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1.
Nat Commun ; 12(1): 5932, 2021 10 11.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34635656

RESUMEN

Domestic ducks are raised for meat, eggs and feather down, and almost all varieties are descended from the Mallard (Anas platyrhynchos). Here, we report chromosome-level high-quality genome assemblies for meat and laying duck breeds, and the Mallard. Our new genomic databases contain annotations for thousands of new protein-coding genes and recover a major percentage of the presumed "missing genes" in birds. We obtain the entire genomic sequences for the C-type lectin (CTL) family members that regulate eggshell biomineralization. Our population and comparative genomics analyses provide more than 36 million sequence variants between duck populations. Furthermore, a mutant cell line allows confirmation of the predicted anti-adipogenic function of NR2F2 in the duck, and uncovered mutations specific to Pekin duck that potentially affect adipose deposition. Our study provides insights into avian evolution and the genetics of oviparity, and will be a rich resource for the future genetic improvement of commercial traits in the duck.


Asunto(s)
Adipogénesis/genética , Proteínas Aviares/genética , Factor de Transcripción COUP II/genética , Patos/genética , Genoma , Lectinas Tipo C/genética , Tejido Adiposo/citología , Tejido Adiposo/metabolismo , Animales , Proteínas Aviares/clasificación , Proteínas Aviares/metabolismo , Cruzamiento , Factor de Transcripción COUP II/metabolismo , Domesticación , Cáscara de Huevo/metabolismo , Femenino , Perfilación de la Expresión Génica , Regulación de la Expresión Génica , Ontología de Genes , Lectinas Tipo C/metabolismo , Metabolismo de los Lípidos/genética , Masculino , Anotación de Secuencia Molecular , Mutación , Cigoto/metabolismo
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