Diversidade genotípica de rotavírus suínos no Estado de São Paulo / Diversity of porcine rotavirus genotypes in São Paulo State, Brazil

RESUMO

Rotavírus é uma das causas mais comuns de diarréia tanto em humanos quanto em diferentes espécies animais. Foi conduzido um estudo transversal a partir de 144 amostras fecais diarréicas colhidas de leitões, provenientes de 16 criações comerciais distribuídas por 10 municípios do Estado de São Paulo, Brasil, com o objetivo de se detectar a ocorrência de rotavírus e realizar sua caracterização molecular quanto seus genotipos G e P. Um total de 43 amostras (29,86 por cento) foram positivas para rotavírus por Eletroforese em Gel de Poliacrilamida (PAGE) e ELISA, num esquema de triagem em paralelo. A caracterização mediante reações do tipo nested-multiplex RT-PCR demonstrou que, isoladamente, o genotipo P[6] foi o mais frequente, detectado em 25,58 por cento das amostras, seguido pelo P[1] (11,63 por cento) e P[7] (9,3 por cento). Infecções concomitantes de genotipos P[6]+P[7] (9,3 por cento), P[1]+P[6] (4,65 por cento), P[1]+P[6]+P[7] (2,33 por cento) foram também observadas. Analogamente, o genotipo G[5] foi detectado em 30,23 por cento das amostras, seguido pelo G[10] (20,93 por cento) e G[6] (4,65 por cento) e G[5]+G[10] (18,6 por cento). O genotipo G[5]P[6] foi o mais frequente (11,63 por cento), porém outras combinações e amostras não tipificáveis também foram observadas. Considerando-se a diversidade de rotavírus suínos encontrada na população estudada, medidas profiláticas específicas devem levar em conta, para sua efetividade, o grau de proteção cruzada entre os genotipos presentes nas formulações vacinais e aqueles que realmente são circulantes numa região.

ABSTRACT

Rotavirus is one the most common causes of diarrhea both in humans and different animal species. It was carried out a transversal study with 144 diarrheic fecal samples of piglets, from 16 commercial swine-producing units distributed among 10 municipalities of São Paulo State, Brazil, aiming at the detection of rotavirus occurrence and its molecular characterization according to G and P genotypes. A total of 43 samples (29.86 percent) were positive for rotavirus by Polyacrylamide Gel Electrophoresis (PAGE) and ELISA, in a parallel screening scheme. The nested-multiplex RT-PCR characterization revealed that, separately, the P[6] genotype was the most frequent, detected in 25.58 percent of the samples, followed by P[1] (11.63 percent) and P[7] (9.3 percent). Concomitant infection of the genotypes P[6]+P[7] (9.3 percent), P[1]+P[6] (4.65 percent), P[1]+P[6]+P[7] (2.33 percent) were also found. Similarly, the G[5] genotype was detected on 30.23 percent of the samples, followed by G[10] (20.93 percent), G[6] (4.65 percent) and G[5]+G[10] (18.6 percent). The genotype G[5]P[6] was the most frequent (11.63 percent), but other combinations and untypeable samples were also observed. Considering the diversity porcine rotavirus found in the surveyed population, specific prophylactic measures should take in charge, for its effectiveness, the cross-protection degree between the genotypes present on vaccine formulations and those that really circulates on a region.