Detalles de la búsqueda
1.
Are Deep Learning Structural Models Sufficiently Accurate for Virtual Screening? Application of Docking Algorithms to AlphaFold2 Predicted Structures.
J Chem Inf Model
; 63(6): 1668-1674, 2023 03 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36892986
2.
Are Deep Learning Structural Models Sufficiently Accurate for Free-Energy Calculations? Application of FEP+ to AlphaFold2-Predicted Structures.
J Chem Inf Model
; 62(18): 4351-4360, 2022 09 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36099477
3.
Development of a Highly Selective Plasmodium falciparum Proteasome Inhibitor with Anti-malaria Activity in Humanized Mice.
Angew Chem Int Ed Engl
; 60(17): 9279-9283, 2021 04 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33433953
4.
Rigorous Free Energy Simulations in Virtual Screening.
J Chem Inf Model
; 60(9): 4153-4169, 2020 09 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32539386
5.
Large-Scale Validation of Mixed-Solvent Simulations to Assess Hotspots at Protein-Protein Interaction Interfaces.
J Chem Inf Model
; 58(4): 784-793, 2018 04 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29617116
6.
What can crystal structures of aminergic receptors tell us about designing subtype-selective ligands?
Pharmacol Rev
; 67(1): 198-213, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25527701
7.
Relative Binding Free Energy Calculations Applied to Protein Homology Models.
J Chem Inf Model
; 56(12): 2388-2400, 2016 12 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28024402
8.
In search of novel ligands using a structure-based approach: a case study on the adenosine A2A receptor.
J Comput Aided Mol Des
; 30(10): 863-874, 2016 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27629350
9.
Accurate and reliable prediction of relative ligand binding potency in prospective drug discovery by way of a modern free-energy calculation protocol and force field.
J Am Chem Soc
; 137(7): 2695-703, 2015 Feb 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25625324
10.
Discovery and characterization of a G protein-biased agonist that inhibits ß-arrestin recruitment to the D2 dopamine receptor.
Mol Pharmacol
; 86(1): 96-105, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24755247
11.
Predicting GPCR promiscuity using binding site features.
J Chem Inf Model
; 54(1): 184-94, 2014 Jan 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24328091
12.
Selecting an optimal number of binding site waters to improve virtual screening enrichments against the adenosine A2A receptor.
J Chem Inf Model
; 54(6): 1737-46, 2014 Jun 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24835542
13.
Successful prediction of the intra- and extracellular loops of four G-protein-coupled receptors.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(20): 8275-80, 2011 May 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21536915
14.
A single glycine in extracellular loop 1 is the critical determinant for pharmacological specificity of dopamine D2 and D3 receptors.
Mol Pharmacol
; 84(6): 854-64, 2013 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24061855
15.
Steric hindrance mutagenesis in the conserved extracellular vestibule impedes allosteric binding of antidepressants to the serotonin transporter.
J Biol Chem
; 287(47): 39316-26, 2012 Nov 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23007398
16.
Loop prediction for a GPCR homology model: algorithms and results.
Proteins
; 81(2): 214-28, 2013 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22965891
17.
Ligand-dependent activation and deactivation of the human adenosine A(2A) receptor.
J Am Chem Soc
; 135(23): 8749-59, 2013 Jun 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23678995
18.
Improved docking of polypeptides with Glide.
J Chem Inf Model
; 53(7): 1689-99, 2013 Jul 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23800267
19.
Structure-based virtual screening of MT2 melatonin receptor: influence of template choice and structural refinement.
J Chem Inf Model
; 53(4): 821-35, 2013 Apr 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23541165
20.
Identification of a small-molecule inhibitor of the PICK1 PDZ domain that inhibits hippocampal LTP and LTD.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 107(1): 413-8, 2010 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20018661