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1.
Braz. j. biol ; 84: e255755, 2024. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1355898

ABSTRACT

Abstract The present study involves the chemical and bacteriological analysis of water from different sources i.e., bore, wells, bottle, and tap, from Peshawar, Mardan, Swat and Kohat districts of Khyber Pakhtunkhwa (KP) province, Pakistan. From each district, 50 water samples (10 samples from each source), regardless of urban and rural status, were collected from these sources and analysed for sulphates, nitrates, nitrites, chlorides, total soluble solids and coliforms (E. coli). Results indicated that majority of the water sources had unacceptable E. coli count i.e.> 34 CFU/100mL. E. coli positive samples were high in Mardan District, followed by Kohat, Swat and Peshawar district. Besides this, the some water sources were also chemically contaminated by different inorganic fertilizers (nitrates/nitrites of sodium, potassium) but under safe levels whereas agricultural and industrial wastes (chloride and sulphate compounds) were in unsafe range. Among all districts, the water quality was found comparatively more deteriorated in Kohat and Mardan districts than Peshawar and Swat districts. Such chemically and bacteriologically unfit water sources for drinking and can cause human health problems.


Resumo O presente estudo envolve a análise química e bacteriológica de água de diferentes fontes, ou seja, furo, poços, garrafa e torneira, dos distritos de Peshawar, Mardan, Swat e Kohat da província de Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. De cada distrito, 50 amostras de água (10 amostras de cada fonte), independentemente do status urbano e rural, foram coletadas dessas fontes e analisadas para sulfatos, nitratos, nitritos, cloretos, sólidos solúveis totais e coliformes (E. coli). Os resultados indicaram que a maioria das fontes de água tinha uma contagem inaceitável de E. coli, ou seja, > 34 UFC / 100 mL. As amostras positivas para E. coli foram elevadas no distrito de Mardan, seguido por Kohat, Swat e distrito de Peshawar. Além disso, algumas fontes de água também foram contaminadas quimicamente por diferentes fertilizantes inorgânicos (nitratos/nitritos de sódio, potássio), mas em níveis seguros, enquanto os resíduos agrícolas e industriais (compostos de cloreto e sulfato) estavam em níveis inseguros. Entre todos os distritos, a qualidade da água foi considerada comparativamente mais deteriorada nos distritos de Kohat e Mardan do que nos distritos de Peshawar e Swat. Essas fontes de água química e bacteriologicamente impróprias para beber podem causar problemas à saúde humana.


Subject(s)
Humans , Drinking Water , Water Quality , Pakistan , Escherichia coli
2.
Braz. j. biol ; 84: e254016, 2024. tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1364529

ABSTRACT

The present study was conducted to isolate and characterize bacteria from water and soil sample taken from the Lahore Canal at different sites i.e. Mall Road, Mohlanwal and Khera site. Isolated bacterial strains were identified on the basis of morphological and biochemical tests. Identification was confirmed by culturing bacteria on selective media. Antibiotic resistance test was also performed to observe the resistance of bacteria against different antibiotics. Blood agar test was performed for identification of different pathogenic bacteria. The result revealed that water and soil samples of Lahore Canal Lahore from different sites were contaminated with Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. and Staphylococcus spp. Due to presence of these pathogens, this water is not suitable for any domestic and irrigation use. Study also revealed that water of the Lahore Canal is harmful for human health as it is contaminated with bacteria that can cause severe disease e.g., Escherichia coli can cause gastroenteritis, Bacillus spp. can cause nausea and vomiting, Enterococcus may infect urinary tract, Salmonella sp. is responsible for Bacteremia, Staphylococcus spp. can cause mild fever and Vibrio sp. can be the reason of cholera. Thus it is rendered unfit for any kind of human use even other than drinking like swimming, bathing, washing etc., until and unless some remedial measures are employed to eradicate pathogenic microorganisms by WASA and LWMS according to standards of WHO. Similarly, it is quite harmful, when and where ever it is used for irrigation without proper treatment.


O presente estudo foi realizado para isolar e caracterizar bactérias de amostras de água e solo retiradas do Canal Lahore, em Lahore, em diferentes locais, ou seja, Mall Road, Mohlanwal e Khera. As cepas bacterianas isoladas foram identificadas com base em testes morfológicos e bioquímicos. A identificação foi confirmada por cultura de bactérias em testes de meios seletivos. O teste de resistência aos antibióticos também foi realizado para observar a resistência das bactérias a diferentes antibióticos. Foi realizado o teste de ágar sangue para identificar diferentes bactérias patogênicas. O resultado revelou que amostras de água e solo do Canal Lahore, Lahore, de diferentes localidades estavam contaminadas com Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. e Staphylococcus spp. Por causa da presença desses patógenos, essa água não é adequada para qualquer uso doméstico e de irrigação. O estudo revelou que a água do Canal Lahore é prejudicial à saúde humana, pois está contaminada com bactérias que podem causar doenças graves, por exemplo: Escherichia coli pode ocasionar gastroenterite; Bacillus spp. pode causar náuseas e vômitos; Enterococcus sp. pode infectar o trato urinário; Salmonella sp. é responsável pela bacteremia; Staphylococcus spp. pode causar febre leve; e Vibrio sp. pode ser a razão da cólera. Assim, torna-se imprópria para uso humano, como natação, banho, lavagem etc., até que algumas medidas corretivas sejam empregadas para erradicar microrganismos patogênicos por WASA e LWMS de acordo com os padrões da OMS. Da mesma forma, é bastante prejudicial, quando usada para irrigação sem tratamento adequado.


Subject(s)
Animals , Soil , Staphylococcus , Vibrio , Drug Resistance, Microbial , Water Samples , Enterococcus , Escherichia coli
3.
Braz. j. biol ; 83: e243332, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1345537

ABSTRACT

Abstract The present study was aimed to manifest the antibacterial and antifungal activity of methanolic extracts of Salix alba L. against seven Gram-positive and Gram-negative bacterial pathogens e.g. Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus (1), S. aureus (2), Shigella sonnei, Escherichia coli (1), E. coli (2) and Neisseria gonorrhoeae and three fungal isolates from the air such as Aspergillus terreus, A. ornatus, and Rhizopus stolonifer. Two different serotypes of S. aureus and E. coli were used. The agar well-diffusion method results showed the dose-dependent response of plant extracts against bacterial and fungal strains while some organisms were found resistant e.g. E. coli (1), S. sonnei, A. terreus and R. stolonifer. The highest antibacterial activity was recorded at 17.000±1.732 mm from 100 mg/mL of leaves methanolic extracts against S. pyogenes while the activity of most of the pathogens decreased after 24 h of incubation. The highest antifungal activity was reported at 11.833±1.0 mm against A. ornatus at 50 mg/mL after 48 h of the incubation period. These experimental findings endorse the use of S. alba in ethnopharmacological formulations and suggest the use of methanolic extracts of the said plant to develop drugs to control the proliferation of resistant disease causing pathogenic microbes.


Resumo O presente estudo teve como objetivo manifestar a atividade antibacteriana e antifúngica de extratos metanólicos de Salix alba L. contra sete patógenos bacterianos Gram-positivos e Gram-negativos. Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus (1), S. aureus (2), Shigella sonnei, Escherichia coli (1), E. coli (2) e Neisseria gonorrhoeae e três isolados de fungos do ar, como Aspergillus terreus, A. ornatus, e Rhizopus stolonifer. Dois sorotipos diferentes de S. aureus e E. coli foram usados. Os resultados do método de difusão em ágar mostraram a resposta dependente da dose de extratos de plantas contra cepas de bactérias e fungos, enquanto alguns organismos foram considerados resistentes, e.g. E. coli (1), S. sonnei, A. terreus e R. stolonifer. A maior atividade antibacteriana foi registrada em 17.000 ± 1.732 de 100 mg/mL de extratos metanólicos de folhas contra S. pyogenes, enquanto a atividade da maioria dos patógenos diminuiu após 24 h de incubação. A maior atividade antifúngica foi relatada em 11,833 ± 1,0 contra A. ornatus a 50 mg/mL após 48 h do período de incubação. Esses achados experimentais endossam o uso de S. alba em formulações etnofarmacológicas e sugerem o uso de extratos metanólicos da referida planta para o desenvolvimento de fármacos que controlem a proliferação de doenças resistentes que causam micróbios patogênicos.


Subject(s)
Salix , Antifungal Agents/pharmacology , Aspergillus , Rhizopus , Staphylococcus aureus , Plant Extracts/pharmacology , Microbial Sensitivity Tests , Methanol , Escherichia coli , Anti-Bacterial Agents/pharmacology
4.
Braz. j. biol ; 83: e249159, 2023. tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339415

ABSTRACT

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.


Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.


Subject(s)
Animals , Galliformes , Escherichia coli , Feces
5.
Braz. j. biol ; 83: e245585, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339413

ABSTRACT

Abstract Many soil microorganisms' i.e., bacteria and fungi produce secondary metabolites called antibiotics. These are used for the treatment of some of the bacterial, fungal and protozoal diseases of humans. There is a need for isolation of a broad spectrum of antibiotics from microorganisms due to the emergence of antibiotic resistance. In the present study two antibiotic producing bacteria Klebsiella pneumoniae and Bacillus cereus were isolated from pharmaceutical and poultry feed industry of Hattar, Haripur Pakistan. Total 10 waste samples were collected from different industries (Marble, Ghee, Soap, Mineral, Steel, Poultry Feed, Pharmaceutical, Qarshi, Cosmetic and Glass). Thirty-three bacterial strains were isolated from industrial wastes of these ten different industries. Fourteen out of thirty-three bacterial strains exhibited antimicrobial activities against at least one of the test microbes considered in this study including Escherchia coli, Staphylococcus aureus and Salmonella typhi. The bacteria were isolated by standard serial dilution spread plate technique. Morphological characterization of the isolates was done by Gram staining. Nine bacterial isolates out of fourteen were initially identified as B. cereus and five as K. pneumoniae through biochemical characterization. The antibacterial activities were tested by well diffusion method. Maximum number of antibiotic producing bacteria were isolated from pharmaceutical and poultry feed industry based on the results of primary screening, the most potential isolates S9, S19, S20, S22 and S23 were selected for secondary screening. The maximum activity against E. coli and S. aureus was recorded by bacterial isolate S19 i.e zones of inhibition of 6.5mm and 9mm while S20 showed 7.5mm and 6mm zones respectively. Molecular identification was carried out on the basis of 16S rRNA sequence analysis. Finally, the isolates were identified as B. cereus accession number LC538271and K. pneumoniae accession number MT078679. Analysis of bacterial extract S20 through GC-MS indicated the presence of 8 compounds of diverse nature and structure. Present study suggests that wastes of pharmaceutical and poultry feed industry may have antibiotic producing bacteria. These bacteria could be utilized for the production of antibiotics. B. cereus and K. pneumoniae isolated from wastes of poultry feed and pharmaceutical industries have the potential to produce antibiotics and could be used to control the microbial growth.


Resumo Muitos microrganismos do solo, ou seja, bactérias e fungos produzem metabólitos secundários chamados antibióticos. Eles são usados ​​para tratamento de algumas doenças bacterianas, fúngicas e protozoárias em humanos. Há necessidade de isolamento de um amplo espectro de antibióticos de microrganismos devido ao surgimento de resistência aos antibióticos. No presente estudo, duas bactérias produtoras de antibióticos, Klebsiella pneumoniae e Bacillus cereus, foram isoladas da indústria farmacêutica e de ração avícola de Hattar, Haripur, Paquistão. Um total de 10 amostras de resíduos foi coletado de diferentes indústrias (mármore, ghee, sabão, mineral, aço, ração para aves, farmacêutica, Qarshi, cosmética e vidro). Trinta e três cepas bacterianas foram isoladas de resíduos industriais dessas dez diferentes indústrias. Quatorze das 33 cepas bacterianas exibiram atividades antimicrobianas contra pelo menos um dos micróbios de teste considerados neste estudo, incluindo Escherchia coli, Staphylococcus aureus e Salmonella typhi. As bactérias foram isoladas pela técnica de placa de diluição em série padrão. A caracterização morfológica dos isolados foi feita por coloração de gram. Nove isolados bacterianos de 14 foram inicialmente identificados como B. cereus e cinco como K. pneumoniae por meio de caracterização bioquímica. As atividades antibacterianas foram testadas pelo método de difusão em poço. O número máximo de bactérias produtoras de antibióticos foi isolado da indústria farmacêutica e de ração avícola com base nos resultados da triagem primária, os isolados mais potenciais S9, S19, S20, S22 e S23 foram selecionados para a triagem secundária. A atividade máxima contra E. coli e S. aureus foi registrada pelo isolado bacteriano S19, ou seja, zonas de inibição de 6,5 mm e 9 mm, enquanto S20 mostrou zonas de 7,5 mm e 6 mm, respectivamente. A identificação molecular foi realizada com base na análise da sequência 16S rRNA. Finalmente, os isolados foram identificados como B. cereus número de acesso LC538271 e K. pneumoniae número de acesso MT078679. A análise do extrato bacteriano S20 por meio de GC-MS indicou a presença de oito compostos de natureza e estrutura diversas. O presente estudo sugere que resíduos da indústria farmacêutica e de ração para aves podem conter bactérias produtoras de antibióticos. Essas bactérias podem ser utilizadas para a produção de antibióticos B. cereus e K. pneumoniae isolados de resíduos de rações de aves e indústrias farmacêuticas têm potencial para produzir antibióticos e podem ser usados ​​para controlar o crescimento microbiano.


Subject(s)
Humans , Staphylococcus aureus , Industrial Waste , RNA, Ribosomal, 16S , Plant Extracts , Microbial Sensitivity Tests , Escherichia coli , Gas Chromatography-Mass Spectrometry , Anti-Bacterial Agents/pharmacology
6.
Braz. j. biol ; 83: e239323, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339341

ABSTRACT

Abstract The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.


Resumo Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.


Subject(s)
Humans , Gram-Negative Bacterial Infections , Gram-Negative Bacterial Infections/epidemiology , Anti-Bacterial Agents/therapeutic use , Microbial Sensitivity Tests , Retrospective Studies , Escherichia coli , Gram-Negative Bacteria
7.
Braz. j. biol ; 83: e244435, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1285619

ABSTRACT

Abstract Increasing trend in antimicrobial resistance and failure of chemically synthesized antibiotics lead to discover alternative methods for the treatment of bacterial infections. Various medicinal plants are in use traditionally and their active compounds can be further applied for treatment of bacterial diseases. This study was designed to determine the antibacterial activity of Punica granatum (P. granatum L.) (pomegranate) peel extract against Enterobacteriaceae [Escherichia coli (E. coli), Salmonella Typhimurium (S. Typhimurium) and Shigella Dysenteriae (S. Dysenteriae)] and gram-positive bacterium [Staphylococcus aureus (Staph aureus)]. Methanolic extract of P. granatum L. peel was prepared by Soxhlet apparatus method. Total flavonoid and phenolic contents from the extract were determined by High Performance Liquid Chromatography (HPLC). The antibacterial activity of P. granatum L. peel extract was evaluated through agar well diffusion method. HPLC showed the range of phenolics (gallic acid, caffeic acid, benzoic acid, cinnamic acid) and flavonoid compounds. The chemical structures of flavonoid and phenolics found in the methanolic extract of P. granatum L. peel have been reported for the first time. The methanolic peel extract (50 ul) of yellow P. granatum L. showed 26, 10, 10 and 9mm zones of inhibition (ZOI) against S. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae and E. coli, respectively. The methanolic extract of red P. granatum L. (100 ul) showed 27, 8, 12 and 15 mm ZOI against Staph. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae and E. coli, respectively. Highest ZOI was observed against Staph. aureus. Many of the bacteria studied in the present work may cause serious gastrointestinal infections, which can lead to hemorrhagic diarrhea in children. These infections can be life-threatening to young children and the elderly. There is an incentive to find alternative control measures, such as plant and herbal extracts, especially in lesser-developed countries where traditional antibiotics may not be readily available.


