RESUMEN
The mec-independent oxacillin non-susceptible S. aureus (MIONSA) strains represent a great clinical challenge, as they are not easily detected and can lead to treatment failure. However, the responsible molecular mechanisms are still very little understood. Here, we studied four clinical ST8-MSSA-t024 isolates recovered during the course of antibiotic treatment from a patient suffering successive episodes of bacteremia. The first isolates (SAMS1, SAMS2, and SAMS3) were susceptible to cefoxitin and oxacillin. The last one (SA2) was susceptible to cefoxitin, resistant to oxacillin, lacked mec genes, and had reduced susceptibility to teicoplanin. SA2 showed higher ß-lactamase activity than SAMS1. However, ß-lactamase hyperproduction could not be linked to oxacillin resistance as it was not inhibited by clavulanic acid, and no genetic changes that could account for its hyperproduction were found. Importantly, we hereby report the in vivo acquisition and coexistence of different adaptive mutations in genes associated with peptidoglycan synthesis (pbp2, rodA, stp1, yjbH, and yvqF/vraT), which is possibly related with the development of oxacillin resistance and reduced susceptibility to teicoplanin in SA2. Using three-dimensional models and PBP binding assays, we demonstrated the high contribution of the SA2 PBP2 Ala450Asp mutation to the observed oxacillin resistance phenotype. Our results should be considered as a warning for physicians and microbiologists in the region, as MIONSA detection and treatment represent an important clinical challenge.
RESUMEN
Resumen Se estudió la actividad in vitro de delafloxacina, ciprofloxacina y levofloxacina por los métodos epsilométrico y de difusión por discos frente a 181 aislamientos clínicos de infecciones de piel y osteoarticulares. Se incluyeron 40 Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (SARM), 44 S. aureus sensibles a meticilina (SASM), 46 estafilococos coagulasa negativos (ECN), 23 Klebsiella pneumoniae y 28 Pseudomonas aeruginosa. Las CIM50/CIM90 (mg/l) de delafloxacina, ciprofloxacina y levofloxacina respectivamente fueron 0,004/0,064, 0,25/16 y 0,125/4 frente a SARM; 0,002/0,004, 0,125/0,25 y 0,125/0,25 frente a SASM; 0,008/0,25, 0,125/>32 y 0,25/>32 frente a ECN; 4/>32,>32/>32 y 16/>32 frente a K. pneumoniae y 1/>32, 0,5/>32 y 4/>32 frente a P. aeruginosa. La proporción de aislamientos sensibles a delafloxacina, ciprofloxacina y levofloxacina fue la siguiente: SARM, 97,5%; 82,5% y 82,5%; SASM, 97,7%; 95,5% y 95,5%; ECN, 93,5%; 63,0% y 60,9%; K. pneumoniae, 21,7%; 26,1% y 43,5%; P. aeruginosa, 35,7%; 53,6% y 42,8%. La concordancia categórica del método de difusión por discos y el método epsilométrico para evaluar la actividad in vitro de la delafloxacina fue del 98,8% en S. aureus y del 91,3% en ECN.
Abstract In vitro activities of delafloxacin, ciprofloxacin and levofloxacin were evaluated by epsilometric and disk diffusion methods against 181 bacterial isolates recovered from bone and skin infections. Isolates included were 84 Staphylococcus aureus (40 MRSA and 44 MSSA), 46 coagulase-negative staphylococci (CNS), 23 Klebsiella pneumoniae and 28 Pseudomonas aeruginosa. The MIC50/MIC90 (mg/l) for delafloxacin, ciprofloxacin and levofloxacin, respectively, were: MRSA, 0.004/0.064, 0.25/16 and 0.125/4; MSSA, 0.002/0.004, 0.125/0.25 and 0.125/0.25; CNS, 0.008/0.25, 0.125/>32 and 0.25/>32; K. pneumoniae, 4/>32,>32/>32 and 16/>32; P. aeruginosa, 1/>32, 0,5/>32 and 4/>32. Susceptibilities for delafloxacin, ciprofloxacin and levofloxacin, respectively, were: MRSA, 97.5%, 82.5% and 82.5%; MSSA, 97.7%, 95.5% and 95.5%; CNS, 93.5%, 63.0% and 60.9%; K. pneumoniae, 21.7%, 26.1% and 43.5%; P aeruginosa, 35.7%, 53.6% and 42.8%. The disk diffusion and epsilometric methods were concordant for evaluating in vitro susceptibility in staphylococci (categorical concordance of 98.8% for S. aureus and 91.3% for CNS).
RESUMEN
Resumen La espectrometría de masas (MALDI-TOF MS) permite la identificación de microorganismos directamente de las colonias en pocos minutos. En este estudio se ha desarrollado y evaluado un protocolo reducido para identificar microorganismos directamente de las botellas de hemocultivos positivos en 30 minutos con una alta sensibilidad y especificidad, utilizando MALDITOF. Un total de 2535 hemocultivos positivos fueron estudiados por el método directo de MALDI-TOF MS, a partir de una alícuota de sangre de las botellas y el método de colonia, utilizando los cultivos desarrollados en medios sólidos. Del total de hemocultivos positivos incluidos en este estudio, 2381 (93,9%) fueron monomicrobianos y 146 (5,8%) polimicrobianos. Mil trescientos treinta (55,9%) de los aislamientos correspondieron a cocos gram positivos, 922 (38,7%) a bacilos gram negativos, 60 (2,5%) a anaerobios, 36 (1,5%) a bacilos gram positivos y 13 a levaduras. La concordancia global entre ambos métodos fue del 81,7% a nivel de especie (90,0% para bacilos gram negativos, 76,7% para cocos gram positivos y 33,3% para bacilos gram positivos). Se identificó al menos un germen en el 88% de las botellas positivas con desarrollo polimicrobiano. Los resultados del presente estudio demostraron que el protocolo basado en MALDI-TOF MS permite la identificación microbiana directamente de hemocultivos positivos en un tiempo corto, con una alta precisión, con excepción de los bacilos gram positivos.
