Detalles de la búsqueda
1.
De novo design of a fluorescence-activating ß-barrel.
Nature
; 561(7724): 485-491, 2018 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30209393
2.
Benchmarking applicability of medium-resolution cryo-EM protein structures for structure-based drug design.
J Comput Chem
; 44(14): 1360-1368, 2023 05 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36847771
3.
Improved protein structure prediction using predicted interresidue orientations.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(3): 1496-1503, 2020 01 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31896580
4.
Pseudo-Isolated α-Helix Platform for the Recognition of Deep and Narrow Targets.
J Am Chem Soc
; 144(34): 15519-15528, 2022 08 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35972994
5.
Protein oligomer modeling guided by predicted interchain contacts in CASP14.
Proteins
; 89(12): 1824-1833, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34324224
6.
Protein tertiary structure prediction and refinement using deep learning and Rosetta in CASP14.
Proteins
; 89(12): 1722-1733, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34331359
7.
Efficient consideration of coordinated water molecules improves computational protein-protein and protein-ligand docking discrimination.
PLoS Comput Biol
; 16(9): e1008103, 2020 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32956350
8.
Protein homology model refinement by large-scale energy optimization.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 115(12): 3054-3059, 2018 03 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29507254
9.
High-accuracy refinement using Rosetta in CASP13.
Proteins
; 87(12): 1276-1282, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31325340
10.
Protein structure prediction using Rosetta in CASP12.
Proteins
; 86 Suppl 1: 113-121, 2018 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28940798
11.
Automatic structure prediction of oligomeric assemblies using Robetta in CASP12.
Proteins
; 86 Suppl 1: 283-291, 2018 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28913931
12.
GalaxyGPCRloop: Template-Based and Ab Initio Structure Sampling of the Extracellular Loops of G-Protein-Coupled Receptors.
J Chem Inf Model
; 58(6): 1234-1243, 2018 06 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29786430
13.
CASP11 refinement experiments with ROSETTA.
Proteins
; 84 Suppl 1: 314-22, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26205421
14.
Structure prediction using sparse simulated NOE restraints with Rosetta in CASP11.
Proteins
; 84 Suppl 1: 181-8, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26857542
15.
GalaxyRefine: Protein structure refinement driven by side-chain repacking.
Nucleic Acids Res
; 41(Web Server issue): W384-8, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23737448
16.
Blind prediction of interfacial water positions in CAPRI.
Proteins
; 82(4): 620-32, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24155158
17.
GalaxyGemini: a web server for protein homo-oligomer structure prediction based on similarity.
Bioinformatics
; 29(8): 1078-80, 2013 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23413437
18.
GalaxyWEB server for protein structure prediction and refinement.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W294-7, 2012 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22649060
19.
Protein Ensemble Generation Through Variational Autoencoder Latent Space Sampling.
J Chem Theory Comput
; 20(7): 2689-2695, 2024 Apr 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38547871
20.
Community-wide evaluation of methods for predicting the effect of mutations on protein-protein interactions.
Proteins
; 81(11): 1980-7, 2013 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23843247