A Quantum-Inspired Method for Three-Dimensional Ligand-Based Virtual Screening.

Measuring similarity between molecules is an important part of virtual screening (VS) experiments deployed during the early stages of drug discovery. Most widely used methods for evaluating the similarity of molecules use molecular fingerprints to encode structural information. While similarity methods using fingerprint encodings are efficient, they do not consider all the relevant aspects of molecular structure. In this paper, we describe a quantum-inspired graph-based molecular similarity (GMS) method for ligand-based VS. The GMS method is formulated as a quadratic unconstrained binary optimization problem that can be solved using a quantum annealer, providing the opportunity to take advantage of this nascent and potentially groundbreaking technology. In this study, we consider various features relevant to ligand-based VS, such as pharmacophore features and three-dimensional atomic coordinates, and include them in the GMS method. We evaluate this approach on various datasets from the DUD_LIB_VS_1.0 library. Our results show that using three-dimensional atomic coordinates as features for comparison yields higher early enrichment values. In addition, we evaluate the performance of the GMS method against conventional fingerprint approaches. The results demonstrate that the GMS method outperforms fingerprint methods for most of the datasets, presenting a new alternative in ligand-based VS with the potential for future enhancement.

Outer membrane vesicles extracted from Neisseria meningitidis serogroup X for prevention of meningococcal disease in Africa.

Meningococcal disease is caused mainly by serogroups A, B, C, Y, W of N. meningitidis. However, numerous cases of meningitis caused by serogroup X N. meningitidis (MenX) have recently been reported in several African countries. Currently, there are no licensed vaccines against this pathogen and most of the MenX cases have been caused by meningococci from clonal complex (c.c) 181. Detergent extracted meningococcal outer membrane vesicle (dOMV) vaccines have previously shown to be safe and effective against epidemics of serogroup B meningococcal disease in all age groups. The aim of this work is therefore to obtain, characterize and evaluate the vaccine potential of dOMVs derived from a MenX strain (OMVx). Three experimental lots of OMVx were prepared by deoxycholate extraction from the MenX strain BF 2/97. Size and morphology of the vesicles was determined by Dynamic Light Scattering and electron microscopy, whereas the antigenic composition was characterized by gel electrophoresis and immunoblotting. OMVx were thereafter adsorbed to aluminium hydroxide (OMVx/AL) and two doses of OMVx were administered s.c. to groups of Balb/c mice three weeks apart. The immunogenicity and functional antibody activities in sera were evaluated by ELISA (anti-OMVx specific IgG responses) and serum bactericidal activity (SBA) assay. The size range of OMVx was shown to be between 90 and 120nm, whereas some of the antigens detected were the outer membrane proteins PorA, OpcA and RmpM. The OMVx/AL elicited high anti-OMVx antibody responses with bactericidal activity and no bactericidal activity was observed in the control group of no immunised mice. The results demonstrate that OMVx are immunogenic and could form part of a future vaccine to prevent the majority of meningococcal disease in the African meningitis belt.

Modeling the epidemiological impact of a preventive behavioral group. / Modelización del impacto epidemiológico de la existencia de un grupo conductual preventivo.

Concerning health, experience indicates that in all human groups a percentage of individuals behave conscientiously when facing contagious diseases. This aware group responds with activities to prevent disease transmission and to minimize risk. In contrast, other individuals tend to behave with less engagement except in catastrophic cases. Assuming the theoretical and methodological framework provided by mathematical epidemiology, and based on a Susceptible – Infectious - Recovered (SIR) model, we evaluated the factors of size and intensity of the behaviours in the aware group to determine the basic reproduction number. This number is the reduction in the number of secondary cases that would be produced by a first infectious individual. Additionally, we calculated the total and individual prevented prevalence for each aware individual for different parametric scenarios. Lastly, we suggest that distance and interpersonal contact should be included as factors associated to the potential of transmission.

En lo que concierne a salud, la experiencia indica que en toda población humana existe un porcentaje de individuos que se comporta en forma consciente ante la presencia de enfermedades infectocontagiosas. Esto implica que existen grupos con una orientación hacia la prevención en sus actividades para atenuar el riego, mientras que en general la mayoría lo hace distraídamente. La excepción la constituyen los casos de orden catastrófico. Asumiendo el marco teórico y metodológico que otorga la epidemiología matemática, se evaluaron los factores tamaño e intensidad de la conducta del grupo cuidadoso en la determinación del número reproductivo básico, basándose en un modelo tipo SIR (susceptibles - infecciosos - recuperados). Es decir, se midió la reducción en la cantidad de casos secundarios que produciría un primer caso infeccioso. Junto con estos indicadores, se procedió a evaluar la prevalencia evitada total e individual por cada sujeto cuidadoso en diferentes escenarios paramétricos. Finalmente, se plantea la necesidad de integrar en futuros estudios la variable distancia y el contacto interpersonal como factores asociados al potencial de transmisión.