Resumo A tendência crescente na resistência antimicrobiana e na falha dos antibióticos sintetizados quimicamente leva à descoberta de métodos alternativos para o tratamento de infecções bacterianas. Várias plantas medicinais estão em uso tradicionalmente e seus compostos ativos podem ser posteriormente aplicados para o tratamento de doenças bacterianas. Este estudo foi desenhado para determinar a atividade antibacteriana do extrato de casca de Punica granatum (P. granatum L.) (romã) contra Enterobacteriaceae [Escherichia coli (E. coli), Salmonella Typhimurium (S. Typhimurium) e Shigella Dysenteriae (S. Dysenteriae) ] e bactéria gram-positiva [Staphylococcus aureus (Staph aureus)]. O extrato metanólico da casca de P. granatum L. foi preparado pelo método do aparelho de Soxhlet. O conteúdo total de flavonoides e fenólicos do extrato foi determinado por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). A atividade antibacteriana do extrato da casca de P. granatum L. foi avaliada através do método de difusão em ágar. HPLC mostrou a gama de compostos fenólicos (ácido gálico, ácido cafeico, ácido benzoico, ácido cinâmico) e flavonoides. As estruturas químicas de flavonoides e fenólicos encontradas no extrato metanólico da casca de P. granatum L. foram relatadas pela primeira vez. O extrato metanólico da casca (50 ul) de P. granatum L. amarelo apresentou zonas de inibição (ZOI) de 26, 10, 10 e 9mm contra S. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae e E. coli, respectivamente. O extrato metanólico de P. granatum L. vermelho (100 ul) apresentou 27, 8, 12 e 15 mm IOI contra Staph. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae e E. coli, respectivamente. O ZOI mais alto foi observado contra Staph. aureus. Muitas das bactérias estudadas no presente trabalho podem causar infecções gastrointestinais graves, que podem levar à diarreia hemorrágica em crianças. Essas infecções podem ser fatais para crianças pequenas e idosos. Há um incentivo para encontrar medidas de controle alternativas, como extratos de plantas e ervas, especialmente em países menos desenvolvidos, onde os antibióticos tradicionais podem não estar prontamente disponíveis.


Subject(s)
Humans , Child, Preschool , Child , Aged , Pomegranate , Staphylococcus aureus , Plant Extracts/pharmacology , Chromatography, High Pressure Liquid , Escherichia coli , Anti-Infective Agents
8.
Braz. j. biol ; 83: e243629, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1285611

ABSTRACT

Abstract As an important enzyme, xylanase is widely used in the food, pulp, and textile industry. Different applications of xylanase warrant specific conditions including temperature and pH. This study aimed to carry out sodium alginate beads as carrier to immobilize previous reported mutated xylanase from Neocallimastix patriciarum which expressed in E. coli, the activity of immobilization of mutated xylanase was elevated about 4% at pH 6 and 13% at 62 °C. Moreover, the immobilized mutated xylanase retained a greater proportion of its activity than the wide type in thermostability. These properties suggested that the immobilization of mutated xylanase has potential to apply in biobleaching industry.


Resumo Como importante enzima, a xilanase é amplamente utilizada na indústria alimentícia, de celulose e têxtil. Diferentes aplicações de xilanase garantem condições específicas, incluindo temperatura e pH. Este estudo teve como objetivo realizar grânulos de alginato de sódio como carreador para imobilizar xilanase mutada relatada anteriormente de Neocallimastix patriciarum que expressa em E. coli, a atividade de imobilização da xilanase mutada foi elevada em cerca de 4% em pH 6 e 13% a 62 °C. Além disso, a xilanase mutada imobilizada reteve uma proporção maior de sua atividade do que o tipo amplo em termoestabilidade. Essas propriedades sugerem que a imobilização da xilanase mutada tem potencial para aplicação na indústria de biobranqueamento.


Subject(s)
Neocallimastix , Temperature , Escherichia coli/genetics
9.
Arq. ciências saúde UNIPAR ; 26(3): 1325-1342, set-dez. 2022.
Article in Portuguese | LILACS | ID: biblio-1402281

ABSTRACT

A infecção do trato urinário (ITU) nada mais é do que o acometimento das vias urinárias por microrganismo. Entre as infecções hospitalares de maior incidência está a infecção do trato urinário, acometendo mais mulheres do que homens. Uma das possíveis causas dessa infecção, em pacientes na unidade de terapia intensiva (UTI), é o uso de cateter vesical. Seu tratamento inadequado pode ocasionar uma pielonefrite, podendo adentrar à circulação sanguínea, gerando uma infecção sistêmica e levar o paciente a óbito. A resistência antimicrobiana é uma das principais dificuldades encontrada em UTI sendo considerado um problema de saúde pública. O objetivo deste trabalho foi realizar um breve relato, baseado na literatura, sobre a resistência antimicrobiana na infecção urinária em unidade de terapia intensiva adulta. Em ambientes hospitalares o principal microrganismo causador de ITU é Escherichia coli, sendo 55,5% das culturas positivas estão associadas a procedimentos invasivos, como as sondas vesicais de demora, como consequência este é o microrganismo que mais apresenta resistência aos antimicrobianos utilizados como a ampicilina, trimetoprima e ciprofloxacino. O uso indiscriminado de antibióticos deixa em evidência a necessidade de análise criteriosa da real necessidade de qual antimicrobianos usar, tempo de uso e forma correta de administração. Portanto é necessária a ação dos profissionais de saúde frente a atenção ao paciente, desde a higiene das mãos, uso do cateter, quando necessário observar a real necessidade do uso do antimicrobianos e que esse seja feito após cultura e antibiograma.


Urinary tract infection (UTI) is nothing more than the involvement of the urinary tract by a microorganism. Among the hospital infections with the highest incidence is urinary tract infections, affecting more women than men. One of the possible causes of this infection in patients in the intensive care unit (ICU) is the use of a bladder catheter. Its inadequate treatment can cause pyelonephritis, which can enter the bloodstream, generating a systemic infection and leading the patient to death. Antimicrobial resistance is one of the main difficulties encountered in ICUs and is considered a public health problem. The objective of this study was to present a brief report, based on the literature, on antimicrobial resistance in urinary tract infections in an adult intensive care unit. In hospital environments, the main microorganism that causes UTI is Escherichia coli, and 55.5% of positive cultures are associated with invasive procedures, such as indwelling urinary catheters, as a consequence, this is the microorganism that is most resistant to antimicrobials used, such as ampicillin, trimethoprim and ciprofloxacin. The indiscriminate use of antibiotics highlights the need for a careful analysis of the real need for which antimicrobials to use, time of use, and correct form of administration. Therefore, it is necessary for the action of health professionals in the care of the patient, from the hygiene of the professional to, the use of the catheter, when necessary to observe the real need for the use of antimicrobials and that this is done after culture and antibiogram.