Abstract Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) enables the identification of microorganisms directly from colonies within minutes. In this study this technology was adapted and tested for use with blood culture bottles, thus allowing identification in 30 minutes once the blood culture is detected as positive by the automate. A total of 2535 blood culture bottles reported as positive were tested by MALDI-TOF MS directly from positive blood culture bottles and colonies. A total of 2381 (93.9%) and 146 (5.8%) of the positive blood cultures were monomicrobial and polymicrobial, respectively. And 1330 (55.9%), 922 (38.7%), 60 (2.5%), 36 (1.5%) and 13 of the isolates were gram-positive cocci (GPC), gram-negative bacilli (GNB), anaerobic bacteria, gram-positive bacilli (GPB) and yeast respectively. Concordance between both methods was 81.7% (76.7% of GPC, 90% of GNB, 74.2% of anaerobic bacteria and 33.3% of GPB) in monomicrobial cultures. Eighty eight per cent of the polymicrobial cultures were identified correctly in at least one of the two bacteria. The results of the present study show that this fast, MALDI-TOF MS based method allows microbial identification directly from positive blood culture in a short time, with a high accuracy, with the exception of gram-positive bacilli.
Resumo A espectrometria de massa (MALDI-TOF MS) permite a identificação de microorganismos diretamente das colônias em minutos. Nesse estudo, foi desenvolvido um protocolo reduzido para identificar microrganismos diretamente das garrafas de hemoculturas positivas em 30 minutos com alta sensibilidade e especificidade, utilizando MALDI-TOF. Um total de 2535 hemoculturas positivas foram relatadas -o método direto de MALDI-TOF MS, a partir de uma alíquota de sangue dos vidros e o método de colônia, a partir das culturas desenvolvidas em meios sólidos. Do total de hemoculturas positivas incluídas neste estudo, 2.381 (93,9%) eram monomicrobianas e 146 (5,8%) eram polimicrobianas. Mil trezentos e trinta (55,9%) dos isolados corresponderam a cocos gram-positivos, 922 (38,7%) bacilos gram-negativos, 60 (2,5%) anaeróbios, 36 (1,5%) bacilos gram-positivos e 13 leveduras. A concordância geral entre os dois métodos foi de 81,7% em nivel de especie (90,0% para bacilos gram-negativos, 76,7% para cocos gram-positivos e 33,3% para bacilos gram-positivos). Pelo menos um germe foi identificado em 88% dos vidros positivos com desenvolvimento polimicrobiano. Os resultados do presente estudo demonstraram que o protocolo baseado em MALDI-TOF MS permite a identificação microbiana diretamente de hemoculturas positivas em um curto espaço de tempo, com alta precisão, com exceção de bacilos gram-positivos.
Asunto(s)
Espectrometría de Masas , Bacilos Grampositivos , Microbiología , Tecnología , Tiempo , Bacterias , Levaduras , Industria del Vidrio , Sensibilidad y Especificidad , Cocos Grampositivos , Guías como Asunto , Cocos , Espectrometría de Masa por Láser de Matriz Asistida de Ionización Desorción , Cultura , Crecimiento y Desarrollo , Cultivo de Sangre , Rayos Láser , MétodosRESUMEN
Resumen La infección por Clostridioides difficile (ICD) es una de las más importantes infecciones intrahospitalarias. Se realizó un estudio observacional que describe la incidencia, las características epi demiológicas y la evolución clínica de la ICD en un hospital universitario de la Ciudad de Buenos Aires. Los episodios, diagnosticados en 117 pacientes adultos consecutivos entre el 01/01/2017 y el 01/04/2020, fueron clasificados en ICD intrahospitalaria (IH) en 63 (53.9%), de inicio comunitario y asociada al ámbito de la salud (ICAAS) en 25 (21.4%) y comunitaria (CO) en 29 (24.8%) pacientes. La incidencia de ICD IH fue 3.1, 5.2 y 2.8 cada 10 000 días paciente en 2017, 2018 y 2019, respectivamente. El diagnóstico microbiológico se realizó mediante inmunocromatografía con glutamato deshidrogenasa y toxina positivas en 51 (43.6%) y mediante glutamato deshidrogenasa positiva, toxina negativa y PCR positiva en 66 (56.4%). Los pacientes con ICD IH e ICAAS presentaron mayor edad (p = 0.018), mayor frecuencia de insuficiencia renal crónica (p = 0.013) e inmu nosupresión (p = 0.021) y mayor puntaje en índice Charlson de comorbilidad (p = 0.001). No hubo diferencia significativa en la forma de presentación clínica entre los tres grupos. Durante la evolución de la ICD, 13 (11.1%) pacientes requirieron internación en terapia intensiva. Se registraron 10 recurrencias, que correspondieron al 8.5% de los episodios de ICD. La mortalidad a los 90 días fue 19.8%, significativamente mayor en los pacientes con ICD IH e ICAAS (p = 0.014). Estos hallazgos destacan la considerable carga de morbilidad de la ICD y la necesidad de implementar estrategias preventivas.
