Detalles de la búsqueda
1.
IMBAS-MS Discovers Organ-Specific HLA Peptide Patterns in Plasma.
Mol Cell Proteomics
; 23(1): 100689, 2024 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38043703
2.
Full Mass Range ΦSDM Orbitrap Mass Spectrometry for DIA Proteome Analysis.
Mol Cell Proteomics
; 23(2): 100713, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38184013
3.
The structural context of posttranslational modifications at a proteome-wide scale.
PLoS Biol
; 20(5): e3001636, 2022 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35576205
4.
Precise, fast and comprehensive analysis of intact glycopeptides and modified glycans with pGlyco3.
Nat Methods
; 18(12): 1515-1523, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34824474
5.
Robust dimethyl-based multiplex-DIA doubles single-cell proteome depth via a reference channel.
Mol Syst Biol
; 19(9): e11503, 2023 09 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37602975
6.
Deep-Learning-Derived Evaluation Metrics Enable Effective Benchmarking of Computational Tools for Phosphopeptide Identification.
Mol Cell Proteomics
; 20: 100171, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34737085
7.
pDeepXL: MS/MS Spectrum Prediction for Cross-Linked Peptide Pairs by Deep Learning.
J Proteome Res
; 20(5): 2570-2582, 2021 05 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33821641
8.
pDeep3: Toward More Accurate Spectrum Prediction with Fast Few-Shot Learning.
Anal Chem
; 93(14): 5815-5822, 2021 04 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33797898
9.
Precision De Novo Peptide Sequencing Using Mirror Proteases of Ac-LysargiNase and Trypsin for Large-scale Proteomics.
Mol Cell Proteomics
; 18(4): 773-785, 2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30622160
10.
Deep Learning in Proteomics.
Proteomics
; 20(21-22): e1900335, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32939979
11.
A Deep Learning-Based Tumor Classifier Directly Using MS Raw Data.
Proteomics
; 20(21-22): e1900344, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32643271
12.
pNovo 3: precise de novo peptide sequencing using a learning-to-rank framework.
Bioinformatics
; 35(14): i183-i190, 2019 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31510687
13.
pValid: Validation Beyond the Target-Decoy Approach for Peptide Identification in Shotgun Proteomics.
J Proteome Res
; 18(7): 2747-2758, 2019 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31244209
14.
MS/MS Spectrum Prediction for Modified Peptides Using pDeep2 Trained by Transfer Learning.
Anal Chem
; 91(15): 9724-9731, 2019 08 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31283184
15.
pSite: Amino Acid Confidence Evaluation for Quality Control of De Novo Peptide Sequencing and Modification Site Localization.
J Proteome Res
; 17(1): 119-128, 2018 01 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29130300
16.
Open-pNovo: De Novo Peptide Sequencing with Thousands of Protein Modifications.
J Proteome Res
; 16(2): 645-654, 2017 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28019094
17.
pDeep: Predicting MS/MS Spectra of Peptides with Deep Learning.
Anal Chem
; 89(23): 12690-12697, 2017 12 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29125736
18.
pTop 1.0: A High-Accuracy and High-Efficiency Search Engine for Intact Protein Identification.
Anal Chem
; 88(6): 3082-90, 2016 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26844380
19.
A note on the false discovery rate of novel peptides in proteogenomics.
Bioinformatics
; 31(20): 3249-53, 2015 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26076724
20.
pQuant improves quantitation by keeping out interfering signals and evaluating the accuracy of calculated ratios.
Anal Chem
; 86(11): 5286-94, 2014 Jun 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24799117