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Genetic diversity among forty coffee varieties assessed by RAPD markers associated with restriction digestion
Diniz, Leandro Eugênio Cardamoni; Ruas, Claudete de Fátima; Carvalho, Valdemar de Paula; Torres, Fabrício Medeiros; Ruas, Eduardo Augusto; Santos, Melissa de Oliveira; Sera, Tumoru; Ruas, Paulo Maurício.
Affiliation
  • Diniz, Leandro Eugênio Cardamoni; Universidade Estadual de Londrina. Departamento de Biologia Geral. Londrina. BR
  • Ruas, Claudete de Fátima; Universidade Estadual de Londrina. Departamento de Biologia Geral. Londrina. BR
  • Carvalho, Valdemar de Paula; Universidade Estadual de Londrina. Departamento de Biologia Geral. Londrina. BR
  • Torres, Fabrício Medeiros; Universidade Estadual de Londrina. Departamento de Biologia Geral. Londrina. BR
  • Ruas, Eduardo Augusto; Universidade Estadual de Londrina. Departamento de Biologia Geral. Londrina. BR
  • Santos, Melissa de Oliveira; Universidade Estadual de Londrina. Departamento de Biologia Geral. Londrina. BR
  • Sera, Tumoru; Instituto Agronômico do Paraná. Londrina. BR
  • Ruas, Paulo Maurício; Universidade Estadual de Londrina. Departamento de Biologia Geral. Londrina. BR
Braz. arch. biol. technol ; Braz. arch. biol. technol;48(4): 511-521, July 2005. ilus, tab, graf
Article in En | LILACS | ID: lil-410046
Responsible library: BR1.1
RESUMO
A variabilidade genética de 40 acessos de cafeeiros de fenótipo arabica foi obtida usando a técnica de RAPD associada a uma digestão prévia do DNA genômico com endonucleases. A variabilidade genética e a relação entre os accessos foram inicialmente avaliadas pela amplificação de 195 primers. Para incrementar a eficiência na detecção de polimorfismo, o DNA genômico de cada acessos foi submetido a digestão com endonucleases antes da PCR. Um total de 24 primers combinados com restrição do DNA gerou 318 bandas, das quais 266 (83,65%) foram polimórficas. A associação entre os 40 acessos foi estimada pelo método de clusters UPGMA, sendo os acessos agrupados de acordo com seu pedigree e aspectos agronômicos. Os resultados mostraram que o uso de enzimas de restrição antes da reação de amplificação pode ser considerada uma ferramenta eficiente para incrementar o número de bandas informativas, possibilitando a diferenciação entre os 40 acessos de C. arabica.
Full text: 1 Index: LILACS Type of study: Risk_factors_studies Language: En Journal: Braz. arch. biol. technol Journal subject: BIOLOGIA Year: 2005 Type: Article
Full text: 1 Index: LILACS Type of study: Risk_factors_studies Language: En Journal: Braz. arch. biol. technol Journal subject: BIOLOGIA Year: 2005 Type: Article