La tuberculosis en Camagüey: acercamiento a las desigualdades municipales, 2014-2018 / Tuberculosis in Camaguey: municipalities inequalities approach, 2014-2018

RESUMEN Fundamento: en el contexto de las poblaciones municipales de la provincia Camagüey, el monitoreo de las desigualdades en la ocurrencia de la tuberculosis es importante para alcanzar su eliminación. Objetivo: valorar las desigualdades de la tuberculosis en la población camagüeyana. Métodos: se realizó un estudio ecológico de la tuberculosis en los 13 municipios de la provincia Camagüey. La fuente de información fue la base de datos de la Vigilancia Nacional. Las variables fueron: número de casos, tasas de notificación y años. Se calculó la media geométrica de las tasas, se tomó la menor como referencia para estimar las diferencias absolutas, las diferencias relativas y el riesgo atribuible poblacional porcentual. Se estimaron las proporciones de casos de tuberculosis y sus tendencias en las personas privadas de libertad y en las personas viviendo con VIH en la provincia. Se propusieron dos escenarios futuros 2019-2020, según perspectivas del Programa cubano de tuberculosis: con reducción del 20 % para todos los municipios por igual y con reducción discriminada del 40 % para aquellos municipios con tasas ≥ 10 por 100 000 habitantes y del 10 % en los que tienen sus tasas < 10, para estimar los índices Pearcy-Keppel y varianza entre grupos. Se estratificaron los municipios según las metas hacia la eliminación. Resultados: el municipio Minas fue la referencia con la media geométrica (0,4 por 100 000), la desigualdad relativa fue 11,5 veces mayor en Camagüey. El riesgo atribuible poblacional estuvo entre 11-95 %, la tendencia fue ascendente en los privados de libertad. El segundo escenario mostró una desigualdad moderada, el índice de Pearcy-Keppel fue 46,1 % y la varianza entre grupos (1,0). Sierra de Cubitas y Najasa están en eliminación. Conclusiones: las poblaciones municipales de Camagüey, Guáimaro, Nuevitas muestran las mayores desigualdades con respecto a Minas. Las intervenciones diferenciadas aportarían mejores resultados en estos territorios.

ABSTRACT Background: the monitoring of tuberculosis inequalities occurrence in Camaguey municipalities is important to achieve their elimination. Objective: to assess the TB inequalities in Camagüey´s population. Methods: tuberculosis ecological study was carried out in the 13 municipalities of Camagüey. The National surveillance database was the source of information. The variables used were: number of cases, notification rates and years. The geometric average of the rates was calculated, taking the lowest as a reference to estimate the absolute and relative differences and the population attributable risk. It was calculated the proportions of cases according to municipalities and the trends in people deprived of liberty and people living with HIV in the province. Two future scenarios 2019-2020 were proposed, according the perspectives of the Cuban Tuberculosis Program: with a 20% reduction for all municipalities and a discriminated reduction of 40% for those municipalities with rates ≥ 10 per 100 000 populations and 10% in those with rates < 10, to estimate the Pearcy-Keppel index and variance between groups. It was stratified the municipalities according to the goals towards elimination. Results: Minas municipality was the reference, with the geometric average (0.4 per 100,000), the relative inequality was 11.5 highest in Camagüey. The population attributable risk was between 11-95%. The trend in people deprived of liberty was ascending. The second scenario showed moderate inequality, Pearcy Keppel index was 46.1% and variance between groups (1.0). The municipalities of Sierra de Cubitas and Najasa were in elimination phase. Conclusions: the municipal populations of Camagüey, Guaimaro, Nuevitas showed the greatest inequalities according to Minas. Differences interventions would bring better results to these territories.

[Satisfactory cervical cytology. Circular exocervical cytologic smears against longitudinal exocervical smears]. / Citología cervical satisfactoria. Extendido exocervical circular comparado con longitudinal.

BACKGROUND: In the Mexican Institute of Social Security, since 1962 the exocervical sample is normally extended with a circular motion technique (the usual technique). In 2006, the Ministry of Health established that the exocervical sample shall be extended with longitudinal technique (standard technique). We proposed a new technique: the exocervical widespread. Our objective was to evaluate the efficacy and quality of three techniques. METHODS: A quasi-experimental study in patients who applied for cervical cytology was performed. The variables analized were the exocervical extended technique, the cell coverage and the quality of exocervical sample. Groups were formed according to the exocervical extended technique. Cytology was processed with Papanicolaou technique and reported according to Bethesda System by three observers. Z-test, chi-squared test, Anova and relative risk were used as statistical methods. RESULTS: The sample size was 213 smears, 71 per group. The inadequate cellular coverage was 2.75 times more frequent with the circular extended technique than with the one we proposed. The exocervical sample quality complies with circular technique; however, with the new tecnique increases 1.5 times (p < 0.05). CONCLUSIONS: The proposed widespread technique allows greater possibilities of exocervical cell coverage, ensuring quality-cellularity and decreasing the amount of inadequate smears.