La infección del tracto urinario (ITU) no es más que la afectación de las vías urinarias por un microorganismo. Entre las infecciones hospitalarias con mayor incidencia se encuentra la infección del tracto urinario, que afecta más a mujeres que a hombres. Una de las posibles causas de esta infección en pacientes en la unidad de cuidados intensivos (UCI) es el uso de una sonda vesical. Su tratamiento inadecuado puede causar pielonefritis, la cual puede ingresar al torrente sanguíneo, generando una infección sistémica y llevando al paciente a la muerte. La resistencia a los antimicrobianos es una de las principales dificultades encontradas en las UCI y se considera un problema de salud pública. El objetivo de este estudio fue presentar un breve informe, basado en la literatura, sobre la resistencia antimicrobiana en infecciones del tracto urinario en una unidad de cuidados intensivos de adultos. En ambientes hospitalarios, el principal microorganismo causante de ITU es Escherichia coli, y el 55,5% de los cultivos positivos están asociados a procedimientos invasivos, como sondas vesicales permanentes, por lo que este es el microorganismo más resistente a los antimicrobianos utilizados, como la ampicilina. ., trimetoprima y ciprofloxacino. El uso indiscriminado de antibióticos pone de relieve la necesidad de un análisis cuidadoso de la necesidad real de qué antimicrobianos utilizar, el momento de uso y la forma correcta de administración. Por lo tanto, es necesaria la actuación de los profesionales de la salud en el cuidado del paciente, desde la higiene del profesional, uso del catéter, cuando sea necesario observar la necesidad real del uso de antimicrobianos y que este se realice previo cultivo y antibiograma.


Subject(s)
Humans , Female , Urinary Tract Infections/complications , Urinary Tract Infections/mortality , Urinary Tract Infections/prevention & control , Urinary Tract Infections/drug therapy , Drug Resistance, Microbial/drug effects , Urinary Tract , Women , Ciprofloxacin/therapeutic use , Cross Infection/complications , Cross Infection/transmission , Escherichia coli/pathogenicity , Catheters/microbiology , Hand Hygiene , Ampicillin/therapeutic use , Intensive Care Units , Anti-Infective Agents/therapeutic use , Anti-Bacterial Agents/therapeutic use
10.
Int. j. high dilution res ; 21(1): 17-17, May 6, 2022.
Article in English | LILACS, HomeoIndex | ID: biblio-1396575

ABSTRACT

Homeopathy is a therapy that uses medications prepared with infinitesimal and dynamized dilutions. Current studies demonstrate in vitro activity of homeopathy on gram-positive bacteria such as Staphylococcus aureusand Streptococcus pyogenes. Among bacterial infections, urinary tract infection (UTI) is frequent, leads to later consequences and the main causal agent is Escherichia coli(E. coli). In other publications, it has been reported inactivity of homeopathy on E. colicultures. Due to the divergence in the literature, the objective of this study was to evaluate gram-negative bacteria growth under homeopathy treatment. Methods:The medicines Atropabelladona, Cantharis, Staphysagria,and Colibacillinumwere tested at 6CH, 12CH and 30CH inE. coliATCC 25922 and EPEC (Enteropathogenic Escherichia coli) ATCC 43887. Two hundred and fifty microliters of the medicines in alcohol 30% were incubated at 37ºC with 3 mL of Müller Hinton broth (MH), 10 µL of cultures at 0.5 Macfarland and subsequent dilution at 1/10. Bacterial growth was evaluated in a spectrophotometer at 600nm, in the periods of 6, 12,and 20 hours of incubation. Resultsand Discussion:The results showed no inhibition of bacterial growth under the studied conditions. These data corroborate with studies already published that indicate the absence of action of homeopathy on E. colicultures. Considering other studies, it can be suggested that homeopathic medicines have direct activity on the growth of Gram-positive and not Gram-negative bacteria. Evaluating the two bacterial groups, it is possible to assume that the difference in homeopathy activity could be linked to differences in the bacterial wall structure. This hypothesis should be evaluated by other tests with the same bacterialstrains. Conclusion:The homeopathic medicines tested have no direct activity on Gram-negative bacteria cultures.


Subject(s)
Urinary Tract Infections/therapy , Homeopathic Remedy , Escherichia coli
11.
Rev. Ciênc. Méd. Biol. (Impr.) ; 21(1): 11-17, maio 05,2022. tab, fig
Article in English | LILACS | ID: biblio-1370480

ABSTRACT

Introduction: Staphylococcus aureus and Escherichia coli are pathogens that cause chronic infections due to antibiotic resistance mechanisms and their ability to adhere to surfaces and to form biofilms. The search for new agents from natural resources to counter microbial biofilms is an urgent priority in healthcare. Objetive: chemical composition, antibacterial and anti-biofilm activity of Plectranthus amboinicus essential oil (PAEO) and carvacrol were investigated against E. coli and S. aureus. Methodology: PAEO was chemically analyzed using gas chromatography coupled to a mass spectrometer. Antimicrobial activity was assessed by the disc diffusion method and broth microdilution method to determine minimum inhibitory concentrations (MICs). Antibiofilm activity was investigated using 96-well plates with a crystal violet assay. Results: carvacrol (85.25%) was the major component of PAEO. The disc diffusion test confirmed the ability of PAEO and carvacrol in inhibiting bacteria in their planktonic form. The MICs of PAEO against S. aureus and E. coli were 0.31 and 1.25%, respectively, with bactericidal effect. Carvacrol demonstrated a significant antibacterial property (MIC = 0.31%), exhibiting bacteriostatic effects against S. aureus and bactericidal effects against E. coli. Carvacrol considerably inhibited E. coli biofilm formations (58.9%). Moreover, carvacrol inactivated the mature biofilms. Conclusion: the data obtained are promising, and facilitates the development of new therapeutic alternatives. These results indicate the potential of carvacrol in treating diseases caused by E. coli and S. aureus


Introdução: Escherichia coli e Staphylococcus aureus são patógenos que podem causar infecções persistentes devido aos mecanismos de resistência e à sua capacidade de aderir e formar biofilme. A busca por novos agentes a partir de recursos naturais para combater o biofilme é uma prioridade na área da saúde. Objetivo: a composição química, a atividade antibacteriana e anti-biofilme do óleo essencial de Plectranthus amboinicus (PAEO) e do carvacrol foram investigadas frente a S. aureus e E. coli. Metodologia: a análise química do PAEO foi realizada por cromatografia gasosa acoplada a espectrômetro de massa. A atividade antimicrobiana foi avaliada por difusão em disco e microdiluição em caldo para determinar as concentrações inibitórias mínimas (CIMs). As atividades do anti-biofilme foram investigadas usando placas de 96 poços pelo ensaio de cristal violeta. Resultados: o carvacrol (85,25%) foi o principal componente do PAEO. A capacidade do PAEO e do carvacrol para inibir bactérias planctônica foi confirmada por difusão em disco. A CIM do PAEO para S. aureus e E. coli foi de 0,31 e 1,25%, respectivamente, com efeito bactericida. O carvacrol demonstrou uma propriedade antibacteriana significativa (CIM=0,31%), exibindo efeito bacteriostático frente a S. aureus e efeito bactericida para E. coli. O carvacrol inibiu significativamente a formação de biofilme de E. coli (58,9%) e promoveu a desestabilização do biofilme maduro. Conclusão: os dados obtidos são promissores, possibilitando o desenvolvimento de novas alternativas terapêuticas e revelam a potencialidade do carvacrol como fonte para o tratamento de doenças causadas por E. coli e S. aureus.