Abstract Clostridioides difficile infection (CDi) is one of the foremost hospital-acquired infections. We present an observa tional study aimed to describe the incidence, epidemiology, and clinical outcome of CDi in a tertiary university hospital in Buenos Aires. The episodes, diagnosed in 117 consecutive adult patients in the period 01/01/2017 to 01/04/2020, were distributed in three groups: 63 (53.9%) were classified as hospital-acquired infections (HA), 25 (21.4%) as community onset-health care-associated infections (CO-HCA) and 29 (24.8%) as community-associated infections (CA). The incidence of HA CDi infections was 3.1, 5. 2 and 2.8 every 10 000 patient days in 2017, 2018 and 2019, respectively. The microbiological diagnosis was made by immunochromatography with antigen GDH and C. difficile toxin positive in 51 episodes (43.6%) and by GDH positive, toxin negative and PCR positive in 66 episodes (56.4%). Older age (p = 0.018), chronic kidney disease (p = 0.013), immunosuppression (p = 0.021), and higher comorbidity Charlson score (p = 0.001) were observed in patients with IH and CA-HCA infections. No significant differences in clinical features were found among groups. During the hospital st ay, 13 patients (11.1%) required admission to the intensive care unit. Ten recurrences occurred, representing 8.5% of CDI episodes. The 90-day mortality was 19.8%, being significantly higher in HA and CO-HCA infections (p = 0.014). Our findings highlight both the local burden of CDi morbidity and mortality and the need for the implementation of preventive strategies.
RESUMEN
Abstract Anisakidosis is an infection caused by larval nematodes that belong to several genera within the family Anisakidae. Anisakidosis has about 20000 cases reported to date, the vast majority (90%) in Japan. Usually, human anisakiosis is more common than human pseudoterranovosis in Japan and Europe, although in North America Pseudoterranova spp. is the more frequent. Cases of human pseudoterranovosis have been reported from Chile and Peru. We here report one of the few cases of human infection by Pseudoterranova cattani by consumption of ``ceviche'' in Buenos Aires, Argentina.
Resumen La anisakidosis es una infección por larvas de nematodos que pertenecen a varios géneros dentro de la familia Anisakidae. Se han registrado aproximadamente 20.000 casos hasta la fecha, la mayoría (90%) en Japón. En Europa y Japón la anisakidosis es más frecuente en el humano que la pseudoterranovosis. En cambio, en América del Norte es más frecuente la infección humana por Pseudoterranova spp. También se han informado casos de pseudoterranovosis humana en Chile y en Perú. Informamos uno de los pocos casos de infección humana por Pseudoterranova cattani por consumo de ceviche en Buenos Aires, Argentina.
Asunto(s)
Adulto , Animales , Humanos , Masculino , Ascaridoidea , Infecciones por Ascaridida , Alimentos Marinos/parasitología , Enfermedades Transmitidas por los Alimentos/parasitología , ArgentinaRESUMEN
La espectrometría de masas, conocida como matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), es una técnica utilizada en la identificación de microorganismos mediante la creación de un espectro basado en el perfil de proteínas, que es único para una especie dada. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la identificación de aislamientos clínicos de levaduras por MALDI-TOF MS en un hospital universitario de Argentina y analizar 2 procedimientos para la extracción de proteínas: el recomendado por el fabricante del equipo y una técnica abreviada rápida. Utilizando el primero de estos procedimientos se analizaron 201 aislamientos identificados previamente por métodos convencionales y se obtuvo coincidencia en la identificación a nivel de especie en el 95,38% de los aislamientos analizados. Con 100 de estos aislamientos se utilizó, además, el procedimiento abreviado para la extracción de proteínas; se obtuvo una identificación correcta a nivel de género y especie en el 98,0% de ellos. La espectrometría de masas MALDI-TOF MS demostró ser una técnica rápida, sencilla y precisa para la identificación de levaduras
The matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry technique known as MALDI-TOF MS is a tool used for the identification of clinical pathogens by generating a protein spectrum that is unique for a given species. In this study we assessed the identification of clinical yeast isolates by MALDI-TOF MS in a university hospital from Argentina and compared two procedures for protein extraction: a rapid method and a procedure based on the manufacturer's recommendations. A short protein extraction procedure was applied in 100 isolates and the rate of correct identification at genus and species level was 98.0%. In addition, we analyzed 201 isolates, previously identified by conventional methods, using the methodology recommended by the manufacturer and there was 95.38% coincidence in the identification at species level. MALDI TOF MS showed to be a fast, simple and reliable tool for yeast identification
Asunto(s)
Espectrometría de Masas/métodos , Levaduras/aislamiento & purificación , Espectrometría de Masa por Láser de Matriz Asistida de Ionización Desorción/métodos , Proteínas Fúngicas/análisis , Estudio de EvaluaciónRESUMEN
