Detalles de la búsqueda
1.
GC content, but not nucleosome positioning, directly contributes to intron splicing efficiency in Paramecium.
Genome Res
; 32(4): 699-709, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35264448
2.
Dynamics of Gene Loss following Ancient Whole-Genome Duplication in the Cryptic Paramecium Complex.
Mol Biol Evol
; 40(5)2023 05 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37154524
3.
Role of Polycomb in the control of transposable elements.
Trends Genet
; 37(10): 882-889, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34210514
4.
Massive colonization of protein-coding exons by selfish genetic elements in Paramecium germline genomes.
PLoS Biol
; 19(7): e3001309, 2021 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34324490
5.
The Paramecium histone chaperone Spt16-1 is required for Pgm endonuclease function in programmed genome rearrangements.
PLoS Genet
; 16(7): e1008949, 2020 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32702045
6.
DNAModAnnot: a R toolbox for DNA modification filtering and annotation.
Bioinformatics
; 37(17): 2738-2740, 2021 Sep 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33471071
7.
A universal method for the rapid isolation of all known classes of functional silencing small RNAs.
Nucleic Acids Res
; 48(14): e79, 2020 08 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32496553
8.
Genome-defence small RNAs exapted for epigenetic mating-type inheritance.
Nature
; 509(7501): 447-52, 2014 May 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24805235
9.
DNA deletion as a mechanism for developmentally programmed centromere loss.
Nucleic Acids Res
; 44(4): 1553-65, 2016 Feb 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26503246
10.
TFIIS-Dependent Non-coding Transcription Regulates Developmental Genome Rearrangements.
PLoS Genet
; 11(7): e1005383, 2015 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26177014
11.
Flow cytometry sorting of nuclei enables the first global characterization of Paramecium germline DNA and transposable elements.
BMC Genomics
; 18(1): 327, 2017 04 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28446146
12.
Improved methods and resources for paramecium genomics: transcription units, gene annotation and gene expression.
BMC Genomics
; 18(1): 483, 2017 06 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28651633
13.
Local effect of enhancer of zeste-like reveals cooperation of epigenetic and cis-acting determinants for zygotic genome rearrangements.
PLoS Genet
; 10(9): e1004665, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25254958
14.
The Paramecium germline genome provides a niche for intragenic parasitic DNA: evolutionary dynamics of internal eliminated sequences.
PLoS Genet
; 8(10): e1002984, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23071448
15.
Small-RNA-guided histone modifications and somatic genome elimination in ciliates.
Wiley Interdiscip Rev RNA
; 15(2): e1848, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38605483
16.
RNA-guided DNA rearrangements in ciliates: is the best genome defence a good offence?
Biol Cell
; 104(6): 309-25, 2012 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22352444
17.
DNA Modification Patterns Filtering and Analysis Using DNAModAnnot.
Methods Mol Biol
; 2624: 87-114, 2023.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36723811
18.
Developmental genome rearrangements in ciliates: a natural genomic subtraction mediated by non-coding transcripts.
Trends Genet
; 25(8): 344-50, 2009 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19596481
19.
Global trends of whole-genome duplications revealed by the ciliate Paramecium tetraurelia.
Nature
; 444(7116): 171-8, 2006 Nov 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-17086204
20.
Paramecium Polycomb repressive complex 2 physically interacts with the small RNA-binding PIWI protein to repress transposable elements.
Dev Cell
; 57(8): 1037-1052.e8, 2022 04 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35429435