An optmized protocol for simultaneous extraction of DNA and RNA from soils
Braz. j. microbiol
;
35(3): 230-234, jul.-set. 2004. ilus
Article
in English
| LILACS
| ID: lil-394988
RESUMO
Nesse trabalho descrevemos um protocolo otimizado para extração simultânea de DNA e RNA de solo. O tratamento das amostras de solo com etanol e posterior agitação com partículas foi uma estratégia bem sucedida para lise das células sem degradação significativa dos ácidos nucléicos, resultando em bom rendimento de DNA e RNA íntegros. O RNA transcrito pode ser amplificado com iniciadores com alvo no fragmento do gene da glutamina sintetase (glnA). Os fragmentos 16S rDNA, tanto do DNA como do cDNA, foram amplificados e analisados por DGGE. O método foi aplicado para amostras de solo e rizosfera (morango e canola). Dois outros protocolos para extração de ácidos nucléicos de solo foram aplicados para o mesmo lote de amostras, de forma a comparar os métodos quanto à eficiência e reprodutibilidade. Os perfis de DGGE mostraram não haver diferença relevante nos padrões obtidos. O método descrito é apropriado para o processamento rápido de muitas amostras e, conseqüentemente, adequado para estudos ecológicos.
Full text:
Available
Index:
LILACS (Americas)
Type of study:
Practice guideline
Language:
English
Journal:
Braz. j. microbiol
Journal subject:
Microbiology
Year:
2004
Type:
Article
/
Project document
Affiliation country:
Germany
Institution/Affiliation country:
Federal Biological Research Centre for Agriculture and Forestry/DE
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