El análisis de espectrometría de masas mediante la metodología hoy conocida como MALDI-TOF MS (Matrix-assited laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) se ha convertido en un recurso de referencia para la identificación de microorganismos en microbiología clínica. No obstante, los datos relativos a algunos grupos de microorganismos son todavía controvertidos. El objetivo del presente estudio fue determinar la utilidad del MALDI-TOF MS para la identificación de aislamientos clínicos de bacterias anaerobias. Se analizaron 106 aislamientos de bacterias anaerobias mediante MALDI-TOF MS y por pruebas bioquímicas convencionales. En aquellos casos en los que la identificación por metodología convencional no era aplicable o frente a una discordancia de resultados entre las metodologías citadas, se realizó la secuenciación del gen 16S del ARNr. El método convencional y el MALDI-TOF MS coincidieron a nivel de género y especie en un 95,3 % de los casos considerando la totalidad de los aislamientos estudiados. Al considerar solo el conjunto de los bacilos gram negativos, la coincidencia fue del 91,4 %; entre los bacilos gram positivos, fue del 100 %; los 8 aislados de cocos gram positivos estudiados coincidieron y también hubo coincidencia en el único coco gram negativo incluido. Los datos obtenidos en este estudio demuestran que el MALDI-TOF MS ofrece la posibilidad de llegar a una adecuada identificación de bacterias anaerobias
The analysis by MALDI-TOF MS (Matrix-assited laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) has become a reference method for the identification of microorganisms in Clinical Microbiology. However, data on some groups of microorganisms are still controversial. The aim of this study is to determine the utility of MALDI-TOF MS for the identification of clinical isolates of anaerobic bacteria. One-hundred and six anaerobic bacteria isolates were analyzed by MALDI-TOF MS and by conventional biochemical tests. In those cases where identification by conventional methodology was not applicable or in the face of discordance between sequencing methodologies, 16 S rRNA gene sequence analysis was performed. The conventional method and MALDI-TOF MS agreed at genus and species level by 95.3 %. Concordance in gram-negative bacilli was 91.4% and 100% among gram-positive bacilli; there was also concordance both in the 8 isolates studied in gram-positive cocci and in the single gram-negative cocci included. The data obtained in this study demonstrate that MALDI-TOF MS offers the possibility of adequate identification of anaerobic bacteria
Asunto(s)
Bacterias Anaerobias/aislamiento & purificación , Espectrometría de Masa por Láser de Matriz Asistida de Ionización Desorción/métodos , Bacterias Anaerobias/clasificación , Técnicas de Tipificación Bacteriana/métodos , Bacterias Anaerobias Gramnegativas/aislamiento & purificación , Bacterias Anaerobias Gramnegativas/clasificaciónRESUMEN
Se investigó el desempeño de diversos métodos fenotípicos para la detección de carbapenemasas KPC en 44 aislamientos de Klebsiella pneumoniae con sensibilidad disminuida a los carbapenems, 30 productores y 14 no productores de KPC. Se determinó la sensibilidad a imipenem, meropenem y ertapenem por dilución en agar y difusión por discos. Se evaluaron los siguientes métodos fenotípicos: sinergia entre discos de carbapenems y discos con los inhibidores amoxicilina/ácido clavulánico (AMC ) y ácido aminofenilborónico (APB); inhibición por "discos combinados" (según una técnica de predifusión diseñada a tal fin en nuestro laboratorio), comparando el efecto de los carbapenems solos o asociados con los inhibidores mencionados; y el test de Hodge modificado, para el cual se propone una lectura cuantificada. El método de Hodge detectó todos los aislamientos KPC positivos con los tres carbapenems evaluados, mientras que fue negativo para todos los aislamientos KPC negativos con imipenem y meropenem, y produjo dos resultados falsos positivos con ertapenem. Cuantificando la lectura de este método se pudieron discriminar objetivamente los resultados verdaderos positivos (≥ 8 mm) de los falsos positivos (< 5 mm). Se observó sinergia entre carbapenems y APB con todos los aislamientos KPC positivos, aunque esto requirió ajustar la distancia entre discos. En los aislamientos KPC negativos no se observó sinergia entre carbapenems y APB. Empleando el método con discos combinados con imipenem o meropenem más APB se detectaron la mayoría de los aislamientos KPC positivos y no se observaron falsos positivos. Por el contrario, las combinaciones carbapenem más AMC no fueron sensibles ni específicas.
We evaluated phenotypic methods for the detection of KPC carbapenemases in 44 clinical isolates of K. pneumoniae having reduced susceptibility to carbapenems, 30 of which were KPC-positive and 14 KPC-negative. Both the agar dilution and disk diffusion methods were performed for imipenem, meropenem and ertapenem. The following phenotypic methods were assayed: the double disk synergy test, using boronic acid or clavulanic acid as inhibitors, "combined" disks of carbapenem plus inhibitor (boronic acid, clavulanic acid and both boronic plus clavulanic acid), by using a pre-diffusion technique and the modified Hodge test. The double disk diffusion test using boronic acid could detect all KPC-positive isolates, but adjustment of disk distance was necessary for achieving such performance. The simulation of combined disks by our pre-diffusion technique detected all KPCpositive strains for all 3 carbapenems when using boronic acid as inhibitor, clavulanic acid was less susceptible and specific as compared with boronic acid. The modified Hodge test using any carbapenem was clearly positive for all KPC-producing isolates. This test was negative for all KPC-negative strains when imipenem or meropenem were used, but 2/14 isolates yielded a weak positive result when using ertapenem. By measuring the enhanced growth of E. coli ATCC 25922 observed in this test, we could objectively discriminate true-positive (≥ 8 mm) from false-positive results (< 5 mm). Our results show that the use of phenotypic methods is effective for the rapid detection of KPC producers in K. pneumoniae isolates with reduced susceptibility to carbapenems.
