A fuzzy method for RNA-Seq differential expression analysis in presence of multireads.

Consiglio, Arianna; Mencar, Corrado; Grillo, Giorgio; Marzano, Flaviana; Caratozzolo, Mariano Francesco; Liuni, Sabino

Consiglio, Arianna; Mencar, Corrado; Grillo, Giorgio; Marzano, Flaviana; Caratozzolo, Mariano Francesco; Liuni, Sabino.

Afiliación

Consiglio A; Institute for Biomedical Technologies of Bari - ITB, National Research Council, Bari, 70126, Italy. arianna.consiglio@ba.itb.cnr.it.
Mencar C; Department of Informatics, University of Bari Aldo Moro, Bari, 70121, Italy.
Grillo G; Institute for Biomedical Technologies of Bari - ITB, National Research Council, Bari, 70126, Italy.
Marzano F; Institute for Biomedical Technologies of Bari - ITB, National Research Council, Bari, 70126, Italy.
Caratozzolo MF; Institute for Biomedical Technologies of Bari - ITB, National Research Council, Bari, 70126, Italy.
Liuni S; Institute for Biomedical Technologies of Bari - ITB, National Research Council, Bari, 70126, Italy.

BMC Bioinformatics ; 17(Suppl 12): 345, 2016 Nov 08.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28185579

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; ARN/genética; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Reproducibilidad de los Resultados; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Programas Informáticos

Palabras clave

Differential expression; Fuzzy sets; Multireads; Possibilistic modeling; RNA-Seq

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: ARN / Biología Computacional / Perfilación de la Expresión Génica Tipo de estudio: Evaluation_studies / Observational_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: Italia

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