rural area of Medellin (Andean region of Colombia). Fecal samples from 70 pigs in prefattening stage were collected. Direct fecal smear examination, trichrome and modified Ziehl-Neelsen stain were used in the study. Univariate analysis (frequency distribution and central tendency measures) and bivariate analysis were used to explore risk factors. Dientamoeba fragilis was found in 13% of the evaluated fecal samples. Other parasites detected included: Entamoeba spp. (66%), Blastocystis spp. (64%), Balantioides coli (36%), Cryptosporidium spp. (36%), Iodamoeba butschlii (17%), coccidias (4%), and Giardia spp. (1,4%). This is the first report of D. fragilis in swine in Colombia, and the high prevalence of other pathogen protozoa was also observed, which corroborates the role of pigs as important reservoirs for human infections. Studies focused on the evaluation of both swine and swine-exposed farm workers should be done in order to know the dynamics of transmission of this parasite.

Controladores biológicos para la reducción de índices aédicos / Biological controllers for the reduction of aedic indices

Ante la ausencia de vacunas eficaces para las arbovirosis transmitidas por el vector A. aegypti y la resistencia a insecticidas se hace necesario buscar alternativas, donde resalta el control biológico con el uso del larvicida microbiológico Bacillus thuringiensis var. israelensis (Bti). Como objetivo, se propuso determinar los índices aédicos y el uso de Bacillus thuringiensis israelensis como controlador biológico de Aedes aegypti en la localidad de Huánuco, Perú durante el segundo semestre de 2019. La investigación fue experimental de corte transversal con una muestra de 263 viviendas distribuidas en cinco bloques. Como instrumento se usó la observación y reporte de fichas a través de la inspección de cada vivienda en dos momentos, inicial y final, separadas por un lapso de 90 días. Para el análisis de los datos se usó estadística descripctiva a través de Epidat 3.0, obteniendo IA, IR e IB. Como resultado, de las 236 casas inspeccionadas, 51% (120/236) fueron no intervenidas y 49% (116/236) fueron intervenidas con Bacillus thuringiensis, de las casas no intervenidas (120/236) en la fase inicial 59% fueron positivas (con la presencia de algún estadío de A. aegypti) y en la fase final fue de 63%, por otra parte, en las casas intervenidas con Bacillus thuringiensis (CCB) (116/236) en la fase inicial 61% (71/116) estaban positivas y la fase final hubo un descenso a 32% (37/116). En conclusión, se sugiere que la aplicación de Bti constituye un componente adecuado para el manejo de poblaciones larvales de A. aegypti, en la ciudad de Perú(AU)

In the absence of effective vaccines for arboviruses transmitted by the vector A. aegypti and resistance to insecticides, it is necessary to look for alternatives, where biological control stands out with the use of the microbiological larvicide Bacillus thuringiensis var. israelensis (Bti). As an objective, it was proposed to determine the aedic indices and the use of Bacillus thuringiensis israelensis as a biological controller of Aedes aegypti in the town of Huánuco, Peru during the second half of 2019. The research was experimental cross-sectional with a sample of 263 homes distributed in five blocks. As an instrument, the observation and reporting of records was used through the inspection of each dwelling in two moments, initial and final, separated by a period of 90 days. For data analysis, descriptive statistics were used through Epidat 3.0, obtaining IA, IR and IB. As a result, of the 236 houses inspected, 51% (120/236) were not intervened and 49% (116/236) were intervened with Bacillus thuringiensis, of the houses not intervened (120/236) in the initial phase, 59% were positive (with the presence of some stage of A. aegypti) and in the final phase it was 63%, on the other hand, in the houses intervened with Bacillus thuringiensis (CCB) (116/236) in the initial phase 61% (71 /116) were positive and the final phase there was a decrease to 32% (37/116). In conclusion, it is suggested that the application of Bti constitutes an adequate component for the management of larval populations of A. aegypti, in the city of Peru(AU)

Fish community turnover in a dammed Andean River over time

We describe the change in the fish community of the Porce River in Magdalena River Basin, Colombia, following the construction of the Porce III hydropower reservoir based on 13 years of monitoring data. The results show a clear reduction of the number of native species, which have been supplanted by colonizing non-native species, especially in the reservoir. Four native species detected prior to dam construction have apparently disappeared, but 12 new species were registered post-construction. We analyzed spatial changes in beta diversity in the aquatic environments surrounding the dam. The new environment generated by the reservoir presents a unique species composition and contributes significantly to the total beta diversity of the system. Altogether three distinct new fish assemblages emerged following reservoir formation and there are now six assemblages where there had previously been three. This dramatic change, already visible within a decade of construction, highlights just how strong of an impact dam construction has on habitats and how rapidly fish communities react in this hotspot for endemic fish diversity. Our findings demonstrate the importance of monitoring fish communities for revealing the impact of damming on river ecosystems and informs potential complementary fish diversity inventories elsewhere in the Magdalena River basin.(AU)

Describimos el cambio en la comunidad de peces del río Porce en la cuenca del río Magdalena en Colombia luego de la construcción del embalse hidroeléctrico Porce III con base en 13 años de datos de monitoreo. Los resultados mostraron una reducción de especies nativas y, el embalse ha sido colonizado por especies no nativas. A lo largo del monitoreo cuatro especies desaparecieron de las capturas, y se registró la aparición de 12 especies nuevas después de la construcción del embalse. Analizamos los cambios espaciales en la diversidad beta en los ambientes acuáticos que rodean la presa. El nuevo entorno generado por el embalse presenta una composición de especies única; en total, surgieron tres nuevos ensamblajes de peces distintos después de la formación del embalse y ahora hay seis ensamblajes. Este cambio, ya visible a una década de la construcción, resalta cuán fuerte es el impacto que tiene la construcción de presas en los hábitats y cuán rápido reaccionan las comunidades de peces. Nuestros hallazgos demuestran la importancia de monitorear las comunidades de peces para revelar el impacto de las represas en los ecosistemas fluviales, además permite complementar los inventarios de diversidad en la cuenca del río Magdalena.(AU)

Responses of the zooplankton community to the formation of a small reservoir on the Caveiras River, southern Brazil

We investigated changes in the species richness, abundance, and composition of the zooplankton community in response to the formation of a small reservoir in the Caveiras River, southern Brazil. Zooplankton were collected using a motor-pump and aplankton net (68 μm mesh), with 600 L of water filtered per sample. Sampling occurred during the pre-(April, August, and December 2011) and post-impoundment (July and October 2013, and January 2014) phases of the Caveiras River. We identified 86 taxa in this study, and rotifers were the predominant group. The species richness and abundance of the zooplankton increased after the filling of the reservoir. Furthermore, the zooplankton community showed a clear change in the species composition between the phases before and after the formation of the reservoir, with the emergence of typical planktonic species. Changes in the structure of the zooplankton community were related to changes in limnological characteristics due to the impoundment of the river, mainlyin the availability of food and in the concentration of nutrients.

Human impacts and the loss of Neotropical freshwater fish diversity

Neotropical Ichthyology promotes the Special Issue (SI) "Human impacts and the loss of Neotropical freshwater fish diversity" with the purpose of publishing relevant scientific articles on the current biodiversity crisis and the loss of Neotropical freshwater fishes in the Anthropocene. The SI is composed of 22 publications, being two review articles and 20 original articles. A total of 107 researchers contributed to these papers, involving 44 institutions based in Brazil and six other countries. Published articles investigated main anthropic activities and their impacts on fish diversity, with special focus on river regulation, mining, land use changes, aquaculture, and fisheries. Studies provided evidence about the loss of fish diversity in the Neotropics, including fish kill events, demographic changes, contamination, changes in assemblage structure, loss of taxonomic and functional diversity, besides the degradation of ecosystem functions and services, and the lack of effective protection and conservation. Studies were conducted in rivers, streams, lakes, and reservoirs from different Neotropical systems. The studies published in this SI represent a relevant sample of the current worrisome situation of freshwater fishes in the Neotropical region and call for urgent revision in environmental policies, management and conservation initiatives, and socioeconomic priorities.(AU)

A revista Neotropical Ichthyology lança o Volume Especial (SI) "Human impacts and the loss of Neotropical freshwater fish diversity" com o objetivo de publicar artigos científicos relevantes sobre a atual crise da biodiversidade e a perda de diversidade de peixes de água doce Neotropicais no Antropoceno. O SI é composto por 22 publicações, sendo dois artigos de revisão e 20 artigos originais. Um total de 107 pesquisadores contribuíram com esses artigos, envolvendo 44 instituições sediadas no Brasil e em seis outros países. Os artigos publicados investigaram as principais atividades antrópicas e seus impactos sobre a diversidade de peixes, com foco especial na regulação dos rios, mineração, mudanças no uso do solo, aquicultura e pesca. Os estudos forneceram evidências sobre a perda de diversidade de peixes na região Neotropical, incluindo eventos de mortandade, alterações demográficas, contaminação, mudanças na estrutura das assembleias, perda de diversidade taxonômica e funcional, além da degradação de funções e serviços ecossistêmicos, e falta de ações efetivas de proteção e conservação. Os estudos foram conduzidos em rios, riachos, lagos e reservatórios de diferentes sistemas Neotropicais. Os estudos publicados neste SI representam uma amostra relevante da atual situação dos peixes de água doce na região Neotropical, reforçando a necessidade de revisão das políticas ambientais, ações de manejo e conservação, e prioridades socioeconômicas.(AU)

New species of Rhyacoglanis (Siluriformes: Pseudopimelodidae) from rio Tocantins basin, northern Brazil

A new species of Rhyacoglanis is described from the rapids of Jatobal, Pará State, Brazil. This species differs from the congeners by fusing hypurals 3, 4, and 5 (vs. hypural 5 free). It also differs from the other species, except for Rhyacoglanis epiblepsis, by the color pattern with numerous dark spots on the body, short post-cleithral process, rounded pectoral and caudal fins, and incomplete lateral line. This species is known only from the type locality, which is currently flooded by the Tucuruí reservoir.(AU)