Asunto(s)
Proteínas Bacterianas/análisis , Proteínas Bacterianas/genética , Klebsiella pneumoniae/enzimología , Klebsiella pneumoniae/genética , beta-Lactamasas/análisis , beta-Lactamasas/genética , FenotipoRESUMEN
Vibrio cholerae no-O1, no-O139 es un agente poco frecuente como causal de bacteriemias y no hay informes que documenten su presencia en pacientes en hemodiálisis crónica. Se describe el caso de una paciente en hemodiálisis crónica que presentó un cuadro de sepsis, por lo cual inició un tratamiento con vancomicina y ceftacidima. Al cabo de seis horas y media de incubación en el sistema BACT/ALERT de hemocultivo, se evidenció la presencia de bacilos curvos gram negativos, posteriormente identificados como Vibrio cholerae mediante pruebas bioquímicas convencionales y el uso de los kits API 20 NE y VITEK 2. La evaluación del serogrupo y de la presencia de factores de patogenicidad, realizada en el laboratorio de referencia, determinó que el microorganismo hallado pertenecía al serogrupo no-O1, no-O139. No se detectó la toxina de cólera, tampoco el factor de colonización ni la toxina termoestable. El aislamiento presentó sensibilidad frente a ampicilina, trimetoprima-sulfametoxazol, ciprofloxacina, tetraciclina, ceftacidima y cefotaxima por el método de difusión con discos y por VITEK 2. La paciente cumplió 14 días de tratamiento con ceftacidima endovenosa, con evolución favorable.
Non-O1, and non-O139 Vibrio cholerae is an infrequent cause of bacteremia. There are no reports of such bacteremia in chronic hemodialysis patients. This work describes the case of a chronic hemodialysis patient that had an episode of septicemia associated with dialysis. Blood cultures were obtained and treatment was begun with vancomycin and ceftazidime. After 6.5 hours of incubation in the Bact/Alert system there is evidence of gram-negative curved bacilli that were identified as Vibrio cholerae by conventional biochemical tests, API 20 NE and the VITEK 2 system. This microorganism was sent to the reference laboratory for evaluation of serogroup and virulence factors and was identified as belonging to the non-O1 and non-O139 serogroup. The cholera toxin, colonization factor and heat-stable toxin were not detected. The isolate was susceptible to ampicillin, trimethoprim-sulfamethoxazole, ciprofloxacin, tetracycline, ceftazidime and cefotaxime by the disk diffusion method and the VITEK 2 system. The patient received intravenous ceftazidime for a 14 day- period and had a favorable outcome.
Asunto(s)
Anciano de 80 o más Años , Femenino , Humanos , Bacteriemia/microbiología , Fallo Renal Crónico/complicaciones , Diálisis Renal , Vibriosis/microbiología , Vibrio cholerae no O1/aislamiento & purificación , Antibacterianos/farmacología , Bacteriemia/complicaciones , Bacteriemia/tratamiento farmacológico , Técnicas de Tipificación Bacteriana/métodos , Ceftazidima/administración & dosificación , Ceftazidima/uso terapéutico , Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple , Nefropatías Diabéticas/complicaciones , Nefropatías Diabéticas/terapia , Huésped Inmunocomprometido , Fallo Renal Crónico/terapia , Pruebas de Sensibilidad Microbiana , Factores de Riesgo , Virulencia , Vancomicina/administración & dosificación , Vancomicina/uso terapéutico , Vibriosis/complicaciones , Vibriosis/tratamiento farmacológico , Vibrio cholerae no O1/efectos de los fármacos , Vibrio cholerae no O1/patogenicidadRESUMEN
Objetivo. Evaluar la capacidad de 17 laboratorios nacionales de referencia que participan en el Programa Latinoamericano de Control de Calidad en Bacteriología y Resistencia a los Antimicrobianos (LA-EQAS) para detectar mecanismos de resistencia emergentes, a saber: resistencia de enterobacterias a carbapenemes por presencia de Klebsiella pneumoniae carbapenemasa (KPC); resistencia de enterobacterias a carbapenemes por presencia de metalobetalactamasas (MBL) tipo IMP, y resistencia intermedia a vancomicina de aislamientos de Staphylococcus aureus (VISA). Métodos. Se enviaron los siguientes tres aislamientos a los 17 laboratorios participantes del LA-EQAS: Klebsiella pneumoniae OPS-161 productor de KPC, Enterobacter cloacae OPS-166 productor de IMP y S. aureus OPS-165 con resistencia intermedia a vancomicina. Se evaluó la interpretación de las pruebas de sensibilidad y detección del mecanismo de resistencia y el tamaño de los halos de inhibición (método de difusión por discos) o valor de la concentración inhibitoria mínima (CIM). Resultados. La concordancia en la detección de los mecanismos de resistencia fue de 76,4%, 73,3% y 66,7% con respecto a la cepas K. pneumoniae OPS-161, E. cloacae OPS-166 y S. aureus OPS-165, respectivamente. La concordancia entre las zonas de inhibición obtenidas por los laboratorios participantes y los rangos establecidos por el laboratorio coordinador fue aceptable en los tres aislamientos, ya que alcanzó 90,8%, 92,8% y 88,9%, respectivamente, para cada cepa. Conclusiones. La concordancia global en la detección de los mecanismos de resistencia KPC, MBL y VISA fue de 72,1%. Consideramos que los laboratorios nacionales de referencia de América Latina son capaces de reconocer estos mecanismos de resistencia emergentes y se espera que en el futuro la concordancia alcance su nivel máximo.
