Detalles de la búsqueda
1.
Efficient mapping of accurate long reads in minimizer space with mapquik.
Genome Res
; 33(7): 1188-1197, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37399256
2.
Assembler artifacts include misassembly because of unsafe unitigs and underassembly because of bidirected graphs.
Genome Res
; 2022 Jul 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35896425
3.
Data structures based on k-mers for querying large collections of sequencing data sets.
Genome Res
; 31(1): 1-12, 2021 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33328168
4.
Markov chains improve the significance computation of overlapping genome annotations.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i203-i211, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758770
5.
The minimizer Jaccard estimator is biased and inconsistent.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i169-i176, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758786
6.
The K-mer File Format: a standardized and compact disk representation of sets of k-mers.
Bioinformatics
; 38(18): 4423-4425, 2022 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35904548
7.
Whole-genome sequence and assembly of the Javan gibbon (Hylobates moloch).
J Hered
; 114(1): 35-43, 2023 03 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36146896
8.
Dynamic evolution of great ape Y chromosomes.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(42): 26273-26280, 2020 10 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33020265
9.
Recombination Marks the Evolutionary Dynamics of a Recently Endogenized Retrovirus.
Mol Biol Evol
; 38(12): 5423-5436, 2021 12 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34480565
10.
What do Eulerian and Hamiltonian cycles have to do with genome assembly?
PLoS Comput Biol
; 17(5): e1008928, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34014915
11.
Dosage regulation, and variation in gene expression and copy number of human Y chromosome ampliconic genes.
PLoS Genet
; 15(9): e1008369, 2019 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31525193
12.
Modeling biological problems in computer science: a case study in genome assembly.
Brief Bioinform
; 20(4): 1376-1383, 2019 07 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29394324
13.
Improved representation of sequence bloom trees.
Bioinformatics
; 36(3): 721-727, 2020 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31504157
14.
Ten Simple Rules for writing algorithmic bioinformatics conference papers.
PLoS Comput Biol
; 16(4): e1007742, 2020 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32240173
15.
Y and W Chromosome Assemblies: Approaches and Discoveries.
Trends Genet
; 33(4): 266-282, 2017 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28236503
16.
Toward fast and accurate SNP genotyping from whole genome sequencing data for bedside diagnostics.
Bioinformatics
; 35(3): 415-420, 2019 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30032192
17.
DiscoverY: a classifier for identifying Y chromosome sequences in male assemblies.
BMC Genomics
; 20(1): 641, 2019 Aug 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31399045
18.
A time- and cost-effective strategy to sequence mammalian Y Chromosomes: an application to the de novo assembly of gorilla Y.
Genome Res
; 26(4): 530-40, 2016 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26934921
19.
RecoverY: k-mer-based read classification for Y-chromosome-specific sequencing and assembly.
Bioinformatics
; 34(7): 1125-1131, 2018 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29194476
20.
Correcting palindromes in long reads after whole-genome amplification.
BMC Genomics
; 19(1): 798, 2018 Nov 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30400848