Subject(s)
Staphylococcus aureus , Biological Products , Oils, Volatile , Biofilms , Escherichia coli
12.
Vitae (Medellín) ; 29(2): 1-9, 2022-05-19. Ilustraciones
Article in English | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1393060

ABSTRACT

BACKGROUND: Propolis has been considered a highly valuable material due to its therapeutic properties. However, in Colombia, the commercialization of propolis is limited not only by low production but also by the little knowledge about its efficient extraction. Therefore, finding an optimal and economical extraction method to obtain propolis is a necessity for beekeepers that would open new possibilities for industrial use and, therefore, for the market. OBJECTIVES:The objective of this study was to evaluate a conventional and ultrasound-assisted extraction method, seeking to obtain the highest yield and a high amount of content of bioactive compounds in propolis extracts. METHODS: The extraction was carried out for three crude propolis from different types of bees: Tetragoniscaangustula or Angelita (ANG), Meliponaeburnea or Melipona(MEL), and Scaptotrigonaspp (SCT). The extracts were characterized by color, pH, visual appearance, solid content, antioxidant capacity, total polyphenol content, and bacterial inhibition capacity. RESULTS: The highest extraction performance was obtained when the ultrasound-assisted method was used, especially for the ANG extract, which in addition to presenting inhibition for gram-negative (E. coli) and gram-positive (S. Aureus) bacteria, had the best antioxidant activity with a value of 545 mg GAE / 100 g of sample and total polyphenol content of 1,884 mg GAE / 100 g of sample. CONCLUSIONS: Ultrasound-assisted extraction can be considered a low-cost alternative to increase the extraction performance of crude propolis, together with its total polyphenol content and antioxidant capacity, without altering its physical properties


ANTECEDENTES: El propóleos ha sido considerado un material de alto valor por sus propiedades terapéuticas. Sin embargo, en Colombia la comercialización de propóleos está limitada no solo por la baja producción sino también por el incipiente conocimiento sobre la extracción eficiente de este. Por ello, encontrar un método de extracción óptimo y económico para la obtención de propóleos es una necesidad para los apicultores que abriría nuevas posibilidades para el uso industrial y por tanto para el mercado. OBJETIVOS: El objetivo de este estudio fue evaluar un método de extracción convencional y asistido por ultrasonido (US) buscando el mayor rendimiento y alto contenido de compuestos bioactivos en extractos de propóleos. MÉTODOS: La extracción se realizó para tres propóleos crudos de diferentes tipos de abejas Tetragonisca angustula o Angelita(ANG), Melipona eburnea o Melipona (MEL) y Scaptotrigona spp (SCT). Todos los extractos se caracterizaron por su color, pH, apariencia visual, contenido de sólidos, capacidad antioxidante, contenido total de polifenoles y capacidad de inhibición bacteriana. RESULTADOS: El mayor rendimiento de extracción se obtuvo cuando se usó el método asistido por ultrasonido y específicamente para el extracto ANG, que además de presentar inhibición para bacterias gram negativas (E. coli) y gram positivas (S. Aureus), tuvo la mejor actividad antioxidante con un valor de 545 mg GAE / 100 g de muestra y contenido total de polifenoles de 1884 mg GAE / 100 g de muestra. CONCLUSIONES: La extracción asistida por ultrasonido puede considerarse una alternativa de bajo costo para aumentar el rendimiento de extracción del propóleos crudo, así como su contenido total de polifenoles y capacidad antioxidante sin alterar sus propiedades físicas


Subject(s)
Humans , Propolis/chemistry , Staphylococcus aureus/drug effects , Escherichia coli/drug effects , Antioxidants/pharmacology , Ultrasonics , Bees , Microbial Sensitivity Tests , Anti-Bacterial Agents/pharmacology
13.
Rev. chil. infectol ; 39(2): 126-131, abr. 2022. tab
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1388349

ABSTRACT

INTRODUCCIÓN: En neonatos y lactantes bajo 90 días de vida la fiebre constituye un signo clínico relevante ya que puede corresponder a una infección bacteriana grave, por lo que se toman hemocultivos de forma rutinaria y el paciente es hospitalizado. Aún no existe una recomendación respecto al tiempo de observación necesario una vez internado el paciente. OBJETIVO: Describir las bacterias aisladas en hemocultivos de lactantes bajo 90 días de vida hospitalizados por fiebre y el tiempo de detección de crecimiento microbiano en los mismos. ¨MÉTODO: Estudio descriptivo, retrospectivo. Se revisaron hemocultivos positivos tomados entre 2014 y 2016 en neonatos y lactantes < 90 días de edad. Se obtuvieron las identificaciones, tiempo de positividad de las bacterias, así como datos clínicos, de laboratorio y demográficos. RESULTADOS: Se identificaron 172 hemocultivos positivos, 51 cumplían los criterios de inclusión. De éstos, 21 microorganismos fueron patógenos (Escherichia coli: 10, Streptococcus agalactiae: 3, Streptococcus pyogenes: 3, otros: 5) y 30 se consideraron contaminación, principalmente Staphylococcus coagulasa negativa. En relación al total de la muestra, la mediana del tiempo de positividad fue de 10 h. A las 24 h de cultivo se detectó crecimiento bacteriano en 94% de la muestra. CONCLUSIÓN: Las bacterias patógenas aisladas en los hemocultivos de pacientes < 90 días de edad, que ingresaron con fiebre, corresponden principalmente a bacilos gramnegativos y estreptococos. Todos los patógenos aislados fueron detectados antes de 24 h de incubación.


BACKGROUND: Fever in infants younger than 90 days may reflect a serious bacterial infection, so blood cultures (BC) are taken routinely and the patient is hospitalized. The observation time to detect occult bacteremia is not well established. AIM: To describe type and positivity time of isolated bacteria in blood cultures in infants under 90 days admitted for fever. METHODS: Retrospective, descriptive study. Positive blood cultures taken between 2014-2016 in young infants admitted for fever were included. Identification and time of positivity of each bacteria, clinical, laboratory and demographic data were recorded. Demographic variables and the clinical outcome was obtained. RESULTS: There were 172 positive blood cultures, only 51 met inclusion criteria. Of these, 21 microorganisms were pathogenic (Escherichia coli: 10, Streptococcus agalactiae: 3, Streptococcus pyogenes: 3, others: 5) and 30 were considered contamination, mainly coagulase negative Staphylococcus. In relation to the total sample, the median time of positivity was 10 hrs. At 24 hours of culture, bacterial growth was detected in 94% of the sample. CONCLUSION: The pathogenic bacteria isolated in the blood cultures of patients younger than 90 days who were admitted with fever correspond mainly to Gram negative bacilli and streptococci. All isolated pathogens were detected before 24 h of incubation.


Subject(s)
Humans , Infant , Child , Bacteremia/diagnosis , Bacteremia/microbiology , Streptococcus agalactiae , Streptococcus pyogenes , Retrospective Studies , Escherichia coli , Fever , Hospitals
14.
Univ. salud ; 24(1): 85-94, ene.-abr. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1361189

ABSTRACT

Introducción: La resistencia a los antimicrobianos (RAM) es un problema de salud pública que manifiesta la disminuida eficacia de estos agentes en la prevención y tratamiento de una proporción cada vez más amplia de patologías. Los actinomicetos son un grupo bacteriano importante de productores de metabolitos activos contra patógenos. Objetivo: Aislar actinomicetos del bosque tropical de Nariño, con potencial producción de metabolitos inhibitorios contra bacterias multidrogo-resistentes. Materiales y métodos: Se tomaron muestras de suelo de Bosque Tropical Húmedo de la Reserva Natural del Río Ñambí, se analizaron microbiológica y molecularmente. Se estimuló la producción in vitro de metabolitos secundarios y evaluó el efecto inhibitorio de estos extractos contra las bacterias multidrogo-resistentes Escherichia coli y Staphylococcus aureus. Resultados: Se obtuvieron 11 aislados presuntivos, se confirmó que cuatro de ellos correspondieron al género Streptomyces sp. Las pruebas de inhibición contra bacterias multidrogo-resistentes E. coli y S. aureus, permitieron verificar que el aislado P3772 fue el más eficiente en la inhibición de los patógenos. Conclusiones: Todos los actinomicetos evaluados presentan actividad antibacteriana contra al menos una de las bacterias patógenas estudiadas; destacando el aislado P3772, que inhibe a E. coli y S. aureus. Se espera caracterizar los compuestos vinculados a la actividad antibacteriana.


