Your browser doesn't support javascript.
loading
TIGR Gene Indices clustering tools (TGICL): a software system for fast clustering of large EST datasets.
Pertea, Geo; Huang, Xiaoqiu; Liang, Feng; Antonescu, Valentin; Sultana, Razvan; Karamycheva, Svetlana; Lee, Yuandan; White, Joseph; Cheung, Foo; Parvizi, Babak; Tsai, Jennifer; Quackenbush, John.
Afiliación
  • Pertea G; The Institute for Genomic Research, Rockville, MD 20850, USA.
Bioinformatics ; 19(5): 651-2, 2003 Mar 22.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-12651724
ABSTRACT
TGICL is a pipeline for analysis of large Expressed Sequence Tags (EST) and mRNA databases in which the sequences are first clustered based on pairwise sequence similarity, and then assembled by individual clusters (optionally with quality values) to produce longer, more complete consensus sequences. The system can run on multi-CPU architectures including SMP and PVM.
Asunto(s)
Buscar en Google
Imprimir
XML
PubMed Links

Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Sistemas de Administración de Bases de Datos / Almacenamiento y Recuperación de la Información / Alineación de Secuencia / Análisis de Secuencia de ADN / Etiquetas de Secuencia Expresada / Perfilación de la Expresión Génica / Bases de Datos de Ácidos Nucleicos Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2003 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos
Buscar en Google
Imprimir
XML
PubMed Links

Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Sistemas de Administración de Bases de Datos / Almacenamiento y Recuperación de la Información / Alineación de Secuencia / Análisis de Secuencia de ADN / Etiquetas de Secuencia Expresada / Perfilación de la Expresión Génica / Bases de Datos de Ácidos Nucleicos Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2003 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos