Detalles de la búsqueda
1.
Using NMR diffusion data to validate MD models of disordered proteins: Test case of N-terminal tail of histone H4.
Biophys J
; 123(1): 80-100, 2024 01 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37990496
2.
X-ray Crystallography Module in MD Simulation Program Amber 2023. Refining the Models of Protein Crystals.
J Chem Inf Model
; 64(1): 18-25, 2024 Jan 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38147516
3.
Conformational and Interaction Landscape of Histone H4 Tails in Nucleosomes Probed by Paramagnetic NMR Spectroscopy.
J Am Chem Soc
; 145(46): 25478-25485, 2023 11 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37943892
4.
Insights into Ubiquitin Product Release in Hydrolysis Catalyzed by the Bacterial Deubiquitinase SdeA.
Biochemistry
; 60(8): 584-596, 2021 03 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33583181
5.
The Role of Rotational Motion in Diffusion NMR Experiments on Supramolecular Assemblies: Application to Sup35NM Fibrils.
Angew Chem Int Ed Engl
; 60(28): 15445-15451, 2021 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33891789
6.
Histone H4 Tails in Nucleosomes: a Fuzzy Interaction with DNA.
Angew Chem Int Ed Engl
; 60(12): 6480-6487, 2021 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33522067
7.
What Drives 15N Spin Relaxation in Disordered Proteins? Combined NMR/MD Study of the H4 Histone Tail.
Biophys J
; 115(12): 2348-2367, 2018 12 18.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30527335
8.
Toward a proper interpretation of hydrogen exchange data in disordered proteins.
Biophys J
; 120(18): 3855-3856, 2021 09 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34416173
9.
Role of Electrostatic Interactions in Binding of Peptides and Intrinsically Disordered Proteins to Their Folded Targets: 2. The Model of Encounter Complex Involving the Double Mutant of the c-Crk N-SH3 Domain and Peptide Sos.
Biochemistry
; 55(12): 1784-800, 2016 Mar 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26910732
10.
Role of electrostatic interactions in binding of peptides and intrinsically disordered proteins to their folded targets. 1. NMR and MD characterization of the complex between the c-Crk N-SH3 domain and the peptide Sos.
Biochemistry
; 53(41): 6473-95, 2014 Oct 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25207671
11.
CP-HISQC: a better version of HSQC experiment for intrinsically disordered proteins under physiological conditions.
J Biomol NMR
; 58(3): 175-92, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24496557
12.
Simulating diffraction photographs based on molecular dynamics trajectories of a protein crystal: a new option to examine structure-solving strategies in protein crystallography.
IUCrJ
; 10(Pt 1): 16-26, 2023 01 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36598499
13.
Aromatic ring flips in differently packed ubiquitin protein crystals from MAS NMR and MD.
J Struct Biol X
; 7: 100079, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36578472
14.
Microsecond time-scale conformational exchange in proteins: using long molecular dynamics trajectory to simulate NMR relaxation dispersion data.
J Am Chem Soc
; 134(5): 2555-62, 2012 Feb 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22206299
15.
Very large residual dipolar couplings from deuterated ubiquitin.
J Biomol NMR
; 54(1): 53-67, 2012 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22828737
16.
Modeling a unit cell: crystallographic refinement procedure using the biomolecular MD simulation platform Amber.
IUCrJ
; 9(Pt 1): 114-133, 2022 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35059216
17.
Effect of rotation in NMR diffusion experiments on micron-sized particles: A generalized theoretical treatment.
J Magn Reson
; 344: 107303, 2022 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36242795
18.
Motion of a disordered polypeptide chain as studied by paramagnetic relaxation enhancements, 15N relaxation, and molecular dynamics simulations: how fast is segmental diffusion in denatured ubiquitin?
J Am Chem Soc
; 133(37): 14614-28, 2011 Sep 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21819149
19.
Domain cooperativity in multidomain proteins: what can we learn from molecular alignment in anisotropic media?
J Biomol NMR
; 51(1-2): 131-50, 2011 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21947922
20.
Comparison of solid-state dipolar couplings and solution relaxation data provides insight into protein backbone dynamics.
J Am Chem Soc
; 132(14): 5015-7, 2010 Apr 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20297847