Introduction: Antimicrobial resistance (AR) is a public health problem that reveals the diminished efficacy of these agents in the prevention and treatment of an increasingly larger number of pathologies. Actinomycetes are an important bacterial producer group of metabolites that are active against pathogens. Objective: To isolate actinomycetes from the tropical forest of Nariño (Colombia), which have the potential to produce inhibitory metabolites against multi-drug resistant bacteria. Materials and methods: Soil samples were taken from the Humid Tropical Forest of the Río Ńambí Natural Reserve and analyzed through microbiological and molecular assays. In vitro production of secondary metabolites was first stimulated, followed by the assessment of the inhibitory effect of these extracts against multi-drug resistant Escherichia coli and Staphylococcus aureus. Results: 11 presumptive isolates were obtained, confirming that four of them corresponded to the Streptomyces sp. genus. The bacterial isolate P3772 was identified as the one with the highest inhibitory effect against multi-drug resistant E. coli and S. aureus. Conclusions: All the actinomycetes evaluated presented antibacterial activity. The isolate P3772 stands out, which inhibited both E. coli and S. aureus. The compounds associated with this antibacterial activity will be characterized in future studies.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Bacteria , Anti-Infective Agents , Staphylococcus aureus , Actinobacteria , Drug Resistance, Bacterial , Escherichia coli , Anti-Bacterial Agents
15.
Rev. bras. med. fam. comunidade ; 17(44): 3067, 20220304. tab
Article in Portuguese | LILACS, ColecionaSUS | ID: biblio-1379772

ABSTRACT

Introdução: Infecção urinária é motivo comum de consulta na Atenção Primária, requerendo tratamento empírico. Para a seleção do antimicrobiano, é necessário conhecer o perfil de resistência dos uropatógenos na comunidade. Objetivo: Analisar o perfil de resistência antimicrobiana em uroculturas realizadas em pacientes da Atenção Primária à Saúde do Serviço de Saúde Comunitária do Grupo Hospitalar Conceição, de julho de 2017 a junho de 2019. Métodos: Estudo transversal, observacional e descritivo com uroculturas de pacientes ambulatoriais das Unidades de Saúde do Serviço de Saúde Comunitária do Grupo Hospitalar Conceição, nas Zonas Norte e Nordeste de Porto Alegre, de julho de 2017 a junho de 2019. Os dados das uroculturas foram fornecidos pelo laboratório do Grupo Hospitalar e analisados por meio das proporções, por sexo, micro-organismo e resistência antimicrobiana. Resultados: Encontraram-se 2.000 uroculturas positivas no período, principalmente por Escherichia coli (75,50%), Klebsiella pneumoniae (7,80%), Staphylococcus saprophyticus (4,95%), Enterococcus specie (3,35%) e Proteus mirabilis (2,85%). Entre os antibióticos orais testados, a maior resistência foi para ampicilina (48,95%), seguida por sulfametoxazol+trimetoprima (25,85%), norfloxacino (18,05%), ciprofloxacino (18,00%), amoxicilina+clavulanato (11,05%) e nitrofurantoína (8,60%). Considerando-se apenas E. coli, as resistências foram 47,75% para ampicilina, 29,74% para sulfametoxazol+trimetoprima, 19,74% para norfloxacino e ciprofloxacino, 8,08% para amoxicilina+clavulanato e 1,99% para nitrofurantoína. Conclusões: O perfil de resistência antimicrobiana nas Zonas Norte e Nordeste de Porto Alegre sugere que sejam utilizados para tratamento empírico de infecção do trato urinário nessa localidade nitrofurantoína ou amoxicilina+clavulanato.


Introduction: Urinary tract infection is a common reason for consultation in primary care, requiring empirical treatment. For the selection of the antimicrobial, it is necessary to know the resistance profile of uropathogens in the community. Objective: To analyze the profile of antimicrobial resistance in urine cultures performed on primary health care patients from the Community Health Service of Grupo Hospitalar Conceição from July 2017 to June 2019. Methods: Cross-sectional, observational and descriptive study with urine cultures of outpatients from the Health Units from the Community Health Service of Grupo Hospitalar Conceição, in North and Northeast Porto Alegre, Brazil, from July 2017 to June 2019. The data on urine cultures were provided by the Grupo Hospitalar laboratory and analyzed through proportions, by sex, microorganism, and antimicrobial resistance. Results: Two thousand positive urine cultures were found in the period, mainly for Escherichia coli (75.50%), Klebsiella pneumoniae (7.80%), Staphylococcus saprophyticus (4.95%), Enterococcus specie (3.35%) and Proteus mirabilis (2.85%). Among the oral antibiotics tested, the most frequent resistance was to ampicillin (48.95%), followed by trimethoprim+sulfamethoxazole (25.85%), norfloxacin (18.05%), ciprofloxacin (18.00%), amoxicillin-clavulanate (11.05%) and nitrofurantoin (8.60%). Considering only E. coli, resistance was 47.75% to ampicillin, 29.74% to trimethoprim+sulfamethoxazole, 19.74% to norfloxacin and ciprofloxacin, 8.08% to amoxicillin-clavulanate and 1.99% to nitrofurantoin. Conclusions: The profile of antimicrobial resistance in the North and Northeast Zones of Porto Alegre suggests that nitrofurantoin or amoxicillin-clavulanate should be used for empirical treatment of urinary tract infection in this locality.


Introducción: La infección del tracto urinario es un motivo frecuente de consulta en atención primaria, requiriendo tratamiento empírico. Para la selección del antimicrobiano, es necesario conocer el perfil de resistencia de los uropatógenos en la comunidad. Objetivo: Analizar el perfil de resistencia antimicrobiana en urocultivos realizados en pacientes de atención primaria de salud de Serviço de Saúde Comunitária de Grupo Hospitalar Conceição de julio de 2017 a junio de 2019. Métodos: Estudio transversal, observacional y descriptivo con urocultivos de pacientes ambulatorios de las Unidades de Salud de Serviço de Saúde Comunitária de Grupo Hospitalar Conceição, en las Zonas Norte y Nordeste de Porto Alegre, de julio de 2017 a junio de 2019. Los datos de urocultivos fueron proporcionados por el laboratorio de Grupo Hospitalar y analizados a través de proporciones, por sexo, microorganismos y resistencia a los antimicrobianos. Resultados: En el período se encontraron 2.000 urocultivos positivos, principalmente por Escherichia coli (75,50%), Klebsiella pneumoniae (7,80%), Staphylococcus saprophyticus (4,95%), Enterococcus especie (3,35%) y Proteus mirabilis (2,85%). Entre los antibióticos orales probados, la mayor resistencia fue para la ampicilina (48,95%), seguida de sulfametoxazol+trimetoprima (25,85%), norfloxacina (18,05%), ciprofloxacina (18,00%), amoxicilina+clavulanato (11,05%) y nitrofurantoína (8,60%). %). Considerando solo a E. coli, la resistencia fue del 47,75% para ampicilina, 29,74% para sulfametoxazol + trimetoprima, 19,74% para norfloxacina y ciprofloxacina, 8,08% para amoxicilina + clavulanato y 1,99% para nitrofurantoína. Conclusiones: El perfil de resistencia a los antimicrobianos en las regiones Norte y Nordeste de Porto Alegre sugiere que se utilizan para el tratamiento empírico de la infección del tracto urinario en esta localidad nitrofurantoína o amoxicilina+clavulanato.


