Detalles de la búsqueda
1.
OrthoMaM v12: a database of curated single-copy ortholog alignments and trees to study mammalian evolutionary genomics.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D529-D535, 2024 Jan 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37843103
2.
A new comprehensive annotation of leucine-rich repeat-containing receptors in rice.
Plant J
; 108(2): 492-508, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34382706
3.
OrthoMaM v10: Scaling-Up Orthologous Coding Sequence and Exon Alignments with More than One Hundred Mammalian Genomes.
Mol Biol Evol
; 36(4): 861-862, 2019 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30698751
4.
MACSE v2: Toolkit for the Alignment of Coding Sequences Accounting for Frameshifts and Stop Codons.
Mol Biol Evol
; 35(10): 2582-2584, 2018 10 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30165589
5.
The genetic map comparator: a user-friendly application to display and compare genetic maps.
Bioinformatics
; 33(9): 1387-1388, 2017 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28453680
6.
Epistatic determinism of durum wheat resistance to the wheat spindle streak mosaic virus.
Theor Appl Genet
; 130(7): 1491-1505, 2017 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28451771
7.
Inferring incomplete lineage sorting, duplications, transfers and losses with reconciliations.
J Theor Biol
; 432: 1-13, 2017 11 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28801222
8.
Inferring gene duplications, transfers and losses can be done in a discrete framework.
J Math Biol
; 72(7): 1811-44, 2016 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26337177
9.
A fast method for calculating reliable event supports in tree reconciliations via Pareto optimality.
BMC Bioinformatics
; 16: 384, 2015 Nov 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26573665
10.
USI: a fast and accurate approach for conceptual document annotation.
BMC Bioinformatics
; 16: 83, 2015 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25887746
11.
OrthoMaM v8: a database of orthologous exons and coding sequences for comparative genomics in mammals.
Mol Biol Evol
; 31(7): 1923-8, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24723423
12.
Exploring the space of gene/species reconciliations with transfers.
J Math Biol
; 71(5): 1179-209, 2015 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25502987
13.
Less is more in mammalian phylogenomics: AT-rich genes minimize tree conflicts and unravel the root of placental mammals.
Mol Biol Evol
; 30(9): 2134-44, 2013 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23813978
14.
Impact of recurrent gene duplication on adaptation of plant genomes.
BMC Plant Biol
; 14: 151, 2014 May 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24884640
15.
Sequencing of the smallest Apicomplexan genome from the human pathogen Babesia microti.
Nucleic Acids Res
; 40(18): 9102-14, 2012 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22833609
16.
Multiomics analysis reveals B. MO1 as a distinct Babesia species and provides insights into its evolution and virulence.
bioRxiv
; 2024 Jan 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38293033
17.
Reconciliation-based detection of co-evolving gene families.
BMC Bioinformatics
; 14: 332, 2013 Nov 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24252193
18.
Disentangling homeologous contigs in allo-tetraploid assembly: application to durum wheat.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 15: S15, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24564644
19.
Efficient selection of branch-specific models of sequence evolution.
Mol Biol Evol
; 29(7): 1861-74, 2012 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22319139
20.
Contrasting GC-content dynamics across 33 mammalian genomes: relationship with life-history traits and chromosome sizes.
Genome Res
; 20(8): 1001-9, 2010 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20530252