Uma nova espécie de Rhyacoglanis é descrita das corredeiras de Jatobal, estado do Pará, Brasil. Essa espécie difere das congêneres pela fusão dos hipurais 3, 4 e 5 (vs. hipural 5 livre). Também difere das demais espécies, exceto de Rhyacoglanis epiblepsis, pelo padrão de colorido com inúmeras pintas escuras no corpo, processo pós-cleitral curto, nadadeiras peitoral e caudal arredondadas, e linha lateral incompleta. Essa espécie é conhecida apenas da localidade tipo, que atualmente se encontra inundada pelo reservatório de Tucuruí.(AU)

Metapopulation dynamics of the migratory fish Prochilodus lineatus (Characiformes: Prochilodontidae) in a lotic remnant of the Grande River, Southeastern Brazil

River impoundments for electricity generation lead to environmental changes which severely affect fish migration and species richness. However, little is known about their effect on the genetic structure and population dynamics downstream from the reservoir. Here, we analyzed a set of ten microsatellite loci of Prochilodus lineatus, an important South American migratory fish. Specimens (n = 150) were sampled from five sites in a remnant lotic system that includes sections of the Grande, Pardo and Mogi Guaçu rivers, southeastern Brazil. The data showed that all microsatellites were polymorphic with the allele number per locus ranging from 5 to 32, and genetic diversity (H e ) varied from 0.74 to 0.80. Indices of genetic differentiation and Bayesian analysis showed a significant genetic structure and three genetic clusters inhabiting this river system. An asymmetric gene flow suggests source-sink metapopulation dynamics from tributaries (genetic source) to the main river (genetic sink). A genetic cluster that was not detected in the upper Mogi and Pardo rivers tributaries may indicate there is a "trapped gene pool" downstream from the Porto Colômbia dam. Thus, here we provide new insights into the genetic structure and population dynamics of a migratory fish species in a highly dammed river basin.(AU)

Represamento de rios para geração de eletricidade levam a mudanças ambientais que afetam severamente a migração de peixes e riqueza de espécies. No entanto, pouco se sabe sobre seu efeito na estrutura genética e dinâmica populacional a jusante de reservatórios. Aqui, analisamos um conjunto de dez loci de microssatélites de Prochilodus lineatus, um importante peixe migratório sul-americano. Os espécimes (n = 150) foram amostrados em cinco locais de um sistema lótico remanescente que inclui seções dos rios Grande, Pardo e Mogi Guaçu, sudeste do Brasil. Os dados mostraram que todos microssatélites eram polimórficos com o número de alelos por locus variando de 5 a 32 e diversidade genética (H e ) variou de 0,74 a 0,80. Índices de diferenciação genética e análise de agrupamento baseada em modelo bayesiano indicou a presença de três agrupamentos genéticos habitando este sistema fluvial. Um fluxo gênico assimétrico sugere dinâmica metapopulacional de fonte-sumidouro dos tributários (fonte genética) para o rio principal (sumidouro genético). Um agrupamento genético que não foi detectado nos tributários rio Mogi e rio Pardo parecem indicar que há um "trapped gene pool" a jusante da represa de Porto Colômbia. Assim, nós provemos aqui novos conhecimentos sobre a estrutura genética e dinâmica populacional de uma espécie de peixe migratório em um rio altamente fragmentado por barramentos.(AU)

Changes in ecosystem functions generated by fish populations after the introduction of a non-native predator (Cichla kelberi) (Perciformes: Cichlidae)

The introduction of non-native predators is a matter of great concern, but their impacts on ecosystem functions remain poorly understood. We investigated how changes in fish diversity following the invasion of Cichla kelberi affected ecosystem functions generated by fish populations. Fish assemblages were sampled in macrophyte patches in a Neotropical impoundment over a 5-year period, before and after the introduction of the predator. We assigned seven ecosystem functions (26 trait-states) to each fish species, and examined how these functions behaved after the invasion. We collected 577 fish belonging to 25 species. Species richness, fish biomass and main species declined significantly over periods. The biomass of ecosystem functions changed significantly over time, and most trait-states declined. Few trait-states were lost, but all functions had at least one trait-state reduced by more than 85%. A null model analysis showed that changes in functions were not driven by species identities, while species richness correlated positively with total biomass and with most functions, suggesting that the loss of taxa and biomass drove observed changes in ecosystem functions. Our study provided evidence that community disassembly associated with the invasion of C. kelberi translated to the decline of several ecosystem functions, affecting energy mobilization and transference.(AU)

