Detalles de la búsqueda
1.
Identification and characterization of RNA binding sites for (p)ppGpp using RNA-DRaCALA.
Nucleic Acids Res
; 51(2): 852-869, 2023 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36617997
2.
Escherichia coli transcriptome assembly from a compendium of RNA-seq data sets.
RNA Biol
; 20(1): 77-84, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36920168
3.
A computational system for identifying operons based on RNA-seq data.
Methods
; 176: 62-70, 2020 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30953757
4.
Small RNA profiling in Mycobacterium tuberculosis identifies MrsI as necessary for an anticipatory iron sparing response.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 115(25): 6464-6469, 2018 06 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29871950
5.
Identification and Characterization of Serotype-Specific Variation in Group A Streptococcus Pilus Expression.
Infect Immun
; 86(2)2018 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29158432
6.
Probing the sRNA regulatory landscape of P. aeruginosa: post-transcriptional control of determinants of pathogenicity and antibiotic susceptibility.
Mol Microbiol
; 106(6): 919-937, 2017 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28976035
7.
TargetRNA2: identifying targets of small regulatory RNAs in bacteria.
Nucleic Acids Res
; 42(Web Server issue): W124-9, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24753424
8.
Computational analysis of bacterial RNA-Seq data.
Nucleic Acids Res
; 41(14): e140, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23716638
9.
Assessing computational tools for the discovery of small RNA genes in bacteria.
RNA
; 17(9): 1635-47, 2011 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21768221
10.
TargetRNA3: predicting prokaryotic RNA regulatory targets with machine learning.
Genome Biol
; 24(1): 276, 2023 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38041165
11.
MLpronto: A tool for democratizing machine learning.
PLoS One
; 18(11): e0294924, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38032968
12.
Bioinformatic prediction and experimental verification of sRNAs in the haloarchaeon Haloferax volcanii.
RNA Biol
; 8(5): 806-16, 2011.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21712649
13.
TargetRNA: a tool for predicting targets of small RNA action in bacteria.
Nucleic Acids Res
; 36(Web Server issue): W109-13, 2008 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18477632
14.
Small non-coding RNAs in Streptomyces coelicolor.
Nucleic Acids Res
; 36(22): 7240-51, 2008 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19008244
15.
Small RNAs of the halophilic archaeon Haloferax volcanii.
Biochem Soc Trans
; 37(Pt 1): 133-6, 2009 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19143617
16.
Target prediction for small, noncoding RNAs in bacteria.
Nucleic Acids Res
; 34(9): 2791-802, 2006.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16717284
17.
Transcriptome Analysis of Neisseria gonorrhoeae during Natural Infection Reveals Differential Expression of Antibiotic Resistance Determinants between Men and Women.
mSphere
; 3(3)2018 08 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29950382
18.
An approach for clustering gene expression data with error information.
BMC Bioinformatics
; 7: 17, 2006 Jan 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16409635
19.
Transcriptome analysis of Escherichia coli using high-density oligonucleotide probe arrays.
Nucleic Acids Res
; 30(17): 3732-8, 2002 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12202758
20.
GRIL-seq provides a method for identifying direct targets of bacterial small regulatory RNA by in vivo proximity ligation.
Nat Microbiol
; 2: 16239, 2016 Dec 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28005055