Objective. To evaluate the capability of 17 national reference laboratories participating in the Latin American Quality Control Program in Bacteriology and Antibiotic Resistance (LA-EQAS) to detect emerging resistance mechanisms namely: resistance of enterobacteria to carbapenems due to the presence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) and metallo-beta-lactamase (MBL) type IMP, and intermediate resistance of Staphylococcus aureus isolates to vancomycin (vancomycinintermediate resistant S. aureusVISA). Methods. The following three isolates were sent to the 17 participating LA-EQAS laboratories: KPC-producing Klebsiella pneumoniae PAHO-161, IMP-producing Enterobacter cloacae PAHO-166, and S. aureus PAHO-165 with intermediate resistance to vancomycin. Performance of each of the following operations was evaluated: interpretation of sensitivity tests, detection of the resistance mechanism, and assessment of either inhibition halo size (disk diffusion method) or minimum inhibitory concentration (MIC). Results. Concordance in the detection of resistance mechanisms was 76.4%, 73.3%, and 66.7% for the K. pneumoniae PAHO-161, E. cloacae PAHO-166, and S. aureus PAHO- 165 strains, respectively. Concordance between the inhibition areas observed by the participating laboratories and the ranges established by the coordinating laboratory was acceptable for all three isolates, at 90.8%, 92.8%, and 88.9%, respectively. Conclusions. Overall concordance in on the detection of KPC, MBL, and VISA resistance mechanisms was 72.1%. We consider the national reference laboratories in Latin America capable of recognizing these emerging resistance mechanisms and expect that maximum levels of concordance will be reached in the future.
Asunto(s)
Proteínas Bacterianas/análisis , Farmacorresistencia Microbiana/fisiología , Laboratorios/normas , Ensayos de Aptitud de Laboratorios , beta-Lactamasas/análisis , Farmacorresistencia Microbiana/genética , Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple , Enterobacter cloacae/enzimología , Klebsiella pneumoniae/enzimología , Laboratorios/estadística & datos numéricos , América Latina , Pruebas de Sensibilidad Microbiana/métodos , Pruebas de Sensibilidad Microbiana/normas , Pruebas de Sensibilidad Microbiana , Organización Panamericana de la Salud , Fenotipo , Control de Calidad , Indicadores de Calidad de la Atención de Salud , Estándares de Referencia , Reproducibilidad de los Resultados , Staphylococcus aureus/enzimología , Resistencia a la VancomicinaRESUMEN
Los abscesos cerebrales por Propionibacterium acnes son poco frecuentes. Es importante para el médico clínico la rápida identificación de este patógeno para la elección de una terapéutica antibiótica adecuada. En este caso se describe un paciente con una exéresis de un glioblastoma multiforme donde a los 9 meses se evidenció la existencia de una recidiva tumoral, se efectuó una extirpación tumoral subtotal y la colocación de implantes de quimioterapia en el lecho tumoral residual. Al cabo de un mes de esta reoperación presentó una lesión ocupante compatible con un absceso cerebral, motivo por el cual se realizó nueva craneotomía y drenaje del mismo. En los cultivos de las biopsias y del material purulento se aisló P. acnes como flora única. Para la identificación se realizaron pruebas bioquímicas y se aplicó el sistema API20A. Se determinó la concentración inhibitoria mínima (CIM) a clindamicina, penicilina, amoxicilina y metronidazol, los valores de CIM (ug/ml) obtenidos fueron: 0.250, 0.040, 0.023 y 256, respectivamente. El paciente recibió cefepime más metronidazol por vía endovenosa durante un período de 30 días y completó tratamiento con clindamicina por vía oral durante 60 días, dada la posible complicación ósea en el sitio de la infección. Luego de 8 meses de la intervención quirúrgica y el drenaje del absceso cerebral no hubo evidencia de signos clínicos de recidiva tumoral e infecciosa. P. acnes es un patógeno infrecuente como causal de abscesos cerebrales, sin embargo no se debe desestimar en muestras neuroquirúrgicas.
Brain abscesses by Propionibacterium acnes are rare. The rapid identification of this pathogen is important in order to choice the appropriate antibiotic therapy. We describe the case of a patient with excision of a multiform glioblastoma who 9 months later presented a tumor recurrence. A subtotal tumor excision was made and implants chemotherapy were placed in the residual tumor. After one month of surgery the patient presented a brain abscess. A craniotomy for drainage was performed. P. acnes was isolated from the biopsy and from purulent material. Identification was made by conventional biochemical tests and by the API system 20 A. The Minimum Inhibitory Concentration (MIC) to clindamycin, penicillin, amoxicillin and metronidazole was determined. The values of MIC (ug/ml) obtained were: 0.250, 0.040, 0.023 and 256, respectively. The patient received cefepime and metronidazole intravenously during 30 days and completed treatment with oral clindamycin for 60 days, considering the possibility of adjacent bone involvement. Eight months after the drainage the patient had no evidence of infection or tumor recurrence. Although P. acnes is a rare cause of post-neurosurgical infection, it should be considered as a possible pathogen in postoperative brain abscesses.