A introdução de predadores não-nativos tem gerado grande preocupação, mas seus impactos sobre a geração de funções ecossistêmicas permanecem pouco investigados. O presente estudo investigou como mudanças na diversidade de peixes, associadas com a invasão de Cichla kelberi, afetaram funções ecossistêmicas geradas por populações de peixes. As assembleias de peixes foram amostradas em bancos de macrófitas em um grande reservatório Neotropical durante um período de cinco anos, antes e depois da introdução do predador. Um conjunto de funções ecossistêmicas (26 trait-states) foi atribuído a cada espécie de peixe, e examinamos como as funções se comportaram depois da invasão. Foram coletados 577 peixes pertencentes a 25 espécies. Registramos declínio significativo da riqueza de espécies, biomassa total e biomassa das principais espécies ao longo dos períodos. A biomassa das funções ecossistêmicas mudou significativamente ao longo do tempo, e a maioria dos trait-states declinou. Poucos trait-states foram perdidos, mas todas as funções tiveram pelo menos um trait-state reduzido em mais de 85%. Uma análise de modelos nulos mostrou que as mudanças nas funções não foram impulsionadas pela identidade das espécies, enquanto que a riqueza de espécies correlacionou positivamente com a biomassa total e com a maioria das funções, sugerindo que a perda de espécies e biomassa impulsionou as mudanças observadas nas funções ecossistêmicas. Nosso estudo apresenta evidências de que a desestruturação da comunidade, associada com a invasão de C. kelberi, se traduziu no declínio de várias funções ecossistêmicas, afetando a mobilização e transferência de energia.(AU)

Impacts on fisheries assessed by local ecological knowledge in a reservoir cascade in the lower São Francisco River, northeastern Brazil

Our study assessed the fishers' perception (local ecological knowledge, LEK) concerning environmental impacts on fisheries and fish species in the final portion of Sub-Middle and Lower São Francisco. The river was divided into four areas where 107 fishers from 22 locations (4 states) were surveyed. The dam was the most significant impact on fisheries. The loss of connectivity, changing the environmental complexity, and its secondary effects (e.g., flow control, interruption of migratory routes) were determining factors. Other impacts were pointed out, such as pollution, macrophytes, overfishing, non-native species, and aquaculture. Among migratory species, Pseudoplatystoma corruscans and Salminus franciscanus have been absent from fishery catches for decades. Prochilodus argenteus records in fisheries are likely associated with migration routes to small tributaries. The environmental disturbance favored the establishment of non-native species such as Oreochromis niloticus, Cichla monoculus, and Metynnis lippincottianus along the studied section. Over the final portion of the São Francisco River, the more significant seawater intrusion changed the target species for fisheries activities. Thus, our data validate the importance of fishers' LEK and reinforce the adverse effects of the reservoir cascade on fishing and migratory fishes.(AU)

Nosso estudo avaliou a percepção dos pescadores (conhecimento ecológico local, CEL) em relação aos impactos ambientais sobre a pesca e peixes no trecho final do Submédio e Baixo São Francisco. O rio foi dividido em quatro áreas onde foram entrevistados 107 pescadores de 22 localidades (4 estados). Barragem foi o impacto mais significativo sobre a pesca. A perda da conectividade alterando a complexidade ambiental e seus efeitos secundários (e.g., controle da vazão, interrupção da rota migratória) foram fatores determinantes. Outros impactos foram apontados, como poluição, macrófitas, sobrepesca, espécies introduzidas e piscicultura. Dentre as espécies migradoras, Pseudoplatystoma corruscans e Salminus franciscanus estão ausentes da pesca há décadas. Os registros de Prochilodus argenteus nas pescarias provavelmente estão associados às rotas migratórias para pequenos tributários. A perturbação ambiental favoreceu o estabelecimento de espécies introduzidas como Oreochromis niloticus, Cichla monoculus e Metynnis lippincottianus ao longo do trecho estudado. No trecho final do rio São Francisco, a maior intrusão de água do mar mudou as espécies-alvo da pesca. Dessa forma, nossos dados validam a importância do conhecimento ecológico local dos pescadores e reforçam os efeitos adversos das cascatas de reservatórios sobre a pesca e peixes migratórios.(AU)

Salivary glands are a target for SARS-CoV-2: a source for salivacontamination

The ability of the new coronavirus SARS-CoV-2 to spread and contaminate is one of the determinants of the COVID-19 pandemic status. SARS-CoV-2 has been detected in saliva consistently, with similar sensitivity to that observed innasopharyngeal swabs. We conducted ultrasound-guided postmortem biopsies in COVID-19 fatal cases. Samples ofsalivary glands (SGs; parotid, submandibular, and minor) were obtained. We analyzed samples using RT-qPCR, immu-nohistochemistry, electron microscopy, and histopathological analysis to identify SARS-CoV-2 and elucidate qual-itative and quantitative viral proles in salivary glands. The study included 13 female and 11 male patients, with amean age of 53.12 years (range 8­83 years). RT-qPCR for SARS-CoV-2 was positive in 30 SG samples from18 patients (60% of total SG samples and 75% of all cases). Ultrastructural analyses showed spherical 70­100 nm viral particles, consistent in size and shape with the Coronaviridae family, in the ductal lining cell cytoplasm,acinar cells, and ductal lumen of SGs. There was also degeneration of organelles in infected cells and the presence of acluster of nucleocapsids, which suggests viral replication in SG cells. Qualitative histopathological analysis showedmorphologic alterations in the duct lining epithelium characterized by cytoplasmic and nuclear vacuolization, as wellas nuclear pleomorphism. Acinar cells showed degenerative changes of the zymogen granules and enlarged nuclei.Ductal epithelium and serous acinar cells showed intense expression of ACE2 and TMPRSS receptors. An anti-SARS-CoV-2 antibody was positive in 8 (53%) of the 15 tested cases in duct lining epithelial cells and acinar cellsof major SGs. Only two minor salivary glands were positive for SARS-CoV-2 by immunohistochemistry. Salivaryglands are a reservoir for SARS-CoV-2 and provide a pathophysiological background for studies that indicate theuse of saliva as a diagnostic method for COVID-19 and highlight this biological uid's role in spreading the disease.© 2021 The Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd.

Hydropower affects fish trophic structure both downstream of the dam and upstream of the reservoir

Dams often cause drastic changes in freshwater environments and can compromise the quality and availability of food resources in rivers. This study aims to analyze the influence of a dam on the trophic structure of fish assemblages in lotic areas located both upstream and downstream of the Irapé Hydroelectric Power Plant. Fish sampling occurred before (2003 to 2005) and after (2011 to 2017) the impoundment, which began in 2006. The trophic structure and species composition before dam construction were similar upstream of the reservoir and downstream of the dam. After the building of the dam, both aspects of the assemblages changed along the lotic stretches - the upstream incurred an increase in biomass of detritivores and a decrease of piscivores and omnivores, while downstream went exactly the opposite, causing a differentiation between the two assemblages. Because lotic areas upstream of reservoirs are also impacted by river damming, efforts for impact mitigation should also focus on these areas.(AU)

Barragens causam mudanças drásticas em ambientes de água doce e podem comprometer a qualidade e a disponibilidade de recursos alimentares nos rios. Este estudo teve como objetivo analisar a influência de uma barragem na estrutura trófica da assembleia de peixes em áreas lóticas localizadas a montante e a jusante da usina hidrelétrica de Irapé. A amostragem de peixes ocorreu antes (2003 a 2005) e após (2011 a 2017) o fechamento das comportas, iniciado em 2006. A estrutura trófica e a composição das espécies antes da construção da barragem eram semelhantes a montante do reservatório e a jusante da barragem. Após a construção da barragem, ambos os aspectos das assembleias mudaram ao longo dos trechos lóticos - a montante ocorreu um aumento na biomassa de detritívoros e diminuição de piscívoros e onívoros, enquanto a jusante ocorreu exatamente o oposto, causando uma diferenciação entre as duas assembleias. Como as áreas lóticas a montante dos reservatórios também são impactadas por barramentos, esforços para mitigação de impactos também devem se concentrar nessas áreas.(AU)

Fish die-off in river and reservoir: A review on anoxia and gas supersaturation

Albeit massive fish mortality has an extraordinary visual impact and is certainly a fatality, we still have rudimentary understanding on how addressing this problem in the Neotropical region. The processes that lead to fish die-off events are complex and sometimes ephemeral, which can lead to incorrect diagnosis. In this review, we discuss these events in Neotropical freshwaters, both in areas impacted by dams and natural environment, with a focus on deaths mediated by the lack of oxygen (anoxia) or the excess of dissolved gases (gas supersaturation). We examine the available knowledge about the related mechanisms, lethal thresholds for dissolved oxygen (DO) and total dissolved gases (TDG) for fish, and the sequelae of gas bubble disease (GBD). An assessment of the main mortality events in Brazil in the last 10 years is also presented, as well as the best practices for monitoring, prevention, and mitigation. Finally, it is concluded that the proliferation of hydroelectric plants in the Neotropical region might contribute to the expansion of these events and, consequently, increasing of impacts on fish conservation. We consider urgent the inclusion of this topic in the licensing processes for new hydropower projects by the environmental agencies.(AU)

Embora mortandades massivas de peixes tenham impacto visual extraordinário e sejam certamente uma fatalidade, estamos ainda engatinhando no entendimento e na solução desse problema. Os processos que levam aos eventos de mortes de peixes são complexos e algumas vezes efêmeros, o que explica diagnoses incorretas. Nessa revisão nós discutimos esses eventos em bacias hidrográficas neotropicais, tanto em barragens como em ambientes naturais, porém com o foco nas mortes por falta de oxigênio (anoxia) ou excesso de gases dissolvidos (supersaturação gasosa). Em particular são examinados o conhecimento disponível acerca dos processos que levam a essas condições, os limiares letais de oxigênio dissolvido (OD) e gases totais dissolvidos (GTD) para os peixes e as sequelas da doença das bolhas de gás (DBG). Uma avaliação dos principais eventos de mortandade que ocorreram no Brasil nos últimos 10 anos é também apresentada, bem como discutidas as melhores práticas para o monitoramento, prevenção e mitigação. Conclui-se, finalmente, que a proliferação de hidrelétricas deve contribuir com a expansão desses eventos e consequentemente com mais um fator de ameaça à biodiversidade. Consideramos urgente a inclusão desse tema nos processos de licenciamento de novos empreendimentos pelo órgão ambiental.(AU)

Structure and spatial distribution of the rotifer assemblages along a tropical reservoir / Estrutura e distribuição espacial da comunidade de rotíferos em um reservatório tropical

