Detalles de la búsqueda
1.
Chromosome structure modeling tools and their evaluation in bacteria.
Brief Bioinform
; 25(2)2024 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38385874
2.
EVRC: reconstruction of chromosome 3D structure models using error-vector resultant algorithm with clustering coefficient.
Bioinformatics
; 39(11)2023 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37847746
3.
Independent Component Analysis Reveals the Transcriptional Regulatory Modules in Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110.
Int J Mol Sci
; 24(16)2023 Aug 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37628727
4.
Computationally Reconstructed Interactome of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA110 Reveals Novel Functional Modules and Protein Hubs for Symbiotic Nitrogen Fixation.
Int J Mol Sci
; 22(21)2021 Nov 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34769335
5.
EVR: reconstruction of bacterial chromosome 3D structure models using error-vector resultant algorithm.
BMC Genomics
; 20(1): 738, 2019 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31615397
6.
Are protein hubs faster folders? Exploration based on Escherichia coli proteome.
Amino Acids
; 48(12): 2747-2753, 2016 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27515434
7.
Molecular mechanisms of adaptation emerging from the physics and evolution of nucleic acids and proteins.
Nucleic Acids Res
; 42(5): 2879-92, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24371267
8.
Spatial features for Escherichia coli genome organization.
BMC Genomics
; 16: 37, 2015 Feb 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25652224
9.
Reconstruction of the genome-scale metabolic network model of Sinorhizobium fredii CCBAU45436 for free-living and symbiotic states.
Front Bioeng Biotechnol
; 12: 1377334, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38590605
10.
OptoCRISPRi-HD: Engineering a Bacterial Green-Light-Activated CRISPRi System with a High Dynamic Range.
ACS Synth Biol
; 12(6): 1708-1715, 2023 06 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37217315
11.
Chemical basis of metabolic network organization.
PLoS Comput Biol
; 7(10): e1002214, 2011 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22022254
12.
The Spatial Organization of Bacterial Transcriptional Regulatory Networks.
Microorganisms
; 10(12)2022 Nov 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36557619
13.
Exploring the common molecular basis for the universal DNA mutation bias: revival of Löwdin mutation model.
Biochem Biophys Res Commun
; 409(3): 367-71, 2011 Jun 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21586276
14.
Defective chromatin architectures in embryonic stem cells derived from somatic cell nuclear transfer impair their differentiation potentials.
Cell Death Dis
; 12(12): 1085, 2021 11 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34785659
15.
Spatial organization of the transcriptional regulatory network of Saccharomyces cerevisiae.
FEBS Lett
; 593(8): 876-884, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30908624
16.
Phosphates as Energy Sources to Expand Metabolic Networks.
Life (Basel)
; 9(2)2019 May 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31121973
17.
How does gene expression level contribute to thermophilic adaptation of prokaryotes? An exploration based on predictors.
Gene
; 421(1-2): 32-6, 2008 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18621118
18.
Reannotation of hypothetical ORFs in plant pathogen Erwinia carotovora subsp. atroseptica SCRI1043.
FEBS J
; 275(1): 198-206, 2008 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18067578
19.
Characters of very ancient proteins.
Biochem Biophys Res Commun
; 366(3): 607-11, 2008 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18073136
20.
What determines protein folding type? An investigation of intrinsic structural properties and its implications for understanding folding mechanisms.
J Mol Biol
; 370(3): 439-48, 2007 Jul 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17524416