Perfil de metilación de genes supresores de tumores como factor pronóstico en pacientes con leucemia mieloide aguda / Promoter methylation profile in tumor suppressor genes as prognosis factor in patients with acute myeloid leukemia

RESUMEN

Existe creciente evidencia que apoya la presencia de un perfil de metilación específico para Leucemia Mieloide Aguda (LMA). La metilación de los islotes CpG en las regiones promotoras de los genes supresores de tumores es un importante mecanismo de control epigenético y participa en el silenciamiento transcripcional. Esto puede contribuir a un nuevo entendimiento de la biología de la enfermedad y vislumbrar nuevas oportunidades terapéuticas. Identificar el perfil de metilación de las áreas promotoras de un grupo de genes supresores de tumores; (p15, p16, ESR1, IGSF4, SOCS1, RARB y DAPK), y relacionar el estatus de metilación gen especifica o combinada con diferentes parámetros clínico patológicos. Se utilizaron muestras de sangre o médula ósea obtenidas al momento del diagnóstico de 33 pacientes con LMA, infantil y del adulto, recolectadas entre los años 1997 y 2008 en el Hospital Hernán Henríquez de Temuco. Se evaluó la presencia de hipermetilación mediante una Reacción de Polimerasa en Cadena Metilación Específica (MSP), previa modificación con bisulfito de sodio. La frecuencia de metilación de los pacientes estudiados fue de 88 por ciento, 27 por ciento, 27 por ciento, 21 por ciento, 15 por ciento, 3 por ciento y 0 por ciento para ESR1, RARb, IGSF4, p15, SOCS1, DAPK, y P16, respectivamente. La hipermetilación de P15 y RARb presentó una asociación significativa para una menor supervivencia en forma individual (p=0,03 y p=0,02), y combinada (p=0,002). No se encontraron diferencias significativas entre metilación y los otros parámetros clínicos analizados. Los pacientes con LMA presentan hipermetilación de la región promotora en algunos genes supresores de tumores, afectando negativamente la supervivencia. Esto pudiese eventualmente contribuir al establecimiento de un patrón de metilación determinado con utilidad clínica.

ABSTRACT

There is growing evidence than acute myeloid leukemia presents a specific methylation profile. The Methylation of CpG islands within gene promoters is a major epigenetic transcriptional control mechanism and plays a critical role in the transcriptional silencing of tumor suppressor genes. This provides new insights into the biology of the disease and it may offer novel therapeutic opportunities. To identify the promoter methylation profile of tumor suppressor genes (p15, p16, ESR1, IGSF4, SOCS1, RARB y DAPK), and to relate the percentage of methylation with clinicopathological features, as age, gender, white cell count, disease classification and survival rates. Bone marrow and peripheral blood samples were collected at diagnosis from 33 patients with acute myeloid leukemia, infants and adult, between 1997 and 2008 from Hernán Henríquez Aravena Hospital, Temuco, Chile. Methylation in the promoter areas of each tumor suppressor gene was analyzed using the mehylation specific polymerase chain reaction (MSP) technique using sodium bisulfite modification. The frequency of hypermethylation among the patient samples was 88 percent, 27 percent, 27 percent, 21 percent, 15 percent, 3 percent and 0 percent for ESR1, RARb, IGSF4, p15, SOCS1, DAPK, and P16 for each one. Methylation was significantly associated with an inferior overall survival (p=0.03 and p=0.02). When both genes are used, inferior survival is even more significant (p=0.002). There is no significant correlation between methylation and clinicopathological features.Patients with AML have hipermetilation at the promoter region of some tumor supressor genes, with a negative effect in the overall survival. This could eventually become part of establishing a characteristical methilation pattern with clinical utility.