The construction of reservoirs is a common practice in the world. These systems modify the hydric landscape and alter the flow of rivers, becoming lotic environments in lentic. Here we investigated the structure and spatial distribution of rotifers along a tropical reservoir. We sampled four points in the Pedra do Cavalo Reservoir, Bahia, Brazil, bimonthly, between August 2014 and June 2015. We registered more than 70 taxa distributed in 17 families, with the majority of species belonging to the Lecanidae, Brachionidae and Trichocercidae families. The species rarefaction curve did not achieve a total asymptote, indicating that species richness in the reservoir is higher than what was registered. Based in the species frequency of occurrence, we identified 48 rare species, 16 common species, five constant species and one frequent species. The highest beta diversity values were registered in riverine P1 (0.513) and intermediate P2 (0.503), although there were no significant differences between the sampling points. Despite the high abundance values in P1, P2 and P3 no significant differences were found between the studied points. Thus, this study substantially increases the knowledge on the rotifer community in the Paraguaçu River and contributes to future studies that focus on biodiversity, ecology and conservation in the Brazilian reservoir ecosystems.

A construção de reservatórios é uma prática comum no mundo. Esses sistemas modificam a paisagem hídrica e alteram o fluxo dos rios, tornando-se ambientes lóticos em lênticos. Aqui investigamos a estrutura e distribuição espacial de rotíferos ao longo de um reservatório tropical. Foram amostrados quatro pontos no Reservatório da Pedra do Cavalo, Bahia, Brasil, bimestralmente, entre agosto de 2014 e junho de 2015. Registramos mais de 70 táxons distribuídos em 17 famílias, com a maioria das espécies pertencentes às famílias Lecanidae, Brachionidae e Trichocercidae. A curva de rarefação das espécies não alcançou uma assíntota total, indicando que a riqueza de espécies no reservatório é superior à registrada. Com base na frequência de ocorrência das espécies, identificamos 48 espécies raras, 16 espécies comuns, cinco espécies constantes e uma espécie frequente. Os maiores valores de diversidade beta foram registrados no ribeirinho P1 (0,513) e no intermediário P2 (0,503), embora não houvesse diferenças significativas entre os pontos de amostragem. Apesar dos altos valores de abundância em P1, P2 e P3, não foram encontradas diferenças significativas entre os pontos estudados. Assim, este estudo aumenta substancialmente o conhecimento sobre a comunidade de rotíferos no rio Paraguaçu e contribui para estudos futuros que enfocam biodiversidade, ecologia e conservação nos ecossistemas de reservatórios brasileiros.

Prevalencia de especies zoonóticas de Arcobacter en cerdos a nivel de matadero en Ecuador / Prevalence of zoonotic Arcobacter species in pigs at slaughterhouse level in Ecuador

RESUMEN Objetivo. Se pretende determinar la prevalencia, la diversidad y la resistencia antimicrobiana de las cuatro especies zoonóticas de Arcobacter en cerdos sanos, a nivel de matadero. Materiales y métodos. Fueron recolectadas, mediante muestreo no probabilístico por conveniencia, 50 muestras fecales obtenidas por hisopado rectal de cerdos sanos a nivel de matadero, antes de su faenamiento. El aislamiento de las cepas de Arcobacter fue realizado por métodos microbiológicos, utilizando enriquecimiento selectivo en caldo y filtración pasiva, mientras que para la identificación de especie fueron utilizadas pruebas bioquímicas y moleculares (multiplex PCR). El comportamiento frente a los antimicrobianos fue determinado por el método de disco difusión. Resultados. Fueron aisladas las cuatro especies zoonóticas, las cuales presentaron las siguientes frecuencias de aislamiento: A. thereius (18.0%), A. skirrowii (18.0%), A. cryaerophilus (6.0%) y A. butzleri (2.0%). Se encontró alta frecuencia de resistencia a ciprofloxacina y en las cuatro especies fueron aisladas cepas multirresistentes (resistentes a más de tres antibióticos).

ABSTRACT Objective. To establish the prevalence, diversity and antimicrobial resistance of the zoonotic species of Arcobacter in healthy pigs at slaughterhouse level. Material and methods. Fifty fecal samples were taken by rectal swabs from healthy pigs, before the beginning of the slaughter at the slaughterhouse of Loja city, Southern Ecuador. Sampling was done by means of a non-probabilistic method for convenience. Isolation of Arcobacter strains was done by microbiological methods and species identification using biochemical and molecular (multiplex PCR) tests. Antimicrobial behavior was performed using the disk diffusion method. Results. The four zoonotic species of Arcobacter were found. The isolation rates were A. thereius (18.0%), A. skirrowii (18.0%), A. cryaerophilus (6.0%) and A. butzleri (2.0%). High resistance to ciprofloxacin was found and multi-resistant strains were isolated from these four species. Conclusions. The fecal carriage of the zoonotic species of Arcobacter was demonstrated in pigs at slaughterhouse level. These species showed high resistance to ciprofloxacin being isolated muti-resistant strains among these four species.

