Genetic diversity among forty coffee varieties assessed by RAPD markers associated with restriction digestion
Braz. arch. biol. technol
; Braz. arch. biol. technol;48(4): 511-521, July 2005. ilus, tab, graf
Article
in En
| LILACS
| ID: lil-410046
Responsible library:
BR1.1
RESUMO
A variabilidade genética de 40 acessos de cafeeiros de fenótipo arabica foi obtida usando a técnica de RAPD associada a uma digestão prévia do DNA genômico com endonucleases. A variabilidade genética e a relação entre os accessos foram inicialmente avaliadas pela amplificação de 195 primers. Para incrementar a eficiência na detecção de polimorfismo, o DNA genômico de cada acessos foi submetido a digestão com endonucleases antes da PCR. Um total de 24 primers combinados com restrição do DNA gerou 318 bandas, das quais 266 (83,65%) foram polimórficas. A associação entre os 40 acessos foi estimada pelo método de clusters UPGMA, sendo os acessos agrupados de acordo com seu pedigree e aspectos agronômicos. Os resultados mostraram que o uso de enzimas de restrição antes da reação de amplificação pode ser considerada uma ferramenta eficiente para incrementar o número de bandas informativas, possibilitando a diferenciação entre os 40 acessos de C. arabica.
Full text:
1
Index:
LILACS
Type of study:
Risk_factors_studies
Language:
En
Journal:
Braz. arch. biol. technol
Journal subject:
BIOLOGIA
Year:
2005
Type:
Article