Detalles de la búsqueda
1.
The Mycobacterium tuberculosis drugome and its polypharmacological implications.
PLoS Comput Biol
; 6(11): e1000976, 2010 Nov 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21079673
2.
Hierarchical bayesian modeling of pharmacophores in bioinformatics.
Biometrics
; 67(2): 611-9, 2011 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20618307
3.
ReverseScreen3D: a structure-based ligand matching method to identify protein targets.
J Chem Inf Model
; 51(3): 624-34, 2011 Mar 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21361385
4.
A machine learning-based method to improve docking scoring functions and its application to drug repurposing.
J Chem Inf Model
; 51(2): 408-19, 2011 Feb 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21291174
5.
Toward the discovery of functional transthyretin amyloid inhibitors: application of virtual screening methods.
J Chem Inf Model
; 50(10): 1806-20, 2010 Oct 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20883031
6.
LigMatch: a multiple structure-based ligand matching method for 3D virtual screening.
J Chem Inf Model
; 49(9): 2056-66, 2009 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19685924
7.
An evaluation of automated homology modelling methods at low target template sequence similarity.
Bioinformatics
; 23(15): 1901-8, 2007 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17510171
8.
Structure-based evaluation of in silico predictions of protein-protein interactions using Comparative Docking.
Bioinformatics
; 23(5): 573-81, 2007 Mar 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-17237047
9.
SitesBase: a database for structure-based protein-ligand binding site comparisons.
Nucleic Acids Res
; 34(Database issue): D231-4, 2006 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16381853
10.
Identification of the REST regulon reveals extensive transposable element-mediated binding site duplication.
Nucleic Acids Res
; 34(14): 3862-77, 2006.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16899447
11.
Identification and characterisation of the angiotensin converting enzyme-3 (ACE3) gene: a novel mammalian homologue of ACE.
BMC Genomics
; 8: 194, 2007 Jun 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17597519
12.
Fold independent structural comparisons of protein-ligand binding sites for exploring functional relationships.
J Mol Biol
; 355(5): 1112-24, 2006 Feb 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16359705
13.
Ligand binding: functional site location, similarity and docking.
Curr Opin Struct Biol
; 13(3): 389-95, 2003 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-12831892
14.
Methods for the prediction of protein-ligand binding sites for structure-based drug design and virtual ligand screening.
Curr Protein Pept Sci
; 7(5): 395-406, 2006 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17073692
15.
Correction to "Machine learning-based method to improve docking scoring functions and its application to drug repurposing".
J Chem Inf Model
; 51(5): 1195-7, 2011 May 23.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21526828
16.
Identification of critical active-site residues in angiotensin-converting enzyme-2 (ACE2) by site-directed mutagenesis.
FEBS J
; 272(14): 3512-20, 2005 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16008552
17.
Towards a structural classification of phosphate binding sites in protein-nucleotide complexes: an automated all-against-all structural comparison using geometric matching.
Proteins
; 56(2): 250-60, 2004 Aug 01.
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| MEDLINE | ID: mdl-15211509
18.
BAYESIAN ALIGNMENT OF SIMILARITY SHAPES.
Ann Appl Stat
; 7(2): 989-1009, 2013.
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| MEDLINE | ID: mdl-24052809
19.
Configurational preferences of arylamide α-helix mimetics via alchemical free energy calculations of relative binding affinities.
J Phys Chem B
; 116(35): 10856-69, 2012 Sep 06.
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| MEDLINE | ID: mdl-22920218
20.
Modeling of arylamide helix mimetics in the p53 peptide binding site of hDM2 suggests parallel and anti-parallel conformations are both stable.
PLoS One
; 7(8): e43253, 2012.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22916232