Detalles de la búsqueda
1.
PaintOmics 4: new tools for the integrative analysis of multi-omics datasets supported by multiple pathway databases.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W551-W559, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35609982
2.
MultiBaC: an R package to remove batch effects in multi-omic experiments.
Bioinformatics
; 38(9): 2657-2658, 2022 04 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35238331
3.
Feedforward regulation of Myc coordinates lineage-specific with housekeeping gene expression during B cell progenitor cell differentiation.
PLoS Biol
; 17(4): e2006506, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30978178
4.
A multi-omic study for uncovering molecular mechanisms associated with hyperammonemia-induced cerebellar function impairment in rats.
Cell Biol Toxicol
; 37(1): 129-149, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33404927
5.
PaintOmics 3: a web resource for the pathway analysis and visualization of multi-omics data.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W503-W509, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29800320
6.
Identification and visualization of differential isoform expression in RNA-seq time series.
Bioinformatics
; 34(3): 524-526, 2018 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28968682
7.
spongeScan: A web for detecting microRNA binding elements in lncRNA sequences.
Nucleic Acids Res
; 44(W1): W176-80, 2016 07 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27198221
8.
Data quality aware analysis of differential expression in RNA-seq with NOISeq R/Bioc package.
Nucleic Acids Res
; 43(21): e140, 2015 Dec 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26184878
9.
RGmatch: matching genomic regions to proximal genes in omics data integration.
BMC Bioinformatics
; 17(Suppl 15): 427, 2016 Nov 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28185573
10.
Transcriptome modulation during host shift is driven by secondary metabolites in desert Drosophila.
Mol Ecol
; 25(18): 4534-50, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27483442
11.
RNAseq analysis of Aspergillus fumigatus in blood reveals a just wait and see resting stage behavior.
BMC Genomics
; 16: 640, 2015 Aug 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26311470
12.
Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series.
Bioinformatics
; 30(18): 2598-602, 2014 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24894503
13.
Differential expression in RNA-seq: a matter of depth.
Genome Res
; 21(12): 2213-23, 2011 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21903743
14.
Qualimap: evaluating next-generation sequencing alignment data.
Bioinformatics
; 28(20): 2678-9, 2012 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22914218
15.
Machine learning approaches in microbiome research: challenges and best practices.
Front Microbiol
; 14: 1261889, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37808286
16.
Advancing microbiome research with machine learning: key findings from the ML4Microbiome COST action.
Front Microbiol
; 14: 1257002, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37808321
17.
acorde unravels functionally interpretable networks of isoform co-usage from single cell data.
Nat Commun
; 13(1): 1828, 2022 04 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35383181
18.
Reference-based comparison of adaptive immune receptor repertoires.
Cell Rep Methods
; 2(8): 100269, 2022 08 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36046619
19.
Machine-learning-derived predictive score for early estimation of COVID-19 mortality risk in hospitalized patients.
PLoS One
; 17(9): e0274171, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36137106
20.
Association Between Sex Hormone Levels and Clinical Outcomes in Patients With COVID-19 Admitted to Hospital: An Observational, Retrospective, Cohort Study.
Front Immunol
; 13: 834851, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35154158