Detalles de la búsqueda
1.
Role for gene conversion in the evolution of cell-surface antigens of the malaria parasite Plasmodium falciparum.
PLoS Biol
; 22(3): e3002507, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38451924
2.
Exploring bacterial diversity via a curated and searchable snapshot of archived DNA sequences.
PLoS Biol
; 19(11): e3001421, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34752446
3.
Detection of simple and complex de novo mutations with multiple reference sequences.
Genome Res
; 30(8): 1154-1169, 2020 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32817236
4.
Genomic Sequencing from Sputum for Tuberculosis Disease Diagnosis, Lineage Determination, and Drug Susceptibility Prediction.
J Clin Microbiol
; 61(3): e0157822, 2023 03 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36815861
5.
ReadItAndKeep: rapid decontamination of SARS-CoV-2 sequencing reads.
Bioinformatics
; 38(12): 3291-3293, 2022 06 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35551365
6.
Benchmarking the empirical accuracy of short-read sequencing across the M. tuberculosis genome.
Bioinformatics
; 38(7): 1781-1787, 2022 03 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35020793
7.
Drug-Resistant Tuberculosis in Pet Ring-Tailed Lemur, Madagascar.
Emerg Infect Dis
; 27(3): 977-979, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33624579
8.
Prediction of Susceptibility to First-Line Tuberculosis Drugs by DNA Sequencing.
N Engl J Med
; 379(15): 1403-1415, 2018 10 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30280646
9.
REINDEER: efficient indexing of k-mer presence and abundance in sequencing datasets.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i177-i185, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657392
10.
Using reference-free compressed data structures to analyze sequencing reads from thousands of human genomes.
Genome Res
; 27(2): 300-309, 2017 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27986821
11.
A reference data set of 5.4 million phased human variants validated by genetic inheritance from sequencing a three-generation 17-member pedigree.
Genome Res
; 27(1): 157-164, 2017 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27903644
12.
SNP-IT Tool for Identifying Subspecies and Associated Lineages of Mycobacterium tuberculosis Complex.
Emerg Infect Dis
; 25(3): 482-488, 2019 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30789126
13.
Indels, structural variation, and recombination drive genomic diversity in Plasmodium falciparum.
Genome Res
; 26(9): 1288-99, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27531718
14.
Integrating long-range connectivity information into de Bruijn graphs.
Bioinformatics
; 34(15): 2556-2565, 2018 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29554215
15.
Machine learning for classifying tuberculosis drug-resistance from DNA sequencing data.
Bioinformatics
; 34(10): 1666-1671, 2018 05 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29240876
16.
Accuracy of Different Bioinformatics Methods in Detecting Antibiotic Resistance and Virulence Factors from Staphylococcus aureus Whole-Genome Sequences.
J Clin Microbiol
; 56(9)2018 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29925638
17.
Evaluation of Whole-Genome Sequencing for Mycobacterial Species Identification and Drug Susceptibility Testing in a Clinical Setting: a Large-Scale Prospective Assessment of Performance against Line Probe Assays and Phenotyping.
J Clin Microbiol
; 56(2)2018 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29167290
18.
Binding of Plasmodium falciparum Merozoite Surface Proteins DBLMSP and DBLMSP2 to Human Immunoglobulin M Is Conserved among Broadly Diverged Sequence Variants.
J Biol Chem
; 291(27): 14285-14299, 2016 Jul 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27226583
19.
Same-Day Diagnostic and Surveillance Data for Tuberculosis via Whole-Genome Sequencing of Direct Respiratory Samples.
J Clin Microbiol
; 55(5): 1285-1298, 2017 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28275074
20.
Inferring Strain Mixture within Clinical Plasmodium falciparum Isolates from Genomic Sequence Data.
PLoS Comput Biol
; 12(6): e1004824, 2016 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27362949