Proposta de reuso da água utilizada no pré-preparo de hortifrutigranjeiros e na higienização de pratos e talheres em um restaurante universitário no Estado do Rio de Janeiro / Prpoposal for reuse of water for the pre-preparation of fruit and vegetables and the sanitization of dishes and flatware in a university restaurant in the state of Rio de Janeiro

Objetivo: O presente estudo teve como objetivo elaborar uma proposta para o reuso de água em um restaurante universitário no Estado do Rio de Janeiro, além de propor medidas para redução do seu consumo. Metodologia: Foi aplicado um formulário para quantificação do consumo de água nas etapas de pré-preparo de hortifrutigranjeiros e na higienização de pratos e talheres, em um período de 9 e 13 dias, respectivamente. Em seguida, foi estimado o volume, em litros, de água potável utilizado diariamente em cada etapa. Resultados: Na etapa de pré-preparo de hortifrutigranjeiros, calculouse que são utilizados 2.400 litros por dia; e na etapa de higienização de pratos e talheres, estimou-se o uso de 478 litros por dia. Desta forma, pôde-se calcular o volume total de 2.878 litros por dia que ficarão armazenados para o reuso com fins não potáveis, como por exemplo, a higienização do piso dos refeitórios do restaurante, o que representa 31,97% da quantidade necessária para limpeza de todo o restaurante universitário. Além disso, realizou-se a quantificação dos pontos de água para possível instalação de arejadores nas torneiras, no intuito de reduzir o consumo. Em seguida, elaborou-se o projeto do reservatório de água para reuso. Conclusão: Por fim, atestou-se a importância da proposta apresentada, tendo em vista a significativa quantidade de água com possibilidade de reuso que é desperdiçada diariamente, contribuindo-se assim com a preservação ambiental e diminuição dos custos do restaurante universitário. (AU)

Objective: The aim of the present study was to propose the reuse of water in a university restaurant in the state of Rio de Janeiro, as well as measures to reduce consumption. Methods: A form was applied to quantify water consumption during the pre-preparation of fresh produce and the sanitization of dishes and flatware, within a period of 9 and 13 days, respectively. Later, the volume of potable water used daily was estimated in liters. Results: The estimated volume of water used per day was 2.400 liters for pre-preparation of fresh produce and 478 liters of water per day for sanitization of dishes and flatware. Thus, a total volume of 2.878 liters of water per day for non-potable reuse was estimated, such as, for example, for the sanitization of the dining hall floor of the restaurant. In addition, the quantification of water points for possible installation of faucet aerators was made aiming to reduce consumption. Next, a project of the storage container for the reuse of water was developed. Conclusion: It may be concluded that the importance of the proposal is related to the significant quantity of daily wasted water that could be reused and thus, contribute to environmental preservation and decrease the water expenses of the university restaurant. (AU)

Efetividade do uso de capas em reservatórios de água para prevenção de aedes aegypti / Effectiveness of the use of covers to protect water reservoirs to prevent Aedes aegypti

Introdução: a intermitência ou deficiência da oferta de água pode ser considerada uma condição de vulnerabilidade para a reprodução do Aedes aegypti. Objetivo: avaliar a efetividade do uso de capas para proteção de reservatório de água, como estratégia de controle do Aedes aegypti. Metodologia: estudo de intervenção não controlado, realizado entre os anos 2015 e 2016, em um bairro do município de Riachão do Jacuípe, localizado na macrorregião centro-leste do estado da Bahia, Brasil. A coleta de dados aconteceu em quatro momentos: visita inicial para avaliação da necessidade de capas e pesquisa de larvas nos reservatórios existentes, seguida de três visitas para monitoramento e inspeção dos reservatórios de água beneficiados com as capas protetoras. O tratamento químico foi aplicado, quando necessário. As visitas foram realizadas durante nove meses, com intervalos de 45 a 60 dias. O estudo foi aprovado pelo CEP/UNEB, Parecer número 1.066.424, CAAE 33095114.0.0000.0057. Resultados: foram pesquisados 273 reservatórios de água (capacidade de 200L, 250L, 500L e 1000L) destes, 87,2% permaneceram com as capas em todas as três visitas de monitoramento. Entre os que apresentaram larvas de mosquitos, incluindo Aedes aegypti, 55,6% não apresentavam capa ou estavam dispostas de maneira inadequada. Observou-se, também, incremento de positividade da presença de larvas entre aqueles que se encontravam com capas colocadas, adequadamente, no momento da visita. Discussão: a aplicação de capas de poliéster em reservatórios de água como estratégia de controle vetorial pode não ser efetiva se não ocorrer uma vigilância constante sobre o uso correto.