INTRODUCCIÓN: en el Instituto Mexicano del Seguro Social, la muestra del frotis del cuello uterino se extiende en el portaobjetos mediante movimientos circulares (técnica habitual) desde el año de 1962. En 2006, la Secretaría de Salud estableció que el extendido exocervical se realizara de forma longitudinal (técnica convencional). El objetivo de la investigación que se presenta fue evaluar la eficacia y calidad de la técnica de extendido exocervical habitual, convencional y una nueva que se propone. MÉTODOS: estudio cuasiexperimental en mujeres que solicitaron prueba citológica cervical. Las variables analizadas fueron técnica de extendido, cobertura celular y calidad de la muestra exocervical. Se conformaron grupos según la técnica que se aplicó. Los estudios citológicos fueron procesados con técnica de Papanicolaou y los resultados fueron informados por tres observadores conforme al sistema Bethesda. Se utilizó prueba Z, ?2, Anova y riesgo relativo. RESULTADOS: la muestra estuvo integrada por 213 frotis (71 por cada grupo de estudio). Con la técnica de extendido circular, la cobertura celular inadecuada fue 2.75 veces más frecuente que con la propuesta. Si bien la calidad de la muestra exocervical fue adecuada con la técnica circular, con la de extendido que se propone se incrementó 1.5 veces (p < 0.05). CONCLUSIONES: la técnica de extendido que se propone permite mayores posibilidades de cobertura celular exocervical, asegura muestra celular de calidad y disminuye cantidad de citologías inadecuadas.

Contenidos de plomo y estaño en leche evaporada durante el almacenamiento / Lead and tin content in evaporated milk during storage

Se estudiaron las concentraciones de plomo y estaño en leche evaporada almacenada en envases de hojalata estañada con el interior en blanco durante 12 meses a temperatura ambiente. Adicionalmente se estudió el efecto de guardar la leche en refrigeración en el propio envase después de abierto. Los resultados se comparan con las especificaciones máximas establecidas en Cuba. Se concluye que el producto almacenado a temperatura ambiente cumple las especificaciones, pero al mantenerlo en el envase de hojalata abierto en refrigeración incrementa notablemente las concentraciones de estaño

Validez interna del diseño curricular: régimen anual de la Ecuela de Medicina Valencia Facultad de Ciencias de la Salud Universidad de Carabobo / Internal validity of the curriculum design: annual regime of the School of Medicine Valencia Faculty of Health Sciences Carabobo University

La presente investigación de tipo descriptivo documental fue realizada por la comisión Curricular de la Escuela de Medicina-Valencia, con la finalidad de obtener la aproximación al diagnóstico de la Validez Interna del Diseño Curricular de la Escuela de Medicina para el régimen anual. Se determinó la relación existente entre el perfil, Plan de Estudios y Programas, su vigencia y prosperidad. La metodología utilizada fue el modelo de Investigación, Desarrollo, Control y Ajuste Permanente del Curriculum. Castro Pereira Manuel (1981). El análisis del Plan de Estudios se obtuvo a partir de la revisión de documentos escritos, de acuerdo a lo previsto en el modelo. Esta revisión se centró en los programas elaborados por las diferentes asignaturas de los Departamentos y aprobados por la Comisión Curricular de la Escuela y son los que están utilizando en la actualidad. El diagnóstico aproximado del Plan de Estudios revela: 1) Ausencia de articulación horizontal y vertical entre Perfil, Plan y Programas. 2) Ausencia del principio de complejidad creciente del aprendizaje. 3)saltos y vacíos entre los años, en lo que se refiere a las características del perfil tanto del ser como del hacer, esto no permite una secuencia lógica pedagógica ni andragógica. 4) El número de horas del Plan de Estudios anuales y totales para la carrera supera al establecido por el Consejo Nacional de Universidades

Variables epidemiológicas relacionadas con patologia de mama en el hospital gineco-obstetrico provincial docente "Mariana Grajales": Villa Clara, 2000-2003 / Epidemiological variables related to breast pathologies in Mariana Grajales Gineco-Obstetrics Provincial teaching Hospital: Villa Clara Province 2000-2003

Se realizó un estudio retrospectivo y explicativo en la consulta de Patología de Mama del Hospital Provincial Gineco- Obstétrico "Mariana Grajales" de Santa Clara durante un período de cuatro años. El propósito general fue profundizar en algunos factores de riesgo que influyen en las enfermedades de la mama. Se encuestaron mediante formularios 1100 pacientes. Divididas en tres grupos: 473 pacientes con diagnóstico de EBM. 77 pacientes con CM y 550 pacientes sin patologia mamaria, predominando el diagnostico de enfermedades benignas. Los FR. que incidieron en el CM fueron la edad por encima de 40 años, raza blanca, residencia urbana, menarquia antes de los 12 años, la nuliparidad o haber tenido un solo parto despues de los 31 años de edad, la no lactancia materma y la historia familiar positiva de CM En el caso de las EBM. La edad entre 30-49 años y mujeres blancas que viven en la ciudad, el resto de los factores de riesgos estudiados no tuvieron gran significación en estas pacientes. Se evidenció en general un pobre conocimiento y realización del antoexamen de mamas, por lo que se recomienda multipliear las actividades educativas an la población femenina teniendo an cuenta no solo al componente cognitivo sino afectivo de estas patologÝas