Subject(s)
Urinary Tract Infections , Drug Resistance , Drug Resistance, Bacterial , Escherichia coli , Community-Acquired Infections
16.
Bol. latinoam. Caribe plantas med. aromát ; 21(1): 81-93, ene. 2022. tab, ilus
Article in English | LILACS | ID: biblio-1372383

ABSTRACT

Escherichia coli is a pathogen associated with infections in piglets in the post-weaning phase, its pathogenicity is related to the animal's susceptibility to bacterial enterotoxins. The objective of the present study was to determine the EOs activity against E. colistrain, in the form planktonic and sessile. Although the Disc-Diffusion tests to determine the Minimum Inhibitory Concentration, do not fully corroborate with the other analyzes of this study, it was noticed bacteria inhibition. The EOs were prepared at 0.4%, 0.8% and 1.0% for tests. The tested EOs were effective against E. coliplanktonic cells (p<0.05). As for the sessile cells, the most significant result was inhibition and 100% sessile cells at the concentration of 1.0% of Cymbopogon citratusEO. Although there was resistance in some treatments, the tested EOs demonstrated inhibition capacity, constituting promising alternatives for the control of E. coli, especially of planktonic cells.


Escherichia coli es un patógeno asociado con infecciones en lechones en la fase posterior al destete, su patogenicidad está relacionada con la susceptibilidad del animal a las enterotoxinas bacterianas. El objetivo del presente estudio fue determinar la actividad de contra E. coli, en la forma planctónico y sésil. Aunque las pruebas de difusión de disco para determinar la concentración inhibitoria mínima, no corroboran completamente con los otros análisis de este estudio, se observó inhibición de la bacteria. Las soluciones basadas en AE se prepararon al 0.4%, 0.8% y 1.0% para pruebas. Los AEs probados fueron efectivos contra las células planctónicas (p<0.05). En cuanto a las células sésiles, el resultado más significativo fue la inhibición y el 100% de las células sésiles a la concentración de 1,0% de Cymbopogon citratus. Aunque hubo resistencia en algunos tratamientos, los AEs probados demostraron capacidad de inhibición, constituyendo alternativas prometedoras para el control de E. coli, especialmente de células planctónicas.


Subject(s)
Animals , Oils, Volatile/pharmacology , Plant Extracts/pharmacology , Escherichia coli/drug effects , Anti-Bacterial Agents/pharmacology , Swine , Oils, Volatile/chemistry , Plant Extracts/chemistry , Microbial Sensitivity Tests , Biofilms/drug effects , Ocimum basilicum , Cymbopogon , Diarrhea/microbiology , Escherichia coli/isolation & purification , Escherichia coli/cytology , Flame Ionization , Gas Chromatography-Mass Spectrometry , Anti-Bacterial Agents/chemistry
17.
Braz. j. biol ; 82: e244735, 2022. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1249280

ABSTRACT

Abstract L-Asparaginase catalysing the breakdown of L-Asparagine to L-Aspartate and ammonia is an enzyme of therapeutic importance in the treatment of cancer, especially the lymphomas and leukaemia. The present study describes the recombinant production, properties and anticancer potential of enzyme from a hyperthermophilic archaeon Pyrococcus abyssi. There are two genes coding for asparaginase in the genome of this organism. A 918 bp gene encoding 305 amino acids was PCR amplified and cloned in BL21 (DE3) strain of E. coli using pET28a (+) plasmid. The production of recombinant enzyme was induced under 0.5mM IPTG, purified by selective heat denaturation and ion exchange chromatography. Purified enzyme was analyzed for kinetics, in silico structure and anticancer properties. The recombinant enzyme has shown a molecular weight of 33 kDa, specific activity of 1175 U/mg, KM value 2.05mM, optimum temperature and pH 80°C and 8 respectively. No detectable enzyme activity found when L-Glutamine was used as the substrate. In silico studies have shown that the enzyme exists as a homodimer having Arg11, Ala87, Thr110, His112, Gln142, Leu172, and Lys232 being the putative active site residues. The free energy change calculated by molecular docking studies of enzyme and substrate was found as ∆G - 4.5 kJ/mole indicating the affinity of enzyme with the substrate. IC50 values of 5U/mL to 7.5U/mL were determined for FB, caco2 cells and HepG2 cells. A calculated amount of enzyme (5U/mL) exhibited 78% to 55% growth inhibition of caco2 and HepG2 cells. In conclusion, the recombinant enzyme produced and characterized in the present study offers a good candidate for the treatment of cancer. The procedures adopted in the present study can be prolonged for in vivo studies.


Resumo A L-asparaginase, que catalisa a degradação da L-asparagina em L-aspartato e amônia, é uma enzima de importância terapêutica no tratamento do câncer, especialmente dos linfomas e da leucemia. O presente estudo descreve a produção recombinante, propriedades e potencial anticancerígeno da enzima de Pyrococcus abyssi, um archaeon hipertermofílico. Existem dois genes que codificam para a asparaginase no genoma desse organismo. Um gene de 918 bp, que codifica 305 aminoácidos, foi amplificado por PCR e clonado na cepa BL21 (DE3) de E. coli usando o plasmídeo pET28a (+). A produção da enzima recombinante foi induzida sob 0,5mM de IPTG, purificada por desnaturação seletiva por calor e cromatografia de troca iônica. A enzima purificada foi analisada quanto à cinética, estrutura in silico e propriedades anticancerígenas. A enzima recombinante apresentou peso molecular de 33 kDa, atividade específica de 1.175 U / mg, valor de KM 2,05 mM, temperatura ótima de 80º C e pH 8. Nenhuma atividade enzimática detectável foi encontrada quando a L-glutamina foi usada como substrato. Estudos in silico mostraram que a enzima existe como um homodímero, com Arg11, Ala87, Thr110, His112, Gln142, Leu172 e Lys232 sendo os resíduos do local ativo putativo. A mudança de energia livre calculada por estudos de docking molecular da enzima e do substrato foi encontrada como ∆G - 4,5 kJ / mol, indicando a afinidade da enzima com o substrato. Valores de IC50 de 5U / mL a 7,5U / mL foram determinados para células FB, células caco2 e células HepG2. Uma quantidade de enzima (5U / mL) apresentou inibição de crescimento de 78% a 55% das células caco2 e HepG2, respectivamente. Em conclusão, a enzima recombinante produzida e caracterizada no presente estudo é uma boa possibilidade para o tratamento do câncer. Os procedimentos adotados na presente pesquisa podem ser aplicados para estudos in vivo.