Introduction: Intermittency or deficiency in water supply can be considered as a condition of vulnerability for reproduction of Aedes aegypti. Objective: To evaluate the effectiveness of the use of covers to protect the water reservoirs as a control strategy against Aedes aegypti. Methodology: An intervention study, with no control group, carried out between 2015 and 2016, in a neighborhood of the municipality of Riachão do Jacuípe, located in the central-eastern macro-region of the state of Bahia, Brazil. Data collection took place in four events: an initial visit to assess the need for covers and search for larvae in the existing reservoirs, followed by three visits to monitor and inspect the water reservoirs benefited by the protective layers. Chemical treatment was applied when necessary. The visits were carried out during nine months, with intervals of 45 to 60 days in between. The study was approved by CEP/UNEB, number 1.066.424, CAAE 33095114.0.0000.0057. Results: A total of 273 water reservoirs (200L, 250L, 500L and 1,000L capacity) were researched, of these 87.2% remained with the covers in all three monitoring visits. Among those who had mosquito larvae, including Aedes aegypti, 55.6% did not have covers or were inappropriately placed at the time of the visit. There was also an increase in positivity of the presence of larvae among those who had their covers properly placed at the time of the visit. Discussion: The application of polyester covers in water reservoirs as a vector control strategy may not be effective if there is not constant surveillance to ensure its correct use.

Influence of fertilizer and hydrogel on physical-chemical attributes of substrate for seedling production / Influência de adubação e hidrogel nos atributos físico-químicos de substrato para produção de mudas florestais

The incorporation of the hydrogel into the substrate used in the forest nursery promotes improvements in its physical-chemical attributes. However, several factors influence the hydrogel efficiency, such as the increase of salts, promoted by fertilizer of the substrate. Therefore, this study aimed to evaluate the effects of the incorporation of fertilizer levels and hydrogel doses on the physical-chemical attributes of a substrate to produce forest seedlings. Different levels of basic fertilizer commonly used in the nursery (100%, 50% and 0%) and different doses of the hydrogel (0, 1, 2 and 3 g L-1) were incorporated into the substrate Tropstrato Florestal®, consisting of 12 treatments in a 3 x 4 factorial scheme. A sample of the substrate in each treatment was sent for analysis of its physical and chemical attributes. To evaluate the effect of the treatments on the physical-chemical attributes of the substrate, was used the multivariate principal components analyses. The levels of fertilizer and hydrogel doses were correlated with the attributes of the substrates obtained in each treatment. The incorporation of different fertilizer levels and hydrogel doses to the substrate modified their chemical and physical attributes. Fertilizers have influenced mainly the chemical attributes of the substrate, whereas hydrogels have influenced the physical attributes, mainly those related to water retention capacity and availability.

A incorporação do hidrogel ao substrato utilizado no viveiro florestal promove melhorias em seus atributos físico-químicos. Porém vários fatores influenciam na eficiência do hidrogel, como o aumento de sais, promovido pela adubação do substrato. Portanto, este estudo teve como objetivo avaliar os efeitos da incorporação de níveis de adubação e doses de hidrogel sobre os atributos físico-químicos de um substrato para a produção de mudas florestais. Foram incorporados ao substrato Tropstrato Florestal® diferentes níveis da adubação de base comumente utilizada no viveiro (100%, 50% e 0%) e diferentes doses do hidrogel (0, 1, 2 e 3 g L-1), consistindo em 12 tratamentos em esquema fatorial 3 x 4. Uma amostra do substrato em cada tratamento foi encaminhada para análise de seus atributos físicos e químicos. Para avaliar o efeito dos tratamentos sobre os atributos físico-químicos do substrato foi utilizada a análise multivariada de componentes principais. Os níveis de adubação e doses de hidrogel foram correlacionados com os atributos dos substratos obtidos em cada tratamento. A incorporação de diferentes níveis de adubação e doses de hidrogel ao substrato modificaram seus atributos químicos e físicos. A adubação influenciou principalmente os atributos químicos do substrato, enquanto que o hidrogel os atributos físicos, principalmente os relacionados à capacidade de retenção e disponibilidade de água.

Presencia de especies de Legionaella en reservorios domciliarios de agua de Resistencia Chaco, Argentina / Presence of Legionella Species in Residential Water Reservoirs of Resistencia Chaco, Argentina

INTRODUCCIÓN: : El género Legionella comprende especies que se encuentran en ambientes acuáticos, pero se deben incorporar a aerosoles e inhalar para producir enfermedad. Si bien la mayoría de los casos de neumonía son causados por L. pneumophila, de las 58 especies que constituyen este género, 24 se relacionaron a enfermedad humana. El objetivo del trabajo fue evaluar la presencia de especies de Legionella en reservorios domiciliarios de agua potable de Resistencia, Chaco. MÉTODOS: Se estudiaron 46 muestras de agua tomadas en diferentes puntos de la ciudad. La detección de Legionella se realizó por cultivo según lo establecido en la norma ISO 11731:1998. La técnica molecular de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real con colorante intercalante (Syber Green) se aplicó a los aislamientos obtenidos por cultivo e identificados como Legionella spp. Las secuencias diana utilizadas correspondieron a fragmentos conservados del gen 23S rRNA para la confirmación del género y el gen mip específico para la especie L. pneumophila. RESULTADOS: En 16 (34,9%) de las 46 muestras estudiadas se recuperaron cepas de Legionella spp. Por la técnica molecular se confirmó la presencia de Legionella pneumophila en 15 de las muestras positivas por cultivo. Además, 3 de estas muestras (6,5%) también resultaron positivas para otras especies del género Legionella. CONCLUSIONES: Este trabajo demostró la presencia de L. pneumophila y otras especies en los reservorios domiciliarios de agua potable en Resistencia