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1.
Imaging active site chemistry and protonation states: NMR crystallography of the tryptophan synthase α-aminoacrylate intermediate.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(2)2022 01 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34996869
2.
Uncovering water effects in protein-ligand recognition: importance in the second hydration shell and binding kinetics.
Phys Chem Chem Phys
; 25(3): 2098-2109, 2023 Jan 18.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36562309
3.
GeomBD3: Brownian Dynamics Simulation Software for Biological and Engineered Systems.
J Chem Inf Model
; 62(10): 2257-2263, 2022 05 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35549473
4.
Binding Kinetics Toolkit for Analyzing Transient Molecular Conformations and Computing Free Energy Landscapes.
J Phys Chem A
; 126(46): 8761-8770, 2022 Nov 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36346951
5.
Proteome-Wide Characterizations of N6-Methyl-Adenosine Triphosphate- and N6-Furfuryl-Adenosine Triphosphate-Binding Capabilities of Kinases.
Anal Chem
; 93(39): 13251-13259, 2021 10 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34549933
6.
Dynamics and molecular interactions of single-stranded DNA in nucleic acid biosensors with varied surface properties.
Phys Chem Chem Phys
; 21(29): 16367-16380, 2019 Aug 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31309941
7.
Endosidin2 targets conserved exocyst complex subunit EXO70 to inhibit exocytosis.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 113(1): E41-50, 2016 Jan 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26607451
8.
Ligand Binding Pathways and Conformational Transitions of the HIV Protease.
Biochemistry
; 57(9): 1533-1541, 2018 03 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29394043
9.
Adaptation of a Genetic Screen Reveals an Inhibitor for Mitochondrial Protein Import Component Tim44.
J Biol Chem
; 292(13): 5429-5442, 2017 Mar 31.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28167535
10.
Construction of a Sequenceable Protein Mimetic Peptide Library with a True 3D Diversifiable Chemical Space.
J Am Chem Soc
; 140(44): 14552-14556, 2018 11 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30362722
11.
Role of Molecular Interactions and Protein Rearrangement in the Dissociation Kinetics of p38α MAP Kinase Type-I/II/III Inhibitors.
J Chem Inf Model
; 58(5): 968-981, 2018 05 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29620886
12.
A molecular dynamics investigation of CDK8/CycC and ligand binding: conformational flexibility and implication in drug discovery.
J Comput Aided Mol Des
; 32(6): 671-685, 2018 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29737445
13.
Immunoproteasome inhibition and bioactivity of thiasyrbactins.
Bioorg Med Chem
; 26(2): 401-412, 2018 01 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29269255
14.
Mechanism of the Association Pathways for a Pair of Fast and Slow Binding Ligands of HIV-1 Protease.
Biochemistry
; 56(9): 1311-1323, 2017 03 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28060481
15.
Syrbactin Structural Analog TIR-199 Blocks Proteasome Activity and Induces Tumor Cell Death.
J Biol Chem
; 291(16): 8350-62, 2016 Apr 15.
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| MEDLINE | ID: mdl-26907687
16.
Visualizing the tunnel in tryptophan synthase with crystallography: Insights into a selective filter for accommodating indole and rejecting water.
Biochim Biophys Acta
; 1864(3): 268-279, 2016 Mar.
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| MEDLINE | ID: mdl-26708480
17.
Characterization of Promiscuous Binding of Phosphor Ligands to Breast-Cancer-Gene 1 (BRCA1) C-Terminal (BRCT): Molecular Dynamics, Free Energy, Entropy and Inhibitor Design.
PLoS Comput Biol
; 12(8): e1005057, 2016 08.
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| MEDLINE | ID: mdl-27560145
18.
Mechanisms of Enhanced Catalysis in Enzyme-DNA Nanostructures Revealed through Molecular Simulations and Experimental Analysis.
Chembiochem
; 17(15): 1430-6, 2016 08 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27173175
19.
Amino acid networks in a (ß/α)8 barrel enzyme change during catalytic turnover.
J Am Chem Soc
; 136(19): 6818-21, 2014 May 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24766576
20.
Protonation states of the tryptophan synthase internal aldimine active site from solid-state NMR spectroscopy: direct observation of the protonated Schiff base linkage to pyridoxal-5'-phosphate.
J Am Chem Soc
; 136(37): 12824-7, 2014 Sep 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25148001