Subject(s)
Humans , Asparaginase/biosynthesis , Asparaginase/pharmacology , Pyrococcus abyssi/enzymology , Antineoplastic Agents/pharmacology , Substrate Specificity , Enzyme Stability , Recombinant Proteins/biosynthesis , Recombinant Proteins/pharmacology , Caco-2 Cells , Escherichia coli/genetics , Molecular Docking Simulation , Hydrogen-Ion Concentration
18.
Braz. j. biol ; 82: e239449, 2022. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1249271

ABSTRACT

Abstract Alpha amylase, catalyzing the hydrolysis of starch is a ubiquitous enzyme with tremendous industrial applications. A 1698 bp gene coding for 565 amino acid amylase was PCR amplified from Geobacillus thermodenitrificans DSM-465, cloned in pET21a (+) plasmid, expressed in BL21 (DE3) strain of E. coli and characterized. The recombinant enzyme exhibited molecular weight of 63 kDa, optimum pH 8, optimum temperature 70°C, and KM value of 157.7µM. On pilot scale, the purified enzyme efficiently removed up to 95% starch from the cotton fabric indicating its desizing ability at high temperature. 3D model of enzyme built by Raptor-X and validated by Ramachandran plot appeared as a monomer having 31% α-helices, 15% β-sheets, and 52% loops. Docking studies have shown the best binding affinity of enzyme with amylopectin (∆G -10.59). According to our results, Asp 232, Glu274, Arg448, Glu385, Asp34, Asn276, and Arg175 constitute the potential active site of enzyme.


Resumo A alfa-amilase, que catalisa a hidrólise do amido, é uma enzima ubíqua com imensas aplicações industriais. Um gene de 1698 pb que codifica a amilase de 565 aminoácidos foi amplificado por PCR, a partir de Geobacillus thermodenitrificans DSM-465, clonado no plasmídeo pET21a (+), expresso na cepa BL21 (DE3) de E. coli e caracterizado. A enzima recombinante exibiu peso molecular de 63 kDa, pH ótimo igual a 8, temperatura ótima de 70° C e valor KM de 157,7 µM. Em escala piloto, a enzima purificada removeu com eficiência até 95% de amido do tecido de algodão, indicando sua capacidade de desengomagem em alta temperatura. O modelo 3D da enzima construída por Raptor-X e validada por Ramachandran plot apareceu como um monômero com 31% de hélices alfa, 15% de folhas beta e 52% de loops. Os estudos de docking mostraram melhor afinidade de ligação da enzima com amilopectina (∆G: - 10,59). De acordo com nossos resultados, Asp 232, Glu274, Arg448, Glu385, Asp34, Asn276 e Arg175 constituem o sítio ativo potencial da enzima.


Subject(s)
Escherichia coli/genetics , alpha-Amylases/genetics , alpha-Amylases/metabolism , Temperature , Enzyme Stability , Cloning, Molecular , Geobacillus , Hydrogen-Ion Concentration
19.
Braz. j. biol ; 82: e235927, 2022. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1249226

ABSTRACT

Abstract Glutamine synthetase (GS), encoded by glnA, catalyzes the conversion of L-glutamate and ammonium to L-glutamine. This ATP hydrolysis driven process is the main nitrogen assimilation pathway in the nitrogen-fixing bacterium Azospirillum brasilense. The A. brasilense strain HM053 has poor GS activity and leaks ammonium into the medium under nitrogen fixing conditions. In this work, the glnA genes of the wild type and HM053 strains were cloned into pET28a, sequenced and overexpressed in E. coli. The GS enzyme was purified by affinity chromatography and characterized. The GS of HM053 strain carries a P347L substitution, which results in low enzyme activity and rendered the enzyme insensitive to adenylylation by the adenilyltransferase GlnE.


Resumo A glutamina sintetase (GS), codificada por glnA, catalisa a conversão de L-glutamato e amônio em L-glutamina. Este processo dependente da hidrólise de ATP é a principal via de assimilação de nitrogênio na bactéria fixadora de nitrogênio Azospirillum brasilense. A estirpe HM053 de A. brasilense possui baixa atividade GS e excreta amônio no meio sob condições de fixação de nitrogênio. Neste trabalho, os genes glnA das estirpes do tipo selvagem e HM053 foram clonados em pET28a, sequenciados e superexpressos em E. coli. A enzima GS foi purificada por cromatografia de afinidade e caracterizada. A GS da estirpe HM053 possui uma substituição P347L que resulta em baixa atividade enzimática e torna a enzima insensível à adenililação pela adenililtransferase GlnE.


Subject(s)
Bacterial Proteins/genetics , Azospirillum brasilense/enzymology , Azospirillum brasilense/genetics , Ammonium Compounds , Glutamate-Ammonia Ligase/genetics , Escherichia coli/genetics
20.
Braz. j. biol ; 82: e234476, 2022. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1153484

ABSTRACT

Abstract The Brazilian Cerrado biome consists of a great variety of endemic species with several bioactive compounds, and Anadenanthera peregrina (L.) Speg is a promising species. In this study, we aimed to perform phytochemical characterization and evaluate the antioxidant and antibacterial activities against Staphylococcus aureus and Escherichia coli of the hydroethanolic extract of A. peregrina stem bark. The barks were collected in the Botanical Garden of Goiânia, Brazil. The hydroethanolic extract was obtained by percolation and subjected to physicochemical screening, total phenolic content estimation, high-performance liquid chromatography (HPLC) fingerprinting, and antioxidant (IC50 values were calculated for the 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl assay - DPPH) and antibacterial activity determination. The pH of the extract was 5.21 and density was 0.956 g/cm3. The phytochemical screening indicated the presence of cardiac glycosides, organic acids, reducing sugars, hemolytic saponins, phenols, coumarins, condensed tannins, flavonoids, catechins, depsides, and depsidones derived from benzoquinones. The extract showed intense hemolytic activity. The total phenolic content was 6.40 g GAE 100 g-1. The HPLC fingerprinting analysis revealed the presence of gallic acid, catechin, and epicatechin. We confirmed the antioxidant activity of the extract. Furthermore, the extract did not inhibit the growth of E. coli colonies at any volume tested, but there were halos around S. aureus colonies at all three volumes tested. These results contribute to a better understanding of the chemical composition of A. peregrina stem bark and further support the medicinal applications of this species.


Resumo O bioma Cerrado brasileiro apresenta em uma grande variedade de espécies endêmicas com diversos compostos bioativos, e Anadenanthera peregrina (L.) Speg é uma espécie promissora. Neste estudo, objetivamos realizar a caracterização fitoquímica e avaliar as atividades antioxidantes e antibacterianas contra Staphylococcus aureus e Escherichia coli do extrato hidroetanólico de cascas do caule de A. peregrina. As cascas foram coletadas no Jardim Botânico de Goiânia, Brasil. O extrato hidroetanólico foi obtido por percolação e submetido a triagem físico-química, estimativa de conteúdo fenólico total, impressão digital por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) e determinação da atividade antioxidante (valores de IC50 foram calculados para o ensaio 2,2-difenil-1-picril-hidrazil) e antibacteriana. O pH do extrato foi de 5,21 e a densidade foi de 0,956 g/cm3. A triagem fitoquímica indicou a presença de glicosídeos cardíacos, ácidos orgânicos, açúcares redutores, saponinas hemolíticas, fenóis, cumarinas, taninos condensados, flavonóides, catequinas, depsídios e depsidonas derivados de benzoquinonas. O extrato mostrou intensa atividade hemolítica. O conteúdo fenólico total foi de 6,40 g de GAE 100 g-1. A análise por impressão digital por HPLC revelou a presença de ácido gálico, catequina e epicatequina. Confirmamos a atividade antioxidante do extrato. Além disso, o extrato não inibiu o crescimento de colônias de E. coli em nenhum volume testado, mas houve halos em torno das colônias de S. aureus nos três volumes testados. Estes resultados contribuem para uma melhor compreensão da composição química da casca de A. peregrina e apoia ainda mais as aplicações medicinais desta espécie.


Subject(s)
Plant Bark , Antioxidants/pharmacology , Staphylococcus aureus , Brazil , Plant Extracts/pharmacology , Escherichia coli , Phytochemicals , Anti-Bacterial Agents/pharmacology
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