Identification, antimicrobial resistance and genotypic characterization of Enterococcus spp. isolated in Porto Alegre, Brazil / Identificação, resistência antimicrobiana e caracterização genotípica de Enterococcus spp. isolados em Porto Alegre, Brasil

ABSTRACT

In the past two decades the members of the genus Enterococcus have emerged as important nosocomial pathogens worldwide. In the present study, we evaluated the antimicrobial resistance and genotypic characteristics of 203 Enterococcus spp. recovered from different clinical sources from two hospitals in Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil. The species were identified by conventional biochemical tests and by an automated system. The genetic diversity of E. faecalis presenting high-level aminoglycoside resistance (HLAR) was assessed by pulsed-field gel electrophoresis of chromosomal DNA after SmaI digestion. The E. faecalis was the most frequent specie (93.6 percent), followed by E. faecium (4.4 percent). The antimicrobial resistance profile was 2.5 percent to ampicillin, 0.5 percent to vancomycin, 0.5 percent teicoplanin, 33 percent to chloramphenicol, 2 percent to nitrofurantoin, 66.1 percent to erythromycin, 66.5 percent to tetracycline, 24.6 percent to rifampicin, 30 percent to ciprofloxacin and 87.2 percent to quinupristin-dalfopristin. A total of 10.3 percent of the isolates proved to be HLAR to both gentamicin and streptomycin (HLRST/GE), with 23.6 percent resistant only to gentamicin (HLR-GE) and 37.4 percent only to streptomycin (HLRST). One predominant clonal group was found among E. faecalis HLR-GE/ST. The prevalence of resistance among beta-lactam antibiotics and glycopeptides was very low. However, in this study there was an increased number of HLR Enterococcus which may be spreading intra and inter-hospital.

RESUMO

Nas últimas duas décadas os membros do gênero Enterococcus emergiram como importantes patógenos nosocomiais ao redor do mundo. No presente estudo, nós avaliamos a resistência antimicrobiana e as características genotípicas de 203 Enterococcus spp. obtidos de diferentes fontes clínicas em dois hospitais de Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brasil. As espécies foram identificadas por testes bioquímicos convencionais e por um sistema automatizado. A diversidade genética de E. faecalis demonstrando resistência à altos níveis de aminoglicosídeos (HLAR) foi avaliada através da análise do DNA cromossômico após digestão com a enzima SmaI, seguido por eletroforese em campo pulsado. O E. faecalis foi a espécie mais freqüente (93,6 por cento), seguido por E. faecium (4,4 por cento). O perfil de resistência antimicrobiana foi 2,5 por cento para ampicilina, 0,5 por cento para vancomicina, 0,5 por cento para teicoplanina, 33 por cento para cloranfenicol, 2 por cento para nitrofurantoína 66,1 por cento para eritromicina, 66,5 por cento para tetraciclina, 24,6 por cento para rifampicina, 30 por cento para ciprofloxacino e 87,2 por cento para quinupristina-dalfopristina. Um total de 10,3 por cento dos isolados apresentaram HLAR para ambos gentamicina e estreptomicina (HLR-ST/GE), sendo 23,6 por cento resistentes somente a gentamicina (HLR-GE) e 37,4 por cento somente a estreptomicina (HLR-ST). Um grupo clonal predominante foi encontrado em E. faecalis HLR-GE/ST. A prevalência de resistência a antibióticos ²-lactâmicos, e em particular aos glicopeptídeos, foi muito baixa. Entretanto, neste estudo, houve um número crescente de Enterococcus HLAR que podem estar se disseminando intra e interhospitais.