Detalles de la búsqueda
1.
Mammalian cells repress random DNA that yeast transcribes.
Nature
; 628(8007): 271-273, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38448526
2.
Codetta: predicting the genetic code from nucleotide sequence.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36511586
3.
Correction: Constructing Benchmark Test Sets for Biological Sequence Analysis Using Independent Set Algorithms.
PLoS Comput Biol
; 19(3): e1010971, 2023 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36888579
4.
ORFeus: a computational method to detect programmed ribosomal frameshifts and other non-canonical translation events.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 471, 2023 Dec 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38093195
5.
Many, but not all, lineage-specific genes can be explained by homology detection failure.
PLoS Biol
; 18(11): e3000862, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33137085
6.
Constructing benchmark test sets for biological sequence analysis using independent set algorithms.
PLoS Comput Biol
; 18(3): e1009492, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35255082
7.
Rfam 14: expanded coverage of metagenomic, viral and microRNA families.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D192-D200, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33211869
8.
Estimating the power of sequence covariation for detecting conserved RNA structure.
Bioinformatics
; 36(10): 3072-3076, 2020 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32031582
9.
Remote homology search with hidden Potts models.
PLoS Comput Biol
; 16(11): e1008085, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33253143
10.
The Pfam protein families database in 2019.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D427-D432, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30357350
11.
A statistical test for conserved RNA structure shows lack of evidence for structure in lncRNAs.
Nat Methods
; 14(1): 45-48, 2017 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27819659
12.
Representation learning of genomic sequence motifs with convolutional neural networks.
PLoS Comput Biol
; 15(12): e1007560, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31856220
13.
Group I introns are widespread in archaea.
Nucleic Acids Res
; 46(15): 7970-7976, 2018 09 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29788499
14.
HMMER web server: 2018 update.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W200-W204, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29905871
15.
Rfam 13.0: shifting to a genome-centric resource for non-coding RNA families.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D335-D342, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29112718
16.
The Dfam database of repetitive DNA families.
Nucleic Acids Res
; 44(D1): D81-9, 2016 Jan 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26612867
17.
The Pfam protein families database: towards a more sustainable future.
Nucleic Acids Res
; 44(D1): D279-85, 2016 Jan 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26673716
18.
HMMER web server: 2015 update.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W30-8, 2015 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25943547
19.
Rfam 12.0: updates to the RNA families database.
Nucleic Acids Res
; 43(Database issue): D130-7, 2015 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25392425
20.
The Oxytricha trifallax macronuclear genome: a complex eukaryotic genome with 16,000 tiny chromosomes.
PLoS Biol
; 11(1): e1001473, 2013.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23382650