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Persona de Mediana Edad , Absceso Encefálico/microbiología , Infecciones por Bacterias Grampositivas/microbiología , Complicaciones Posoperatorias/microbiología , Propionibacterium acnes/aislamiento & purificación , Biopsia , Absceso Encefálico/patología , Absceso Encefálico/terapia , Drenaje , Infecciones por Bacterias Grampositivas/patología , Infecciones por Bacterias Grampositivas/terapia , Complicaciones Posoperatorias/patología , Complicaciones Posoperatorias/terapiaRESUMEN
El laboratorio de microbiología clínica requiere, en cada una de las etapas del procesamiento de las muestras, un adecuado control de calidad. Debido a que no se encuentran disponibles localmente esquemas interlaboratorio que evalúen etapas iniciales del análisis microbiológico, el objetivo del trabajo fue desarrollar y evaluar mediante una "prueba piloto" la utilización de una muestra liofilizada como material de control de aislamiento e identificación de microorganismos. Para la elaboración de la muestra se utilizó un líquido de diálisis peritoneal inoculado con bacilos gram negativos (BGN) y cocos gram positivos (CGP) aislados de muestras clínicas. Las muestras se fraccionaron por 2 mL y se liofilizaron según el protocolo provisto por el ProgBA. Treinta y cuatro laboratorios recibieron un vial de la muestra y una planilla con las instrucciones para su manejo e informe del resultado. La tasa de respuesta fue del 44%. El porcentaje de aciertos en la evaluación microscópica fue 100% y 79% para BGN y CGP respectivamente. El 70% de los laboratorios recuperó e identificó correctamente ambos microorganismos, el 100% recuperó los BGN. Considerando un valor mayor del 80% de concordancia en la recuperación de microorganismos, los resultados obtenidos fueron aceptables para BGN. Este protocolo podría ser utilizado para la preparación de un esquema interlaboratorio a mayor escala.
The microbiology laboratory requires an appropriate quality control in each stage of the sample procedure. To date, interlaboratory studies that evaluate the initial stages of microbiologic analysis procedures have not been reported. The development of a lyophilized sample for isolation control and identification of microorganisms (mo) was performed with that purpose. For the sample's elaboration a peritoneal dialysis liquid was inoculated with gram negative bacilli (GNB) and gram positive cocci (GPC). The samples were divided into 2 mL vials and lyophilized according to the protocol provided by ProgBA. Thirty four laboratories received the sample with instructions for its handling and results report. The rate of response was of 44%. The percentage of success in microscopic evaluation was 100% and 79% for BGN and CGP respectively. Seventy per cent of the laboratories succeeded in isolating and identifying both microorganisms correctly; 100% of them identified the GNB. Considering an 80% of agreement in mo recovery a validity criterion, the results obtained were acceptable for GNB. This protocol could be used for the preparation of an interlaboratory quality control scheme on a greater scale.
Asunto(s)
Control de Calidad , Servicios de Laboratorio Clínico , MicrobiologíaRESUMEN
Regional antimicrobial surveillance programs might help to guide empiric antimicrobial therapy. This study reports the antimicrobial susceptibility patterns of 2198 isolates from bloodstream infections in a period of 1997 to 2002. Susceptibility testing was performed by broth microdilution methods. The most frequent organism was Staphylococcus aureus (23.4%) with an oxacillin-resistance rate of 41.8%. Extended Spectrum Beta Lactamases phenotype was presented in 10.0% of Escherichia coli and 49.4% in Klebsiella pneumoniae isolates. Imipenem and meropenem were active against 74.3% and 84.0% of Acinetobacter spp. and Pseudomonas aeruginosa, respectively. Bacterial resistance continues to be a great problem in Argentinean medical centers.
Asunto(s)
Bacteriemia/diagnóstico , Bacteriemia/microbiología , Bacteriemia/terapia , Bacterias Gramnegativas/aislamiento & purificación , Imipenem , Oxacilina , Staphylococcus aureus/aislamiento & purificación , Streptococcus pneumoniae/aislamiento & purificación , Argentina/epidemiología , Farmacorresistencia Microbiana , Pruebas de Sensibilidad MicrobianaRESUMEN
Introducción. Los enterococos resistentes a vancomicina (ERV) han producido múltiples brotes en unidades de cuidados intensivos (UCI). La contaminación del ambiente hospitalario, manos del personal de salud y pacientes portadores con ERV pueden ejercer un importante papel perpetuando la cadena de transmisión de esos brotes. El objetivo de nuestro trabajo fue caracterizar el primer brote de ERV en nuestra institución y evaluar el papel de la contaminación ambiental y de manos del personal de salud en la diseminación de nuevos casos de portación de ERV. Material y métodos. Se realizaron cultivos de vigilancia a los pacientes admitidos a UCI (n = 113) y cultivos de muestras ambientales (n = 69) y de manos de personal (n = 23) entre agosto y diciembre del 2003. Resultados. Se obtuvieron 25 aislamientos de ERV (24 Enterococcus faecium y 1 E. avium) provenientes de 8 pacientes y 7 muestras ambientales. No se obtuvo crecimiento de ERV en manos de personal sanitario. Todos los aislamientos de E. faecium resistentes a vancomicina, ambientales y de pacientes, eran portadores del gen vanA y pertenecieron a un mismo clon. Conclusión. La contaminación ambiental posee un importante papel en el reservorio de futuros brotes de ERV perpetuando la transmisión del mismo en el ambiente hospitalario (AU)
