Detalles de la búsqueda
1.
The co-evolution of the genome and epigenome in colorectal cancer.
Nature
; 611(7937): 733-743, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36289335
2.
Phenotypic plasticity and genetic control in colorectal cancer evolution.
Nature
; 611(7937): 744-753, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36289336
3.
Germline MBD4 deficiency causes a multi-tumor predisposition syndrome.
Am J Hum Genet
; 109(5): 953-960, 2022 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35460607
4.
A Bayesian method to infer copy number clones from single-cell RNA and ATAC sequencing.
PLoS Comput Biol
; 19(11): e1011557, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37917660
5.
PMCE: efficient inference of expressive models of cancer evolution with high prognostic power.
Bioinformatics
; 38(3): 754-762, 2022 01 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34647978
6.
A Bayesian method to cluster single-cell RNA sequencing data using copy number alterations.
Bioinformatics
; 38(9): 2512-2518, 2022 04 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35298589
7.
Detecting repeated cancer evolution from multi-region tumor sequencing data.
Nat Methods
; 15(9): 707-714, 2018 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30171232
8.
The MOBSTER R package for tumour subclonal deconvolution from bulk DNA whole-genome sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 531, 2020 Nov 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33203356
9.
Spatially constrained tumour growth affects the patterns of clonal selection and neutral drift in cancer genomic data.
PLoS Comput Biol
; 15(7): e1007243, 2019 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31356595
10.
Learning mutational graphs of individual tumour evolution from single-cell and multi-region sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 210, 2019 Apr 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31023236
11.
Algorithmic methods to infer the evolutionary trajectories in cancer progression.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 113(28): E4025-34, 2016 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27357673
12.
TRONCO: an R package for the inference of cancer progression models from heterogeneous genomic data.
Bioinformatics
; 32(12): 1911-3, 2016 06 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26861821
13.
CABeRNET: a Cytoscape app for augmented Boolean models of gene regulatory NETworks.
BMC Bioinformatics
; 17: 64, 2016 Feb 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26846964
14.
CAPRI: efficient inference of cancer progression models from cross-sectional data.
Bioinformatics
; 31(18): 3016-26, 2015 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25971740
15.
Automatising the analysis of stochastic biochemical time-series.
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 9: S8, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26051821
16.
GESTODIFFERENT: a Cytoscape plugin for the generation and the identification of gene regulatory networks describing a stochastic cell differentiation process.
Bioinformatics
; 29(4): 513-4, 2013 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23292740
17.
Clinical application of tumour-in-normal contamination assessment from whole genome sequencing.
Nat Commun
; 15(1): 323, 2024 Jan 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38238294
18.
Computational validation of clonal and subclonal copy number alterations from bulk tumor sequencing using CNAqc.
Genome Biol
; 25(1): 38, 2024 Jan 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38297376
19.
Cancer genomes tolerate deleterious coding mutations through somatic copy number amplifications of wild-type regions.
Nat Commun
; 14(1): 3594, 2023 06 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37328455
20.
Immune selection determines tumor antigenicity and influences response to checkpoint inhibitors.
Nat Genet
; 55(3): 451-460, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36894710