Detalles de la búsqueda
1.
Comprehensive evaluation of peptide de novo sequencing tools for monoclonal antibody assembly.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36545804
2.
Multi-Cell Line Analysis of Lysosomal Proteomes Reveals Unique Features and Novel Lysosomal Proteins.
Mol Cell Proteomics
; 22(3): 100509, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36791992
3.
MpoxRadar: a worldwide MPXV genomic surveillance dashboard.
Nucleic Acids Res
; 51(W1): W331-W337, 2023 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37167010
4.
Deep learning-based real-time detection of novel pathogens during sequencing.
Brief Bioinform
; 22(6)2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34297793
5.
ReadBouncer: precise and scalable adaptive sampling for nanopore sequencing.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i153-i160, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758774
6.
Detecting DNA of novel fungal pathogens using ResNets and a curated fungi-hosts data collection.
Bioinformatics
; 38(Suppl_2): ii168-ii174, 2022 09 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36124807
7.
DrDimont: explainable drug response prediction from differential analysis of multi-omics networks.
Bioinformatics
; 38(Suppl_2): ii113-ii119, 2022 09 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36124784
8.
CovRadar: continuously tracking and filtering SARS-CoV-2 mutations for genomic surveillance.
Bioinformatics
; 38(17): 4223-4225, 2022 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35799354
9.
multiFLEX-LF: A Computational Approach to Quantify the Modification Stoichiometries in Label-Free Proteomics Data Sets.
J Proteome Res
; 21(4): 899-909, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35086334
10.
Predicting bacterial virulence factors - evaluation of machine learning and negative data strategies.
Brief Bioinform
; 21(5): 1596-1608, 2020 09 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32978619
11.
MegaGO: A Fast Yet Powerful Approach to Assess Functional Gene Ontology Similarity across Meta-Omics Data Sets.
J Proteome Res
; 20(4): 2083-2088, 2021 04 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33661648
12.
DeePaC: predicting pathogenic potential of novel DNA with reverse-complement neural networks.
Bioinformatics
; 36(1): 81-89, 2020 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31298694
13.
ganon: precise metagenomics classification against large and up-to-date sets of reference sequences.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i12-i20, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657362
14.
Systems-level Analysis Reveals Multiple Modulators of Epithelial-mesenchymal Transition and Identifies DNAJB4 and CD81 as Novel Metastasis Inducers in Breast Cancer.
Mol Cell Proteomics
; 18(9): 1756-1771, 2019 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31221721
15.
Improving tuberculosis surveillance by detecting international transmission using publicly available whole genome sequencing data.
Euro Surveill
; 26(2)2021 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33446303
16.
TaxIt: An Iterative Computational Pipeline for Untargeted Strain-Level Identification Using MS/MS Spectra from Pathogenic Single-Organism Samples.
J Proteome Res
; 19(6): 2501-2510, 2020 06 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32362126
17.
Connecting MetaProteomeAnalyzer and PeptideShaker to Unipept for Seamless End-to-End Metaproteomics Data Analysis.
J Proteome Res
; 19(8): 3562-3566, 2020 08 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32431147
18.
Evaluating de novo sequencing in proteomics: already an accurate alternative to database-driven peptide identification?
Brief Bioinform
; 19(5): 954-970, 2018 09 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28369237
19.
Where did you come from, where did you go: Refining metagenomic analysis tools for horizontal gene transfer characterisation.
PLoS Comput Biol
; 15(7): e1007208, 2019 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31335917
20.
Computational pan-genome mapping and pairwise SNP-distance improve detection of Mycobacterium tuberculosis transmission clusters.
PLoS Comput Biol
; 15(12): e1007527, 2019 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31815935