Introduction. Vancomycin-resistant enterococci isolates (VRE) have caused numerous outbreaks in intensive care units (ICUs). A contaminated hospital environment, the hands of health care workers (HCW), and carrier patients may play important roles in perpetuating the chain of transmission in these outbreaks. The aims of this study were to report the first VRE outbreak in our center and assess the role of environmental contamination and HCW hands in the spread of new cases of enterococcal infection. Material and Method. Between August and December 2003, surveillance cultures were performed with samples from all patients (n = 113) admitted to the ICU, as well as cultures of samples from the environment (n = 69) and HCW hands (n = 23). Results. Eighteen clinical samples from 8 patients and 7 environmental samples yielded Enterococcus faecium (24 strains) and E. avium (1 strain). VRE was not detected on HCW hands. All the VRE isolates belonged to a single clone and carried the vanA gene. Conclusion. Environmental contamination provides an important reservoir for future outbreaks of VRE, perpetuating transmission of the microorganism in the hospital setting (AU)
Asunto(s)
Humanos , Enterococcus/patogenicidad , Infección Hospitalaria/epidemiología , Contaminación Biológica , Resistencia a la Vancomicina , Brotes de EnfermedadesRESUMEN
Para contribuir a aclarar la frecuente discusión con respecto a la utilidad de la coloración de Gram en el diagnóstico preliminar de un proceso infeccioso, se determinó su utilidad, estudiando 455 muestras tomadas por punción. Se efectuó coloración de Gram, examen microscópico en fresco y cultivo semicuantitativo de 287 muestras provenientes de piel y partes blandas: (celulitis y pie diabético, líquidos abdominales, líquidos sinoviales, heridas quirúrgicas y bilis) y de 168 sitios estériles (LCR, líquido pleural, líquidos ascíticos). La sensibilidad (S), especificidad (E), valor predictivo positivo (VPP) y valor predictivo negativo (VPN) fueron: 43,1 por ciento, 97,2 por ciento, 90,4 por ciento y 73,6 por ciento respectivamente para el primer grupo y de 45,5 por ciento, 99,4 por ciento, 83,3 por ciento y 96,3 por ciento respectivamente para el segundo. En las muestras en las que no se observaron microorganismos en la coloración de Gram, en su mayoría se obtuvo desarrollo sólo en medio líquido. Al considerar estos aislamientos como no significativos, la sensibilidad de la coloración de Gram aumentó a 51,7 por ciento para el primer grupo y 66,7 por ciento para el segundo. El grado de concordancia entre la observación de microorganismos en la coloración de Gram y el cultivo fue del 92,2 por ciento. A pesar de su baja S, por su aceptable E, VPP y VPN, bajo costo y rapidez, la coloración de Gram de muestras tomadas por punción constituye un importante aporte para predecir infección y orientar a un adecuado y temprano tratamiento antimicrobiano
Asunto(s)
Humanos , Bacterias Gramnegativas , Infecciones por Bacterias Gramnegativas , Bacterias Grampositivas , Infecciones por Bacterias Grampositivas , Bilis , Celulitis (Flemón) , Infección de la Herida Quirúrgica/etiología , Infección de la Herida Quirúrgica/microbiología , Líquido Ascítico/microbiología , Líquido Cefalorraquídeo/microbiología , Líquido Sinovial/microbiología , Peritonitis , Pie Diabético/etiología , Pie Diabético/microbiología , Derrame Pleural , Valor Predictivo de las Pruebas , Punciones , Sensibilidad y Especificidad , Coloración y EtiquetadoRESUMEN
Objetivos: 1) Determinar la prevalencia de infección por Chlamydia trachomatis (CT) en una población hospitalaria de mujeres adolescentes. 2) Analizar factores epidemiológicos asociados. Materiales y métodos: Población: se realizó un estudio prospectivo en 126 mujeres adolescentes seleccionadas al azar que concurrieron a la Sección Adolescencia entre octubre de 2000 a febrero de 2002. Se incluyeron de hasta 21 años de edad inclusive, no embarazadas y que hayan iniciado relaciones sexuales. Métodos: las mujeres fueron interrogadas utilizando un cuestionario diseñado previamente, evaluando sintomatología (disuria, dispareunia, prurito, ardor o dolor vulvar, algia pelviana), conducta sexual y factores demográficos. Se consideraron pacientes sintomáticas a aquellas que presentaron al menos uno de los síntomas antes mencionados. Se recogieron muestras de primer chorro miccional (20 ml) para investigar CT. La detección de este microorganismo se efectuó por la técnica de LCR (reacción en cadena de la ligasa) con LCx Chlamydia trachomatis Assay (Laboratorios Abbott, Argentina). Resultados: La prevalencia de infección por CT en la población estudiada fue del 9.5 por ciento (12/126). Las pacientes sintomáticas fueron 58 (46 por ciento) y las asintomáticas 68 (54 por ciento). No hubo diferencia significativa entre prevalencias de infección en mujeres sintomáticas y asintomáticas (10.3 por ciento y 8.8 por ciento, respectivamente; p>0.05). Sólo el 50 por ciento de las pacientes infectadas presentaron síntomas. El promedio de edad fue de 18.4 años (rango: 14-21). El promedio de edad de mujeres infectadas por CT no difirió significativamente del de las mujeres no infectadas (18.4 vs 18.8; p>0.05). El promedio de IRS en la población infectada y en la no infectada fue de 15.5 y 16.1 años respectivamente. Conclusiones: Las prevalencias de infección por CT en los grupos de pacientes sintomáticas y asintomáticas fue semejante. De esto se desprende la necesidad de realizar un "screening" universal en poblaciones adolescentes sexualmente activas para prevenir el impacto en la fertilidad futura. Es importante destacar la practicidad de utilizar el primer chorro miccional para la detección de CT en una institución hospitalaria